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| Registros recuperados : 63 | |
| 21. |  | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Analysis of Paspalum notatum transcriptome under drought condition. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 14., 2018, São Pedro. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2018. p. 210. X-meeting 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 22. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Analysis of paspalum notatum transcriptome under drought condition. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 10., 2015, São Pedro, SP. Proceedings...São Pedro, SP: Meeting, 2018. p. 210. p. 210| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 23. | | OLIVEIRA, P. S. N.; MALAGO JUNIOR, W.; TIZIOTO, P. C.; NASCIMENTO, M. L. do; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. NEUROD1 gene is not associated with feed efficiency in Nellore cattle. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Abstract... Guarujá:[ s.n.], 2013. AB.28.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 24. | | BILHASSI, T. B.; IBELLI, A. M. G.; GIGLIOTI, R.; MALAGO JUNIOR, W.; REGITANO, L. C. de A.; OLIVEIRA, M. C. de S.; OLIVEIRA, H. N. de. Estimativa da taxa de infecção por Babesia bovis usando a técnica de RT-PCR em animais de diferentes grupos genéticos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém. O Desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios. Anais... Belém: SBZ: UFRA, 2011. 4 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 25. | | ROCHA, M. I. P.; MELLO, S. S. DE; BUZATTO, V. C.; OLIVEIRA, A. de L.; BRESSANI, F. A.; MALAGO JUNIOR, W.; NICIURA, S. C. M. Estudo da metilação de ilhas CpG no gene da calpastatina, relacionado à maciez de carne em bovinos de corte: resultados preliminares. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 37. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56).| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 26. | | OLIVEIRA, M. C. de S.; BILHASSI, T. B.; GIGLIOTI, R; IBELLI, A. M. G.; MALAGO JUNIOR, W.; OLIVEIRA, H. N. de. Estudo da prevalência e do nível de infecção por Babesia bovis e Babesia bigemina em bovinos da raça Angus, Nelore e cruzados, criados em áreas Indêmicas do Estado de São Paulo. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. 26 p. (Embrapa Pecuária Sudeste. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 37).| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 27. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Transcriptome analysis of Paspalum notatum and Paspalum vaginatum under water deficit condition. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 65., 2019, Águas de Lindóia. Edição de genes e genomas. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, 2019. p. 198. E-book. Genética 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 28. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Transcriptome analysis of Paspalum notatum and Paspalum vaginatum under water deficit condition. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 65., 2019, Águas de Lindóia. Edição de genes e genomas. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, 2019. p. 198. E-book. Genética 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 29. | | VIGNA, B. B. Z.; ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C. Transcriptome analysis of paspalum vaginatum under drought condition. In: INTERNATIONAL FORAGE & TURF BREEDING CONFERENCE, 2019, Lake Buena Vista. A global vision for innovation: abstract book. Gainesville: University of Florida, 2019. p. 129. Na publicação: M.A. Mudadu. IFTBC 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 30. | | VIGNA, B. B. Z.; ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C. Transcriptome analysis of paspalum vaginatum under drought condition. In: INTERNATIONAL FORAGE & TURF BREEDING CONFERENCE - a global vision for innovation, 2019, Lake Buena Vista, USA. Proceedings... Lake Buena Vista, USA: IFTBC, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 31. | | BRANDÃO, M. M.; ARRUDA, L. H.; NESHICH, G.; NESHICH, I. P.; PEREIRA, J. G. C.; MALAGÓ JÚNIOR, W.; SILVA-FILHO, M. C. Structural and phylogenetic analysis of Spodoptera frugiperda chymotrypsins involved on insect chemical protective barrier against plant Proteinase Inhibitors (PIs). In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 32. | | BEGNAMI, I. DOS S.; AONO, A. H.; MALAGO JUNIOR, W.; GUSMAO, M. R.; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA, A. P. DE. Differential gene expression for elucidating Paspalum regnellii resistance against Spittlebugs (Mahanarva spectabilis). In: GB MEETING, 5., 2023, Campinas. Proceedings... Campinas: Unicamp, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 33. | | BILHASSI, T. B.; GIGLIOTI, R.; OKINO, C. H.; MALAGO JUNIOR, W.; OLIVEIRA, H. N. de; MARCONDES, C. R.; OLIVEIRA, M. C. de S. Differential IL10 mRNA profiles associated to Babesia bovis and B. bigemina infection levels in persistently infected animals. Open Journal of Veterinary Medicine, v. 9, p.161-169, 2019| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 34. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de dados de transcriptoma de Paspalum submetido à seca. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p. 39. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 35. | | ARAKAKI, J. E.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; SANTOS, P. M.; FAVERO, A. P.; BORRA, R. C.; VIGNA, B. B. Z. Obtenção de dados de transcriptoma de Paspalum submetido à seca. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 10., 2018, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2018. p.39. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 68). Editores técnicos: Daniel Souza Corrêa, Elaine Cristina Paris, Maria Alice Martins, Paulino Ribeiro Villas Boas, Wilson Tadeu Lopes da Silva.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 36. | | FERREIRA, E. M.; ROMERO, L. C.; CUNHA, M. DE L. R. DE S. DA; MALAGO JUNIOR, W.; CAMARGO, C. H.; BARIONI JUNIOR, W.; ZAFALON, L. F. Persistence of Staphylococcus spp. in milk from cows undergoing homeopathy to control subclinical mastitis. BMC Veterinary Research, v. 18, n. 273, 2022. 13 p.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 37. | | NICIURA, S. C. M.; OKINO, C. H.; NUCCI, A. DA S.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; ESTEVES, S. N.; CHAGAS, A. C. de S. Polymorphisms in exon 11 of the mptl-1 gene and monepantel resistance in Haemonchus contortus. Parasitology Research, v. 121, p. 3581-3588, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 38. | | OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; NORONHA, C. T.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. A SNP in NEUROD1 is associated with production traits in Nelore beef cattle. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barra dos Coqueiros. A produção animal frente às mudanças climáticas e tecnológicas - anais. Barra dos coqueiros: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2014. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 39. | | LIMA, B. L.; LIMA, A. O. de; MOKRY, F. B.; BRESSANI, F.; MALAGO JUNIOR, W.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. Validação de um SNP associado à área de olho de lombo em uma população de animais Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 43. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56).| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 40. | | ROSA, D. S.; OLIVEIRA, J. F. da S.; COSTA, M. M. da; MELO, A. M. Y. de; GOUVEIA, J. J. de S.; MALAGO JUNIOR, W.; REGITANO, L. C. de A.; GOUVEIA, G. V. Presence of Enterobacteriaceae and Clostridiaceae in thte soil according to the use of biofertilizers of feces from goats and sheep. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 30., 2019, Maceió. Resumos... São Paulo, SP: Sociedade Brasileira de Microbiologia -SBM, 2019. 311.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 63 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Pecuária Sudeste. Para informações adicionais entre em contato com cppse.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
10/08/2018 |
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Data da última atualização: |
24/09/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; Giovanna Gabrielle Cruvinel, UNICEP; Caroline Valério Moraes, UFSCar; FLAVIA ALINE BRESSANI DONATONI, CPPSE; WILSON MALAGO JUNIOR, CPPSE; MAGDA VIEIRA BENAVIDES, CPPSUL; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v.45, n.4, p.651-654, aug. 2018. |
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ISSN: |
1573-4978 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-018-4206-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the main type of variation in genome, enabling them to be associated with traits of economic importance in livestock. Genome-wide association studies (GWAS) have led to the discovery of SNPs associated with desirable traits in sheep. However, in these studies, SNPs are genotyped by high-throughput methods in genome scale, which are expensive and require sophisticated equipment and analysis methods. Therefore, the goal of this study was to develop a reliable, rapid, and inexpensive polymerase chain reaction (PCR)-based method to genotype a medium number of animals for a few candidate SNPs previously associated with desirable phenotypes in sheep by GWAS, using markers associated with gastrointestinal nematode resistance as a model. DNA extracted from white-blood cells of 150 sheep was submitted to PCR amplification followed by agarose gel electrophoresis and determination of banding pattern. Tetra-primer ARMS-PCR was successfully optimized after changes in annealing temperature; annealing and extension times; concentration of MgCl2 and DNA; ratios of inner, outer, forward and reverse primer; and addition of adjuvants, for genotyping the OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, and OAR12_69606944 SNPs in sheep. An extensive optimization of tetra-primer ARMS-PCR resulted in a suitable, simple, cost-effective PCR-based method of genotyping four SNP markers previously detected by chip arrays. |
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Palavras-Chave: |
PCR RFLP; Resistência nematódeo gastrintestinal; Tetra primer ARMS PCR. |
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Thesagro: |
Marcador Molecular; Ovino. |
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Thesaurus NAL: |
Genome. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02300naa a2200289 a 4500
001 2094070
005 2018-09-24
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a1573-4978
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s11033-018-4206-8$2DOI
100 1 $aNICIURA, S. C. M.
245 $aPCR-based genotyping of SNP markers in sheep.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aSingle nucleotide polymorphisms (SNPs) are the main type of variation in genome, enabling them to be associated with traits of economic importance in livestock. Genome-wide association studies (GWAS) have led to the discovery of SNPs associated with desirable traits in sheep. However, in these studies, SNPs are genotyped by high-throughput methods in genome scale, which are expensive and require sophisticated equipment and analysis methods. Therefore, the goal of this study was to develop a reliable, rapid, and inexpensive polymerase chain reaction (PCR)-based method to genotype a medium number of animals for a few candidate SNPs previously associated with desirable phenotypes in sheep by GWAS, using markers associated with gastrointestinal nematode resistance as a model. DNA extracted from white-blood cells of 150 sheep was submitted to PCR amplification followed by agarose gel electrophoresis and determination of banding pattern. Tetra-primer ARMS-PCR was successfully optimized after changes in annealing temperature; annealing and extension times; concentration of MgCl2 and DNA; ratios of inner, outer, forward and reverse primer; and addition of adjuvants, for genotyping the OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, and OAR12_69606944 SNPs in sheep. An extensive optimization of tetra-primer ARMS-PCR resulted in a suitable, simple, cost-effective PCR-based method of genotyping four SNP markers previously detected by chip arrays.
650 $aGenome
650 $aMarcador Molecular
650 $aOvino
653 $aPCR RFLP
653 $aResistência nematódeo gastrintestinal
653 $aTetra primer ARMS PCR
700 1 $aCRUVINEL, G. G.
700 1 $aMORAES, C. V.
700 1 $aDONATONI, F. A. B.
700 1 $aMALAGO JUNIOR, W.
700 1 $aBENAVIDES, M. V.
700 1 $aCHAGAS, A. C. de S.
773 $tMolecular Biology Reports$gv.45, n.4, p.651-654, aug. 2018.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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