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| Registros recuperados : 208 | |
| 141. |  | PAIVA, J. T.; RESENDE, M. D. V. de; RESENDE, R. T.; OLIVEIRA, H. R.; SILVA, H. T.; CAETANO, G. C.; LOPES, P. S.; SILVA, F. F. Epigenética: mecanismos, herança e implicações no melhoramento animal. Archivos de Zootecnia, v. 68, n. 262, p. 304-311, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 142. | | BREDA, F. C.; ALBUQUERQUE, L. G. de; REIS FILHO, J. C.; YAMAKI, M.; SARMENTO, J. L. R.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T. Estimativas de parâmetros genéticos para a produção de leite de cabras da raça Alpina utilizando a função de Ali e Schaeffer e polínômios de legendre em modelos de regressão aleatória. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2005. 5 f. CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 143. | | BREDA, F. C.; ALBUQUERQUE, L. G. de A.; REIS FILHO, J. C.; YAMAKI, M.; SARMENTO, J. L. R.; LOPES, P. S.; RODRIGUES, M. T. Estimativas de parâmetros genéticos para a produção de leite de cabras da raça Parda Alpina utilizando a função de Ali e Schaeffer e polinômios de Legendre em modelos de regressão aleatória. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2005. 5 f. CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 144. | | CANAZA-CAYO, A. W.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; TORRES, R. de A.; COBUCI, J. A.; DALTRO, D. dos S. Estimativas de parâmetros genéticos para a produção de leite utilizando modelos de regressão aleatória em bovinos da raça Girolando. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 11., 2015, Santa Maria, RS. Melhoramento animal da academia ao campo: uma parceria em construção: anais. Santa Maria, RS: SBMA: UFSM, 2015. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 145. | | COSTA, E. V.; DINIZ, D. B.; VERONEZE, R.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; GUIMARÃES, S. E. F.; SILVA, F. F.; LOPES, P. S. Estimating additive and dominance variances for complex traits in pigs combining genomic and pedigree information. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 2, p. 6303-6311, June 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 146. | | CANAZA-CAYO, A. W.; LOPES, P. S.; SILVA, M. V. G. B.; COBUCI, J. A.; TORRES, R. de A.; MARTINS, M. F.; ARBEX, W. A. Estrutura populacional da raça Girolando. Ciência Rural, v. 44, n. 11, p. 2072-2077, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 147. | | CAMPÊLO, J. E. G.; LOPES, P. S.; TORRES, R. de A.; EUCLYDES, R. F.; SILVA, L. O. C.; ARAÚJO, C. V. de; PEREIRA, C. S. Efeitos maternos na avaliação genética de reprodutores da raça Tabapuã. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 38., 2001, Piracicaba. Anais... Piracicaba: FEALQ, 2001. p. 517-518. CNPGC. SBZ.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 148. | | PEIXOTO, M. G. C. D.; CANDA, R. A.; BRUNELI, F. A. T.; SANTOS, G. G. dos; VENTURA, H. T.; LOPES, P. S. Correlation between PTA for milk and beef traits of Guzerá animals from dual-purpose herds in Brazil. In: WORLD CONGRESS OF GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 3 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 149. | | SILVA, D. A. da; SILVA, F. F. e; VENTURA, H. T.; JUNQUEIRA, V. S.; SILVA, A. A. da; MOTA, R. R.; LOPES, P. S. Contemporary groups in the genetic evaluation of Nellore cattle using Bayesian inference. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 52, n. 8, p. 643-651, fev. 2017. Título em português: Grupos de contemporâneos na avaliação genética de gado Nelore por inferência bayesiana.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 150. | | NASCIMENTO, C. S.; MACHADO, M. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARÃES, M. F. M.; CAMPOS, A. L.; VERNEQUE, R. da S.; LOPES, P. S. Expressão aumentada do gene S100A7 em bovinos F2 desafiados com o parasita Boophilus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 241.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 151. | | MIRANDA, C. L.; FONSECA, I.; SILVA, P. V.; NASCIMENTO, C. S.; GUIMARÃES, S. E. F.; GUIMARÃES, M. F. M.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, J. D. Expressão diferencial do gene p4r (receptor de progesterona) em células da granulosa de suínos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 74.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 152. | | LOPES, P. S.; SILVA, M. de A. e; TORRES, R. de A.; LUDWIG, A.; OLIVEIRA, L. M. de; SOARES, P. R. Estudo de indices de selecao para aves Legorne. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 21., 1984, Belo Horizonte, MG. Anais... Belo Horizonte: SBZ, 1984. p.24| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 154. | | SOARES, T. L. da S.; SANTOS, F. L. C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARRARA, E. R.; BRUNELI, F. A. T.; VERONEZE, R.; LOPES, P. S. A interação genótipo-ambiente já afeta características leiteiras e idade ao primeiro parto em animais Guzerá. Revista Guzerate, ano 2, n. 2, p. 66-70, maio 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 155. | | ARAUJO, C. V.; TORRES, R. A.; COSTA, C. N.; LOPES, P. S.; PERREIRA, C. S.; EUCLYDES, R. F.; TORRES FILHO, R. A. Interação reprodutor x rebanho na produção de leite da raça Holandesa no Brasil. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 30, n. 3, p. 992-999, 2001.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 156. | | PEREIRA, R. J.; VERNEQUE, R. da S.; LOPES, P. S.; SANTANA JUNIOR, M. L.; LAGROTTA, M. R.; TORRES, R. A.; VERCESI FILHO, A. E.; MACHADO, M. A. Milk yield persistency in brazilian gyr cattle based on a random regression model. Genetics and Molecular Research, v. 11, n. 2., p. 1599-1609, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 157. | | PINHEIRO, V. R.; SILVA, F. F. e; GUIMARÃES, S. E. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S.; CRUZ, C. D.; AZEVEDO, C. F. Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 2, p. 190-196, fev. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 158. | | SILVA, M. V. G. B. da; MARTINEZ, M. L.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S.; EUCLYDES, R. F.; PEREIRA, C. S.; MACHADO, M. A.; ARBEX, W. Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 34, n. 1, p. 66-75, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 159. | | MENEZES, G. R. de O.; TORRES, R. de A.; SARMENTO, J. L. R.; RODRIGUES, M. T.; BRITO, L. F.; LOPES, P. S.; SILVA, F. G. da. Modelos de regressão aleatória na avaliação da produção de leite em cabras da raça Saanen. Revista Brasileira de Zootecnia, v.40, n.7, p.1526-1532, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 160. | | TORAL, F. L.; BARBOSA, L.; CUNHA, E. E.; ALBUQUERQUE, L. G. de; LOPES, P. S.; TEIXEIRA, M. R.; SARMENTO, J. L. R. Modelos de regressão aleatória com diferentes estruturas de variância na estimação de parâmetros genéticos para produção de leite em caprinos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2005. 5 f. CD ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| Registros recuperados : 208 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
03/01/2018 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
BARROSO, L. M. A.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; SILVA, F. F.; SERÃO, N. V. L.; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. L.; AZEVEDO, C. F.; LOPES, P. S.; GUIMARÃES, S. E. F. |
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Afiliação: |
L. M. A. Barroso, UFV; M. Nascimento, UFV; A. C. C. Nascimento, UFV; F. F. Silva, UFV; N. V. L. Serão, Iowa State University; C. D. Cruz, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; F. L. Silva, UFV; C. F. Azevedo, UFV; P. S. Lopes, UFV; S. E. F. Guimarães, UFV. |
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Título: |
Regularized quantile regression for SNP marker estimation of pig growth curves. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Science and Biotechnology, v. 8, n. 59, 2017. |
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Páginas: |
9 p. |
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DOI: |
10.1186/s40104-017-0187-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Genomic growth curves are generally defined only in terms of population mean; an alternative approach that has not yet been exploited in genomic analyses of growth curves is the Quantile Regression (QR). This methodology allows for the estimation of marker effects at different levels of the variable of interest. We aimed to propose and evaluate a regularized quantile regression for SNP marker effect estimation of pig growth curves, as well as to identify the chromosome regions of the most relevant markers and to estimate the genetic individual weight trajectory over time (genomic growth curve) under different quantiles (levels). Results: The regularized quantile regression (RQR) enabled the discovery, at different levels of interest (quantiles), of the most relevant markers allowing for the identification of QTL regions. We found the same relevant markers simultaneously affecting different growth curve parameters (mature weight and maturity rate): two (ALGA0096701 and ALGA0029483) for RQR(0.2), one (ALGA0096701) for RQR(0.5), and one (ALGA0003761) for RQR(0.8). Three average genomic growth curves were obtained and the behavior was explained by the curve in quantile 0.2, which differed from the others. Conclusions: RQR allowed for the construction of genomic growth curves, which is the key to identifying and selecting the most desirable animals for breeding purposes. Furthermore, the proposed model enabled us to find, at different levels of interest (quantiles), the most relevant markers for each trait (growth curve parameter estimates) and their respective chromosomal positions (identification of new QTL regions for growth curves in pigs). These markers can be exploited under the context of marker assisted selection while aiming to change the shape of pig growth curves. MenosBackground: Genomic growth curves are generally defined only in terms of population mean; an alternative approach that has not yet been exploited in genomic analyses of growth curves is the Quantile Regression (QR). This methodology allows for the estimation of marker effects at different levels of the variable of interest. We aimed to propose and evaluate a regularized quantile regression for SNP marker effect estimation of pig growth curves, as well as to identify the chromosome regions of the most relevant markers and to estimate the genetic individual weight trajectory over time (genomic growth curve) under different quantiles (levels). Results: The regularized quantile regression (RQR) enabled the discovery, at different levels of interest (quantiles), of the most relevant markers allowing for the identification of QTL regions. We found the same relevant markers simultaneously affecting different growth curve parameters (mature weight and maturity rate): two (ALGA0096701 and ALGA0029483) for RQR(0.2), one (ALGA0096701) for RQR(0.5), and one (ALGA0003761) for RQR(0.8). Three average genomic growth curves were obtained and the behavior was explained by the curve in quantile 0.2, which differed from the others. Conclusions: RQR allowed for the construction of genomic growth curves, which is the key to identifying and selecting the most desirable animals for breeding purposes. Furthermore, the proposed model enabled us to find, at different levels of interest (quantiles), t... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genome association; Growth curves; Pig; QTL; Regularized quantile regression. |
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Thesagro: |
Melhoramento genético animal; Porco; Suíno. |
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Thesaurus NAL: |
Swine. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170172/1/2017-M.Deon-JASB-Regularized.pdf
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Marc: |
LEADER 02860naa a2200373 a 4500
001 2084057
005 2018-01-03
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1186/s40104-017-0187-z$2DOI
100 1 $aBARROSO, L. M. A.
245 $aRegularized quantile regression for SNP marker estimation of pig growth curves.$h[electronic resource]
260 $c2017
300 $a9 p.
520 $aBackground: Genomic growth curves are generally defined only in terms of population mean; an alternative approach that has not yet been exploited in genomic analyses of growth curves is the Quantile Regression (QR). This methodology allows for the estimation of marker effects at different levels of the variable of interest. We aimed to propose and evaluate a regularized quantile regression for SNP marker effect estimation of pig growth curves, as well as to identify the chromosome regions of the most relevant markers and to estimate the genetic individual weight trajectory over time (genomic growth curve) under different quantiles (levels). Results: The regularized quantile regression (RQR) enabled the discovery, at different levels of interest (quantiles), of the most relevant markers allowing for the identification of QTL regions. We found the same relevant markers simultaneously affecting different growth curve parameters (mature weight and maturity rate): two (ALGA0096701 and ALGA0029483) for RQR(0.2), one (ALGA0096701) for RQR(0.5), and one (ALGA0003761) for RQR(0.8). Three average genomic growth curves were obtained and the behavior was explained by the curve in quantile 0.2, which differed from the others. Conclusions: RQR allowed for the construction of genomic growth curves, which is the key to identifying and selecting the most desirable animals for breeding purposes. Furthermore, the proposed model enabled us to find, at different levels of interest (quantiles), the most relevant markers for each trait (growth curve parameter estimates) and their respective chromosomal positions (identification of new QTL regions for growth curves in pigs). These markers can be exploited under the context of marker assisted selection while aiming to change the shape of pig growth curves.
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773 $tJournal of Animal Science and Biotechnology$gv. 8, n. 59, 2017.
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