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| Registros recuperados : 260 | |
| 61. |  | EGITO, A. A. do; BARRERA, G.; CUARTAS, P.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; MARIANTE, A. da S. Análise preliminar da relação existente entre raças Crioulas colombianas e Brasileiras mediante o uso de marcadores microssatélites. In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 10., 2009, Palmira. Memorias... Palmira, Colombia: Universidad Nacional de Colombia, 2009. p. 430-433| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 62. | | DAURIA, B. D.; FERRAZ, A. L. J.; EGITO, A. A. do; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D. Caracterização genética de raças zebuínas e taurinas e sua aplicação na determinação da composição racial de animais cruzados. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213). 2 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 63. | | GODOY, A. P. de J.; LIMA, T. P. C.; JULIANO, R. S.; OLIVEIRA, M. V. M.; EGITO, A. A. do. Desenvolvimento de ferramenta molecular para a análise e certificação racial de bovinos da raça Pantaneira. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 12., 2016, Campo Grande, MS. Anais... Brasília, DF: Embrapa Gado de Corte, 2016. 112 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 227). Comissão organizadora: Marta Pereira da Silva - Coordenadora; Mateus Figueiredo Santos - Vice-Coordenador; Rodrigo Carvalho Alva - Secretário Executivo e Editoração.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 64. | | BEM, A. R. de; FREITAS, V. C.; SOUSA, R. V.; RUMPF, R.; EGITO, A. A. do; PEGORARO-RUMPF,L.M. Criopreservacao de ovocitos imaturos de bovinos utilizando como crioprotetor o propanediol. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE TRANSFERENCIA DE EMBRIOES,7., 1992, Jaboticabal. Anais... [S.l.: s.n.], 1992. p.94.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 65. | | ALMEIDA, L. D. de; MARIANTE, A. da S.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; OLIVEIRA, J. V.; EGITO, A. A. do. Evidências genéticas da origem das raças de asininos criadas no Brasil. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.491.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 66. | | WALKER, C. C.; MORAIS, M. G.; FEIJO, G. L. D.; ALVES, F. V.; EGITO, A. A. do. Frequência alélica de polimorfismos do gene estearoil-coa dessaturase (SCD1) em raças bovinas In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 68. | | BARRETO, C. F.; WALKER, C. C.; JULIANO, R. S.; RAMOS, A. F.; BARBOSA, E. A.; EGITO, A. A. do. Polimorfismo de base única (snp) no gene da tireoglobulina relacionado ao marmoreio cárneo em bovinos da raça pantaneira. In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 13., 2012, San Lorenzo, PY. Memorias. Asuncion : CEMIT, 2012. p. 118| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 69. | | FIORAVANTI, M. C. S.; JULIANO, R. S.; PIOVEZAN, U.; RAMOS, A. F.; ALVES, F. V.; EGITO, A. A. do. Rede Pró-Centro Oeste curraleiro pé-duro e pantaneiro: uma experiência de sucesso na conservação de recursos genéticos animais. In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 16., 2015, Villavicencio, Colombia. Iberoamérica compartirá experiencias y logros científicos: libro de resúmenes... Villavicencio, Colombia: Asocriollanos: Red Conbiand Co-lombia: Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, 2015. p. 57| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 70. | | FERNANDES, A. F.; OLIVEIRA, F. S.; WALKER, C.; AGIOVA, J. A.; FEIJO, G. L. D.; EGITO, A. A. do. Transferabilidade de SNPs em genes candidatos relacionados à termotolerância em bovinos para a espécie ovina-resultados preliminares In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 15., 2019, Campo Grande, MS. [Resumos dos trabalhos...]. Brasília, DF: Embrapa, 2019 80 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 264). Comitê Organizador: Marlene de Barros Coelho; Lenita Ramires dos Santos; Rodrigo Carvalho Alva; Lucimara Chiari; Thais Basso Amaral. p. 10-11| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 71. | | CASTRO, D.; PIRES, H.; LIMA, F.; COSTA, G.; EGITO, A. A. do; PIMENTEL, C.; COSTA, M.; FIORAVANTI, M. C. Ultrasound evaluation of Gluteus medius and Biceps femoris muscles of Curraleiro, Pantaneiro and Nellore bovine in feedlot. In: WORLD BUIATRICS CONGRESS, 26., 2010, Santiago. Proceedings... Santiago: Buatrics, 2010. 1 p.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 72. | | OLIVEIRA, F. S.; FERREIRA, A. B. R.; JULIANO, R. S.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; EGITO, A. A. do. Variabilidade do loco BoLA DRB3.2 em raças bovinas localmente adaptadas. In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 16., 2015, Villavicencio, Colombia. Iberoamérica compartirá experiencias y logros científicos: libro de resúmenes... Villavicencio, Colombia: Asocriollanos: Red Conbiand Co-lombia: Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, 2015. p. 82| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 73. | | NASCIMENTO, M. E. M.; MAZETO, C. M.; FERREIRA, A. B. R.; SOUSA, I. I.; MARTINI, E. A.; EGITO, A. A. do; FEIJO, G. L. D.; SIQUEIRA, F. Banco de DNA para prospecção e validação de marcadores moleculares associados a características de interesse econômico em bovinos de corte. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). p. 74-75| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Gado de Corte. |
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| 74. | | ALBUQUERQUE, M. do S. M.; EGITO, A. A. do; PAIVA, S. R.; MARIANTE, A. da S.; CASTRO, S. T. R.; BIAZIO, G. R. de; RAMOS, A. F. Bancos de ADN como herramienta para programas de gestión y conservación ex situ e in situ de recursos zoogenéticos. In: SIMPOSIO INTERNACIONAL DE RECURSOS GENETICOS PARA AMERICA LATINA Y EL CARIBE, 9., 2013, El Salvador. Memoria resúmenes. El Salvador, Centa, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 75. | | EGITO, A. A. do; MARTINEZ MARTINEZ, A.; FIORAVANTI, M. C. S.; JULIANO, R. S.; LANDI, V.; MOURA, M. I.; SILVA, M. C.; DELGADO, J. V. B. Similaridade genética entre rebanhos de bovinos Curraleiro Pé-Duro: implicações para a sua conservação. In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 16., 2015, Villavicencio, Colombia. Iberoamérica compartirá experiencias y logros científicos: libro de resúmenes. Villavicencio, Colombia: Asocriollanos: Red Conbiand Colombia: Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, 2015. p. 80.| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 76. | | MARIANTE, A. da S.; EGITO, A. A. do; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; PAIVA, S. R.; CASTRO, S. T. R.; MCMANUS, C. Situação atual da caracterização genética das diversas raças de animais domésticos ameaçadas de extinção do Brasil. In: CONGRESO DE LA FEDERACIÓN IBEROAMERICANA DE RAZAS CRIOLLAS Y AUTÓCTONAS, 7., 2005, Buenos Aires. La ganadería criolla, riqueza genética para el desarrollo sostenible de la agricultura y ganadería de Iberoamérica. [Buenos Aires]: Federación Iberoamericana de Razas Criollas y Autóctonas, 2005. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 77. | | OLIVEIRA, F. S.; LIMA, T. P. C.; FERRAZ, A. L. J.; FERREIRA, A. B. R.; SUNIGA, P. A. P.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do. Sequenciamento e diversidade do gene drb3.2 do complexo principal de histocompatibilidade (mhc) de bovinos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 40-41. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 78. | | SILVA, T. G. da; WALKER, C. C.; MORAIS, M. G.; COMPARING, M. A. S.; FEIJO, G. L. D.; ALVES, F. V.; EGITO, A. A. do. Genotipagem do SNP g. 10329T>C no gene estearoil-coa dessaturase (SCD1) relacionado a composição de ácidos graxos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 12., 2016, Campo Grande, MS. Anais... Brasília, DF: Embrapa Gado de Corte, 2016. 112 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 227). Comissão organizadora: Marta Pereira da Silva - Coordenadora; Mateus Figueiredo Santos - Vice-Coordenador; Rodrigo Carvalho Alva - Secretário Executivo e Editoração. p. 30-31| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 79. | | FONTEQUE, J. H.; TEIXEIRA, W. T.; FONTEQUE, G. V.; MARTINS, E.; MARTINS, V. M. V.; SAITO, M. E.; RAMOS, A. F.; EGITO, A. A. do. Hemograma e fibrinogênio em bezerros da raça Crioula Lageana e holandesa preta e branca nos primeiros seis meses de vida. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). CD-ROM| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 80. | | FONTEQUE, J. H.; TEIXEIRA, W. T.; FONTEQUE, G. V.; MARTINS, E.; MARTINS, V. M. V.; SAITO, M. E.; RAMOS, A. F.; EGITO, A. A. do. Hemograma e fibrinogênio em bezerros da raça crioula lageana e holandesa preta e branca nos primeiros seis meses de vida. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 550 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). Editora técnica Clara Oliveira Goedert. p. 9| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Registros recuperados : 260 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
10/02/2023 |
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Data da última atualização: |
14/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; EGITO, A. A. do; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. |
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Afiliação: |
ELISA PERIPOLLI, Universidade Estadual Paulista; NEDENIA BONVINO STAFUZZA, Centro de Pesquisa em Bovinos de Corte; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; ANDREA ALVES DO EGITO, CNPGC; FERNANDO BALDI, Universidade Estadual Paulista; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
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Título: |
Assessment of copy number variants in three Brazilian locally adapted cattle breeds using whole-genome re-sequencing data. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Animal Genetics, v. 54, n. 3, p. 254-270, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1111/age.13298 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Further characterization of genetic structural variations should strongly focus on small and endangered local breeds given their role in unraveling genes and structural variants underlying selective pressures and phenotype variation. A comprehensive genome-wide assessment of copy number variations (CNVs) based on whole-genome re-sequencing data was performed on three Brazilian locally adapted cattle breeds (Caracu Caldeano, Crioulo Lageano, and Pantaneiro) using the ARS-UCD1.2 genome assembly. Data from 36 individuals with an average coverage depth of 14.07× per individual was used. A total of 24?945 CNVs were identified distributed among the breeds (Caracu Caldeano = 7285, Crioulo Lageano = 7297, and Pantaneiro = 10 363). Deletion events were 1.75?2.07-fold higher than duplications, and the total length of CNVs is composed mostly of a high number of segments between 10 and 30?kb. CNV regions (CNVRs) are not uniformly scattered throughout the genomes (n = 463), and 105 CNVRs were found overlapping among the studied breeds. Functional annotation of the CNVRs revealed variants with high consequence on protein sequence harboring relevant genes, in which we highlighted the BOLA-DQB, BOLA-DQA5, CD1A, ?-defensins, PRG3, and ULBP21 genes. Enrichment analysis based on the gene list retrieved from the CNVRs disclosed over-represented terms (p?MenosFurther characterization of genetic structural variations should strongly focus on small and endangered local breeds given their role in unraveling genes and structural variants underlying selective pressures and phenotype variation. A comprehensive genome-wide assessment of copy number variations (CNVs) based on whole-genome re-sequencing data was performed on three Brazilian locally adapted cattle breeds (Caracu Caldeano, Crioulo Lageano, and Pantaneiro) using the ARS-UCD1.2 genome assembly. Data from 36 individuals with an average coverage depth of 14.07× per individual was used. A total of 24?945 CNVs were identified distributed among the breeds (Caracu Caldeano = 7285, Crioulo Lageano = 7297, and Pantaneiro = 10 363). Deletion events were 1.75?2.07-fold higher than duplications, and the total length of CNVs is composed mostly of a high number of segments between 10 and 30?kb. CNV regions (CNVRs) are not uniformly scattered throughout the genomes (n = 463), and 105 CNVRs were found overlapping among the studied breeds. Functional annotation of the CNVRs revealed variants with high consequence on protein sequence harboring relevant genes, in which we highlighted the BOLA-DQB, BOLA-DQA5, CD1A, ?-defensins, PRG3, and ULBP21 genes. Enrichment analysis based on the gene list retrieved from the CNVRs disclosed over-represented terms (p?Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Variação fenotípica. |
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Thesagro: |
Bovino; Gado Crioulo; Genoma; Raça. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151656/1/Assessment-of-copy-number-variants-in-three-Brazilian.pdf
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Marc: |
LEADER 02604naa a2200265 a 4500
001 2151656
005 2023-06-14
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1111/age.13298$2DOI
100 1 $aPERIPOLLI, E.
245 $aAssessment of copy number variants in three Brazilian locally adapted cattle breeds using whole-genome re-sequencing data.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aFurther characterization of genetic structural variations should strongly focus on small and endangered local breeds given their role in unraveling genes and structural variants underlying selective pressures and phenotype variation. A comprehensive genome-wide assessment of copy number variations (CNVs) based on whole-genome re-sequencing data was performed on three Brazilian locally adapted cattle breeds (Caracu Caldeano, Crioulo Lageano, and Pantaneiro) using the ARS-UCD1.2 genome assembly. Data from 36 individuals with an average coverage depth of 14.07× per individual was used. A total of 24?945 CNVs were identified distributed among the breeds (Caracu Caldeano = 7285, Crioulo Lageano = 7297, and Pantaneiro = 10 363). Deletion events were 1.75?2.07-fold higher than duplications, and the total length of CNVs is composed mostly of a high number of segments between 10 and 30?kb. CNV regions (CNVRs) are not uniformly scattered throughout the genomes (n = 463), and 105 CNVRs were found overlapping among the studied breeds. Functional annotation of the CNVRs revealed variants with high consequence on protein sequence harboring relevant genes, in which we highlighted the BOLA-DQB, BOLA-DQA5, CD1A, ?-defensins, PRG3, and ULBP21 genes. Enrichment analysis based on the gene list retrieved from the CNVRs disclosed over-represented terms (p?<?0.01) strongly associated with immunity and cattle resilience to harsh environments. Additionally, QTL associated with body conformation and dairy-related traits were also unveiled within the CNVRs. These results provide better understanding of the selective forces shaping the genome of such cattle breeds and identify traces of natural selection pressures by which these populations have been exposed to challenging environmental conditions.
650 $aBovino
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650 $aGenoma
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653 $aVariação fenotípica
700 1 $aSTAFUZZA, N. B.
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aPANETTO, J. C. do C.
700 1 $aEGITO, A. A. do
700 1 $aBALDI, F.
700 1 $aSILVA, M. V. G. B.
773 $tAnimal Genetics$gv. 54, n. 3, p. 254-270, 2023.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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