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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
05/07/2019 |
Data da última atualização: |
09/06/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LIMA L. P.; AZEVEDO, C. F.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; SUELA, M. M.; NASCIMENTO, M.; VIANA, J. M. S. |
Afiliação: |
Leísa Pires Lima, Universidade Federal de Viçosa; Camila Ferreira Azevedo, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Fabyano Fonseca e Silva, Universidade Federal de Viçosa; Matheus Massariol Suela, Universidade Federal de Viçosa; Moysés Nascimento, Universidade Federal de Viçosa; José Marcelo Soriano Viana, Universidade Federal de Viçosa. |
Título: |
New insights into genomic selection through population-based non-parametric prediction methods. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricicola, v. 76, n. 4, p. 290-298, July/Aug. 2019. |
DOI: |
10.1590/1678-992x-2017-0351 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Genome-wide selection (GWS) is based on a large number of markers widely distributed throughout the genome. Genome-wide selection provides for the estimation of the effect of each molecular marker on the phenotype, thereby allowing for the capture of all genes affecting the quantitative traits of interest. The main statistical tools applied to GWS are based on random regression or dimensionality reduction methods. In this study a new non-parametric method, called Delta-p was proposed, which was then compared to the Genomic Best Linear Unbiased Predictor (G-BLUP) method. Furthermore, a new selection index combining the genetic values obtained by the G-BLUP and Delta-p, named Delta-p/G-BLUP methods, was proposed. The efficiency of the proposed methods was evaluated through both simulation and real studies. The simulated data consisted of eight scenarios comprising a combination of two levels of heritability, two genetic architectures and two dominance status (absence and complete dominance). Each scenario was simulated ten times. All methods were applied to a real dataset of Asian rice (Oryza sativa) aiming to increase the efficiency of a current breeding program. The methods were compared as regards accuracy of prediction (simulation data) or predictive ability (real dataset), bias and recovery of the true genomic heritability. The results indicated that the proposed Delta-p/G-BLUP index outperformed the other methods in both prediction accuracy and predictive ability. |
Palavras-Chave: |
Asian rice; Genetic gain; Genomic prediction. |
Thesagro: |
Arroz; Oryza Sativa. |
Thesaurus Nal: |
Selection index. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/199238/1/2019-M.Deon-SA-New-insights.pdf
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Marc: |
LEADER 02306naa a2200277 a 4500 001 2110406 005 2020-06-09 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1590/1678-992x-2017-0351$2DOI 100 1 $aLIMA L. P. 245 $aNew insights into genomic selection through population-based non-parametric prediction methods.$h[electronic resource] 260 $c2019 520 $aGenome-wide selection (GWS) is based on a large number of markers widely distributed throughout the genome. Genome-wide selection provides for the estimation of the effect of each molecular marker on the phenotype, thereby allowing for the capture of all genes affecting the quantitative traits of interest. The main statistical tools applied to GWS are based on random regression or dimensionality reduction methods. In this study a new non-parametric method, called Delta-p was proposed, which was then compared to the Genomic Best Linear Unbiased Predictor (G-BLUP) method. Furthermore, a new selection index combining the genetic values obtained by the G-BLUP and Delta-p, named Delta-p/G-BLUP methods, was proposed. The efficiency of the proposed methods was evaluated through both simulation and real studies. The simulated data consisted of eight scenarios comprising a combination of two levels of heritability, two genetic architectures and two dominance status (absence and complete dominance). Each scenario was simulated ten times. All methods were applied to a real dataset of Asian rice (Oryza sativa) aiming to increase the efficiency of a current breeding program. The methods were compared as regards accuracy of prediction (simulation data) or predictive ability (real dataset), bias and recovery of the true genomic heritability. The results indicated that the proposed Delta-p/G-BLUP index outperformed the other methods in both prediction accuracy and predictive ability. 650 $aSelection index 650 $aArroz 650 $aOryza Sativa 653 $aAsian rice 653 $aGenetic gain 653 $aGenomic prediction 700 1 $aAZEVEDO, C. F. 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aSILVA, F. F. e 700 1 $aSUELA, M. M. 700 1 $aNASCIMENTO, M. 700 1 $aVIANA, J. M. S. 773 $tScientia Agricicola$gv. 76, n. 4, p. 290-298, July/Aug. 2019.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
30/03/2009 |
Data da última atualização: |
30/03/2009 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
Nacional - A |
Autoria: |
FANCELLI, M.; VENDRAMIM, J. D.; LOURENÇÃO, A. L. |
Afiliação: |
Marilene Fancelli, CNPMF; José Djair Vendramim, ESALQ; André Luiz Lourenção, IAC. |
Título: |
Oviposição e dispersão de ninfas de Bemisia tabaci biótipo B em genótipos de tomateiro. |
Ano de publicação: |
2008 |
Fonte/Imprenta: |
Bragantia, Campinas, v. 67, n. 4, p. 933-939, out./dez. 2008. |
ISSN: |
0006-8705 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Diversos métodos tém sido empregados para avaliar a resistência de plantas a moscas-brancas. Todavia, poucos trabalhos têm sido realizados visando determinar a dispersão de ninfas desses insetos sobre as plantas. O objetivo do presente trabalho foi avaliar a oviporação de B. tabaci biótipo B e a dispersão de suas nínfas em folíodos com e sem axsudatos de genótipos de tomateiro. Foram utilizados sete genótipos de tomateiro: LA716, LA1739, PI134417, LA462, LA1584, 'Santa Clara' e P25 (controle suscetível). A oviposição de B. tabaci biótipo B foi avaliada em gaiolas plástcas (2,8cm²) fixadas na face abaxial dos folíolos, nas quais foram inseridos dez casais do ínseto. Para avaliação da dispersão das ninfas, considerou-se o deslocamento dos insetos além do limite da área ocupada pelas gaiolas. As variáveis observadas foram: mortalidades de adultos 24 horas após a liberação, número de ovos, viabilidade da fase de ovo, período de incubação, número de ninfase dispersão. Em folíodos com exsudato, LA716, LA1739 e PI4417 provocaram as maiores mortalidades. Adultos mortos nos folíodos desse genótipos ficaram aderidos aos tricomas glandulares, o que provocou redução na oviposição do inseto. Para dispersão, nos folíolos com exsudato, os máximos valores ocorreram nos genótipos LA716, LA462 e P25. Na condição sem exsudato, LA716 promoveu a menor dispersão das ninfas. A presença do exsudato influencia negativamente a sobrevivência a oviposisão do inseto. A dispersão das ninfas também é afetada pelo exsudato, embora outros fatores possam ser importantes para o deslocamento do inseto. MenosDiversos métodos tém sido empregados para avaliar a resistência de plantas a moscas-brancas. Todavia, poucos trabalhos têm sido realizados visando determinar a dispersão de ninfas desses insetos sobre as plantas. O objetivo do presente trabalho foi avaliar a oviporação de B. tabaci biótipo B e a dispersão de suas nínfas em folíodos com e sem axsudatos de genótipos de tomateiro. Foram utilizados sete genótipos de tomateiro: LA716, LA1739, PI134417, LA462, LA1584, 'Santa Clara' e P25 (controle suscetível). A oviposição de B. tabaci biótipo B foi avaliada em gaiolas plástcas (2,8cm²) fixadas na face abaxial dos folíolos, nas quais foram inseridos dez casais do ínseto. Para avaliação da dispersão das ninfas, considerou-se o deslocamento dos insetos além do limite da área ocupada pelas gaiolas. As variáveis observadas foram: mortalidades de adultos 24 horas após a liberação, número de ovos, viabilidade da fase de ovo, período de incubação, número de ninfase dispersão. Em folíodos com exsudato, LA716, LA1739 e PI4417 provocaram as maiores mortalidades. Adultos mortos nos folíodos desse genótipos ficaram aderidos aos tricomas glandulares, o que provocou redução na oviposição do inseto. Para dispersão, nos folíolos com exsudato, os máximos valores ocorreram nos genótipos LA716, LA462 e P25. Na condição sem exsudato, LA716 promoveu a menor dispersão das ninfas. A presença do exsudato influencia negativamente a sobrevivência a oviposisão do inseto. A dispersão das ninfas também é af... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Mosca-branca; Oviposição. |
Thesagro: |
Bemisia Tabaci; Dinâmica Populacional; Dispersão; Genótipo; Inseto; Mosca Branca; Resistência; Tomate. |
Thesaurus NAL: |
Solanum lycopersicum. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02443naa a2200289 a 4500 001 1655633 005 2009-03-30 008 2008 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0006-8705 100 1 $aFANCELLI, M. 245 $aOviposição e dispersão de ninfas de Bemisia tabaci biótipo B em genótipos de tomateiro. 260 $c2008 520 $aDiversos métodos tém sido empregados para avaliar a resistência de plantas a moscas-brancas. Todavia, poucos trabalhos têm sido realizados visando determinar a dispersão de ninfas desses insetos sobre as plantas. O objetivo do presente trabalho foi avaliar a oviporação de B. tabaci biótipo B e a dispersão de suas nínfas em folíodos com e sem axsudatos de genótipos de tomateiro. Foram utilizados sete genótipos de tomateiro: LA716, LA1739, PI134417, LA462, LA1584, 'Santa Clara' e P25 (controle suscetível). A oviposição de B. tabaci biótipo B foi avaliada em gaiolas plástcas (2,8cm²) fixadas na face abaxial dos folíolos, nas quais foram inseridos dez casais do ínseto. Para avaliação da dispersão das ninfas, considerou-se o deslocamento dos insetos além do limite da área ocupada pelas gaiolas. As variáveis observadas foram: mortalidades de adultos 24 horas após a liberação, número de ovos, viabilidade da fase de ovo, período de incubação, número de ninfase dispersão. Em folíodos com exsudato, LA716, LA1739 e PI4417 provocaram as maiores mortalidades. Adultos mortos nos folíodos desse genótipos ficaram aderidos aos tricomas glandulares, o que provocou redução na oviposição do inseto. Para dispersão, nos folíolos com exsudato, os máximos valores ocorreram nos genótipos LA716, LA462 e P25. Na condição sem exsudato, LA716 promoveu a menor dispersão das ninfas. A presença do exsudato influencia negativamente a sobrevivência a oviposisão do inseto. A dispersão das ninfas também é afetada pelo exsudato, embora outros fatores possam ser importantes para o deslocamento do inseto. 650 $aSolanum lycopersicum 650 $aBemisia Tabaci 650 $aDinâmica Populacional 650 $aDispersão 650 $aGenótipo 650 $aInseto 650 $aMosca Branca 650 $aResistência 650 $aTomate 653 $aMosca-branca 653 $aOviposição 700 1 $aVENDRAMIM, J. D. 700 1 $aLOURENÇÃO, A. L. 773 $tBragantia, Campinas$gv. 67, n. 4, p. 933-939, out./dez. 2008.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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