| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
|
Data corrente: |
21/06/2016 |
|
Data da última atualização: |
21/06/2016 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
TEIXEIRA, F. R. F.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; SILVA, F. F. e; CRUZ, C. D.; AZEVEDO, C. F.; PAIXÃO, D. M.; BARROSO, L. M. A.; VERARDO, L. L.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; LOPES, P. S. |
|
Afiliação: |
F. R. F. Teixeira, UFV; M. Nascimento, UFV; A. C. C. Nascimento, UFV; F. F. e Silva, UFV; C. D. Cruz, UFV; C. F. Azevedo, UFV; D. M. Paixão, UFV; L. M. A. Barroso, UFV; L. L. Verardo, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; S. E. F. Guimarães, UFV; P. S. Lopes, UFV. |
|
Título: |
Factor analysis applied to genome prediction for high-dimensional phenotypes in pigs. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 15, n. 2, 2016. 10 p. |
|
DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr.15028231 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The aim of the present study was to propose and evaluate the use of factor analysis (FA) in obtaining latent variables (factors) that represent a set of pig traits simultaneously, for use in genome-wide selection (GWS) studies. We used crosses between outbred F2 populations of Brazilian Piau X commercial pigs. Data were obtained on 345 F2 pigs, genotyped for 237 SNPs, with 41 traits. FA allowed us to obtain four biologically interpretable factors: ?weight?, ?fat?, ?loin?, and ?performance?. These factors were used as dependent variables in multiple regression models of genomic selection (Bayes A, Bayes B, RR-BLUP, and Bayesian LASSO). The use of FA is presented as an interesting alternative to select individuals for multiple variables simultaneously in GWS studies; accuracy measurements of the factors were similar to those obtained when the original traits were considered individually. The similarities between the top 10% of individuals selected by the factor, and those selected by the individual traits, were also satisfactory. Moreover, the estimated markers effects for the traits were similar to those found for the relevant factor. |
|
Palavras-Chave: |
Análise multivariada; Genome enabled prediction; SNP effects. |
|
Thesagro: |
Estatística; Melhoramento genético animal; Seleção genética. |
|
Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Multivariate analysis. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/144605/1/2016-M.Deon-GMR-FactorAnalysis.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02251naa a2200361 a 4500
001 2047516
005 2016-06-21
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.4238/gmr.15028231$2DOI
100 1 $aTEIXEIRA, F. R. F.
245 $aFactor analysis applied to genome prediction for high-dimensional phenotypes in pigs.$h[electronic resource]
260 $c2016
520 $aThe aim of the present study was to propose and evaluate the use of factor analysis (FA) in obtaining latent variables (factors) that represent a set of pig traits simultaneously, for use in genome-wide selection (GWS) studies. We used crosses between outbred F2 populations of Brazilian Piau X commercial pigs. Data were obtained on 345 F2 pigs, genotyped for 237 SNPs, with 41 traits. FA allowed us to obtain four biologically interpretable factors: ?weight?, ?fat?, ?loin?, and ?performance?. These factors were used as dependent variables in multiple regression models of genomic selection (Bayes A, Bayes B, RR-BLUP, and Bayesian LASSO). The use of FA is presented as an interesting alternative to select individuals for multiple variables simultaneously in GWS studies; accuracy measurements of the factors were similar to those obtained when the original traits were considered individually. The similarities between the top 10% of individuals selected by the factor, and those selected by the individual traits, were also satisfactory. Moreover, the estimated markers effects for the traits were similar to those found for the relevant factor.
650 $aAnimal breeding
650 $aMultivariate analysis
650 $aEstatística
650 $aMelhoramento genético animal
650 $aSeleção genética
653 $aAnálise multivariada
653 $aGenome enabled prediction
653 $aSNP effects
700 1 $aNASCIMENTO, M.
700 1 $aNASCIMENTO, A. C. C.
700 1 $aSILVA, F. F. e
700 1 $aCRUZ, C. D.
700 1 $aAZEVEDO, C. F.
700 1 $aPAIXÃO, D. M.
700 1 $aBARROSO, L. M. A.
700 1 $aVERARDO, L. L.
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aGUIMARÃES, S. E. F.
700 1 $aLOPES, P. S.
773 $tGenetics and Molecular Research$gv. 15, n. 2, 2016. 10 p.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 295 | |
| 241. |  | AZEVEDO, G. C.; CHEAVEGATTI-GANOTTO, A.; NEGRI, B. F.; HUFNAGEL, B.; SILVA, L. da C. e; MAGALHAES, J. V.; GARCIA, A. A. F.; LANA, U. G. P.; SOUSA, S. M. de; GUIMARAES, C. T. Multiple interval QTL mapping and searching for PSTOL1 homologs associated with root morphology, biomass accumulation and phosphorus content in maize seedlings under low-P. BMC Plant Biology, v. 15, n. 172, p. 1-17, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
| 242. | | MAGALHAES, J. V.; GUIMARAES, C. T.; SCHAFFERT, R. E.; CANIATO, F. F.; LANA, U. P.; ALVES, V. M. C.; KLEIN, P. E.; WANG, Y.; LIU, J.; KOCHIAN, L. V. Molecular genetic studies of aluminum tolerance in sorghum: towards the positional cloning of a major Al tolerance gene and diversity for Al tolerance control in the genus sorghum. In: GRANTEE CONFERENCE FROM PARTNERSHIPS TO COMMUNITY: THE ARC OF CHANGE IN THE CCRP, 2004, Vaals, The Netherlands. [Proceedings]. [Minneapolis]: The McKnight Foundation, 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 243. | | PEREIRA, G. S.; SOUZA, V. F.; PARRELLA, R. A. C.; DAMASCENO, C. M. B.; SIMEONE, M. L. F.; SCHAFFERT, R. E.; BRACONNIER, S.; GARCIA, A. A. F.; MAGALHAES, J. V. Quantitative trait loci mapping for sugar-related traits in sweet sorghum based on high-density SNP markers. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 244. | | AZEVEDO, G. C.; CHEAVEGATTI-GIANOTTO, A.; NEGRI, B. N.; SILVA, L. da C. e; MAGALHAES, J. V.; GARCIA, A. A. F.; LANA, U. G. P.; SOUSA, S. M. de; GUIMARAES, C. T. QTL mapping and identification of putative PSTOL homologs associated with phosphorus acquisition traits in maize seedlings. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls. Abstracts. [S.l.]: International Society for Plant Molecular Biology, 2015. p. 232.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|  |
| 245. | | GUIMARAES, C. T.; MAGALHAES, J. V. D.; JARDIM, S. N.; ALMEIDA, R. V.; MARON, L.; PARENTONI, S. N.; ALVES, V. M. C.; LANA, U. G. D. P.; GAMA, E. E. G.; HOEKENGA, O.; PAIVA, E.; KOCHIAN, L. V. QTL and selection mapping for Al tolerance in tropical maize. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON PLANT-SOIL INTERACTIONS AT LOW pH, 7., 2009, Guangzhou. Plant-Soil Interactions at Low pH: nutriomic approach: proceedings. Guangzhou: South China University of Technology, 2009. p. 147-148.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 246. | | GUIMARAES, C. T.; MAGALHAES, J. V. D.; JARDIM, S. N.; ALMEIDA, R. V.; HOEKENGA, O.; PAIVA, E.; ALVES, V. M. C.; MARON, L. G.; PARENTONI, S. N.; GAMA, E. E. G.; KOCHIAN, L. V. QTL and selection mapping for aluminum tolerance in tropical maize. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 248. | | LIVIO, D. F.; FIGUEIREDO JÚNIOR, J. M. M. de; PINTO, M. de O.; MAGALHAES, J. V. de; MENEZES, C. B. de; GUIMARÃES, C. T.; COTA, L. V.; DAMASCENO, C. M. B.; SILVA, D. D. da; SCHAFFERT, R. E. Seleção de fontes de resistência ao míldio, à helmintosporiose e de tolerância ao alumínio em sorgo. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2019. 14 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Documentos, 244).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 249. | | PARENTONI, S. N.; ALVES, V. M. C.; GAMA, E. E. G. e; COELHO, A. M.; GUIMARAES, C. T.; PACHECO, C. A. P.; MAGALHAES, J. V. de; MEIRELLES, W. F. Seleção para tolerância ao alumínio e eficiência de utilização do fósforo na Embrapa Milho e Sorgo. In: SIMPÓSIO SOBRE ATUALIZAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS, 10., 2006, Lavras. Melhoramento de plantas visando a tolerância a estresses abiótiicos: anais. Lavras: UFLA, 2006. p. 23-28.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 250. | | PENA, G. C.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P.; BELICUAS, S. N. J.; MAGALHAES, J. V. de; LANA, U. G. de P.; TINOCO, C. F. da S.; GUIMARAES, C. T. Retrocruzamento assistido por marcadores moleculares para introgressão do gene AltSB em milho. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 4., 2012, Sete Lagoas. [Trabalhos apresentados]. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 251. | | LOPES, S. S.; PALHARES, P. L. S.; LANA, U. G. P.; ALVES, M. C.; BARROS, B. A.; MAGALHAES, J. V.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Rice Phosphorus Starvation Tolerance 1 gene and its sorghum and maize homologs improve root and vegetative growth in transgenic tobacco. In: ANNUAL MAIZE GENETICS CONFERENCE, 59., 2017, St. Louis. Program and abstracts... St. Louis: [s.n.], 2017. p. 138.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 252. | | SOUSA, S. M. de; CLARK, R. T.; MENDES, F. F.; OLIVEIRA, A. C. de; VASCONCELOS, M. J. V. de; PARENTONI, S. N.; KOCHIAN, L. V.; GUIMARAES, C. T.; MAGALHAES, J. V. A role for root morphology and related candidate genes in P acquisition efficiency in maize. Functional Plant Biology, Victoria, v. 39, n. 11, p. 925-935, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 253. | | MAGALHAES, J. V. de; KOCHIAN, L.; LIU, J.; GUIMARAES, C.; LANA, U.; ALVES, V.; WANG, Y.; SCHAFFERT, R. E.; HOEKENGA, O.; PINEROS, M.; SHAFF, J.; KLEIN, P.; CARNEIRO, N.; COELHO, C.; TRICK, H.; CANIATO, F.; KRESOVICH, S.; MITCHELL, S. Positional cloning and association analysis of a mate gene that confers aluminum tolerance in sorghum via the AltSB locus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 16., 2008, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2008. p. 13.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 254. | | MAGALHAES, J. V. de; LIU, J.; ALVES, V. M. C.; GUIMARAES, C. T.; WANG, Y.; LANA, U. G. de P.; SCHAFFERT, R. E.; KLEIN, P.; HOEKENGA, O.; PINEROS, M.; KOCHIAN, L. Positional cloning and characterization of AltSB, a major aluminum tolerance gene in sorghum: toward the identification of the molecular and physiological basis of allelic effects. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 15., 2007, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 255. | | BERNARDELI, A.; DAMASCENO, C. M. B.; MAGALHAES, J. V. de; SOUZA, V. F. de; MELO, J. de O.; OLIVEIRA, A. A. de; SIMEONE, M. L. F.; BORÉM, A.; SCHAFFERT, R. E.; PARRELLA, R. A. da C.; PASTINA, M. M. Population genomics and molecular breeding of sorghum. In: RAJORA, O. M. (ed.). Population genomics: crop plants, population genomics. Switzerland: Springer Nature, 2022. p. 1-52.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 256. | | CAMPOS, L. J. M.; PRATES, H. T.; QUEIROZ, C. G. de S.; MAGALHAES, J. V.; PITTA, G. V. E.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; ALVES, V. M. C. Physiological characterization of a possible aluminum tolerance mechanism in maize (Zea mays L.) based on aluminum induced release of organic acids by root apical region. In: GRANTEE CONFERENCE FROM PARTNERSHIPS TO COMMUNITY: THE ARC OF CHANGE IN THE CCRP, 2004, Vaals, The Netherlands. [Proceedings]. [Minneapolis]: The McKnight Foundation, 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 257. | | PALHARES, P. L. S.; LOPES, S. da S.; LANA, U. G. de P.; ALVES, M. de C.; MAGALHAES, J. V.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Superexpressão do gene Phosphorus Starvation Tolerance1 de arroz (OsPSTOL1) em tabaco. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2016. 33 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 143).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 258. | | PALHARES, P. L. S.; LOPES, S. da S.; LANA, U. G. de P.; ALVES, M. de C.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Superexpressão do gene Phosphorus Starvation Tolerance 1 de arroz (osPSTOL1) em tabaco. Cadernos Saberes, Sete Lagoas, n. 3, p. 106-111, 2017. Trabalhos de conclusão de curso de graduação e trabalhos do mestrado.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 259. | | LOPES, S. da S.; PALHARES, P. L. S.; LANA, U. G. de P.; ALVES, M. de C.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Superexpressão em tabaco do gene Pstol1 de arroz e de seus homólogos em milho e sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 260. | | LOPES, S. da S.; LANA, U. G. de P.; ALVES, M. de C.; PALHARES, P. L. S.; MAGALHAES, J. V.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Tobacco transformation with rice Phosphorus-Starvation Tolerance 1 gene and its sorghum and maize homologs. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls. Abstracts. [S.l.]: International Society for Plant Molecular Biology, 2015. p. 166.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| Registros recuperados : 295 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
