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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
11/12/2018 |
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Data da última atualização: |
05/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; ROCHA, M. I. P.; DINIZ, W. J. S.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
MARCELA M. DE SOUZA, UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; LUDWIG GEISTLINGER, CPPSE; POLYANA C. TIZIOTO, NGS Genomic Solution; JEREMY F. TAYLOR, University of Missouri; MARINA I. P. ROCHA, UFSCar; WELLISON J. S. DINIZ, UFSCar; LUIZ L. COUTINHO, USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
A comprehensive manually-curated compendium of bovine transcription factors. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 8, p. 1-12, 2018. |
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DOI: |
10.1038/s41598-018-32146-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Article number: 13747. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana C. A. Regitano. |
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Conteúdo: |
Transcription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an improved comprehension of regulatory mechanisms that are specific to the species. |
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Palavras-Chave: |
DNA bovine; DNA bovino; Expressão gênica; Gene expression in cattle. |
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Thesaurus Nal: |
Gene expression regulation. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/189042/1/AP-Comprehensive-Adhemar-etal.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/188184/1/ComprehensiveManuallyCurated.pdf
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Marc: |
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005 2019-02-05
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520 $aTranscription factors (TFs) are pivotal regulatory proteins that control gene expression in a contextdependent and tissue-specific manner. In contrast to human, where comprehensive curated TF collections exist, bovine TFs are only rudimentary recorded and characterized. In this article, we present a manually-curated compendium of 865 sequence-specific DNA-binding bovines TFs, which we analyzed for domain family distribution, evolutionary conservation, and tissue-specific expression. In addition, we provide a list of putative transcription cofactors derived from known interactions with the identified TFs. Since there is a general lack of knowledge concerning the regulation of gene expression in cattle, the curated list of TF should provide a basis for an improved comprehension of regulatory mechanisms that are specific to the species.
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653 $aGene expression in cattle
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 562. | | VELLOSO, C. C. V.; RIBEIRO, V. P.; CARVALHO, C. G. de; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; LANA, U. G. de P.; MARRIEL, I. E.; SOUSA, S. M. de; GOMES, E. A. Tropical endophytic Bacillus species enhance plant growth and nutrient uptake in cereals. In: MAHESHWARI, D. K.; DHEEMAN, D. (ed.). Endophytes: mineral nutrient management. Cham: Springer, 2021. v. 3, p. 157-180. (Sustainable Development and Biodiversity, 26).| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 563. | | OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; GOMES, E. A.; MATTOS, B. B.; TEIXEIRA, J. A. de M.; CRISTELLI, E. A.; DIAS, F. E. S.; BARACHO, A. de O.; MARRIEL, I. E. Utilização de bioinoculantes para cultivo de milheto (Pennisetum glaucum) com fontes naturais de fosfato. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2012. 1 CD-ROM. Fertbio 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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