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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
18/10/2019 |
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Data da última atualização: |
18/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PORTO, B. N.; CAIXETA, E. T.; MATHIONI, S. M.; VIDIGAL, P. M. P.; ZAMBOLIM, L.; ZAMBOLIM, E. M.; DONOFRIO, N.; POLSON, S. W.; MAIA, T. A.; CHEN, C.; ADETUNJI, M.; KINGHAM, B.; DALIO, R. J. D.; RESENDE, M. L. V. de. |
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Afiliação: |
Brenda Neves Porto, Universidade Federal de Lavras - UFLA. Progama de Pós-graduação em Biotecnologia Vegetal; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; Sandra Marisa Mathioni, Universidade Federal de Lavras - UFLA/Departamento de Fitopatologia; Pedro Marcus Pereira Vidigal, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Núcleo de Análises de Biomoléculas; Laércio Zambolim, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitopatologia; Eunize Maciel Zambolim, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitopatologia; Nicole Donofrio, University of Delaware/Department of Plant and Soil Sciences; Shawn W. Polson, Delaware Biotechnology Institute/Center for Bioinformatics and Computational Biology; Thiago Andrade Maia, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitopatologia; Chuming Chen, Delaware Biotechnology Institute/Center for Bioinformatics and Computational Biology; Modupe Adetunji, Delaware Biotechnology Institute/Center for Bioinformatics and Computational Biology; Brewster Kingham, University of Delaware, Newark/Delaware Biotechnology Institute/Sequencing and Genotyping Center; Ronaldo José Durigan Dalio, Instituto Agronoˆmico de Campinas - IAC/Centro de Citricultura “Sylvio Moreira”; Mário Lúcio Vilela de Resende, Departamento de Fitopatologia, Universidade Federal de Lavras. |
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Título: |
Genome sequencing and transcript analysis of Hemileia vastatrix reveal expression dynamics of candidate effectors dependent on host compatibility. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
PLOSONE, April 18, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Coffee leaf rust caused by the fungus Hemileia vastatrix is one of the most important leaf diseases of coffee plantations worldwide. Current knowledge of the H. vastatrix genome is limited and only a small fraction of the total fungal secretome has been identified. In order to obtain a more comprehensive understanding of its secretome, we aimed to sequence and assemble the entire H. vastatrix genome using two next-generation sequencing platforms and a hybrid assembly strategy. This resulted in a 547 Mb genome of H. vastatrix race XXXIII (Hv33), with 13,364 predicted genes that encode 13,034 putative proteins with transcriptomic support. Based on this proteome, 615 proteins contain putative secretion peptides, and lack transmembrane domains. From this putative secretome, 111 proteins were identified as candidate effectors (EHv33) unique to H. vastatrix, and a subset consisting of 17 EHv33 genes was selected for a temporal gene expression analysis during infection. Five genes were significantly induced early during an incompatible interaction, indicating their potential role as pre-haustorial effectors possibly recognized by the resistant coffee genotype. Another nine genes were significantly induced after haustorium formation in the compatible interaction. Overall, we suggest that this fungus is able to selectively mount its survival strategy with effectors that depend on the host genotype involved in the infection process. |
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Thesagro: |
Ferrugem; Fungo; Hemileia Vastatrix. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Infection; Leaf rust. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/203101/1/Genome-sequencing-and-transcript.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
12/03/2012 |
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Data da última atualização: |
16/04/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
KISHINO, N.; SATURNO, D. F.; FERNANDO FARIA; SILVA, A. P. da; BABUJIA, L. C.; SOUZA, D. I. de; NOGUEIRA, M. A. |
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Afiliação: |
NAGOMI KISHINO, UEL; DIOGO FERNANDO SATURNO, UEL; FARIA, F., UEL; ADRIANA PEREIRA DA SILVA, UEL; LETÍCIA CARLOS BABUJIA, UEL; DEBORAH INGRID DE SOUZA, UEL; MARCO ANTONIO NOGUEIRA, CNPSO. |
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Título: |
Atividade microbiana em solos sob diferentes níveis de contaminação por lodo galvânico. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo 374-2. |
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Conteúdo: |
Com a contaminação decorrente de atividades antrópicas, as concentrações de elementos-traço no solo podem atingir concentrações que ultrapassam o limite de tolerância de microrganismos, causando graves conseqüências aos ecossistemas devido ao importante papel da comunidade microbiana nos ciclos biogeoquímicos, na fertilidade do solo e no desenvolvimento vegetal. O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos de níveis crescentes de contaminação por lodo galvânico em três solos representativos do Norte do Paraná sobre algumas de suas propriedades microbiológicas. Amostras de 3 kg dos solos Nitossolo Vermelho eutroférrico, Latossolo Bruno álico e Latossolo Vermelho acriférrico, foram acondicionadas em vasos e submetidas a diferentes níveis de contaminação, nas doses crescentes de 0%, 0,2%, 0,4% e 0,6% (m/m) de lodo galvânico. Os solos foram cultivados com soja por três meses. Na sequência, as plantas foram removidas e novo cultivo foi realizado com trigo (cv. COODETEC 104) por 99 dias. Foram avaliados o C e N da biomassa microbiana, atividade da desidrogenase e respiração microbiana do solo. Os resultados indicaram efeitos negativos da adição de doses de lodo galvânico na biomassa e na atividade microbiana. A biomassa microbiana, tanto de C quanto de N, sofreu maiores efeitos negativos no Latossolo Vermelho acriférrico. A redução da biomassa pode ter sido causada pelos efeitos tóxicos dos elementos-traço sobre a comunidade microbiana, que prejudicam o metabolismo dos microrganismos e, por conseguinte, a síntese de componentes celulares. A atividade da desidrogenase diminuiu gradativamente com o aumento das doses de lodo. Estes resultados enfatizam o efeito negativo da contaminação do solo com lodo galvânico, porém seu efeito depende das condições do solo, sobretudo do pH, da textura e do teor de matéria orgânica. A adição de lodo galvânico ao Nitossolo Vermelho eutroférrico estimulou a taxa de liberação de CO2, porém os efeitos do lodo não foram significativos no Latossolo Bruno álico e Latossolo Vermelho acriférrico. As propriedades microbiológicas do solo, por serem responsivas aos níveis de contaminação, podem ser usadas para avaliar o grau de vulnerabilidade de cada tipo de solo à contaminação, e assim estabelecer estratégias para prevenir níveis que levem à perda de sua funcionalidade e consequente degradação. MenosCom a contaminação decorrente de atividades antrópicas, as concentrações de elementos-traço no solo podem atingir concentrações que ultrapassam o limite de tolerância de microrganismos, causando graves conseqüências aos ecossistemas devido ao importante papel da comunidade microbiana nos ciclos biogeoquímicos, na fertilidade do solo e no desenvolvimento vegetal. O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos de níveis crescentes de contaminação por lodo galvânico em três solos representativos do Norte do Paraná sobre algumas de suas propriedades microbiológicas. Amostras de 3 kg dos solos Nitossolo Vermelho eutroférrico, Latossolo Bruno álico e Latossolo Vermelho acriférrico, foram acondicionadas em vasos e submetidas a diferentes níveis de contaminação, nas doses crescentes de 0%, 0,2%, 0,4% e 0,6% (m/m) de lodo galvânico. Os solos foram cultivados com soja por três meses. Na sequência, as plantas foram removidas e novo cultivo foi realizado com trigo (cv. COODETEC 104) por 99 dias. Foram avaliados o C e N da biomassa microbiana, atividade da desidrogenase e respiração microbiana do solo. Os resultados indicaram efeitos negativos da adição de doses de lodo galvânico na biomassa e na atividade microbiana. A biomassa microbiana, tanto de C quanto de N, sofreu maiores efeitos negativos no Latossolo Vermelho acriférrico. A redução da biomassa pode ter sido causada pelos efeitos tóxicos dos elementos-traço sobre a comunidade microbiana, que prejudicam o metabolismo dos microrg... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Microbiologia. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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500 $aResumo 374-2.
520 $aCom a contaminação decorrente de atividades antrópicas, as concentrações de elementos-traço no solo podem atingir concentrações que ultrapassam o limite de tolerância de microrganismos, causando graves conseqüências aos ecossistemas devido ao importante papel da comunidade microbiana nos ciclos biogeoquímicos, na fertilidade do solo e no desenvolvimento vegetal. O objetivo deste trabalho foi avaliar os efeitos de níveis crescentes de contaminação por lodo galvânico em três solos representativos do Norte do Paraná sobre algumas de suas propriedades microbiológicas. Amostras de 3 kg dos solos Nitossolo Vermelho eutroférrico, Latossolo Bruno álico e Latossolo Vermelho acriférrico, foram acondicionadas em vasos e submetidas a diferentes níveis de contaminação, nas doses crescentes de 0%, 0,2%, 0,4% e 0,6% (m/m) de lodo galvânico. Os solos foram cultivados com soja por três meses. Na sequência, as plantas foram removidas e novo cultivo foi realizado com trigo (cv. COODETEC 104) por 99 dias. Foram avaliados o C e N da biomassa microbiana, atividade da desidrogenase e respiração microbiana do solo. Os resultados indicaram efeitos negativos da adição de doses de lodo galvânico na biomassa e na atividade microbiana. A biomassa microbiana, tanto de C quanto de N, sofreu maiores efeitos negativos no Latossolo Vermelho acriférrico. A redução da biomassa pode ter sido causada pelos efeitos tóxicos dos elementos-traço sobre a comunidade microbiana, que prejudicam o metabolismo dos microrganismos e, por conseguinte, a síntese de componentes celulares. A atividade da desidrogenase diminuiu gradativamente com o aumento das doses de lodo. Estes resultados enfatizam o efeito negativo da contaminação do solo com lodo galvânico, porém seu efeito depende das condições do solo, sobretudo do pH, da textura e do teor de matéria orgânica. A adição de lodo galvânico ao Nitossolo Vermelho eutroférrico estimulou a taxa de liberação de CO2, porém os efeitos do lodo não foram significativos no Latossolo Bruno álico e Latossolo Vermelho acriférrico. As propriedades microbiológicas do solo, por serem responsivas aos níveis de contaminação, podem ser usadas para avaliar o grau de vulnerabilidade de cada tipo de solo à contaminação, e assim estabelecer estratégias para prevenir níveis que levem à perda de sua funcionalidade e consequente degradação.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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