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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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Data corrente: |
28/04/2021 |
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Data da última atualização: |
28/04/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CORNACINI, M. R.; MANOEL, R. O.; ALCANTARA, M. A. M.; MORAES, M. L. T.; SILVA, E. A. A.; PEREIRA NETO, L. G.; SEBBENN, A. M.; ROSSINI, B. C.; MARINO, C. L. |
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Afiliação: |
MAIARA R. CORNACINI, UNESP, Botucatu-SP; RICARDO O. MANOEL, UNESP, Botucatu-SP; MARCELO A. M. ALCANTARA, UNESP, Botucatu-SP; MARIO L. T. MORAES, UNESP, Ilha Solteira-SP; EDVALDO A. A. SILVA, UNESP, Botucatu-SP; LEONEL GONCALVES PEREIRA NETO, CNPASA; ALEXANDRE M. SEBBENN, INSTITUTO FLORESTAL DE SÃO PAULO, Piracicaba-SP; BRUNO C. ROSSINI, UNESP, Botucatu-SP; CELSO L. MARINO, UNESP, Botucatu-SP. |
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Título: |
Detection and application of novel SSR markers from transcriptome data for Astronium fraxinifolium Schott, a threatened Brazilian tree species. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, 2021. |
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ISSN: |
0301-4851 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-021-06338-5 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Astronium fraxinifolium is an endangered tree species from Brazil. Due to its significance in environmental reforestation, as well as the continued exploitation of its wood, it is necessary to develop management programs that support the conservation of the species. Simple sequence repeats (SSR) or microsatellite markers are widely used in population genetic studies across a range of diverse organisms. In this study, we present the first SSR markers developed for A. fraxinifolium as well as their frequency and distribution based on transcriptome data. From transcriptome data, we identified more than 100 thousand sequences presenting microsatellites, with a predominant distribution of trinucleotide repeats. From the initial screening, we selected 20 microsatellite loci which were validated and evaluated for genetic indices in two natural populations. All loci were polymorphic, ranging from four to 11 alleles per locus. The observed and expected heterozygosities ranged from 0 to 1.0 and from 0.533 to 1.0, respectively, while the genetic differentiation (GST = 0.363) was greater within than between populations. The developed SSR loci from RNA-Seq data provides a foundation for future studies on genetic diversity and population structure, mating system, and gene flow for A. fraxinifolium populations and related species, aiming at conservation and management. |
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Palavras-Chave: |
Conservation genetics; Microsatellite markers. |
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Thesagro: |
Anacardiaceae; Astronium Fraxinifolium. |
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Thesaurus Nal: |
Conservation plants; Genetic markers; Microsatellite repeats; Population genetics. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/222904/1/mbr-2021.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
30/04/2018 |
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Data da última atualização: |
22/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
RODRIGUES, J. D. B.; FERNANDES, J. R. Q.; CUNHA, R. L. M. da; TEIXEIRA, A. L.; ALVES, R. M. |
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Afiliação: |
Jardel Diego Barbosa Rodrigues, MESTRANDO UNESP; JOSE RAIMUNDO QUADROS FERNANDES, CPATU; Raimundo Lázaro Moraes da Cunha, UFRA; Amanda Lobato Teixeira, GRADUANDA UFRA; RAFAEL MOYSES ALVES, CPATU. |
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Título: |
Seleção de progênies de cupuaçuzeiro quanto as características biométricas e a taxa de geminação das sementes. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO AMAZÔNICO DE AGRÁRIAS, 9., 2017, Belém, PA. Anais... Belém, PA: UFRA, 2018. |
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Páginas: |
p. 969-974. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
IX ENAAG. |
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Conteúdo: |
O cupuaçuzeiro pode ser propagado por via sexuada ou assexuada, sendo a via seminífera o processo mais utilizado. A utilização de sementes de boa qualidade constitui fator determinante para o êxito do pomar, e o principal atributo de qualidade a ser considerado é a capacidade germinativa das sementes, bem como suas características biométricas. este contexto, objetivouse com o presente trabalho identificar materiais genéticos promissores quanto as características biométricas e a germinação de sementes de cupuaçuzeiro, para promover seleção precoce de progênies. O experimento foi conduzido em sementeira no período de março de 2015, na Embrapa Amazônia Oriental, Belém-PA, utilizando delineamento experimental em blocos casualizados com quatro repetições, constituídas por 10 sementes e 16 tratamentos. As variáveis avaliadas foram: largura (mm) comprimento (mm), espessura (mm), massa (g) das sementes frescas e taxa de germinação. O estudo identificou que os materiais 51 e 215 foram os mais promissores quanto a caracterização biométrica das sementes. Já as progênies 46 e 57 foram as que obtiveram menor destaque. Os materiais 32, 47, 48, 174 e 215 foram os que obtiveram 100% de germinação de plântulas normais. As progênies de maior massa foram as que obtiveram as melhores taxas de germinação. Diante disso, foi possível agrupar as progênies de cupuaçuzeiro, baseado em caracterização biométricas e germinação das sementes. |
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Palavras-Chave: |
Caracteres agronômicos; Materiais genéticos. |
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Thesagro: |
Cupuaçu; Semente; Theobroma Grandiflorum. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/176153/1/ANAIS-IX-ENAAG-19.pdf
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Marc: |
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100 1 $aRODRIGUES, J. D. B.
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500 $aIX ENAAG.
520 $aO cupuaçuzeiro pode ser propagado por via sexuada ou assexuada, sendo a via seminífera o processo mais utilizado. A utilização de sementes de boa qualidade constitui fator determinante para o êxito do pomar, e o principal atributo de qualidade a ser considerado é a capacidade germinativa das sementes, bem como suas características biométricas. este contexto, objetivouse com o presente trabalho identificar materiais genéticos promissores quanto as características biométricas e a germinação de sementes de cupuaçuzeiro, para promover seleção precoce de progênies. O experimento foi conduzido em sementeira no período de março de 2015, na Embrapa Amazônia Oriental, Belém-PA, utilizando delineamento experimental em blocos casualizados com quatro repetições, constituídas por 10 sementes e 16 tratamentos. As variáveis avaliadas foram: largura (mm) comprimento (mm), espessura (mm), massa (g) das sementes frescas e taxa de germinação. O estudo identificou que os materiais 51 e 215 foram os mais promissores quanto a caracterização biométrica das sementes. Já as progênies 46 e 57 foram as que obtiveram menor destaque. Os materiais 32, 47, 48, 174 e 215 foram os que obtiveram 100% de germinação de plântulas normais. As progênies de maior massa foram as que obtiveram as melhores taxas de germinação. Diante disso, foi possível agrupar as progênies de cupuaçuzeiro, baseado em caracterização biométricas e germinação das sementes.
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650 $aSemente
650 $aTheobroma Grandiflorum
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653 $aMateriais genéticos
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700 1 $aCUNHA, R. L. M. da
700 1 $aTEIXEIRA, A. L.
700 1 $aALVES, R. M.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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