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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
13/08/2021 |
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Data da última atualização: |
29/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RIBEIRO, V. M. P.; GOUVEIA, G. C.; MORAES, M. M. de; ARAÚJO, A. E. M. de; RAIDAN, F. S. S.; FONSECA, P. A. de S.; CARDOSO, E. P.; SILVA, M. V. G. B.; TORAL, F. L. B. |
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Afiliação: |
VIRGÍNIA MARA PEREIRA RIBEIRO, Universidade Federal de Minas Gerais; GABRIELA CANABRAVA GOUVEIA, Universidade Federal de Minas Gerais; MARIANA MAMEDES DE MORAES, Universidade Federal de Minas Gerais; ANDRESA EVA MELO DE ARAÚJO, Universidade Federal de Minas Gerais; FERNANDA SANTOS SILVA RAIDAN, CSIRO Tasmania, Australia; PABLO AUGUSTO DE SOUZA FONSECA, University of Guelph; EDUARDO PENTEADO CARDOSO; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; FABIO LUIZ BURANELO TORAL, Universidade Federal de Minas Gerais. |
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Título: |
Genes underlying genetic correlation between growth, reproductive and parasite burden traits in beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 244, 104332, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.livsci.2020.104332 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genetic correlation is the outcome of linkage disequilibrium and/or pleiotropic genes. As such, identifying which genes take part in the genetic control of genetically correlated traits can help us better understand the relationship between economic traits and promote more efficient breeding programs. We aim to estimate the genetic correlations between growth, reproduction and parasite burden traits and to identify functional candidate genes (FCG) underlying these correlations. Six traits were evaluated, comprising two of growth (body weight - BW and average daily gain - ADG), one reproductive trait (scrotal circumference - SC) and three related to parasite burden (tick count - TICK, gastrointestinal nematode eggs per gram of feaces - GIN, and Eimeria spp. oocysts per gram of faeces - EIM). The genetic correlations were estimated using a multiple-trait model. A total of 21,667 SNP markers were used to perform a single-step GWAS and to identify genomic windows explaining at least 1% of the genetic variance for the studied traits. The posterior means and highest posterior density intervals of the genetic correlations were positive and of moderate magnitudes for the pairs of traits BW-ADG (0.64; 0.52, 0.76), BW-SC (0.38; 0.26, 0.50), BW-TICK (0.39; 0.25, 0.76), ADG-SC (0.27; 0.11, 0.43), and TICK-EIM (0.33; 0.12, 0.53). Only the pair ADG-EIM presented a negative correlation (-0.22; -0.39, -0.05). All the other pairs showed genetic correlations close to zero. Additionally, functional analyses were performed and FCGs were selected based on their roles in biological processes for each of the traits. The effects of the SNPs were calculated as a proportion of the genetic standard deviation. Seven FCGs (SLC16A4, KCNA2, LAMTOR5, DUSP10, MAP3K1, TPMT, and KIF13A) were identified for more than one trait. Regardless of the genetic correlation values (lowmoderate), there were FCGs which could influence both correlated traits. There were SNPs mapped in FCGs that might be used to promote genetic improvement in multiple traits. There are common FCGs that might control production, reproduction and parasite burden traits in beef cattle and contribute to genetic correlation values. MenosGenetic correlation is the outcome of linkage disequilibrium and/or pleiotropic genes. As such, identifying which genes take part in the genetic control of genetically correlated traits can help us better understand the relationship between economic traits and promote more efficient breeding programs. We aim to estimate the genetic correlations between growth, reproduction and parasite burden traits and to identify functional candidate genes (FCG) underlying these correlations. Six traits were evaluated, comprising two of growth (body weight - BW and average daily gain - ADG), one reproductive trait (scrotal circumference - SC) and three related to parasite burden (tick count - TICK, gastrointestinal nematode eggs per gram of feaces - GIN, and Eimeria spp. oocysts per gram of faeces - EIM). The genetic correlations were estimated using a multiple-trait model. A total of 21,667 SNP markers were used to perform a single-step GWAS and to identify genomic windows explaining at least 1% of the genetic variance for the studied traits. The posterior means and highest posterior density intervals of the genetic correlations were positive and of moderate magnitudes for the pairs of traits BW-ADG (0.64; 0.52, 0.76), BW-SC (0.38; 0.26, 0.50), BW-TICK (0.39; 0.25, 0.76), ADG-SC (0.27; 0.11, 0.43), and TICK-EIM (0.33; 0.12, 0.53). Only the pair ADG-EIM presented a negative correlation (-0.22; -0.39, -0.05). All the other pairs showed genetic correlations close to zero. Additionally, funct... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Correlação genética. |
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Thesagro: |
Bovino; Gado de Corte; Gado Nelore; Gene; Genética Animal; Melhoramento Genético Animal. |
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Thesaurus Nal: |
Body weight; Parasites; Pleiotropy. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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520 $aGenetic correlation is the outcome of linkage disequilibrium and/or pleiotropic genes. As such, identifying which genes take part in the genetic control of genetically correlated traits can help us better understand the relationship between economic traits and promote more efficient breeding programs. We aim to estimate the genetic correlations between growth, reproduction and parasite burden traits and to identify functional candidate genes (FCG) underlying these correlations. Six traits were evaluated, comprising two of growth (body weight - BW and average daily gain - ADG), one reproductive trait (scrotal circumference - SC) and three related to parasite burden (tick count - TICK, gastrointestinal nematode eggs per gram of feaces - GIN, and Eimeria spp. oocysts per gram of faeces - EIM). The genetic correlations were estimated using a multiple-trait model. A total of 21,667 SNP markers were used to perform a single-step GWAS and to identify genomic windows explaining at least 1% of the genetic variance for the studied traits. The posterior means and highest posterior density intervals of the genetic correlations were positive and of moderate magnitudes for the pairs of traits BW-ADG (0.64; 0.52, 0.76), BW-SC (0.38; 0.26, 0.50), BW-TICK (0.39; 0.25, 0.76), ADG-SC (0.27; 0.11, 0.43), and TICK-EIM (0.33; 0.12, 0.53). Only the pair ADG-EIM presented a negative correlation (-0.22; -0.39, -0.05). All the other pairs showed genetic correlations close to zero. Additionally, functional analyses were performed and FCGs were selected based on their roles in biological processes for each of the traits. The effects of the SNPs were calculated as a proportion of the genetic standard deviation. Seven FCGs (SLC16A4, KCNA2, LAMTOR5, DUSP10, MAP3K1, TPMT, and KIF13A) were identified for more than one trait. Regardless of the genetic correlation values (lowmoderate), there were FCGs which could influence both correlated traits. There were SNPs mapped in FCGs that might be used to promote genetic improvement in multiple traits. There are common FCGs that might control production, reproduction and parasite burden traits in beef cattle and contribute to genetic correlation values.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 314 | |
| 61. |  | VIGNOLO, G. K.; PICOLOTTO, L.; GONÇALVES, M. A.; PEREIRA, I. dos S.; ANTUNES, L. E. C. Efeito da presença de folhas no enraizamento de estacas de amoreira-preta durante o inverno. In:SIMPÓSIO NACIONAL DO MORANGO, 6.; ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 5., 2012, Pelotas. Palestras e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. 231 p. Organizadores: Marcia Vizzotto, Carlos Reisser Júnior, Rosa Lia Barbieri, Rodrigo Cezar Franzon.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 62. | | GONÇALVES, M. A.; PICOLOTTO, L.; COCCO, C.; RUTZ, L. N.; ANTUNES, L. E. C. Efeito da presença de folhas na sobrevivência de mudas de morangueiro. In:SIMPÓSIO NACIONAL DO MORANGO, 6.; ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 5., 2012, Pelotas. Palestras e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. 231 p. Organizadores: Marcia Vizzotto, Carlos Reisser Júnior, Rosa Lia Barbieri, Rodrigo Cezar Franzon.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 63. | | VIGNOLO, G. K.; PICOLOTTO, L.; GONÇALVES, M. A.; PEREIRA, I. dos s.; ANTUNES, L. E. C. Efeito de substratos e doses de adubo de liberação lenta no crescimento de seedllngs de pitangueira. In:SIMPÓSIO NACIONAL DO MORANGO, 6.; ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 5., 2012, Pelotas. Palestras e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. 231 p. Organizadores: Marcia Vizzotto, Carlos Reisser Júnior, Rosa Lia Barbieri, Rodrigo Cezar Franzon.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 64. | | FERRIRA, L. V.; COCCO, C.; GONÇALVES, M. A.; CARVALHO, S. F. de; PICOLOTTO, L.; MONTE, F. Efeito da aplicação de cálcio e boro em pré-colheita na qualidade pós-colheita de Amoreira-preta 'Tupy'. Revista Iberoamericana de Tecnologia Poscosecha, v. 14, n. 1, p. 48-52, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 66. | | GONÇALVES, M. de M.; MEDEIROS, C. A. B.; NAVA, D. E. Consumo foliar de batata tratada com diferentes extratos de meliaceas por diabrotica speciosa (Germar, 1824) (Coleoptera: Chrysomelidae) In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROECOLOGIA, 6.; CONGRESSO LATINO AMERICANO DE AGROECOLOGIA, 2., 2009, Curitiba. Anais... Curitiba: ABA, SOCLA, Governo do Parana, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 67. | | GONÇALVES, M. A.; COCCO, C.; VIGNOLO, G. K.; PICOLOTTO, L.; ANTUNES, L. E. C. Comportamento produtivo de Cultivares de Morangueiro estabelecidos a partir de mudas com Torrão. Revista Eletrônica Científica, Uergs, Porto Alegre, v. 2, n. 3, p. 277-283.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 72. | | PEREIRA, I. dos S.; PICOLOTTO, L.; VIGNOLO, G. K.; GONÇALVES, M. A.; ANTUNES, L. E. C. Crescimento vegetativo e qualidade dos frutos da amoreira-preta em resposta a doses de nitrogênio e potássio. In:SIMPÓSIO NACIONAL DO MORANGO, 6.; ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 5., 2012, Pelotas. Palestras e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. 231 p. Organizadores: Marcia Vizzotto, Carlos Reisser Júnior, Rosa Lia Barbieri, Rodrigo Cezar Franzon.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 73. | | GONÇALVES, M. A.; PICOLOTTO, L.; COCCO, C.; VIGNOLO, G. K.; ANTUNES, L. E. C. Crescimento e desenvolvimento. In: ANTUNES, L. E. C.; REISSER JUNIOR, C.; SCHWENGBER, J. E. (Ed.). Morangueiro. Pelotas: Embrapa Clima Temperado: Brasília, DF: Embrapa, 2016. 589 p. p. 47-66| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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|  |
| 74. | | VIGNOLO, G. K.; GONÇALVES, M. A.; CARPENEDO, S.; MOURA, G. C. de; ANTUNES, L. E. C. Desenvolvimento inicial de mudas de araçazeiro em diferentes substratos. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE FRUTICULTURA DE CLIMA TEMPERADO, 11., 2009, Fraiburgo. Anais... Caçador:Epagri, 2009. v. 2 Resumos, p. 18.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 77. | | PICOLOTTO, L.; KULKAMP, A.; VIGNOLO, G. K.; GONÇALVES, M. A.; ANTUNES, L. E. C. Desenvolvimento inicial de plantas de mirtileiro em diferentes substratos. In:SIMPÓSIO NACIONAL DO MORANGO, 6.; ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 5., 2012, Pelotas. Palestras e resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2012. 231 p. Organizadores: Marcia Vizzotto, Carlos Reisser Júnior, Rosa Lia Barbieri, Rodrigo Cezar Franzon.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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