|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
09/07/2009 |
Data da última atualização: |
14/06/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
KUBO, K. S.; STUART, R. M.; FREITAS-ASTÚA, J.; ANTONIOLI-LUIZON, R.; LOCALI-FABRIS, E. C.; COLETTA-FILHO, H. D.; MACHADO, M. A.; KITAJIMA, E. W. |
Afiliação: |
Karen Sumire Kubo, APTA; R. M. Stuart, APTA; Juliana Freitas-Ástua, CNPMF; Renata Antonioli-Luizon, APTA; Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Helvecio Della Coletta-Filho, APTA; Marcos Antonio Machado, APTA; Elliot Watanabe Kitajima, ESALQ. |
Título: |
Evaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid. |
Ano de publicação: |
2009 |
Fonte/Imprenta: |
Archives of Virology, v. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009. |
ISSN: |
0304-8608 |
DOI: |
DOI 10.1007/s00705-009-0395-8 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The variability of a fragment of the nucleocapsid gene of orchid fleck virus (OFV) was investigated by single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis and nucleotide sequencing. Forty-eight samples of 18 genera of orchids were collected from Brazil, Costa Rica and Australia. The SSCP analysis yielded six different band patterns, and phylogenetic analysis based on the nucleotide fragment sequence obtained in this work and six available in GenBank showed two different groups, one with isolates 023Germany and So-Japan, and other with the rest of the isolates. None of the analyses showed geographic correlation among the Brazilian strains. The data obtained in this study showed a low genetic variation in this region of the genome; the dN/dS ratio of 0.251-0.405 demonstrated a negative selective pressure that maintains the stability of the analyzed fragments. |
Palavras-Chave: |
Nuclear type. |
Thesaurus Nal: |
Orchid fleck virus. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 01736naa a2200253 a 4500 001 1654417 005 2023-06-14 008 2009 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0304-8608 024 7 $aDOI 10.1007/s00705-009-0395-8$2DOI 100 1 $aKUBO, K. S. 245 $aEvaluation of the genetic variability of orchid fleck virus by single-strand conformational polymorphism analysis and nucleotide sequencing of a fragment from the nucleocapsid.$h[electronic resource] 260 $c2009 520 $aThe variability of a fragment of the nucleocapsid gene of orchid fleck virus (OFV) was investigated by single-strand conformational polymorphism (SSCP) analysis and nucleotide sequencing. Forty-eight samples of 18 genera of orchids were collected from Brazil, Costa Rica and Australia. The SSCP analysis yielded six different band patterns, and phylogenetic analysis based on the nucleotide fragment sequence obtained in this work and six available in GenBank showed two different groups, one with isolates 023Germany and So-Japan, and other with the rest of the isolates. None of the analyses showed geographic correlation among the Brazilian strains. The data obtained in this study showed a low genetic variation in this region of the genome; the dN/dS ratio of 0.251-0.405 demonstrated a negative selective pressure that maintains the stability of the analyzed fragments. 650 $aOrchid fleck virus 653 $aNuclear type 700 1 $aSTUART, R. M. 700 1 $aFREITAS-ASTÚA, J. 700 1 $aANTONIOLI-LUIZON, R. 700 1 $aLOCALI-FABRIS, E. C. 700 1 $aCOLETTA-FILHO, H. D. 700 1 $aMACHADO, M. A. 700 1 $aKITAJIMA, E. W. 773 $tArchives of Virology$gv. 154, n. 6, p. 1009-1014, mai. 2009.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Algodão. |
Data corrente: |
06/03/2015 |
Data da última atualização: |
09/03/2015 |
Tipo da produção científica: |
Documentos |
Autoria: |
SEVERINO, L. S.; LIMA, M. M. de A.; SILVA FILHO, E. C. da; BARBOSA, O. S. |
Afiliação: |
LIV SOARES SEVERINO, CNPA; MARLEIDE MAGALHAES DE ANDRADE LIMA, CNPA; EVERALDO CORREIA DA SILVA FILHO, CNPA; ORIEL SANTANA BARBOSA, CNPA. |
Título: |
IX Encontro de Produção Científica da Embrapa Algodão - EPC 2014, 9., 2014, Campina Grande. Resumos... |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2014. |
Páginas: |
37 p. |
Descrição Física: |
23 cm. |
Série: |
( Embrapa Algodão. Documentos 251) |
ISSN: |
0103-0205 |
Idioma: |
Português |
Palavras-Chave: |
EMTOMOLOGIA AGRÍCOLA; FITOSSANIDADE; INICIAÇÃO CIENTÍFICA; MATOLOGIA; MELHORAMENTO GENÉTICO; METODOLOGIA CIENTIFICA; QUÍMICA ANALÍTICA. |
Thesagro: |
Fitotecnia; Genética Vegetal; Melhoramento Vegetal. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/119750/1/DOC.ALGODAO.pdf
|
Marc: |
LEADER 00916nam a2200289 a 4500 001 2010866 005 2015-03-09 008 2014 bl uuuu u0uu1 u #d 022 $a0103-0205 100 1 $aSEVERINO, L. S. 245 $aIX Encontro de Produção Científica da Embrapa Algodão - EPC 2014, 9., 2014, Campina Grande. Resumos...$h[electronic resource] 260 $aCampina Grande, PB: Embrapa Algodão$c2014 300 $a37 p.$c23 cm. 490 $a( Embrapa Algodão. Documentos 251) 650 $aFitotecnia 650 $aGenética Vegetal 650 $aMelhoramento Vegetal 653 $aEMTOMOLOGIA AGRÍCOLA 653 $aFITOSSANIDADE 653 $aINICIAÇÃO CIENTÍFICA 653 $aMATOLOGIA 653 $aMELHORAMENTO GENÉTICO 653 $aMETODOLOGIA CIENTIFICA 653 $aQUÍMICA ANALÍTICA 700 1 $aLIMA, M. M. de A. 700 1 $aSILVA FILHO, E. C. da 700 1 $aBARBOSA, O. S.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Algodão (CNPA) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|