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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
17/03/2014 |
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Data da última atualização: |
05/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ARAUJO, C. P.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; RAMOS, C. A. N.; S. FILHO, A. F.; VIDAL, C. E. S.; ROXO, E.; NISHIBE, c.; ALMEIDA, N. F.; F. JUNIOR, A. A.; SILVA, M. R.; B. NETO, J. D.; CERQUEIRA, V. D.; ZUMÁRRAGA, M.; ARAUJO, F. R. |
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Afiliação: |
MARCIO ROBERTO SILVA, CNPGL. |
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Título: |
Detection of Mycobacterium bovis in Bovine and Bubaline Tissues Using Nested-PCR for TbD1. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 9, n. 3, p. 1-6, 2014 |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Conteúdo: |
In the present study, a nested-PCR system, targeting the TbD1 region, involving the performance of conventional PCR followed by real-time PCR, was developed to detect Mycobacterium bovis in bovine/bubaline tissue homogenates. The sensitivity and specificity of the reactions were assessed with DNA samples extracted from tuberculous and non-tuberculous mycobacteria, as well as other actinomycetales species and DNA samples extracted directly from bovine and bubaline tissue homogenates. In terms of analytical sensitivity, the DNA of M. bovis AN5 was detected up to 1.56 ng with conventional PCR, 97.6 pg with real-time PCR, and 1.53 pg with nested-PCR in the reaction mixture. The nested-PCR exhibited 100% analytical specificity for M. bovis when tested with the DNA of reference strains of environmental mycobacteria and closely-related Actinomycetales. A clinical sensitivity value of 76.0% was detected with tissue samples from animals that exhibited positive results in the comparative intradermal tuberculin test (CITT), as well as from those with lesions compatible with tuberculosis (LCT) that rendered positive cultures. A clinical specificity value of 100% was detected with tissue samples from animals with CITT- results, with no visible lesions (NVL) and negative cultures. No significant differences were found between the nested-PCR and culture in terms of detecting CITT+ animals with LCT or with NVL. No significant differences were recorded in the detection of CITT- animals with NVL. However, nested-PCR detected a significantly higher number of positive animals than the culture in the group of animals exhibiting LCT with no previous records of CITT. The use of the nested-PCR assay to detect M. bovis in tissue homogenates provided a rapid diagnosis of bovine and bubaline tuberculosis. MenosIn the present study, a nested-PCR system, targeting the TbD1 region, involving the performance of conventional PCR followed by real-time PCR, was developed to detect Mycobacterium bovis in bovine/bubaline tissue homogenates. The sensitivity and specificity of the reactions were assessed with DNA samples extracted from tuberculous and non-tuberculous mycobacteria, as well as other actinomycetales species and DNA samples extracted directly from bovine and bubaline tissue homogenates. In terms of analytical sensitivity, the DNA of M. bovis AN5 was detected up to 1.56 ng with conventional PCR, 97.6 pg with real-time PCR, and 1.53 pg with nested-PCR in the reaction mixture. The nested-PCR exhibited 100% analytical specificity for M. bovis when tested with the DNA of reference strains of environmental mycobacteria and closely-related Actinomycetales. A clinical sensitivity value of 76.0% was detected with tissue samples from animals that exhibited positive results in the comparative intradermal tuberculin test (CITT), as well as from those with lesions compatible with tuberculosis (LCT) that rendered positive cultures. A clinical specificity value of 100% was detected with tissue samples from animals with CITT- results, with no visible lesions (NVL) and negative cultures. No significant differences were found between the nested-PCR and culture in terms of detecting CITT+ animals with LCT or with NVL. No significant differences were recorded in the detection of CITT- animals with ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bovine and bubaline tuberculosis; Nested-PCR system. |
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Thesaurus Nal: |
Mycobacterium abscessus. |
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Categoria do assunto: |
--
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/119848/1/ARAUJO-C.-P..pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/99300/1/pone.0091023-1..6-2014-Nested-PCR.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Solos. Para informações adicionais entre em contato com cnps.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
28/02/2005 |
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Data da última atualização: |
02/05/2005 |
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Autoria: |
CUNHA, T. J. F. |
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Título: |
Ácidos húmicos de solos escuros da Amazônia (Terra Preta de Índio). |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
Seropédica, RJ: UFRRJ, 2005. |
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Páginas: |
119 + [19) f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado em Ciências em Agronomia, Ciência do Solo) - Instituto de Agronomia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica.
Orientação do Professor Gabriel de Araújo Santos e co-orientação dos pesquisadores Beata Emoke Madari e Ladislau Martin Neto. |
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Conteúdo: |
Ácidos húmicos de solos escuros da Amazônia brasileira (Terra Preta do Índio) foram caracterizados usando-se espectroscopias de UV -Vis, DRIFT, Fluorescência de excitação e emissão, EPR, e RMN, analises termogravimétricas, composição elementar, e medidas de acidez (total, carboxílica e fenólica). Amostras de solos foram coletadas nos municípios de Humaitá, Novo Aripuanã, Apuí, Iranduba, Rio Preto da Eva, Novo Airão, Açutuba, e Manicoré no Estado do Amazonas. A fração ácidos húmicos (AR) foi extraída usando-se o método da Sociedade Internacional de Substâncias Húmicas (IHSS). Os AH foram separados em três grupos conforme o uso da terra. Solos antropogênicos sob floresta (SAF), solos antropogênicos sob cultivo (SAC) e solos não antropogênicos sob floresta (SNAF). Os solos do grupo SNAF são representativos dos Latossolos amazônicos e foram coletados em áreas adjacentes aos solos antropogênicos, sendo este o grupo referência para comparação como os grupos SAF e SACo Teste de comparação de media (teste t), e análises estatísticas multivariadas (análise fatorial, análise de agrupamento e análise discriminante) foram aplicadas no estudo. Os solos dos grupos SAF e SAC mostraram melhores características de fertilidade que os solos não antropogênicos (SNAF) (pH: SAF = 2.1, SAC = 5.4, SNAF = 4.4; saturação por bases [V%]: SAF =59, SAC = 51, SNAF = 18; capacidade de troca cátions [CTC]: SAF = 17.5, SAC = 17.2, SNAF = 9.5 cmolc kg-l; P assimilável: SAF = 116, SAC = 291, SNAF = 5 mg kg-1). No grupo SAF e SAC ~ 44% do carbono total foi encontrado na fração humina, ~32% na fração ácidos húmicos e ~ 13% na fração ácidos fúlvicos. Estes valores para o grupo SNAF foram 49, 19 e 16%, respectivamente. A mais relevante característica dos AH dos solos antropogênicos, comparado aos solos não antropogênicos foram sua superior reatividade, estabilidade, e grau de humificação. Os AH dos grupos SAF e SAC foram caracterizados por alta acidez total (SAF = 612, SAC = 712, SNAF = 575 cmol kg-l) e acidez carboxílica (SAF = 435, SAC = 454, SNAF = 320 cmol kg-1, altas concentrações de radicais livres orgânicos (SAF = 4.07, SAC = ... MenosÁcidos húmicos de solos escuros da Amazônia brasileira (Terra Preta do Índio) foram caracterizados usando-se espectroscopias de UV -Vis, DRIFT, Fluorescência de excitação e emissão, EPR, e RMN, analises termogravimétricas, composição elementar, e medidas de acidez (total, carboxílica e fenólica). Amostras de solos foram coletadas nos municípios de Humaitá, Novo Aripuanã, Apuí, Iranduba, Rio Preto da Eva, Novo Airão, Açutuba, e Manicoré no Estado do Amazonas. A fração ácidos húmicos (AR) foi extraída usando-se o método da Sociedade Internacional de Substâncias Húmicas (IHSS). Os AH foram separados em três grupos conforme o uso da terra. Solos antropogênicos sob floresta (SAF), solos antropogênicos sob cultivo (SAC) e solos não antropogênicos sob floresta (SNAF). Os solos do grupo SNAF são representativos dos Latossolos amazônicos e foram coletados em áreas adjacentes aos solos antropogênicos, sendo este o grupo referência para comparação como os grupos SAF e SACo Teste de comparação de media (teste t), e análises estatísticas multivariadas (análise fatorial, análise de agrupamento e análise discriminante) foram aplicadas no estudo. Os solos dos grupos SAF e SAC mostraram melhores características de fertilidade que os solos não antropogênicos (SNAF) (pH: SAF = 2.1, SAC = 5.4, SNAF = 4.4; saturação por bases [V%]: SAF =59, SAC = 51, SNAF = 18; capacidade de troca cátions [CTC]: SAF = 17.5, SAC = 17.2, SNAF = 9.5 cmolc kg-l; P assimilável: SAF = 116, SAC = 291, SNAF = 5 mg kg-1)... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Ácido húmico; àcidos húmicos; Análise espectral; Carbono pirogênico; Espectroscopia; Estabilidade; Reatividade; solos Antrogênicos. |
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Thesagro: |
Acidez; Fertilidade; Química; Solo. |
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Thesaurus NAL: |
Amazonia. |
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Categoria do assunto: |
--
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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Marc: |
LEADER 03217nam a2200289 a 4500
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500 $aTese (Doutorado em Ciências em Agronomia, Ciência do Solo) - Instituto de Agronomia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica. Orientação do Professor Gabriel de Araújo Santos e co-orientação dos pesquisadores Beata Emoke Madari e Ladislau Martin Neto.
520 $aÁcidos húmicos de solos escuros da Amazônia brasileira (Terra Preta do Índio) foram caracterizados usando-se espectroscopias de UV -Vis, DRIFT, Fluorescência de excitação e emissão, EPR, e RMN, analises termogravimétricas, composição elementar, e medidas de acidez (total, carboxílica e fenólica). Amostras de solos foram coletadas nos municípios de Humaitá, Novo Aripuanã, Apuí, Iranduba, Rio Preto da Eva, Novo Airão, Açutuba, e Manicoré no Estado do Amazonas. A fração ácidos húmicos (AR) foi extraída usando-se o método da Sociedade Internacional de Substâncias Húmicas (IHSS). Os AH foram separados em três grupos conforme o uso da terra. Solos antropogênicos sob floresta (SAF), solos antropogênicos sob cultivo (SAC) e solos não antropogênicos sob floresta (SNAF). Os solos do grupo SNAF são representativos dos Latossolos amazônicos e foram coletados em áreas adjacentes aos solos antropogênicos, sendo este o grupo referência para comparação como os grupos SAF e SACo Teste de comparação de media (teste t), e análises estatísticas multivariadas (análise fatorial, análise de agrupamento e análise discriminante) foram aplicadas no estudo. Os solos dos grupos SAF e SAC mostraram melhores características de fertilidade que os solos não antropogênicos (SNAF) (pH: SAF = 2.1, SAC = 5.4, SNAF = 4.4; saturação por bases [V%]: SAF =59, SAC = 51, SNAF = 18; capacidade de troca cátions [CTC]: SAF = 17.5, SAC = 17.2, SNAF = 9.5 cmolc kg-l; P assimilável: SAF = 116, SAC = 291, SNAF = 5 mg kg-1). No grupo SAF e SAC ~ 44% do carbono total foi encontrado na fração humina, ~32% na fração ácidos húmicos e ~ 13% na fração ácidos fúlvicos. Estes valores para o grupo SNAF foram 49, 19 e 16%, respectivamente. A mais relevante característica dos AH dos solos antropogênicos, comparado aos solos não antropogênicos foram sua superior reatividade, estabilidade, e grau de humificação. Os AH dos grupos SAF e SAC foram caracterizados por alta acidez total (SAF = 612, SAC = 712, SNAF = 575 cmol kg-l) e acidez carboxílica (SAF = 435, SAC = 454, SNAF = 320 cmol kg-1, altas concentrações de radicais livres orgânicos (SAF = 4.07, SAC = ...
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653 $aReatividade
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Registro original: |
Embrapa Solos (CNPS) |
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