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| Registros recuperados : 24 | |
| 3. |  | BRAGA, M. F.; VIEIRA, M. L. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GIRALDI, I. O.; JUNQUEIRA, N. T. V. Mapeamento de QTL (quantitative trait loci) associados à resistência do maracujá-doce à bacteriose. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 4. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; GARCIA, A. A. F.; COUTINHO, L. L. Base genética da correlação entre características de desempenho e de rendimento de carcaça no cromossomo 1 da galinha. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2011, Santos, SP. Anais... Santos: FACTA, 2011. Trabalhos de Pesquisa José Maria Lamas da Silva. 1 CD-ROM. Projeto: 02.09.07.006.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | FREITAS, E. G. de; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; PINTO, L. R.; XAVIER, M. A.; LANDELL, M. G. de A.; GARCIA, A. A. F. Modelos mistos para seleção de genótipos superiores e de futuros genitores de cana-de-açúcar. In: REUNIÃO ANUAL DA REGIÃO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA, 58.; SIMPÓSIO DE ESTATÍSTICA APLICADA À EXPERIMENTAÇÃO AGRONÔMICA, 15., 2013, Campina Grande. Modelagem estatística em áreas multidisciplinares: impactos causados pelas mudanças climáticas na Região Nordeste: anais. Campina Grande: Sociedade Internacional de Biometria, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 6. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; GARCIA, A.; COUTINHO, L. L. Multitrait composite interval mapping reveals pleiotropic QTL on chicken chromosome 1. In: CONFERENCE OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS, 33., 2012, Cairns. Programme and abstract book... Cairns: ISAG, 2012. p.40.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. S. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. Journal of Applied Genetics, Pozna, on line 28 nov. 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 8. | | LIMA, B. M.; TEIXEIRA, J. E. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GRATTAPAGLIA, D.; VALLE, R. K. D.; CAMARGO, L. E. A. Identification of a novel QTL contributing to rust resistance in Eucalyptus. BMC Proceedings 2011, v. 5, Suppl 7, p. P32, 2011. Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration, 2011 Arraial d?Ajuda, Bahia.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | ANONI, C. A.; MANCINI, M. C.; COSTA, E. A.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping for yield related trait in a biparental cross of sugarcane. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 126.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 11. | | ROSÁRIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. QTLs associados a características de carcaça na galinha: mapeamento por intervalo vs mapeamento por intervalo composto. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 27., 2009, Porto Alegre. Anais [dos] trabalhos de pesquisa José Maria Lamas de Silva. [Campinas]: FACTA, 2009. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10. Publicado em CD-ROM (CD00156).| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 12. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; BOSCHIERO, C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. G. QTL's mapeados para características de desempenho na galinha através do mapeamento por intervalo composto com modelo misto. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais. São Carlos, SP: SBMA, 2008. 4 p. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 13. | | VIGNA, B. B. Z.; SANTOS, J. C.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; MOLLINARI, M.; CANCADO, L. J.; VALLE, C. B. do; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA; SOUZA, A. P. The Preliminary Genetic Linkage Map of hexaploid Brachiaria humidicola Based on Microsatellite Markers. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 42-45 1 CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 14. | | SILVA, F. E. de J.; GUIDO, L. N.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; ROSÁRIO, M. F. do. Regiões genômicas associadas a características de desempenho e carcaça no cromossomo 5 de linhagens brasileiras de galinha. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 3, p. 229-238, 2011. Projeto: 01.06.01.006.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | PEREIRA, G. S.; NUNES, E. S.; LAPERUTA, L. D. C.; BRAGA, M. F.; PENHA, H. A.; DINIZ, A. L.; MUNHOZ, C. F.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. Molecular polymorphism and linkage analysis in sweet passion fruit, an outcrossing species. Annals of Applied Biology, v. 162, n. 3, p. 347-361, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 16. | | MORAIS, L. K. de; CURSI, D. E.; SANTOS, J. M. dos; SAMPAIO, M.; CAMARA, T. M. M.; SILVA, P. de A.; BARBOSA, G. V.; HOFFMANN, H. P; CHAPOLA, R. G.; FERNANDES JUNIOR, A. R.; GAZAFFI, R. Melhoramento genético da cana-de-açúcar. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2015. 40 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 200).| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 17. | | PERSEGUINI, J. M. C. K.; CHIORATTO, A. F.; ZUCCHI, M. I.; COLOMBO, C. A.; CARBONELL, S. A. M.; MONDEGO, J. M. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; CAMPOS, T. de; SOUZA, A. P. de; RUBIANO, L. B. Genetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 34, n. 1, p. 88-102, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 18. | | COSTA, E. A.; ANONI, C. O.; MANCINI, M. C.; SANTOS, F. R. C.; MARCONI, T. G.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PERECIN, D.; MOLINARI, M.; XAVIER, M. A.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping including codominant SNP markers with ploidy level information in a sugarcane progeny. Euphytica, Dordrecht, v. 211, n. 1, p. 1-16, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 19. | | ANONI, C. O.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; MANCINI, M. C.; COSTA, E. A.; MOLLINARI, M.; MARCONI, T. G.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping for yield components in a sugarcane commercial cross. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 55.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 20. | | PEREIRA, G. da S.; LAPERUTA, L. D. C.; NUNES, E. S.; CHAVARRIA, L.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; GERALDI, I. O.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. The sweet passion fruit (Passiflora alata) crop: genetic and phenotypic parameter estimates and QTL mapping for fruit traits. Tropical Plant Biology, v. 10, n. 1, p. 18-29, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| Registros recuperados : 24 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Cerrados. Para informações adicionais entre em contato com cpac.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
16/12/2013 |
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Data da última atualização: |
10/12/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
PEREIRA, G. S.; NUNES, E. S.; LAPERUTA, L. D. C.; BRAGA, M. F.; PENHA, H. A.; DINIZ, A. L.; MUNHOZ, C. F.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. |
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Afiliação: |
ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; MARCELO FIDELES BRAGA, CPAC; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP. |
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Título: |
Molecular polymorphism and linkage analysis in sweet passion fruit, an outcrossing species. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Annals of Applied Biology, v. 162, n. 3, p. 347-361, 2013. |
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ISSN: |
0003-4746 |
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DOI: |
10.1111/aab.12028 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
One of the current challenges of tropical fruit crop improvement is to incorporate molecular marker-based approaches into conventional breeding programmes. This study was designed to build an integrated genetic map of the sweet passion fruit (Passiflora alata), a diploid (2n = 18) outcrossing species which is greatly appreciated for in natura consumption, and reported to inspire cosmetic and pharmaceutical companies to create plant-derived compounds. With this in mind, a full-sib family of 180 individuals was genotyped using different molecular marker types, such as amplified fragment length polymorphisms (AFLP), microsatellite-AFLP (M-AFLP), simple sequence repeats (SSR), resistance gene analogues (RGA) and target region amplification polymorphism (TRAP). On average, the rate of polymorphism between the parental genotypes was 20.3%. We also searched for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in some AFLP bands and in seven gene fragments, and found one SNP every 87 bp. All SNPs were biallelic and occurred most frequently in putative gene fragments (81.5%) rather than in AFLP bands (60.0%) analyzed. Excellent gel profiles were obtained allowing the recognition of all types of segregation expected for a progeny of an outcrossing species. Multipoint linkage analysis was performed using OneMap software, with logarithm of the odds (LOD) score ≥ 5.6 and recombination fraction <0.5. The resulting integrated map consists of 549 markers, 2.0% of which fit a segregation ratio of 1:1:1:1, 1.3% a ratio of 1:2:1, 27.3% a ratio of 3:1 and 69.4% a ratio of 1:1. The map spanned a total of 2073.0 cM, with an average distance between adjacent markers of 3.8 cM. This is the first linkage study on sweet passion fruit and should prove useful for quantitative trait loci mapping. MenosOne of the current challenges of tropical fruit crop improvement is to incorporate molecular marker-based approaches into conventional breeding programmes. This study was designed to build an integrated genetic map of the sweet passion fruit (Passiflora alata), a diploid (2n = 18) outcrossing species which is greatly appreciated for in natura consumption, and reported to inspire cosmetic and pharmaceutical companies to create plant-derived compounds. With this in mind, a full-sib family of 180 individuals was genotyped using different molecular marker types, such as amplified fragment length polymorphisms (AFLP), microsatellite-AFLP (M-AFLP), simple sequence repeats (SSR), resistance gene analogues (RGA) and target region amplification polymorphism (TRAP). On average, the rate of polymorphism between the parental genotypes was 20.3%. We also searched for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in some AFLP bands and in seven gene fragments, and found one SNP every 87 bp. All SNPs were biallelic and occurred most frequently in putative gene fragments (81.5%) rather than in AFLP bands (60.0%) analyzed. Excellent gel profiles were obtained allowing the recognition of all types of segregation expected for a progeny of an outcrossing species. Multipoint linkage analysis was performed using OneMap software, with logarithm of the odds (LOD) score ≥ 5.6 and recombination fraction <0.5. The resulting integrated map consists of 549 markers, 2.0% of w... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Maracujá; Marcador genético; Marcador molecular; Melhoramento genético vegetal; Polimorfismo Genético. |
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Thesaurus NAL: |
Genetic improvement; Genetic markers; Genetic polymorphism; Passiflora alata; Passion fruits. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02903naa a2200373 a 4500
001 1973873
005 2014-12-10
008 2013 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a0003-4746
024 7 $a10.1111/aab.12028$2DOI
100 1 $aPEREIRA, G. S.
245 $aMolecular polymorphism and linkage analysis in sweet passion fruit, an outcrossing species.
260 $c2013
520 $aOne of the current challenges of tropical fruit crop improvement is to incorporate molecular marker-based approaches into conventional breeding programmes. This study was designed to build an integrated genetic map of the sweet passion fruit (Passiflora alata), a diploid (2n = 18) outcrossing species which is greatly appreciated for in natura consumption, and reported to inspire cosmetic and pharmaceutical companies to create plant-derived compounds. With this in mind, a full-sib family of 180 individuals was genotyped using different molecular marker types, such as amplified fragment length polymorphisms (AFLP), microsatellite-AFLP (M-AFLP), simple sequence repeats (SSR), resistance gene analogues (RGA) and target region amplification polymorphism (TRAP). On average, the rate of polymorphism between the parental genotypes was 20.3%. We also searched for single nucleotide polymorphisms (SNPs) in some AFLP bands and in seven gene fragments, and found one SNP every 87 bp. All SNPs were biallelic and occurred most frequently in putative gene fragments (81.5%) rather than in AFLP bands (60.0%) analyzed. Excellent gel profiles were obtained allowing the recognition of all types of segregation expected for a progeny of an outcrossing species. Multipoint linkage analysis was performed using OneMap software, with logarithm of the odds (LOD) score ≥ 5.6 and recombination fraction <0.5. The resulting integrated map consists of 549 markers, 2.0% of which fit a segregation ratio of 1:1:1:1, 1.3% a ratio of 1:2:1, 27.3% a ratio of 3:1 and 69.4% a ratio of 1:1. The map spanned a total of 2073.0 cM, with an average distance between adjacent markers of 3.8 cM. This is the first linkage study on sweet passion fruit and should prove useful for quantitative trait loci mapping.
650 $aGenetic improvement
650 $aGenetic markers
650 $aGenetic polymorphism
650 $aPassiflora alata
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700 1 $aLAPERUTA, L. D. C.
700 1 $aBRAGA, M. F.
700 1 $aPENHA, H. A.
700 1 $aDINIZ, A. L.
700 1 $aMUNHOZ, C. F.
700 1 $aGAZAFFI, R.
700 1 $aGARCIA, A. A. F.
700 1 $aVIEIRA, M. L. C.
773 $tAnnals of Applied Biology$gv. 162, n. 3, p. 347-361, 2013.
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