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| Registros recuperados : 78 | |
| 61. |  | GOUVEIA, G. V.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, v. 43, n. 5, p. 518-524, oct. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 62. | | VENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, v. 43, n. 5, p. 518?524, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 63. | | VENERONI-GOUVEIA, G.; MEIRELLES, S. L.; GROSSI, D. A.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; MATUKUMALLI, L. K.; COUTINHO, L. L.; ALENCAR, M. M. de; OLIVEIRA, H. N.; REGITANO, L. C. de A. Whole-genome analysis for backfat thickness in a tropically adapted, composite cattle breed from Brazil. Animal Genetics, v. 43, n. 5, p. 518-524, nov. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 64. | | MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A. Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. BMC Genomics, London v. 15, S6, p. 1-9, 2014. Suppl 7.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 65. | | SOUZA, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; IBELLI, A. M. G.; MEIRELLES, S. L.; ROCHA, M. I.; TIZIOTO, P. C.; GASPARIN, G.; CARVALHO, M. E.; VENERONI, G.; OLIVEIRA, P. S. N.; SIQUEIRA, F.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Bialellic expression studies of CAST gene in bovine muscle. Journal Animal Science, v. 89, (E-Suppl. 1); Journal of Dairy Science, v. 89 (E-Suppl. 1), p.277, 2011| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 66. | | TIZIOTO, P. C.; SOUZA, M. M. de; MUDADU, M. de A.; THOLON, P.; MEIRELLES, S. L. C.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; ROSA, A. do N.; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; REGITANO, L. C. de A. Association of KCNJ11 gene variants with tenderness in Nelore breed. In: CONFERENCE OF INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS, 33., 2012, Cairns, AU. Abstracts... Cairns: ISAG, 2012. p.109-110 P4046| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 67. | | TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; VENERONI, G. B.; SOUZA, M. M. DE.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; FEIJO, G. L. D.; REGITANO, L. C. de A. Novel associations between a SNP in the bovine DDEF1 gene and production traits in Nellore breed. In: ADSA-PSA-AMPA-ASAS JOINT ANNUAL MEETING, 2011, New Orleans, Louisiana. [Abstracts]. Publicado em: Journal Animal Science, v. 89, (E-Suppl. 1); Journal of Dairy Science, v. 89 (E-Suppl. 1), p.276-277, 2011. Breeding and Genetics: Molecular Genetics. T.33.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 68. | | IBELLI, A. M. G.; GIGLIOTI, R.; PAÇO, A. L.; RIBEIRO, A. R. B.; MEIRELLES, S. L.; VENERONI, G. B.; OLIVEIRA, M. C. de S.; CHAGAS, A. C. de S.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Comportamento de auto-limpeza e seu papel no controle de carrapatos R. (Boophilus) microplus em bovinos Nelore, Senepol x Nelore e Angus x Nelore. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendedorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda: anais. Salvador: SBZ: UFBA, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 69. | | BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. do A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; CHUD, T. C. S.; STAFUZZA, N. B.; ROLA, L. D.; MEIRELLES, S. L. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; HIGA, R. H.; SILVA, M. V. G. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Candidate genes for male and female reproductive traits in Canchim beef cattle. Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 8, p. 1-10, 2017. Artigo 67. Na publicação: Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 70. | | TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; REGITANO, L. C. de A. Candidate genes for production traits in Nelore beef cattle. Genetics and Molecular Research, v. 11, n. 4, p. 4138-4144, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 71. | | TIZIOTO, P. C.; VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; NASCIMENTO, M. L.; SOUZA, A. R. D. L.; FEIJO, G. L. D.; REGITANO, L. C. de A. Candidate genes for production traits in reference families of Nellore beef cattle. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9., 2010, Leipzig. Proceedings... Leipzig: German Society fo Animal Science, 2010. 4 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 72. | | TIZIOTO, P. C.; VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; NASCIMENTO, M. L.; SOUZA, A. R. D. L.; FEIJO, G. L. D.; REGITANO, L. C. de A. Candidate genes for production traits in reference families of Nellore beef cattle. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 9., 2010, Leipzig. Proceedings... Leipzig: German Society of Animal Science, 2010. 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 73. | | TIZIOTO, P. C.; GASPARIN, G.; SOUZA, M. M.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; THOLON, P.; MEIRELLES, S. L. C.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A. Identification of KCNJ11 as a functional candidate gene for bovine meat tenderness. Physiological Genomics, v. 45, n. 24, p. 1215-1221, October 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 74. | | TIZIOTO, P.; GASPARINI, G.; SOUZA, M. M.; MUDADU, M. de A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; THOLON, P.; MEIRELLES, S. L. C.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; MEDEIROS, S. R.; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A. Identification of KCNJ11 as a functional candidate gene for bovine meat tenderness. Physiological Genomics, v. 45, n. 24, p. 1215-1221, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 75. | | BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C. O; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. Genome-wide association for growth traits in Canchim beef cattle. Plos One, v. 9, n. 4, e94802 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 76. | | MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B.; CARDOSO, F. F.; NICIURA, S. C. M.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. BMC Genetics, London, v. 14, article 47, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 77. | | MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; LIMA, A. O. de; MEIRELLES, S. L. C.; SILVA, M. V. G. B. da; CARDOSO, F. F.; OLIVEIRA, M. M. de; URBINATI, I.; NICIURA, S. C. M.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Genome-wide association study for backfat thickness in Canchim beef cattle using Random Forest approach. BMC Genetics, London v. 14, n. 47, 2013. 11 p.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 78. | | TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; VENERONE, G. B.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; REGITANO, L. C. de A. A SNP in ASAP1 gene is associated with meat quality and production traits in Nelore breed. Meat Science, v. 92, n. 4, p. 855-857, dec. 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 78 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
17/12/2014 |
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Data da última atualização: |
05/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
MOKRY, F. B.; BUZANSKAS, M. E.; MUDADU, M. de A.; GROSSI, D. do A.; HIGA, R. H.; VENTURA, R. V.; LIMA, A. O. de; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C.; SCHENKEL, F. S.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; ALENCAR, M. M. de; MINARI, D. P.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
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Título: |
Linkage disequilibrium and haplotype block structure in a composite beef cattle breed. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, London v. 15, S6, p. 1-9, 2014. |
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DOI: |
10.1186/1471-2164-15-S7-S6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Suppl 7. |
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Conteúdo: |
Abstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances ranging from 400 to 500 kb, clearly showing that the average r2 reduced with the increase in SNP pair distances. The persistence of LD phase showed higher values at shorter genomic distances, decreasing with the increase in physical distance, varying from 0.96 at a distance of < 2.5 kb to 0.66 at a distance from 400 to 500 kb. A total of 78% of all SNPs were clustered into haplotype blocks, covering 1,57 Mb of the total autosomal genome size. Conclusions: This study presented the first high density linkage disequilibrium map and haplotype block structure for a composite beef cattle population, and indicates that the high density SNP panel over 700 k can be used for genomic selection implementation and GWA studies for Canchim beef cattle. MenosAbstract. Background: The development of linkage disequilibrium (LD) maps and the characterization of haplotype block structure at the population level are useful parameters for guiding genome wide association (GWA) studies, and for understanding the nature of non-linear association between phenotypes and genes. The elucidation of haplotype block structure can reduce the information of several single nucleotide polymorphisms (SNP) into the information of a haplotype block, reducing the number of SNPs in a coherent way for consideration in GWA and genomic selection studies. Results: The maximum average LD, measured by r2 varied between 0.33 to 0.40 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied between 0.05 to 0.07 at distances ranging from 400 to 500 kb, clearly showing that the average r2 reduced with the increase in SNP pair distances. The persistence of LD phase showed higher values at shorter genomic distances, decreasing with the increase in physical distance, varying from 0.96 at a distance of < 2.5 kb to 0.66 at a distance from 400 to 500 kb. A total of 78% of all SNPs were clustered into haplotype blocks, covering 1,57 Mb of the total autosomal genome size. Conclusions: This study presented the first high density linkage disequilibrium map and haplotype block structure for a composite beef cattle population, and indicates that the high density SNP panel over 700 k can be used for genomic selection implementation and GWA studies for Canchim bee... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Composite; Desequilíbrio de ligação; Genome wide association studies; Halplotype block; Linjage disequilibirium; Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Gado de corte. |
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Thesaurus NAL: |
Beef cattle; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/119863/1/MOKRY.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114007/1/PROCI-2104.00140.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114252/1/1471-2164-15-S7-S6.pdf
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Marc: |
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773 $tBMC Genomics, London$gv. 15, S6, p. 1-9, 2014.
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Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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