| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|
Data corrente: |
28/07/2015 |
|
Data da última atualização: |
03/03/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CARMO, C. D.; SANTOS, D. B.; ALVES, L. B.; OLIVEIRA, G. A. F.; OLIVEIRA, E. J. de. |
|
Afiliação: |
C. D. CARMO, UFRB; D. B. SANTOS, UFRB; L. B. ALVES, UFRB; G. A. F. OLIVEIRA, UFRB; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
|
Título: |
Development of TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) as New Tool for Molecular Genetic Analysis in Cassava. |
|
Ano de publicação: |
2015 |
|
Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporte, 18 April 2015. |
|
Páginas: |
14P. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Cassava (Manihot esculenta Crantz) lacks molecular studies for use in breeding and germplasm bank maintenance. This work aimed to develop and validate TRAP (target region amplification olymorphism) markers for cassava and evaluate their potential for structuring the genetic diversity of this species. Preliminary analyses with 396 combinations found 64%of combinations with a good amplification pattern and polymorphism. The 69 most polymorphic TRAP combinations were used to characterize 46 cassava genotypes, from which 606 alleles (range 3 to 18 with a mean of 8.8 alleles per combination) were identified. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.03 to 0.38 (average 0.23), while 31 combinations showed a PIC >0.25. The resolving power (Rp) parameter ranged from 0.10 to 6.30 (average 3.21). The primers that were related to starch and carotenoid biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation, and defense responses were the most polymorphic (>70 % of polymorphic fragments, PIC>0.25, and Rp>3.21). A total of 37 private alleles were identified in 20 accessions. Bayesian clustering as implemented in STRU CTURE revealed the presence of two major clusters (K=2) and four subclusters (K=4). The group differentiation based on the molecular variance analysis (AMOVA) showed that most of the genetic variation is within groups but with significant differences between groups. Therefore, TRAP primers have a high polymorphism for use as a molecular tool in cassava, in addition to the association with genetic regions that may increase the chances of obtaining functional markers. MenosCassava (Manihot esculenta Crantz) lacks molecular studies for use in breeding and germplasm bank maintenance. This work aimed to develop and validate TRAP (target region amplification olymorphism) markers for cassava and evaluate their potential for structuring the genetic diversity of this species. Preliminary analyses with 396 combinations found 64%of combinations with a good amplification pattern and polymorphism. The 69 most polymorphic TRAP combinations were used to characterize 46 cassava genotypes, from which 606 alleles (range 3 to 18 with a mean of 8.8 alleles per combination) were identified. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.03 to 0.38 (average 0.23), while 31 combinations showed a PIC >0.25. The resolving power (Rp) parameter ranged from 0.10 to 6.30 (average 3.21). The primers that were related to starch and carotenoid biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation, and defense responses were the most polymorphic (>70 % of polymorphic fragments, PIC>0.25, and Rp>3.21). A total of 37 private alleles were identified in 20 accessions. Bayesian clustering as implemented in STRU CTURE revealed the presence of two major clusters (K=2) and four subclusters (K=4). The group differentiation based on the molecular variance analysis (AMOVA) showed that most of the genetic variation is within groups but with significant differences between groups. Therefore, TRAP primers have a high polymorphism for use as... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Marcador molelular. |
|
Thesagro: |
Mandioca; Marcador genético. |
|
Thesaurus Nal: |
Cassava; Genetic markers. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
Marc: |
LEADER 02362naa a2200241 a 4500
001 2020697
005 2023-03-03
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aCARMO, C. D.
245 $aDevelopment of TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) as New Tool for Molecular Genetic Analysis in Cassava.$h[electronic resource]
260 $c2015
300 $a14P.
520 $aCassava (Manihot esculenta Crantz) lacks molecular studies for use in breeding and germplasm bank maintenance. This work aimed to develop and validate TRAP (target region amplification olymorphism) markers for cassava and evaluate their potential for structuring the genetic diversity of this species. Preliminary analyses with 396 combinations found 64%of combinations with a good amplification pattern and polymorphism. The 69 most polymorphic TRAP combinations were used to characterize 46 cassava genotypes, from which 606 alleles (range 3 to 18 with a mean of 8.8 alleles per combination) were identified. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.03 to 0.38 (average 0.23), while 31 combinations showed a PIC >0.25. The resolving power (Rp) parameter ranged from 0.10 to 6.30 (average 3.21). The primers that were related to starch and carotenoid biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation, and defense responses were the most polymorphic (>70 % of polymorphic fragments, PIC>0.25, and Rp>3.21). A total of 37 private alleles were identified in 20 accessions. Bayesian clustering as implemented in STRU CTURE revealed the presence of two major clusters (K=2) and four subclusters (K=4). The group differentiation based on the molecular variance analysis (AMOVA) showed that most of the genetic variation is within groups but with significant differences between groups. Therefore, TRAP primers have a high polymorphism for use as a molecular tool in cassava, in addition to the association with genetic regions that may increase the chances of obtaining functional markers.
650 $aCassava
650 $aGenetic markers
650 $aMandioca
650 $aMarcador genético
653 $aMarcador molelular
700 1 $aSANTOS, D. B.
700 1 $aALVES, L. B.
700 1 $aOLIVEIRA, G. A. F.
700 1 $aOLIVEIRA, E. J. de
773 $tPlant Molecular Biology Reporte, 18 April 2015.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Territorial. Para informações adicionais entre em contato com cnpm.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Territorial. |
|
Data corrente: |
02/03/2017 |
|
Data da última atualização: |
03/05/2019 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
FONSECA, M. F.; DALTIO, J.; MAGALHÃES, L. A.; CASTRO, G. S. A.; CARVALHO, C. A. de; MARTINHO, P. R. R. |
|
Afiliação: |
MARCELO FERNANDO FONSECA, CNPM; JAUDETE DALTIO, SGTE; LUCIOLA ALVES MAGALHAES, CNPM; GUSTAVO SPADOTTI AMARAL CASTRO, CNPM; CARLOS ALBERTO DE CARVALHO, CNPM; PAULO ROBERTO RODRIGUES MARTINHO, SGTE. |
|
Título: |
Análise do cadastro das terras atribuídas no Brasil e sua importância para a gestão de conflitos no âmbito da governança fundiária |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: COLETÂNEA DO II SEMINÁRIO GOVERNANÇA DE TERRAS E DESENVOLVIMENTO ECONÔMICO, 2016, Campinas. Anais... Campinas, SP: Unicamp, 2016. |
|
Páginas: |
p. 323 - 337. |
|
ISBN: |
978-85-86215-88-9 |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
II Seminário Governança de Terras e Desenvolvimento Econômico. Disponível em: |
|
Conteúdo: |
As ações de governança fundiária no Brasil compõem processos de enorme complexidade frente às inúmeras demandas de atores sociais em busca de sua consolidação e afirmação no território. O poder público exerce papel fundamental nessa dinâmica, sendo o responsável pleno pela atribuição de terras no país. Em 2014, as áreas atribuídas representavam 35,7% do território brasileiro. A existência de cadastros e bases de dados cartográficas consistentes sobre esses territórios auxilia as deliberações, decretos e atos governamentais que demandam tomadas de decisões estratégicas. Um primeiro complicador nesse cenário é a dispersão dos dados: cada órgão governamental (INCRA, FUNAI, MMA, por exemplo) é responsável por organizar e gerenciar sua própria base e, nesse processo, particularidades intrínsecas a gestão interna de cada órgão são observadas. Além disso, vários aspectos a respeito da disponibilidade, qualidade e acurácia dos dados ainda precisam ser superados. O objetivo deste trabalho é realizar uma análise dos registros de terras legalmente atribuídas no país com ênfase na componente geoespacial e atributos. O intuito é identificar, quantificar e qualificar as terras atribuídas no país e suas respectivas categorias temáticas. Os resultados mostram a necessidade de correções dos dados vetoriais georreferenciados, dada ocorrência de sobreposição e duplicidade de áreas, além de uma verificação dos atributos associados, visando integridade e completude. Entende-se que bases de dados consistentes e atualizadas sobre terras atribuídas são ferramentas indispensáveis no processo de governança fundiária do país. MenosAs ações de governança fundiária no Brasil compõem processos de enorme complexidade frente às inúmeras demandas de atores sociais em busca de sua consolidação e afirmação no território. O poder público exerce papel fundamental nessa dinâmica, sendo o responsável pleno pela atribuição de terras no país. Em 2014, as áreas atribuídas representavam 35,7% do território brasileiro. A existência de cadastros e bases de dados cartográficas consistentes sobre esses territórios auxilia as deliberações, decretos e atos governamentais que demandam tomadas de decisões estratégicas. Um primeiro complicador nesse cenário é a dispersão dos dados: cada órgão governamental (INCRA, FUNAI, MMA, por exemplo) é responsável por organizar e gerenciar sua própria base e, nesse processo, particularidades intrínsecas a gestão interna de cada órgão são observadas. Além disso, vários aspectos a respeito da disponibilidade, qualidade e acurácia dos dados ainda precisam ser superados. O objetivo deste trabalho é realizar uma análise dos registros de terras legalmente atribuídas no país com ênfase na componente geoespacial e atributos. O intuito é identificar, quantificar e qualificar as terras atribuídas no país e suas respectivas categorias temáticas. Os resultados mostram a necessidade de correções dos dados vetoriais georreferenciados, dada ocorrência de sobreposição e duplicidade de áreas, além de uma verificação dos atributos associados, visando integridade e completude. Entende-se que bases de dados... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Geoprocessamento; Governança fundiária; Terra atribuída. |
|
Thesagro: |
Base de dados. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02760nam a2200253 a 4500
001 2065814
005 2019-05-03
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
020 $a978-85-86215-88-9
100 1 $aFONSECA, M. F.
245 $aAnálise do cadastro das terras atribuídas no Brasil e sua importância para a gestão de conflitos no âmbito da governança fundiária$h[electronic resource]
260 $aIn: COLETÂNEA DO II SEMINÁRIO GOVERNANÇA DE TERRAS E DESENVOLVIMENTO ECONÔMICO, 2016, Campinas. Anais... Campinas, SP: Unicamp$c2016
300 $ap. 323 - 337.
500 $aII Seminário Governança de Terras e Desenvolvimento Econômico. Disponível em: <http://governancadeterras.com.br/wp-content/uploads/2017/01/Coleta%CC%82nea-II-Semina%CC%81rio.pdf>
520 $aAs ações de governança fundiária no Brasil compõem processos de enorme complexidade frente às inúmeras demandas de atores sociais em busca de sua consolidação e afirmação no território. O poder público exerce papel fundamental nessa dinâmica, sendo o responsável pleno pela atribuição de terras no país. Em 2014, as áreas atribuídas representavam 35,7% do território brasileiro. A existência de cadastros e bases de dados cartográficas consistentes sobre esses territórios auxilia as deliberações, decretos e atos governamentais que demandam tomadas de decisões estratégicas. Um primeiro complicador nesse cenário é a dispersão dos dados: cada órgão governamental (INCRA, FUNAI, MMA, por exemplo) é responsável por organizar e gerenciar sua própria base e, nesse processo, particularidades intrínsecas a gestão interna de cada órgão são observadas. Além disso, vários aspectos a respeito da disponibilidade, qualidade e acurácia dos dados ainda precisam ser superados. O objetivo deste trabalho é realizar uma análise dos registros de terras legalmente atribuídas no país com ênfase na componente geoespacial e atributos. O intuito é identificar, quantificar e qualificar as terras atribuídas no país e suas respectivas categorias temáticas. Os resultados mostram a necessidade de correções dos dados vetoriais georreferenciados, dada ocorrência de sobreposição e duplicidade de áreas, além de uma verificação dos atributos associados, visando integridade e completude. Entende-se que bases de dados consistentes e atualizadas sobre terras atribuídas são ferramentas indispensáveis no processo de governança fundiária do país.
650 $aBase de dados
653 $aGeoprocessamento
653 $aGovernança fundiária
653 $aTerra atribuída
700 1 $aDALTIO, J.
700 1 $aMAGALHÃES, L. A.
700 1 $aCASTRO, G. S. A.
700 1 $aCARVALHO, C. A. de
700 1 $aMARTINHO, P. R. R.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Territorial (CNPM) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
