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1.Imagem marcado/desmarcadoPARIS, C. L. Automatic documentation generation: including examples. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON ARTIFICIAL INTELLIGENCE, 12., 1995, Campinas. Advances in artificial intelligence: proceedings. Berlin: Springer, 1995. p.12-25 (Lecture Notes in Artificial Intelligence, 991; Lecture Notes in Computer Science). SBIA'95. Ed. by Jacques Wainer and Ariadne Carvalho.

Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.

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2.Imagem marcado/desmarcadoPÁRIS, C.; GRIGOLETTI JÚNIOR, A. Comparação morfológica entre conídios de oídio isolados de Eucalipto, Dália e Roseira. In: EVENTO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA FLORESTAS, 5., 2006, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2006. 1 CD-ROM (Embrapa Florestas. Documentos, 132). EVINCI. Resumo 039.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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3.Imagem marcado/desmarcadoPÁRIS, C.; GRIGOLETTI JUNIOR, A. Podridão de raízes em mudas de Pinus taeda. In: EVENTO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA FLORESTAS, 5., 2006, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2006. 1 CD-ROM (Embrapa Florestas. Documentos, 132). EVINCI. Resumo 041.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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4.Imagem marcado/desmarcadoASPIRAS, R. B.; DELA CRUZ, A. R.; PARIS, C. B. Dinitrogen fixation by nodulated non-legumes occurring at high elevations in the Philippines. J. Biol., v.10, n.2, p.321-324, 1981.

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.

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5.Imagem marcado/desmarcadoASPIRAS, R. B.; PARIS, C. B.; DELA CRUZ, A. R. Dinitrogen fixation in root nodules of gymnosperms in the Philippines. J. Biol., v.10, n.2, p.334-336, 1981.

Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia.

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6.Imagem marcado/desmarcadoGRIGOLETTI JÚNIOR, A.; PARIS, C.; AUER, C. G. Doença em mudas de Pinus. Revista da Madeira, Curitiba, v. 21, n. 125, p. 30-31, 2010.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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7.Imagem marcado/desmarcadoGRIGOLETTI JÚNIOR, A.; PARIS, C.; AUER, C. G. Fusariose em mudas de Pinus taeda. Boletim de Pesquisa Florestal, Colombo, n. 52, p. 157-162, jan./jun. 2006. Nota técnica.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br.

Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  30/12/2019
Data da última atualização:  06/02/2024
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  SBARDELLA, A. P.; WELLER, M. M. D. C. A.; I. FONSECA; N. B. STAFUZZA; P. A. BERNARDES; F. F. e SILVA; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; D. P. MUNARI.
Afiliação:  A. P. SBARDELLA; M. M. D. C. A. WELLER; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL.
Título:  Ribonucleic acid sequencing differential gene expression analysis of isolated perfused bovine udders experimentally inoculated with Streptococcus agalactiae.
Ano de publicação:  2019
Fonte/Imprenta:  Journal of Dairy Science, v. 102, n. 2, p. 1761-1767, 2019.
DOI:  https://doi.org/10.3168/jds.2018-15516
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  The aim of this study was to elucidate the differential gene expression in the RNA sequencing transcriptome of isolated perfused udders collected from 4 slaughtered Holstein × Zebu crossbred dairy cows experimentally inoculated with Streptococcus agalactiae. We studied 3 different statistical tools (edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2). In summary, 2 quarters of each udder were experimentally inoculated with Strep. agalactiae and the other 2 were used as a control. Mammary tissue biopsies were collected at times 0 and 3 h after infection. The total RNA was extracted and sequenced on an Illumina HiSeq 2000 (Illumina Inc., San Diego, CA). Transcripts were assembled from the reads aligned to the bovine UMD 3.1 reference genome, and the statistical analyses were performed using the previously mentioned tools (edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2). Finally, the identified genes were submitted to pathway enrichment analysis. A total of 1,756, 1,161, and 3,389 genes with differential gene expression were identified when using edgeR, baySeq, and Cuffdiff 2, respectively. A total of 122 genes were identified by the overlapping of the 3 methods; however, only the platelet activation presented a significantly enriched pathway. From the results, we suggest the FCER1G, GNAI2, ORAI1, and VASP genes shared among the 3 methods in this pathway for posterior biological validation.
Palavras-Chave:  BaySeq; Crossbred dairy cow; Cuffdiff 2; EdgeR; RNA sequencing.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPGL24917 - 1UPCAP - DD
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