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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
03/12/2021 |
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Data da última atualização: |
03/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OGBONNA, A. C.; ANDRADE, L. R. B. de; MUELLER, L. A.; OLIVEIRA, E. J. de; BAUCHET, G. J. |
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Afiliação: |
ALEX C. OGBONNA, Cornell University; LUCIANO ROGERIO BRAATZ DE ANDRADE; LUKAS A. MUELLER, Cornell University; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; GUILLAUME J. BAUCHET, Boyce Thompson Institute for Plant Research. |
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Título: |
Comprehensive genotyping of a Brazilian cassava (Manihot esculenta Crantz) germplasm bank: insights into diversification and domestication. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v.134, P.1343-1362, 2021. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cassava (Manihot esculenta Crantz) is a major staple root crop of the tropics, originating from the Amazonian region. In this study, 3354 cassava landraces and modern breeding lines from the Embrapa Cassava Germplasm Bank (CGB) were characterized. All individuals were subjected to genotyping-by-sequencing (GBS), identifying 27,045 single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Identity-by-state and population structure analyses revealed a unique set of 1536 individuals and 10 distinct genetic groups with heterogeneous linkage disequilibrium (LD). On this basis, a density of 1300?4700 SNP markers were selected for large-effect quantitative trait loci (QTL) detection. Identified genetic groups were further characterized for population genetics parameters including minor allele frequency (MAF), observed heterozygosity (Ho), effective population size estimate (Ne?) and polymorphism information content (PIC). Selection footprints and introgressions of M. glaziovii were detected. Spatial population structure analysis revealed five ancestral populations related to distinct Brazilian ecoregions. Estimation of historical relationships among identified populations suggests an early population split from Amazonian to Atlantic forest and Caatinga ecoregions and active gene flows. This study provides a thorough genetic characterization of ex situ germplasm resources from cassava?s center of origin, South America, with results shedding light on Brazilian cassava characteristics and its biogeographical landscape. These findings support and facilitate the use of genetic resources in modern breeding programs including implementation of association mapping and genomic selection strategies. MenosCassava (Manihot esculenta Crantz) is a major staple root crop of the tropics, originating from the Amazonian region. In this study, 3354 cassava landraces and modern breeding lines from the Embrapa Cassava Germplasm Bank (CGB) were characterized. All individuals were subjected to genotyping-by-sequencing (GBS), identifying 27,045 single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Identity-by-state and population structure analyses revealed a unique set of 1536 individuals and 10 distinct genetic groups with heterogeneous linkage disequilibrium (LD). On this basis, a density of 1300?4700 SNP markers were selected for large-effect quantitative trait loci (QTL) detection. Identified genetic groups were further characterized for population genetics parameters including minor allele frequency (MAF), observed heterozygosity (Ho), effective population size estimate (Ne?) and polymorphism information content (PIC). Selection footprints and introgressions of M. glaziovii were detected. Spatial population structure analysis revealed five ancestral populations related to distinct Brazilian ecoregions. Estimation of historical relationships among identified populations suggests an early population split from Amazonian to Atlantic forest and Caatinga ecoregions and active gene flows. This study provides a thorough genetic characterization of ex situ germplasm resources from cassava?s center of origin, South America, with results shedding light on Brazilian cassava characteristics and its biogeogra... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Mandioca. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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520 $aCassava (Manihot esculenta Crantz) is a major staple root crop of the tropics, originating from the Amazonian region. In this study, 3354 cassava landraces and modern breeding lines from the Embrapa Cassava Germplasm Bank (CGB) were characterized. All individuals were subjected to genotyping-by-sequencing (GBS), identifying 27,045 single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Identity-by-state and population structure analyses revealed a unique set of 1536 individuals and 10 distinct genetic groups with heterogeneous linkage disequilibrium (LD). On this basis, a density of 1300?4700 SNP markers were selected for large-effect quantitative trait loci (QTL) detection. Identified genetic groups were further characterized for population genetics parameters including minor allele frequency (MAF), observed heterozygosity (Ho), effective population size estimate (Ne?) and polymorphism information content (PIC). Selection footprints and introgressions of M. glaziovii were detected. Spatial population structure analysis revealed five ancestral populations related to distinct Brazilian ecoregions. Estimation of historical relationships among identified populations suggests an early population split from Amazonian to Atlantic forest and Caatinga ecoregions and active gene flows. This study provides a thorough genetic characterization of ex situ germplasm resources from cassava?s center of origin, South America, with results shedding light on Brazilian cassava characteristics and its biogeographical landscape. These findings support and facilitate the use of genetic resources in modern breeding programs including implementation of association mapping and genomic selection strategies.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
21/09/2015 |
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Data da última atualização: |
21/09/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, W. H. da; GUIMARAES, T. G.; ROCHA, J. C. C. G.; XAVIER, J. H. V.; GASTAL, M. L. |
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Afiliação: |
WARLEY HENRIQUE DA SILVA, INESC UNAÍ; TADEU GRACIOLLI GUIMARAES, CPAC; JOSE CARLOS COSTA GONCALVES ROCHA, CPAC; JOSE HUMBERTO VALADARES XAVIER, CPAC; MARCELO LEITE GASTAL, CPAC. |
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Título: |
Validação de tecnologia na agricultura familiar: estudo de caso acerca de cultivo de frutas, hortaliças e cultivos anuais em consórcios irrigados. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO, 10., 2014, Foz do Iguaçu. Anais... Foz do Iguaçu: Sociedade Brasileira de Sistemas de Produção, 2014. |
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Páginas: |
p. 231-236. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Este trabalho tem como objetivo analisar os resultados obtidos por meio da introdução/validação de um sistema de cultivo de produção de frutas, hortaliças e cultivos anuais em consórcios irrigados, no contexto de um sistema de produção de agricultura familiar, localizado no município de Unaí-MG. A análise dos resultados alcançados foi realizada por meio dos seguintes indicadores: a) Produtividade Geral - PG; b) Produto Bruto - PB; c) Consumo Intermediário - CI e; d) Valor Agregado Bruto - VAB. Os resultados obtidos foram positivos (VAB = R$ 670,71), o que demonstra que o agricultor foi capaz de adaptar a proposta às suas características específicas. Salienta-se que os resultados podem melhorar desde que sejam tomadas precauções relacionadas aos aspectos técnicos.Atenção deve ser dada aos gastos no primeiro ano agrícola para garantir que haja rentabilidade, principalmente nos sistemas de produção com características semelhantes ao sistema em questão. Abstract: This work aims to analyze the technical and economical results obtained through the introduction of irrigation based system on the production of fruits, vegetables and annual crops in family farm, located in the municipal district of Unaí-MG. The analysis was accomplished through the following indicators: a) General Productivity - PG; b) Gross Product - PB; c) Costs - CI and; d) Gross Aggregated Value - VAB. The results were positive (VAB = R$ 670,71), which demonstrate that the farmerswere able to adapt the proposal fortheir specific characteristics. It is important to note that the results wouldimproveif precautions related to the technical aspects were taken. Especial Attention should be given to the costs developed in the first agricultural yearin order to guarantee that there is profitability, especially in the production systems whose characteristics are similar to the system in subject. MenosEste trabalho tem como objetivo analisar os resultados obtidos por meio da introdução/validação de um sistema de cultivo de produção de frutas, hortaliças e cultivos anuais em consórcios irrigados, no contexto de um sistema de produção de agricultura familiar, localizado no município de Unaí-MG. A análise dos resultados alcançados foi realizada por meio dos seguintes indicadores: a) Produtividade Geral - PG; b) Produto Bruto - PB; c) Consumo Intermediário - CI e; d) Valor Agregado Bruto - VAB. Os resultados obtidos foram positivos (VAB = R$ 670,71), o que demonstra que o agricultor foi capaz de adaptar a proposta às suas características específicas. Salienta-se que os resultados podem melhorar desde que sejam tomadas precauções relacionadas aos aspectos técnicos.Atenção deve ser dada aos gastos no primeiro ano agrícola para garantir que haja rentabilidade, principalmente nos sistemas de produção com características semelhantes ao sistema em questão. Abstract: This work aims to analyze the technical and economical results obtained through the introduction of irrigation based system on the production of fruits, vegetables and annual crops in family farm, located in the municipal district of Unaí-MG. The analysis was accomplished through the following indicators: a) General Productivity - PG; b) Gross Product - PB; c) Costs - CI and; d) Gross Aggregated Value - VAB. The results were positive (VAB = R$ 670,71), which demonstrate that the farmerswere able to adapt the proposal fo... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Sistemas de produção; Validação de tecnologia. |
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Thesagro: |
Agricultura Familiar. |
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Categoria do assunto: |
E Economia e Indústria Agrícola |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/130051/1/34719.pdf
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Marc: |
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300 $ap. 231-236.
520 $aEste trabalho tem como objetivo analisar os resultados obtidos por meio da introdução/validação de um sistema de cultivo de produção de frutas, hortaliças e cultivos anuais em consórcios irrigados, no contexto de um sistema de produção de agricultura familiar, localizado no município de Unaí-MG. A análise dos resultados alcançados foi realizada por meio dos seguintes indicadores: a) Produtividade Geral - PG; b) Produto Bruto - PB; c) Consumo Intermediário - CI e; d) Valor Agregado Bruto - VAB. Os resultados obtidos foram positivos (VAB = R$ 670,71), o que demonstra que o agricultor foi capaz de adaptar a proposta às suas características específicas. Salienta-se que os resultados podem melhorar desde que sejam tomadas precauções relacionadas aos aspectos técnicos.Atenção deve ser dada aos gastos no primeiro ano agrícola para garantir que haja rentabilidade, principalmente nos sistemas de produção com características semelhantes ao sistema em questão. Abstract: This work aims to analyze the technical and economical results obtained through the introduction of irrigation based system on the production of fruits, vegetables and annual crops in family farm, located in the municipal district of Unaí-MG. The analysis was accomplished through the following indicators: a) General Productivity - PG; b) Gross Product - PB; c) Costs - CI and; d) Gross Aggregated Value - VAB. The results were positive (VAB = R$ 670,71), which demonstrate that the farmerswere able to adapt the proposal fortheir specific characteristics. It is important to note that the results wouldimproveif precautions related to the technical aspects were taken. Especial Attention should be given to the costs developed in the first agricultural yearin order to guarantee that there is profitability, especially in the production systems whose characteristics are similar to the system in subject.
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653 $aValidação de tecnologia
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Embrapa Cerrados (CPAC) |
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