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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Convert2RGWAS. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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2.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. MicroarrayCluster. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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3.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Solvat. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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4.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. snpQC. versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.

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5.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. snpQC. Versão 2.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

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6.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Introdução a especificação formal de módulos de software por traços. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 1993. 16 p.

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7.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Um estudo preliminar dos requisitos para construção de um software DRIS. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2000. 15 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 1).

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8.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Entendendo e interpretando os parâmetros utilizados por BLAST. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2001. 12 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Instruções técnicas, 6).

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9.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Especificação formal por traços, composição de componentes e protótipos de ferramentas. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 1993. 90 p.

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10.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Predição de regiões de interface proteína-proteína baseada em informações estruturais. 2009. 134 p. Tese (Doutorado em Engenharia Elétrica. Área de concentração Engenharia de Computação) - Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação, Universidade Estadual de Campinas, Campinas.

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11.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Upload/GenBank/Chado. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.

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12.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Tutorial: introdução ao software brblup. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2020. 41 p. il. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 168).

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13.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Uso de prolog para executar especificações formais por traços. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 1997. 19 p. (EMBRAPA-CNPTIA. Relatório Técnico, 1).

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14.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H. Uso do Prolog para executar especificações formais por traços. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 1997. 19 p. (EMBRAPA-CNPTIA. Relatório Técnico, 1).

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15.Imagem marcado/desmarcadoPIETROBON, T.; HIGA, R. H. Disponibilização de análise de controle de qualidade em GWAS e seleção de SNPs para exclusão de paternidade na plataforma Galaxy. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 9., 2013, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 23-24.

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16.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, G. B. de; HIGA, R. H. Armazenamento de dados de genotipagem e fenotipagem para estudos de genética animal. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 9., 2015, Campinas. Anais... Campinas: IAC, 2015. 1 CD-ROM. CIIC 2015. Nº 15603.

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17.Imagem marcado/desmarcadoGUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H. Análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes: implementação em R. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 10., 2014, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 101-104.

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18.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; OLIVEIRA, G. B. de. AnotaSNP: software para organização de informações de anotação de genes em estudos de associação genômica ampla. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 28 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 129).

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19.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; OLIVEIRA, G. B. de. Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos (BDGF) para suporte a estudos de associação genômica ampla e seleção genômica em programas de melhoramento animal. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2015. 30 p. (Embrapa Informática Agropecuária. Documentos, 133).

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20.Imagem marcado/desmarcadoDIAS, V. F.; HIGA, R. H. Banco de dados de genótipos da Rede genômica animal. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 9., 2013, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2013. p. 55-57.

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Biblioteca(s):  Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente:  25/02/2015
Data da última atualização:  21/01/2020
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  SOARES, A. R.; HIGA, R. H.
Afiliação:  AUGUSTO RENAN SOARES, Universidade Estadual de Campinas (Unicamp); ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA.
Título:  Avaliação de ferramentas para detecção de interações epistáticas para fenótipos quantitativos em estudos de associação genômica ampla.
Ano de publicação:  2014
Fonte/Imprenta:  In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 10., 2014, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2014.
Páginas:  p. 105-107.
Idioma:  Português
Conteúdo:  Variações genéticas presentes em uma população podem estar associadas a muitas características como susceptibilidade a doenças em humanos (ex: diabetes, câncer, e doenças psiquiátricas). Atualmente, tecnologias de genotipagem de baixo custo, baseadas em marcadores moleculares do tipo polimorfismo de base única Single Nucleotide Polymorphism (SNP) são utilizados para identificar variações desse tipo associadas com doenças. Tais estudos, são denominados, estudos de associação genômica ampla, Genome Wide Association Studies (GWAS). No caso de espécies de interesse agropecuário, essas variações genéticas estão relacionadas a características que podem impactar ganhos de qualidade e produção. Portanto, é de extrema importância a utilização de novos métodos computacionais para identificação desses marcadores, já que isto pode contribuir para a seleção de indivíduos superiores, considerando os traços fenotípicos de interesse em espécies animais utilizadas em programas de melhoramento coordenados pela Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa).
Palavras-Chave:  Epistasia; Fenótipos quantitativos; GWAS; Paralelismo.
Categoria do assunto:  --
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/118691/1/resumos-avaliacaoferramentas.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
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