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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
28/08/2014 |
Data da última atualização: |
02/04/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
PERINI, P.; PASQUALI, G.; MARGIS-PINHEIRO, M.; OLIVEIRA, P. R. D. de; REVERS, L. F. |
Afiliação: |
Pâmela Perini; Giancarlo Pasquali; Márcia Margis-Pinheiro; PAULO RICARDO DIAS DE OLIVEIRA, CNPUV; LUIS FERNANDO REVERS, CNPUV. |
Título: |
Reference genes for transcriptional analysis of flowering and fruit ripening stages in apple (Malus 3 domestica Borkh.). |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Breeding, mar. 2014. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
DOI 10.1007/s11032-014-0078-3 |
Conteúdo: |
Apple (Malus 9 domestica Borkh.) is the most important deciduous tree fruit crop grown around the world. Comparisons of gene expression profiles from different tissues, conditions or cultivars are valuable scientific tools to better understand the gene expression changes behind important silvicultural and nutritional traits. However, the accuracy of techniques employed to access gene expression is dependent on the evaluation of stable reference genes for data normalization to avoid statistical significance undue or incorrect conclusions. The objective of this work was to select the best genes to be used as references for gene expression studies in apple trees by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Vegetative and reproductive tissues of the apple ??Gala?? cultivar were evaluated during their seasonal cycle of growth and dormancy. The expression of 23 traditional housekeeping genes or genes suggested as constitutive by microarray data was investigated. Tested combinations of primers allowed the specific amplification and the generation of suitable efficiency curves for gene expression studies by RT-qPCR. Gene stability was determined by two different statistical descriptors, geNorm and Norm-Finder. The known variable PAL gene expression was used to validate selected normalizers. Results obtained allowed us to conclude that MDH, SAND, THFS, TMp1 and WD40 are the best reference genes to accurately normalize the relative transcript abundances using RT-qPCR in various tissues of apple. MenosApple (Malus 9 domestica Borkh.) is the most important deciduous tree fruit crop grown around the world. Comparisons of gene expression profiles from different tissues, conditions or cultivars are valuable scientific tools to better understand the gene expression changes behind important silvicultural and nutritional traits. However, the accuracy of techniques employed to access gene expression is dependent on the evaluation of stable reference genes for data normalization to avoid statistical significance undue or incorrect conclusions. The objective of this work was to select the best genes to be used as references for gene expression studies in apple trees by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR). Vegetative and reproductive tissues of the apple ??Gala?? cultivar were evaluated during their seasonal cycle of growth and dormancy. The expression of 23 traditional housekeeping genes or genes suggested as constitutive by microarray data was investigated. Tested combinations of primers allowed the specific amplification and the generation of suitable efficiency curves for gene expression studies by RT-qPCR. Gene stability was determined by two different statistical descriptors, geNorm and Norm-Finder. The known variable PAL gene expression was used to validate selected normalizers. Results obtained allowed us to conclude that MDH, SAND, THFS, TMp1 and WD40 are the best reference genes to accurately normalize the relative transcript abundances u... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Expressão genética; Gala; Genes de referencia; RT-qPCR. |
Thesagro: |
Genetica vegetal; Maçã. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/107436/1/Perini2014-Reference-Genes-Apple.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Biblioteca |
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URL |
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| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
07/12/2015 |
Data da última atualização: |
17/03/2016 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SILVA, T. S.; FERREIRA, J. A. B.; DUARTE, S. de J.; LESSA, L. S.; LEDO, C. A. da S. |
Afiliação: |
THAIS SOARES SILVA, UFRB; JACQUELlNE ALVES BORGES FERREIRA, UFRB; SARA DE JESUS DUARTE, UFRB; LAURO SARAIVA LESSA, CPAF-AC; CARLOS ALBERTO DA SILVA LEDO, CNPMF. |
Título: |
Propagação vegetativa em estacas de espécies silvestres de manihot. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DE CIÊNCIA, TECNOLOGIA, INOVAÇÃO E CULTURA NO RECÔNCAVO DA BAHIA - RECONCITEC, 2., 2012, Cruz das Almas. Energias Renováveis, Educação, Tecnologia e Sociedade. Cruz das Almas, BA: UFRB, 2012. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A mandioca é uma das culturas mais difundidas no mundo. Sua importância social é maior em países onde os índices de desnutrição são mais elevados. O Brasil é o segundo maior produtor da cultura, perdendo apenas para a Nigéria. Porém, mesmo sendo um dos maiores produtores, nossas exportações são irrisórias quando comparadas com outros países de menor produção. Entre os fatores que contribuem para isso estão o alto consumo no mercado interno e baixa adoção de tecnologias para aumento de produtividade pelos produtores, além de estresses a fatores bióticos (pragas e doenças) e a fatores abióticos. |
Thesagro: |
Enraizamento; Mandioca; Melhoramento. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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