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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
11/04/2013 |
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Data da última atualização: |
12/07/2016 |
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Autoria: |
ANDERLINI, G. A.; FARIA, E. B.; SILVA, A. M. da; PINHEIRO JÚNIOR, J. W.; VALENÇA, R. M. B.; ANDERLINI, G. P. de O. e S.; MOTA, R. A. |
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Título: |
Prevalência de anticorpos anti-Neospora caninum em caprinos no estado de Alagoas, Brasil. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Veterinária e Zootecnia, v. 18, n. 4, p. 583-590, dez., 2011. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: Objetivou-se com este estudo determinar a prevalência de anticorpos anti-Neospora caninum em caprinos no estado de Alagoas, Brasil, além de identificar os fatores de risco associados à infecção pelo parasito. A pesquisa foi realizada em dez municípios, dos quais foram analisadas 24 propriedades de produção caprina com animais de aptidão mista. Foram coletadas amostras sanguíneas de 454 animais para pesquisa de anticorpos anti-N. caninum utilizando a técnica de Imunofluorescência Indireta. Em cada propriedade foi aplicado questionário investigativo com questões referentes ao sistema de produção e manejo nutricional, reprodutivo e sanitário. A soroprevalência encontrada foi de 5,3% com 62,5% das propriedades apresentando pelo menos um animal positivo. Não foi observada associação significativa para as variáveis referentes aos fatores de risco pesquisados. A existência de focos de infecção nas diferentes Mesorregiões do estado indica a presença de N. caninum nos rebanhos e a necessidade de diagnóstico do parasito em propriedades com histórico de distúrbios reprodutivos.
[Prevalence of antibodies anti-Neospora caninum in goats in the state of Alagoas, Brazil].
Abstract: The objective of this work was to determine the prevalence and identify the risks concerning to Neospora caninum infection in goats of the state of Alagoas, Brazil. The research was perfomed on 24 farms of goat breeding from ten municipalities. A total of 454 sera sample from goats were examined by anti-N. caninum antibodies using an indirect immunofluorescence antibody test (IFAT). All farm were also investigated by questionnaires about system of production, nutritional, reproductive and sanitary management. The serological prevalence was 5.3% with 62.5% of farms presenting at least one seropositive animal. No significant association was observed to variables of risck factors searched in this study. The existence of infection foci in different mesoregions of the State indicate presence of N. caninum in farms and importance of diagnosis of neosporosis in farms with reproductive problems. MenosResumo: Objetivou-se com este estudo determinar a prevalência de anticorpos anti-Neospora caninum em caprinos no estado de Alagoas, Brasil, além de identificar os fatores de risco associados à infecção pelo parasito. A pesquisa foi realizada em dez municípios, dos quais foram analisadas 24 propriedades de produção caprina com animais de aptidão mista. Foram coletadas amostras sanguíneas de 454 animais para pesquisa de anticorpos anti-N. caninum utilizando a técnica de Imunofluorescência Indireta. Em cada propriedade foi aplicado questionário investigativo com questões referentes ao sistema de produção e manejo nutricional, reprodutivo e sanitário. A soroprevalência encontrada foi de 5,3% com 62,5% das propriedades apresentando pelo menos um animal positivo. Não foi observada associação significativa para as variáveis referentes aos fatores de risco pesquisados. A existência de focos de infecção nas diferentes Mesorregiões do estado indica a presença de N. caninum nos rebanhos e a necessidade de diagnóstico do parasito em propriedades com histórico de distúrbios reprodutivos.
[Prevalence of antibodies anti-Neospora caninum in goats in the state of Alagoas, Brazil].
Abstract: The objective of this work was to determine the prevalence and identify the risks concerning to Neospora caninum infection in goats of the state of Alagoas, Brazil. The research was perfomed on 24 farms of goat breeding from ten municipalities. A total of 454 sera sample from goats were examined by anti-... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Prevalência; Sorodiagnóstico. |
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Thesagro: |
Anticorpo; Caprino; Doença animal; Neospora caninum; Neosporose. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
31/08/2022 |
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Data da última atualização: |
17/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
VIGNATO, B. S.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; MOREIRA, G. C. M.; POLETI, M. D.; PETRINI, J.; GARCIA, I. S.; CLEMENTE, L. G.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
BÁRBARA SILVA VIGNATO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; ALINE SILVA MELLO CESAR, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; JULIANA AFONSO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; MIRELE DAIANA POLETI, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; JULIANA PETRINI, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; INGRID SOARES GARCIA, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; LUAN GASPAR CLEMENTE, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; GERSON BARRETO MOURÃO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; LUIZ LEHMANN COUTINHO, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO. |
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Título: |
Integrative analysis between genome-wide association study and expression quantitative trait Loci reveals bovine muscle gene expression regulatory polymorphisms associated with intramuscular fat and backfat thickness. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, v. 13, 935238, aug. 2022. |
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Páginas: |
15 p. |
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DOI: |
10.3389/fgene.2022.935238 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Understanding the architecture of gene expression is fundamental to unravel the molecular mechanisms regulating complex traits in bovine, such as intramuscular fat content (IMF) and backfat thickness (BFT). These traits are economically important for the beef industry since they affect carcass and meat quality. Our main goal was to identify gene expression regulatory polymorphisms within genomic regions (QTL) associated with IMF and BFT in Nellore cattle. For that, we used RNA-Seq data from 193 Nellore steers to perform SNP calling analysis. Then, we combined the RNA-Seq SNP and a high-density SNP panel to obtain a new dataset for further genome-wide association analysis (GWAS), totaling 534,928 SNPs. GWAS was performed using the Bayes B model. Twenty-one relevant QTL were associated with our target traits. The expression quantitative trait loci (eQTL) analysis was performed using Matrix eQTL with the complete SNP dataset and 12,991 genes, revealing a total of 71,033 cis and 36,497 trans-eQTL (FDR < 0.05). Intersecting with QTL for IMF, we found 231 eQTL regulating the expression levels of 117 genes. Within those eQTL, three predicted deleterious SNPs were identified. We also identified 109 eQTL associated with BFT and affecting the expression of 54 genes. This study revealed genomic regions and regulatory SNPs associated with fat deposition in Nellore cattle. We highlight the transcription factors FOXP4, FOXO3, ZSCAN2, and EBF4, involved in lipid metabolism-related pathways. These results helped us to improve our knowledge about the genetic architecture behind important traits in cattle. MenosUnderstanding the architecture of gene expression is fundamental to unravel the molecular mechanisms regulating complex traits in bovine, such as intramuscular fat content (IMF) and backfat thickness (BFT). These traits are economically important for the beef industry since they affect carcass and meat quality. Our main goal was to identify gene expression regulatory polymorphisms within genomic regions (QTL) associated with IMF and BFT in Nellore cattle. For that, we used RNA-Seq data from 193 Nellore steers to perform SNP calling analysis. Then, we combined the RNA-Seq SNP and a high-density SNP panel to obtain a new dataset for further genome-wide association analysis (GWAS), totaling 534,928 SNPs. GWAS was performed using the Bayes B model. Twenty-one relevant QTL were associated with our target traits. The expression quantitative trait loci (eQTL) analysis was performed using Matrix eQTL with the complete SNP dataset and 12,991 genes, revealing a total of 71,033 cis and 36,497 trans-eQTL (FDR < 0.05). Intersecting with QTL for IMF, we found 231 eQTL regulating the expression levels of 117 genes. Within those eQTL, three predicted deleterious SNPs were identified. We also identified 109 eQTL associated with BFT and affecting the expression of 54 genes. This study revealed genomic regions and regulatory SNPs associated with fat deposition in Nellore cattle. We highlight the transcription factors FOXP4, FOXO3, ZSCAN2, and EBF4, involved in lipid metabolism-related pathways... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Backfat thickness; Carcass and meat quality; Expression quantitative trait loci; Intramuscular fat content; Nellore cattle; RNA Seq; SNP. |
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Thesaurus NAL: |
Nellore. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1145918/1/IntegrativeAnalysisGenome.pdf
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Marc: |
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100 1 $aVIGNATO, B. S.
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520 $aUnderstanding the architecture of gene expression is fundamental to unravel the molecular mechanisms regulating complex traits in bovine, such as intramuscular fat content (IMF) and backfat thickness (BFT). These traits are economically important for the beef industry since they affect carcass and meat quality. Our main goal was to identify gene expression regulatory polymorphisms within genomic regions (QTL) associated with IMF and BFT in Nellore cattle. For that, we used RNA-Seq data from 193 Nellore steers to perform SNP calling analysis. Then, we combined the RNA-Seq SNP and a high-density SNP panel to obtain a new dataset for further genome-wide association analysis (GWAS), totaling 534,928 SNPs. GWAS was performed using the Bayes B model. Twenty-one relevant QTL were associated with our target traits. The expression quantitative trait loci (eQTL) analysis was performed using Matrix eQTL with the complete SNP dataset and 12,991 genes, revealing a total of 71,033 cis and 36,497 trans-eQTL (FDR < 0.05). Intersecting with QTL for IMF, we found 231 eQTL regulating the expression levels of 117 genes. Within those eQTL, three predicted deleterious SNPs were identified. We also identified 109 eQTL associated with BFT and affecting the expression of 54 genes. This study revealed genomic regions and regulatory SNPs associated with fat deposition in Nellore cattle. We highlight the transcription factors FOXP4, FOXO3, ZSCAN2, and EBF4, involved in lipid metabolism-related pathways. These results helped us to improve our knowledge about the genetic architecture behind important traits in cattle.
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Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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