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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
26/12/2019 |
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Data da última atualização: |
13/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BLECHA, I. M. Z.; SOUSA, I. I.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F. |
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Afiliação: |
Isabella Maiumi Zaidan Blecha, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul - UFMS/Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal; Isadora Inácio Sousa, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul - UFMS/Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal; ANNA BEATRIZ ROBOTTOM FERREIRA, CTAA; GELSON LUIS DIAS FEIJO, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC. |
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Título: |
Alternative methodologies for genotyping polymorphisms in the CAST and CAPN1 genes in beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 48, e20180218, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform in any basic molecular biology laboratory. If the association of these markers with traits of economic interest in beef cattle is confirmed in new studies, these methodologies may contribute to the selection of animals with superior genetics, i.e., with the potential to produce better-quality meat, either by marker-assisted selection or by the inclusion of these polymorphisms in high-density marker panels. MenosThe objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform i... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Marker-assisted selection; Meat tenderness. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207815/1/Alternative-methodologies-for-genotyping.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrossilvipastoril; Embrapa Florestas; Embrapa Pecuária Sul. |
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Data corrente: |
08/04/2019 |
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Data da última atualização: |
23/08/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
TONINI, H.; MORALES, M. M.; PORFIRIO-DA-SILVA, V.; LULU, J.; FARIAS NETO, A. L. de. |
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Afiliação: |
HELIO TONINI, CPPSUL; MARINA MOURA MORALES, CNPF; VANDERLEY PORFIRIO DA SILVA, CNPF; JORGE LULU, CPAMT; AUSTECLINIO LOPES DE FARIAS NETO, CPAMT. |
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Título: |
Efeito do sistema de plantio e da exposição solar sobre a alocação da biomassa no desenvolvimento inicial do eucalipto. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Ciência Florestal, v. 29, n. 1, p. 86-95, jan./mar. 2019. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho foi desenvolvido com o objetivo de comparar a alocação da biomassa arbórea, a conicidade do tronco e a relação altura e diâmetro ao longo do fuste de árvores de eucalipto implantadas em um sistema silvipastoril, em diferente exposição solar, e em monocultivo. Os dados foram coletados em 13 árvores-amostra aos 27 meses de idade, selecionadas em função do intervalo de confiança da média dos diâmetros a altura do peito (DAP) e da posição das árvores na faixa de plantio, com face de exposição sul, norte e central. Concluiu-se que na comparação com o monocultivo, as árvores plantadas em sistema silvipastoril apresentaram menor altura total, maior conicidade e maior biomassa na copa. No sistema silvipastoril, não houve efeito da posição da árvore na faixa de plantio sobre a produção total de biomassa na parte aérea, porém, árvores com face de exposição norte foram mais baixas, cônicas e produziram maior biomassa de galhos e folhas nas partes inferiores da copa. Palavras-chave: Sistemas agroflorestais; Conicidade do tronco; Produtividade Abstract This work was developed in order to compare the arboreal biomass allocation, trunk taper, height and diameter ratio, along the stem of eucalyptus trees planted in silvopastoral system in different sun exposure and monoculture. The data were collected from 13 trees at 27 months, selected according to confidence interval average of breast height diameter (DAP) trees position in planting strip, sun exposure (face south, north and central). It was found that compared to the monoculture, the trees planted in silvopastoral system had lower overall height, larger taper and higher biomass in pantry. There was no sun exposure effect for planting strip and total biomass for silvipastoral systems, however, trees with north sun exposure were lower, more conical, produced more branches and leaves in the lower parts of the treetops. Keywords: Agroforestry; Taper; Productivity MenosEste trabalho foi desenvolvido com o objetivo de comparar a alocação da biomassa arbórea, a conicidade do tronco e a relação altura e diâmetro ao longo do fuste de árvores de eucalipto implantadas em um sistema silvipastoril, em diferente exposição solar, e em monocultivo. Os dados foram coletados em 13 árvores-amostra aos 27 meses de idade, selecionadas em função do intervalo de confiança da média dos diâmetros a altura do peito (DAP) e da posição das árvores na faixa de plantio, com face de exposição sul, norte e central. Concluiu-se que na comparação com o monocultivo, as árvores plantadas em sistema silvipastoril apresentaram menor altura total, maior conicidade e maior biomassa na copa. No sistema silvipastoril, não houve efeito da posição da árvore na faixa de plantio sobre a produção total de biomassa na parte aérea, porém, árvores com face de exposição norte foram mais baixas, cônicas e produziram maior biomassa de galhos e folhas nas partes inferiores da copa. Palavras-chave: Sistemas agroflorestais; Conicidade do tronco; Produtividade Abstract This work was developed in order to compare the arboreal biomass allocation, trunk taper, height and diameter ratio, along the stem of eucalyptus trees planted in silvopastoral system in different sun exposure and monoculture. The data were collected from 13 trees at 27 months, selected according to confidence interval average of breast height diameter (DAP) trees position in planting strip, sun exposure (face south, north an... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Sistema silvipastoril. |
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Thesagro: |
Árvore; Biomassa; Densidade de Plantio; Eucalyptus Grandis; Eucalyptus Urophylla; Radiação Solar. |
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Categoria do assunto: |
--
A Sistemas de Cultivo |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/195579/1/Tonini-et-al-2019.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/197467/1/2019-Porfirio-CF-Efeito.pdf
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Marc: |
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245 $aEfeito do sistema de plantio e da exposição solar sobre a alocação da biomassa no desenvolvimento inicial do eucalipto.$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aEste trabalho foi desenvolvido com o objetivo de comparar a alocação da biomassa arbórea, a conicidade do tronco e a relação altura e diâmetro ao longo do fuste de árvores de eucalipto implantadas em um sistema silvipastoril, em diferente exposição solar, e em monocultivo. Os dados foram coletados em 13 árvores-amostra aos 27 meses de idade, selecionadas em função do intervalo de confiança da média dos diâmetros a altura do peito (DAP) e da posição das árvores na faixa de plantio, com face de exposição sul, norte e central. Concluiu-se que na comparação com o monocultivo, as árvores plantadas em sistema silvipastoril apresentaram menor altura total, maior conicidade e maior biomassa na copa. No sistema silvipastoril, não houve efeito da posição da árvore na faixa de plantio sobre a produção total de biomassa na parte aérea, porém, árvores com face de exposição norte foram mais baixas, cônicas e produziram maior biomassa de galhos e folhas nas partes inferiores da copa. Palavras-chave: Sistemas agroflorestais; Conicidade do tronco; Produtividade Abstract This work was developed in order to compare the arboreal biomass allocation, trunk taper, height and diameter ratio, along the stem of eucalyptus trees planted in silvopastoral system in different sun exposure and monoculture. The data were collected from 13 trees at 27 months, selected according to confidence interval average of breast height diameter (DAP) trees position in planting strip, sun exposure (face south, north and central). It was found that compared to the monoculture, the trees planted in silvopastoral system had lower overall height, larger taper and higher biomass in pantry. There was no sun exposure effect for planting strip and total biomass for silvipastoral systems, however, trees with north sun exposure were lower, more conical, produced more branches and leaves in the lower parts of the treetops. Keywords: Agroforestry; Taper; Productivity
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sul (CPPSUL) |
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