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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
25/04/2023 |
Data da última atualização: |
16/06/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RIBEIRO, C. A. G.; SOUSA, S. M. de; SOUZA, V. F. de; NEGRI, B. F.; GAULT, C. M.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, L. J. M.; BARROS, E. G. de; BUCKLER. E. S.; GUIMARÃES, C. T. |
Afiliação: |
CARLOS ALEXANDRE GOMES RIBEIRO, Universidade Federal de Viçosa; SYLVIA MORAIS DE SOUSA TINOCO, CNPMS; VANDER FILLIPE DE SOUZA, Universidade Federal de São João del-Rei; BARBARA FRANÇA NEGRI, Universidade Federal de São João del-Rei; CHRISTINE MARIE GAULT, Cornell University; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; EVERALDO GONÇALVES DE BARROS, Universidade Federal de Viçosa; EDWARD S. BUCKLER, USDA-ARS; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS. |
Título: |
Genome-wide association study for root morphology and phosphorus acquisition efficiency in diverse maize panels. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
International Journal of Molecular Sciences, v. 24, n. 7, 6233, 2023. |
DOI: |
https://doi.org/10.3390/ijms24076233 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Maximizing soil exploration through modifications of the root system is a strategy for plants to overcome phosphorus (P) deficiency. Genome-wide association with 561 tropical maize inbred lines from Embrapa and DTMA panels was undertaken for root morphology and P acquisition traits under low- and high-P concentrations, with 353,540 SNPs. P supply modified root morphology traits, biomass and P content in the global maize panel, but root length and root surface area changed differentially in Embrapa and DTMA panels. This suggests that different root plasticity mechanisms exist for maize adaptation to low-P conditions. A total of 87 SNPs were associated to phenotypic traits in both P conditions at ?log10(p-value) ? 5, whereas only seven SNPs reached the Bonferroni significance. Among these SNPs, S9_137746077, which is located upstream of the gene GRMZM2G378852 that encodes a MAPKKK protein kinase, was significantly associated with total seedling dry weight, with the same allele increasing root length and root surface area under P deficiency. The C allele of S8_88600375, mapped within GRMZM2G044531 that encodes an AGC kinase, significantly enhanced root length under low P, positively affecting root surface area and seedling weight. The broad genetic diversity evaluated in this panel suggests that candidate genes and favorable alleles could be exploited to improve P efficiency in maize breeding programs of Africa and Latin America. |
Palavras-Chave: |
Deficiência de fósforo; Morfologia radicular. |
Thesagro: |
Milho; Morfologia Vegetal; Sistema Radicular. |
Thesaurus Nal: |
Phosphorus; Plant morphology; Roots. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1153347/1/Genome-wide-association-study-for-root-morphology-and-phosphorus.pdf
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Marc: |
LEADER 02514naa a2200349 a 4500 001 2153347 005 2023-06-16 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.3390/ijms24076233$2DOI 100 1 $aRIBEIRO, C. A. G. 245 $aGenome-wide association study for root morphology and phosphorus acquisition efficiency in diverse maize panels.$h[electronic resource] 260 $c2023 520 $aMaximizing soil exploration through modifications of the root system is a strategy for plants to overcome phosphorus (P) deficiency. Genome-wide association with 561 tropical maize inbred lines from Embrapa and DTMA panels was undertaken for root morphology and P acquisition traits under low- and high-P concentrations, with 353,540 SNPs. P supply modified root morphology traits, biomass and P content in the global maize panel, but root length and root surface area changed differentially in Embrapa and DTMA panels. This suggests that different root plasticity mechanisms exist for maize adaptation to low-P conditions. A total of 87 SNPs were associated to phenotypic traits in both P conditions at ?log10(p-value) ? 5, whereas only seven SNPs reached the Bonferroni significance. Among these SNPs, S9_137746077, which is located upstream of the gene GRMZM2G378852 that encodes a MAPKKK protein kinase, was significantly associated with total seedling dry weight, with the same allele increasing root length and root surface area under P deficiency. The C allele of S8_88600375, mapped within GRMZM2G044531 that encodes an AGC kinase, significantly enhanced root length under low P, positively affecting root surface area and seedling weight. The broad genetic diversity evaluated in this panel suggests that candidate genes and favorable alleles could be exploited to improve P efficiency in maize breeding programs of Africa and Latin America. 650 $aPhosphorus 650 $aPlant morphology 650 $aRoots 650 $aMilho 650 $aMorfologia Vegetal 650 $aSistema Radicular 653 $aDeficiência de fósforo 653 $aMorfologia radicular 700 1 $aSOUSA, S. M. de 700 1 $aSOUZA, V. F. de 700 1 $aNEGRI, B. F. 700 1 $aGAULT, C. M. 700 1 $aPASTINA, M. M. 700 1 $aMAGALHAES, J. V. de 700 1 $aGUIMARAES, L. J. M. 700 1 $aBARROS, E. G. de 700 1 $aBUCKLER. E. S. 700 1 $aGUIMARÃES, C. T. 773 $tInternational Journal of Molecular Sciences$gv. 24, n. 7, 6233, 2023.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Data corrente: |
23/10/2020 |
Data da última atualização: |
25/04/2024 |
Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Autoria: |
MATTOS, V. da Silva; CARES, J. E.; GOMES, C. B.; GOMES, A. C. M. M.; MONTEIRO, J. da M. dos S.; CASTAGNONE-SERENO, P.; CARNEIRO, R. M. D. G. |
Afiliação: |
VANESSA DA SILVA MATTOS, CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO (CNPQ); JUVENIL ENRIQUE CARES, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; CESAR BAUER GOMES, CPACT; ANA CRISTINA MENESES M GOMES, CENARGEN; JESSICA DA MATA DOS SANTOS MONTEIRO, EMPRESA JCO BIOPRODUTOS; PHILIPPE CASTAGNONE-SERENO, INSTITUT SOPHIA AGROBIOTECH; REGINA MARIA DECHECHI G CARNEIRO, CENARGEN. |
Título: |
Taxonomia integrativa de Meloidogyne oryzae (Nematoda: Meloidogynidae) parasitando arroz irrigado no sul do Brasil. |
Título original: |
Integrative Taxonomy of Meloidogyne oryzae (Nematoda:Meloidogynidae) parasitizing irrigated rice in Southern Brazil. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
Série: |
(Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 363.) |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Uma espécie de nematoide das galhas parasitando o arroz irrigado (Oryza sativa L.) no estado de Santa Catarina (Brasil) foi identificada como Meloidogyne oryzae Maas, Sanders e Dede, 1978, através de diferentes abordagens. A espécie foi estudada a partir dessa população brasileira e comparada com a descrição de M. oryzae do Suriname, com caracterizações morfológicas, bioquímicas e moleculares. A fêmea apresentou estilete mais longo (15,0 μm) que o de M. graminicola Golden; Birchfield (1965) (11,2 μm) com bulbos irregulares, vulva ?off-set? e a presença de ligeira protuberância na região posterior. A anelação pós-labial foi distinta do primeiro anel do corpo, o disco labial e os lábios medianos fundiram-se em uma estrutura em forma de âncora. Padrões perineais foram semelhantes aos de M. graminicola. Os machos apresentaram região labial alta e a presença de algumas linhas curtas e irregulares na região anterior, lábios medianos divididos, não fundidos com disco labial, e estilete (18,2 μm) maior que em M. graminicola (16,8 μm). A cauda do juvenil de segundo estádio (J2) (75,8 μm) foi maior que a de M. graminicola (70,9 μm), com porção hialina estreita e muito longa (22 μm em M. oryzae e 17,9 μm em M. graminicola). Bioquimicamente, M. oryzae apresentou um perfil de esterase distinto (Est O1), que permitiu diferenciá-la de M. graminicola (Est VS1). O número de cromossomos foi 3n = 50-56, e em árvore filogenética de sequências de DNA da região ITS1-5.8S-ITS2 RNAr, as duas populações de M. oryzae agruparam-se com outras espécies partenogenéticas mitóticas, diferenciando-se de M. graminicola, que apresentou n = 18 cromossomos e suas populações agruparam-se com outras espécies partenogenéticas meióticas. Este estudo relatou a primeira detecção de M. oryzae no Brasil e a segunda no mundo, após a descrição da espécie. MenosUma espécie de nematoide das galhas parasitando o arroz irrigado (Oryza sativa L.) no estado de Santa Catarina (Brasil) foi identificada como Meloidogyne oryzae Maas, Sanders e Dede, 1978, através de diferentes abordagens. A espécie foi estudada a partir dessa população brasileira e comparada com a descrição de M. oryzae do Suriname, com caracterizações morfológicas, bioquímicas e moleculares. A fêmea apresentou estilete mais longo (15,0 μm) que o de M. graminicola Golden; Birchfield (1965) (11,2 μm) com bulbos irregulares, vulva ?off-set? e a presença de ligeira protuberância na região posterior. A anelação pós-labial foi distinta do primeiro anel do corpo, o disco labial e os lábios medianos fundiram-se em uma estrutura em forma de âncora. Padrões perineais foram semelhantes aos de M. graminicola. Os machos apresentaram região labial alta e a presença de algumas linhas curtas e irregulares na região anterior, lábios medianos divididos, não fundidos com disco labial, e estilete (18,2 μm) maior que em M. graminicola (16,8 μm). A cauda do juvenil de segundo estádio (J2) (75,8 μm) foi maior que a de M. graminicola (70,9 μm), com porção hialina estreita e muito longa (22 μm em M. oryzae e 17,9 μm em M. graminicola). Bioquimicamente, M. oryzae apresentou um perfil de esterase distinto (Est O1), que permitiu diferenciá-la de M. graminicola (Est VS1). O número de cromossomos foi 3n = 50-56, e em árvore filogenética de sequências de DNA da re... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Caracterização enzimática; Caracterização morfológica; Meloidogyne oryzae. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216965/1/Boletim-arroz-CLP363-final.pdf
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Marc: |
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