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| Registros recuperados : 39 | |
| 2. |  | FREITAS, E. O.; PAIXÃO, J. F. R.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; GARCIA, R. A.; FERREIRA, M. A.; SA, M. F. G. de. Novos promotores de genes induzíveis pelo ataque do inseto-praga bicudo-doalgodoeiro em tecido floral de algodão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., Gramado. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Gramado: SEB, 2018. Na publicação: Maria F. Grossi-de-Sá.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 4. | | LIMA, G. P. G. DE; ROCHA-BEZERRA, L. C. B. DA; MACEDO, L. L. P. DE; BEMQUERER, M. P.; SA, M. F. G. de; CARVALHO, A. F. U. Purification, partial characterization and in vitro biological activity against pest insects of a novel trypsin inhibitor from Sapindus saponaria seeds. The FEBS Journal, v. 279, p. 81, 2012. Supplement 1. Edições do resumo do Congresso: 22nd IUBMB Congress, 37th FEBS Congress, 2012, Seville, Spain. Proceedings of the 22nd IUBMB Congress/37th FEBS Congress. USA: WILEY-BLACKWELL, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | MACEDO, C. L. de; MARTINS, E. S.; MACEDO, L. L. P. de; SANTOS, A. C. dos; PRAÇA, L. B.; GÓIS, L. A. B. de; MONNERAT, R. G. Seleção e caracterização de estirpes de Bacillus thuringiensis eficientes contra a Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae). Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 12, p. 1759-1765, dez. 2012. Título em inglês: Selection and characterization of Bacillus thuringiensis efficient strains against Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae).| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | ARTICO, S.; RIBEIRO ALVES, M.; OLIVEIRA NETO, O. B.; MACEDO, L. L. P. de; SILVEIRA, S.; GROSI-DE-SA, M. F.; MARTINELLI, A. P.; ALVES FERREIRA, M. Transcriptome analysis of Gossypium hirsutum flower buds infested by cotton boll weevil (Anthonomus grandis) larvae. BMC Genomics, 15:854, 2014. (Open Access).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | VASQUEZ, D. D. N.; RIBEIRO, T. P.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; PAES-DE-MELO, B.; BASSO, M. F.; MIRANDA, J. E.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de. Algodão GM para o controle do bicudo do algodoeiro mediante silenciamento multiplo de genes. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 8, 2023, Florianópolis, SC. Anais...Florianópolis: SBG, 2023. p. 44 Na publicação: Leonardo Lima Pepino Macedo; Isabela Tristan Lourenço-Tessutti; Jose Miranda.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | RIBEIRO, T. P.; RUFFO, G. C.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; SOUZA, J. P. A.; OLIVEIRA NETO, O. B.; SILVA, M. C. M. da; SA, M. F. G. de. Algodão transgênico expressando duas novas tóxinas cry confere alta resistência ao bicudo do algodoeiro. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 8, 2023, Florianópolis, SC. Anais...Florianópolis: SBG, 2023. p. 66 Na publicação: Leonardo Lima Pepino Macedo.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | BASSO, M. F.; LOURENCO-TESSUTTI, I. T.; MENDES, R. A. G.; PINTO, C. E. M.; BOURNAUD, C.; GILLET, F.-X.; TOGAWA, R. C.; MACEDO, L. L. P. de; ENGLER, J. d A.; GROSSI-DE-SA, M. F. MiDaf16-like and MiSkn1-like gene families are reliable targets to develop biotechnological tools for the control and management of Meloidogyne incognita. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-13, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | LUCENA, W. A.; PELEGRINI, P. B.; MARTINS-DE-SA, D.; FONSECA, F. C. A.; GOMES JÚNIOR, J. E.; MACEDO, L. L. P. de; SILVA, M. C. M. da; OLIVEIRA, R. D.; GROSSI DE SA, M. F. Molecular approaches to improve the insecticidal activity of Bacillus thuringiensis cry toxins. Toxins, v. 6, p. 2393-2423, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | MOURA, H. F. N.; COELHO, R. R.; GARCIA, R. A.; MOREIRA-PINTO, C. E.; REDJIMI, I. M. N.; MACEDO, L. L. P. de; ANTONINO-DE-SOUZA, J. D.; SA, M. F. G. de. Desafios e perspectivas para o silenciamento gênico em Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 27.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 10., Gramado. Saúde, ambiente e agricultura: anais. Gramado: SEB, 2018. p. 915 Na publicação: Leonardo L. P. Macedo, Maria F. Grossi-de-Sá.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | NEGRISOLI JUNIOR, A. S.; BALDANI, J. I.; SA, M. F. G. de; SILVA, M. C. M. da; MACEDO, L. L. P. de; FONSECA, F. C. de A.; NEGRISOLI, C. R. de C. B.; GUZZO, E. C. Manejo da broca-gigante da cana-de-açúcar (Telchinlicus) (Drury) (Lepidoptera: Castniidae) no nordeste do Brasil. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2015. 52 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 198).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 13. | | HABIB, P.; SOCCOL, C. R.; O'KEEFE, B. R.; KRUMPE, L. R. H.; WILSON, J.; MACEDO, L. L. P. de; FAHEEM, M.; SANTOS, V. O. dos; PRADO, G. S.; BOTELHO, M. A.; LACOMBE, S.; SA, M. F. G. de. Gene-silencing suppressors for high-level production of the HIV-1 entry inhibitor griffithsin in Nicotiana benthamiana. Process Biochemistry, v. 70, p. 45-54, 2018. Na publicação: Maria Fatima Grossi-de-Sa.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | MACEDO, C. L. de; MARTINS, E. S.; MACEDO, L. L. P. de; SANTOS, A. C. dos; PRACA, L. B.; GÓIS, L. A. B. de; PONTES, R. G. M. S. de. Seleção e caracterização de estirpes de Bacillus thuringiensis eficientes contra a Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae). Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 47, n. 12, p. 1759-1765, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | NORIEGA, D. D.; ARRAES, F. B. M.; ANTONINO, J. D.; MACEDO, L. L. P. de; FONSECA, F. C. A.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; SILVA, M. C. M. da; NEGRISOLI JUNIOR, A. S.; SA, M. F. G. de. Transcriptome Analysis and Knockdown of the Juvenile Hormone Esterase Gene Reveal Abnormal Feeding Behavior in the Sugarcane Giant Borer. Frontiers in Physiology, v. 11, 588450, jul. 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 16. | | SILVA, P. L. R.; MACEDO, L. L. P. de; SÁ, M. E. L. de; AMORIM. R. M. S. de; MORGANTE, C. V.; TESSUTTI, I. T. L.; BASSO, M. F.; GALBIERI, R.; SÁ, M. F. G. de. Transgenic cotton applied to phytonematode control using in plant RNA interfering strategy. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 17. | | RIBEIRO, T. P.; LOURENCO, I. T.; MELO, B. P. de; MORGANTE, C. V.; SALLES FILHO, A.; LINS, C. B. J.; FERREIRA, G. F.; MELLO, G. N.; MACEDO, L. L. P. de; LUCENA, W. A.; SILVA, M. C. M. da; OLIVEIRA‑NETO, O. B.; SA, M. F. G. de. Improved cotton transformation protocol mediated by Agrobacterium and biolistic combined-methods. Planta, v. 254, 20, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| 18. | | MOREIRA-PINTO, C. E.; COELHO, R. R.; LEITE, A. G. B.; SILVEIRA, D. A.; SOUZA, D. A.; LOPES, R. B.; MACEDO, L. L. P. de; SILVA, M. C. M. da; RIBEIRO, T. P.; MORGANTE, C. V.; ANTONINO, J. D.; SA, M. F. G. de. Increasing Anthonomus grandis susceptibility to Metarhizium anisopliae through RNAi-induced AgraRelish knockdown: a perspective to combine biocontrol and biotechnology. Pest Management Science, v. 77, n. 9, p. 4054-4063, 2021. Na publicação: Leonardo L P Macedo; Maria C M Silva; Maria F Grossi-de-Sa.,| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| 19. | | MENDES, R. A. G.; BASSO, M. F.; AMORA, D. X.; SILVA, A. P.; PAES-DE-MELO, B.; TOGAWA, R. C.; FREIRE, E. V. S. A.; LISEI-DE-SA, M. E.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; SA, M. F. G. de. In planta RNAi approach targeting three M. incognita effector genes disturbed the process of infection and reduced plant susceptibility. Experimental Parasitology, v. 238, 2022, 108246. Na publicação: Erika Valéria Saliba Albuquerque; Leonardo Lima Pepino Macedo; Isabela Tristan Lourenço-Tessutti; Maria Fatima Grossi-de-Sa.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | MOREIRA, V. J. V.; PINHEIRO, D. H.; LOURENCO, I. T.; BASSO, M. F.; LISEI-DE-SA, M. E.; SILVA, M. C. M. da; DANCHIN, E. G. J.; GUIMARAES, P. M.; GRYNBERG, P.; BRASILEIRO, A. C. M.; MACEDO, L. L. P. de; MORGANTE, C. V.; ENGLER, J. de A.; SA, M. F. G. de. In planta RNAi targeting Meloidogyne incognita Minc16803 gene perturbs nematode parasitism and reduces plant susceptibility. Journal of Pest Science, v. 97, p. 411-427, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| Registros recuperados : 39 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
19/02/2021 |
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Data da última atualização: |
07/02/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
ARRAES, F. B. M.; MARTINS-DE-SA, D; VASQUEZ, D. D. N.; MELO, B. P.; FAHEEM, M.; MACEDO, L. L. P. de; MORGANTE, C. V.; BARBOSA, J. A. R. G.; TOGAWA, R. C.; MOREIRA, V. J. V.; DANCHIN, E. G. J.; SA, M. F. G. de. |
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Afiliação: |
FABRICIO BARBOSA MONTEIRO ARRAES; DIOGO MARTINS-DE-SA; DANIEL D. NORIEGA VASQUEZ; BRUNO PAES MELO; MUHAMMAD FAHEEM; LEONARDO LIMA PEPINO DE MACEDO; CAROLINA VIANNA MORGANTE, CPATSA; JOÃO ALEXANDRE R. G. BARBOSA; ROBERTO COITI TOGAWA; VALDEIR JUNIO VAZ MOREIRA; ETIENNE G. J. DANCHIN; MARIA FATIMA GROSSI DE SA. |
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Título: |
Dissecting protein domain variability in the core rna interference machinery of five insect orders. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
RNA Biology, v. 18, n. 11, p. 1653-1681, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1080/15476286.2020.1861816 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
RNA interference (RNAi)-mediated gene silencing can be used to control specific insect pest populations. Unfortunately, the variable efficiency in the knockdown levels of target genes has narrowed the applicability of this technology to a few species. Here, we examine the current state of knowledge regarding the miRNA (micro RNA) and siRNA (small interfering RNA) pathways in insects and investigate the structural variability at key protein domains of the RNAi machinery. Our goal was to correlate domain variability with mechanisms affecting the gene silencing efficiency. To this end, the protein domains of 168 insect species, encompassing the orders Coleoptera, Diptera, Hemiptera, Hymenoptera, and Lepidoptera, were analysed using our pipeline, which takes advantage of meticulous structure-based sequence alignments. We used phylogenetic inference and the evolutionary rate coefficient (K) to outline the variability across domain regions and surfaces. Our results show that four domains, namely dsrm, Helicase, PAZ and Ribonuclease III, are the main contributors of protein variability in the RNAi machinery across different insect orders. We discuss the potential roles of these domains in regulating RNAi-mediated gene silencing and the role of loop regions in fine-tuning RNAi efficiency. Additionally, we identified several order-specific singularities which indicate that lepidopterans have evolved differently from other insect orders, possibly due to constant coevolution with plants and viruses. In conclusion, our results highlight several variability hotspots that deserve further investigation in order to improve the application of RNAi technology in the control of insect pests. MenosRNA interference (RNAi)-mediated gene silencing can be used to control specific insect pest populations. Unfortunately, the variable efficiency in the knockdown levels of target genes has narrowed the applicability of this technology to a few species. Here, we examine the current state of knowledge regarding the miRNA (micro RNA) and siRNA (small interfering RNA) pathways in insects and investigate the structural variability at key protein domains of the RNAi machinery. Our goal was to correlate domain variability with mechanisms affecting the gene silencing efficiency. To this end, the protein domains of 168 insect species, encompassing the orders Coleoptera, Diptera, Hemiptera, Hymenoptera, and Lepidoptera, were analysed using our pipeline, which takes advantage of meticulous structure-based sequence alignments. We used phylogenetic inference and the evolutionary rate coefficient (K) to outline the variability across domain regions and surfaces. Our results show that four domains, namely dsrm, Helicase, PAZ and Ribonuclease III, are the main contributors of protein variability in the RNAi machinery across different insect orders. We discuss the potential roles of these domains in regulating RNAi-mediated gene silencing and the role of loop regions in fine-tuning RNAi efficiency. Additionally, we identified several order-specific singularities which indicate that lepidopterans have evolved differently from other insect orders, possibly due to constant coevolution with plant... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Argonaute; DCR1; Dicer; Drosha; DsRBDs; Evolução da proteína; In silico analysis; Loquacious; Pasha; Protein evolution; R2D2; RIIID II; Sequência de proteínas inteira; Structure-function relationship. |
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Thesagro: |
Controle Genético; Genoma; Inseto; Praga; Proteína. |
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Thesaurus NAL: |
Insect control; Pest control; Protein structure; Proteins. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230917/1/Dissecting-protein-domain-variability-2021.pdf
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Marc: |
LEADER 03184naa a2200541 a 4500
001 2130159
005 2022-02-07
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1080/15476286.2020.1861816$2DOI
100 1 $aARRAES, F. B. M.
245 $aDissecting protein domain variability in the core rna interference machinery of five insect orders.$h[electronic resource]
260 $c2021
520 $aRNA interference (RNAi)-mediated gene silencing can be used to control specific insect pest populations. Unfortunately, the variable efficiency in the knockdown levels of target genes has narrowed the applicability of this technology to a few species. Here, we examine the current state of knowledge regarding the miRNA (micro RNA) and siRNA (small interfering RNA) pathways in insects and investigate the structural variability at key protein domains of the RNAi machinery. Our goal was to correlate domain variability with mechanisms affecting the gene silencing efficiency. To this end, the protein domains of 168 insect species, encompassing the orders Coleoptera, Diptera, Hemiptera, Hymenoptera, and Lepidoptera, were analysed using our pipeline, which takes advantage of meticulous structure-based sequence alignments. We used phylogenetic inference and the evolutionary rate coefficient (K) to outline the variability across domain regions and surfaces. Our results show that four domains, namely dsrm, Helicase, PAZ and Ribonuclease III, are the main contributors of protein variability in the RNAi machinery across different insect orders. We discuss the potential roles of these domains in regulating RNAi-mediated gene silencing and the role of loop regions in fine-tuning RNAi efficiency. Additionally, we identified several order-specific singularities which indicate that lepidopterans have evolved differently from other insect orders, possibly due to constant coevolution with plants and viruses. In conclusion, our results highlight several variability hotspots that deserve further investigation in order to improve the application of RNAi technology in the control of insect pests.
650 $aInsect control
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650 $aProtein structure
650 $aProteins
650 $aControle Genético
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653 $aStructure-function relationship
700 1 $aMARTINS-DE-SA, D
700 1 $aVASQUEZ, D. D. N.
700 1 $aMELO, B. P.
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700 1 $aMOREIRA, V. J. V.
700 1 $aDANCHIN, E. G. J.
700 1 $aSA, M. F. G. de
773 $tRNA Biology$gv. 18, n. 11, p. 1653-1681, 2021.
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