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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
01/06/2022 |
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Data da última atualização: |
01/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GLADMAN, N.; HUFNAGEL, B.; REGULSKI, M.; LIU, Z.; WANG, X.; CHOUGULE, K.; KOCHIAN, L.; MAGALHAES, J. V. de; WARE, D. |
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Afiliação: |
NICHOLAS GLADMAN, Cold Spring Harbor Laboratory; BARBARA HUFNAGEL, Centre National de la Recherche Scientifique, Montpellier; MICHAEL REGULSKI, Cold Spring Harbor Laboratory; ZHIGANG LIU, University of Saskatchewan; XIAOFEI WANG, Cold Spring Harbor Laboratory; KAPEEL CHOUGULE, Cold Spring Harbor Laboratory; LEON KOCHIAN, University of Saskatchewan; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS; DOREEN WARE, Cornell University. |
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Título: |
Sorghum root epigenetic landscape during limiting phosphorus conditions. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Direct, v. 6, n. 5, e393, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1002/pld3.393 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Efficient acquisition and use of available phosphorus from the soil is crucial for plant growth, development, and yield. With an ever-increasing acreage of croplands with suboptimal available soil phosphorus, genetic improvement of sorghum germplasm for enhanced phosphorus acquisition from soil is crucial to increasing agricultural output and reducing inputs, while confronted with a growing world population and uncertain climate. Sorghum bicolor is a globally important commodity for food, fodder, and forage. Known for robust tolerance to heat, drought, and other abiotic stresses, its capacity for optimal phosphorus use efficiency (PUE) is still being investigated for optimized root system architectures (RSA). Whilst a few RSA-influencing genes have been identified in sorghum and other grasses, the epigenetic impact on expression and tissue-specific activation of candidate PUE genes remains elusive. Here, we present transcriptomic, epigenetic, and regulatory network profiling of RSA modulation in the BTx623 sorghum background in response to limiting phosphorus (LP) conditions. We show that during LP, sorghum RSA is remodeled to increase root length and surface area, likely enhancing its ability to acquire P. Global DNA 5-methylcytosine and H3K4 and H3K27 trimethylation levels decrease in response to LP, while H3K4me3 peaks and DNA hypomethylated regions contain recognition motifs of numerous developmental and nutrient responsive transcription factors that display disparate expression patterns between different root tissues (primary root apex, elongation zone, and lateral root apex). MenosEfficient acquisition and use of available phosphorus from the soil is crucial for plant growth, development, and yield. With an ever-increasing acreage of croplands with suboptimal available soil phosphorus, genetic improvement of sorghum germplasm for enhanced phosphorus acquisition from soil is crucial to increasing agricultural output and reducing inputs, while confronted with a growing world population and uncertain climate. Sorghum bicolor is a globally important commodity for food, fodder, and forage. Known for robust tolerance to heat, drought, and other abiotic stresses, its capacity for optimal phosphorus use efficiency (PUE) is still being investigated for optimized root system architectures (RSA). Whilst a few RSA-influencing genes have been identified in sorghum and other grasses, the epigenetic impact on expression and tissue-specific activation of candidate PUE genes remains elusive. Here, we present transcriptomic, epigenetic, and regulatory network profiling of RSA modulation in the BTx623 sorghum background in response to limiting phosphorus (LP) conditions. We show that during LP, sorghum RSA is remodeled to increase root length and surface area, likely enhancing its ability to acquire P. Global DNA 5-methylcytosine and H3K4 and H3K27 trimethylation levels decrease in response to LP, while H3K4me3 peaks and DNA hypomethylated regions contain recognition motifs of numerous developmental and nutrient responsive transcription factors that display disparate ex... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Cromatina. |
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Thesagro: |
Deficiência; DNA; Fósforo; Metilação; Sistema Radicular; Sorghum Bicolor; Sorgo. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1143596/1/Sorghum-root-epigenetic-landscape.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
08/08/2014 |
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Data da última atualização: |
08/08/2014 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
MORAES, C. B. de; FREITAS, T. C. M. de; PIERONI, G. B.; RESENDE, M. D. V. de; ZIMBACK, L.; MORI, E. S. |
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Afiliação: |
CRISTIANO BUENO DE MORAES, FCA/UNESP; TALITHA CASELLA MOREIRA DE FREITAS, FCA/UNESP; GUSTAVO BLOISE PIERONI, Engenharia Florestal, Empresa Palmasola S.A.; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; LÉO ZIMBACK, Instituto Florestal do Estado de São Paulo; EDSON SEIZO MORI, FCA/UNESP. |
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Título: |
Estimativas de parâmetros genéticos para seleção precoce de clones de Eucalyptus para região com ocorrência de geadas. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientia Forestalis, Piracicaba, v. 42, n. 102, p. 219-227, jun. 2014. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Além de procurar o aumento da produtividade, a adaptação a solos e clima são também metas do melhoramento genético. Espécies perenes como Eucalyptus spp., possuem um ciclo muito longo e a ocorrência de geadas tornam seu cultivo limitante. O objetivo do estudo foi determinar a variabilidade genética de clones para plantio na região do município de Palma Sola, SC com eventos de geadas e determinar correlações genéticas entre idades de seleção. Um teste clonal foi instalado em 2008 no município de Palma Sola, SC no delineamento estatístico de blocos completos ao acaso, sendo avaliados 29 clones, seis repetições, seis plantas por parcela e espaçamento de 3,0 m x 3,0 m. Os caracteres silviculturais altura total de plantas, diâmetro à altura do peito (DAP) e volume de madeira foram avaliados aos 24, 36, 48 e 60 meses após o plantio. A análise de deviance e as estimativas dos parâmetros genéticos foram realizadas com base no procedimento genético estatístico REML/BLUP. Diferenças significativas foram observadas para todos os caracteres na análise de deviance. Correlações altas e significativas entre os caracteres foram observadas, indicando que a seleção precoce gerará ganhos significativos. Parte dos clones avaliados (USP/IPEF 64, USP/IPEF 78, USP/IPEF 52, USP/IPEF 68 e USP/IPEF 74) apresenta potencial para ser aproveitado no programa de melhoramento genético da empresa e em plantios comerciais na região onde se encontra o município de Palma Sola. |
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Palavras-Chave: |
Clone selection; Correlação; Espécie exótica; Improvement; Seleção de clones; Tolerância ao frio. |
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Thesagro: |
Eucalipto; Melhoramento. |
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Thesaurus NAL: |
cold tolerance; correlation; Eucalyptus. |
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Categoria do assunto: |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/106239/1/EstimativasParametros.pdf
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Marc: |
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520 $aAlém de procurar o aumento da produtividade, a adaptação a solos e clima são também metas do melhoramento genético. Espécies perenes como Eucalyptus spp., possuem um ciclo muito longo e a ocorrência de geadas tornam seu cultivo limitante. O objetivo do estudo foi determinar a variabilidade genética de clones para plantio na região do município de Palma Sola, SC com eventos de geadas e determinar correlações genéticas entre idades de seleção. Um teste clonal foi instalado em 2008 no município de Palma Sola, SC no delineamento estatístico de blocos completos ao acaso, sendo avaliados 29 clones, seis repetições, seis plantas por parcela e espaçamento de 3,0 m x 3,0 m. Os caracteres silviculturais altura total de plantas, diâmetro à altura do peito (DAP) e volume de madeira foram avaliados aos 24, 36, 48 e 60 meses após o plantio. A análise de deviance e as estimativas dos parâmetros genéticos foram realizadas com base no procedimento genético estatístico REML/BLUP. Diferenças significativas foram observadas para todos os caracteres na análise de deviance. Correlações altas e significativas entre os caracteres foram observadas, indicando que a seleção precoce gerará ganhos significativos. Parte dos clones avaliados (USP/IPEF 64, USP/IPEF 78, USP/IPEF 52, USP/IPEF 68 e USP/IPEF 74) apresenta potencial para ser aproveitado no programa de melhoramento genético da empresa e em plantios comerciais na região onde se encontra o município de Palma Sola.
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