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| Registros recuperados : 417 | |
| 81. |  | GODOY, T. F.; SILVA, V. H.; TESSMANN, A. L.; PANDOLFI, J. R. C.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Adiponectin receptor 2 gene associated with bone traits in broiler chickens. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 39.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 82. | | ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; COUTINHO, L. L.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C. Análise integrada do transcriptoma e exoma revela novos genes relacionados ao acometimento de hérnia escrotal em suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador. Anais... Salvador: SBMA, 2019. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 83. | | MIYATA, M.; GASPARINI, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; CAMPOS, A. L.; REGITANO, L. C. de A. Associação entre o marcador microssatélite ILSTS011 e peso ao nascimento no cromossomo 14 (BTA14) de bovinos. In: SIMPÓSIO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO ANIMAL, 5., 2004, Pirassunuga, SP. Anais... Pirassunuga: SBMA, 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 84. | | SOUSA JUNIOR, L. P. B.; MEIRA, A. N.; COUTINHO, L. L.; MOURAO, G. B.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; PEDROSA, V. B.; PINTO, L. F. B. Associação de haplótipos do gene MSTN com atributos de carne em ovinos Santa Inês. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador, BA. Anais... Salvador: SBMA, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 85. | | SOUSA JUNIOR, L. P. B.; MEIRA, A. N.; COUTINHO, L. L.; MOURAO, G. B.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; PEDROSA, V. B.; PINTO, L. F. B. Associação de haplótipos do gene MyoD1 em atributos de carne de ovinos Santa Inês. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 13., 2019, Salvador, BA. Anais... Salvador: SBMA, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 86. | | SERRA, V.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Análise de qualidade de RNA para estudo do perfil transcriptômico de animais extremos para eficiência alimentar da raça Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 5., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste: Embrapa Instrumentação , 2013. p. 12 (Embrapa Pecuária Sudeste. Documentos, 110). Editado por Ana Rita de Araújo nogueira, simone Cristina Méo Nicura| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 87. | | NINOV, K.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; COLDEBELLA, A.; BERTOL, T. M.; CAETANO, A. R.; BELICUAS, S. N. J.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L. Análise de genes candidatos para características de produção e qualidade da carcaça em aves. In: COLDEBELLA, A.; SCHEUERMANN, G. N. (Ed.). Relatório dos projetos concluídos 2009. Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2009. cap. 4.1, p. 57-63. (Embrapa Suínos e Aves. Documentos, 138).| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 88. | | NINOV, K.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; COLDEBELLA, A.; BERTOL, T. M.; CAETANO, A. R.; JARDIM, S. N.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L. Análise de genes candidatos para características de produção e qualidade da carcaça em aves Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2009. p. 55-63| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 89. | | MACHADO, A. L.; MEIRA, A. N.; SOUSA JUNIOR, L. P. B.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; PINTO, L. F. B. Associação de polimorfismos no gene CAPN1 com atributos da carne em ovinos Santa Inês. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. p. 2083-2085.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 90. | | MACHADO, A. L.; MEIRA, A. N.; SOUSA JUNIOR, L. P. B.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; PINOT, L. F. B. Associação de polimorfismos no gene LEP com atributos de carne em ovinos Santa Inês. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. p. 2077-2079.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 91. | | SENES, B. B.; SOUSA JUNIOR, L. P. B.; MEIRA, A. N.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; MOURAO. G. B.; COUTINHO, L. L. C.; PINTO, L. F. B. Associação de polimorfismos no gene MSTN com atributos de carne em ovinos Santa Inês. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. p. 2098-2100.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 92. | | SOUSA JUNIOR, L. P. B.; MEIRA, A. N.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; PEDROSA, V. B.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; PINTO, L. F. B. Associação de polimorfismos no gene MyoD1 com atributos de carne em ovinos Santa Inês. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. p. 2053-2055.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 93. | | SOUSA JUNIOR, L. P. B.; MEIRA, A. N.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; PEDROSA, V. B.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; PINTO, L. F. B. Associação de polimorfismos no gene MyoG com atributos de carne em ovinos Santa Inês. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. p. 2047-2049.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 94. | | SOISA JUNIOR. L. P. B.; MEIRA, A. N.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; PEDROSA, V. B.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; PINTO, L. F. B. Associação de polimorfismos nos genes Myf5 e Myf6 com atributos de carne em ovinos Santa Inês. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. p. 2050-2052.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 95. | | BOSCHIERO, C.; CAMPOS, R. L. R.; AMBO, M.; ROSÁRIO, M. F.; NONES, K.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; MOURA, A. S. A. M. T. Associações entre marcadores microssatélites do cromossomo 13 e características de desempenho, carcaça e órgãos em galinhas. In: CONGRESSO LATINOAMERICANO DE AVICULTURA, 20., 2007, Porto Alegre. Memorias. Porto Alegre: UBA : FIERGS, 2007. p. 255-257. Projeto n. 01.02.10.210-10.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 97. | | SENES, B. B.; SOUSA JUNIOR, L. P. B.; MEIRA, A. N.; AZEVEDO, H. C.; MUNIZ, E. N.; MOURAO, G. B.; COUTINHO, L. L.; PINTO, L. F. B. Associações de polimorfismos nos genes GH e IGF1 e atributos da carne em ovinos Santa Inês. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 12.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 18.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO DE RUMINANTES, 5.; SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE FORRAGICULTURA E PASTAGENS, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE CONSERVAÇÃO E UTILIZAÇÃO DE RECURSOS GENÉTICOS ANIMAIS, 6.; SIMPÓSIO NORDESTINO SOBRE AMBIÊNCIA, BEM-ESTAR ANIMAL E CONVIVÊNCIA COM O SEMIÁRIDO, 1.; SIMPÓSIO IMPORTÂNCIA DAS PASTAGENS NATIVAS PARA A SUSTENTABILIDADE PECUÁRIA NO SEMIÁRIDO; FÓRUM DE COORDENADORES DE PROGRAMAS DE PÓS-GRADUAÇÃO EM ZOOTECNIA E RECURSOS PESQUEIROS DO NORDESTE, 7.; FÓRUM DE INTEGRAÇÃO ENTRE A ACADEMIA, AGENTES DE EXTENSÃO RURAL E PRODUTORES, 1. 2017, Juazeiro, BA. Construindo pontes entre o ensino, a pesquisa e a extensão: anais. Petrolina: Univasf: Embrapa Semiárido: Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia, Sertão de Pernambuco, 2017. p. 2095-2097.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 98. | | BOSCHIERO, C.; JORGE, E. C.; NINOV, K.; NONES, K.; ROSÁRIO, M. F. do; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C.; BURT, D. W.; MOURA, A. S. A. M. T. Association of IGF1 and KDM5A polymorphisms with performance, fatness and carcass traits in chickens. Journal of Applied Genetics, 6 dez. 2012. Projeto: 01.06.01.006.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 99. | | IBELLI, A. M. G.; FONGARO, G.; TESSMANN, A. L.; RIBEIRO, J. B.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Association of an InDel in the ghrelin gene with performance traits in a paternal broiler line. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: SBG, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 100. | | BOSCHIERO, C.; ROSÁRIO, M. F.; LEDUR, M. C.; CAMPOS, R. L. R.; AMBO, M.; COUTINHO, L. L.; MOURA, A. S. A. M. T. Associations between microsatellite markers and traits related to performance, carcass and organs in chickens International Journal of Poultry Science, v. 8, n. 7, p. 615-620. 2009. Disponível em: . Acesso em: 09 fev. 2010 Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| Registros recuperados : 417 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
13/07/2018 |
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Data da última atualização: |
13/07/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
MOREIRA, G. C. M.; GODOY, T. F.; BOSCHIERO, C.; CESAR, A. S. M.; REECY, J. M.; LEDUR, M. C.; GARRICK, D.; SILVA, V. H. da; CROOIJAMANS, R. P.; GROENEN, M. A. M.; COUTINHO, L. L. |
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Afiliação: |
GABRIEL COSTA MONTEIRO MOREIRA, ESALQ; THAÍS FERNANDA GODOY, ESALQ; CLARISSA BOSCHIERO, ESALQ; ALINE SILVA MELLO CESAR, ESALQ; JAMES M. REECY, Iowa State University; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA; DORIAN GARRICK, Massey University/New Zealand; VINICIUS H. da SILVA, Wageningen University/Swedish University of Agricultural Sciences; RICHAR P. CROOIJAMANS, Wageningen University; MARTIEN A. M. GROENEN, Wageningen University; LUIZ LEHMMAN COUTINHO, ESALQ. |
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Título: |
Integration of GWAS, CNV and sele ction signature reveals candidate genes for abdominal fat regulation in chickens. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Carcass fat content is an economically important trait in commercial chickens. The use of genome-wide high density SNPs may improve the power and resolution to identify QTLs, putative candidate genes and copy number variations (CNVs), for selection programs. The main goal of this study was to identify genomic windows and putative candidate genes for carcass fat content. We checked the overlap of QTL with regions demonstrating signatures of selection and inherited CNVs identified in the same population. A total of 497 42 day-old chickens from the EMBRAPA F2 Chicken Resource Population developed for QTL studies were genotyped with the 600K SNP genotyping array (Affymetrix®), and phenotyped for carcass fat content weight (CFCW) and carcass fat content on a dry matter basis (CFCDM). After quality control, a total of 480 samples and 371,557 SNPs annotated in autosomal chromosomes (GGA1-28) based on Gallus_gallus-5.0 (NCBI) were kept for further analysis. GWAS analyses were performed with GenSel software using BayesB method (π=0.9988) to identify genomic windows associated with CFCW or CFC%. We identified 15 genomic windows associated with CFC% on GGA1, 7, 15, 20 and 28, and from those, we identified two adjacent windows on GGA7 considered as the same QTL explaining 1.31 and 2.18% of the genetic variance for CFCW and CFC%, respectively. This QTL overlapped with one regions previsiouly know to regulate abdominal fat in chickens and the QTL region encompassed two putative candidate genes overlapping with signatures of selection and inherited CNVs. Our findings are helpful to better understand the genetic regulation of fatness in chickens. Resumo: O teor de gordura na carcaça é uma característica economicamente importante em frangos comerciais. O uso de SNPs de alta densidade em todo o genoma pode melhorar o poder e a resolução para identificar QTLs, genes candidatos putativos e variações no número de cópias (CNVs), para programas de seleção. O principal objetivo deste estudo foi identificar janelas genômicas e possíveis genes candidatos para o conteúdo de gordura na carcaça. Verificamos a sobreposição de QTL com regiões demonstrando assinaturas de seleção e CNVs herdadas identificadas na mesma população. Um total de 497 galinhas com 42 dias de idade da EMBRAPA F2 Chicken Resource Population desenvolvidas para estudos QTL foram genotipadas com o arranjo de genótipos SNP 600K (Affymetrix®) e fenotipadas para peso de gordura na carcaça (CFCW) e teor de gordura na carcaça seca. matéria básica (CFCDM). Após o controle de qualidade, um total de 480 amostras e 371.557 SNPs anotados em cromossomos autossômicos (GGA1-28) baseados em Gallus_gallus-5.0 (NCBI) foram mantidos para análise posterior. As análises de GWAS foram realizadas com o software GenSel usando o método de BayesB (π = 0,9988) para identificar janelas genômicas associadas ao CFCW ou CFC%. Foram identificadas 15 janelas genômicas associadas a% CFC em GGA1, 7, 15, 20 e 28 e, a partir delas, identificamos duas janelas adjacentes em GGA7 consideradas como os mesmos QTLs explicando 1,31 e 2,18% da variância genética para CFCW e CFC% , respectivamente. Este QTL se sobrepunha a uma das regiões previsamente conhecidas para regular a gordura abdominal em frangos e a região QTL englobava dois supostos genes candidatos que se sobrepunham com assinaturas de seleção e CNVs herdadas. Nossas descobertas são úteis para entender melhor a regulação genética da gordura em frangos. MenosAbstract: Carcass fat content is an economically important trait in commercial chickens. The use of genome-wide high density SNPs may improve the power and resolution to identify QTLs, putative candidate genes and copy number variations (CNVs), for selection programs. The main goal of this study was to identify genomic windows and putative candidate genes for carcass fat content. We checked the overlap of QTL with regions demonstrating signatures of selection and inherited CNVs identified in the same population. A total of 497 42 day-old chickens from the EMBRAPA F2 Chicken Resource Population developed for QTL studies were genotyped with the 600K SNP genotyping array (Affymetrix®), and phenotyped for carcass fat content weight (CFCW) and carcass fat content on a dry matter basis (CFCDM). After quality control, a total of 480 samples and 371,557 SNPs annotated in autosomal chromosomes (GGA1-28) based on Gallus_gallus-5.0 (NCBI) were kept for further analysis. GWAS analyses were performed with GenSel software using BayesB method (π=0.9988) to identify genomic windows associated with CFCW or CFC%. We identified 15 genomic windows associated with CFC% on GGA1, 7, 15, 20 and 28, and from those, we identified two adjacent windows on GGA7 considered as the same QTL explaining 1.31 and 2.18% of the genetic variance for CFCW and CFC%, respectively. This QTL overlapped with one regions previsiouly know to regulate abdominal fat in chickens and the QTL region encompassed two puta... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
600k snp genotyping array; Analyses were performed with GenSel; Genotyping by sequencing; Selection signatures. |
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Thesagro: |
Carcaça; Frango de Corte; Genoma; Gordura; Melhoramento Genético Animal; Polimorfismo Genético. |
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Thesaurus NAL: |
Abdominal fat; Animal genetic resources; Broiler chickens; Carcass characteristics; Genetic polymorphism; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/179774/1/final8887.pdf
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Marc: |
LEADER 04944nam a2200421 a 4500
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005 2018-07-13
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aMOREIRA, G. C. M.
245 $aIntegration of GWAS, CNV and sele ction signature reveals candidate genes for abdominal fat regulation in chickens.$h[electronic resource]
260 $aIn: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive.$c2018
520 $aAbstract: Carcass fat content is an economically important trait in commercial chickens. The use of genome-wide high density SNPs may improve the power and resolution to identify QTLs, putative candidate genes and copy number variations (CNVs), for selection programs. The main goal of this study was to identify genomic windows and putative candidate genes for carcass fat content. We checked the overlap of QTL with regions demonstrating signatures of selection and inherited CNVs identified in the same population. A total of 497 42 day-old chickens from the EMBRAPA F2 Chicken Resource Population developed for QTL studies were genotyped with the 600K SNP genotyping array (Affymetrix®), and phenotyped for carcass fat content weight (CFCW) and carcass fat content on a dry matter basis (CFCDM). After quality control, a total of 480 samples and 371,557 SNPs annotated in autosomal chromosomes (GGA1-28) based on Gallus_gallus-5.0 (NCBI) were kept for further analysis. GWAS analyses were performed with GenSel software using BayesB method (π=0.9988) to identify genomic windows associated with CFCW or CFC%. We identified 15 genomic windows associated with CFC% on GGA1, 7, 15, 20 and 28, and from those, we identified two adjacent windows on GGA7 considered as the same QTL explaining 1.31 and 2.18% of the genetic variance for CFCW and CFC%, respectively. This QTL overlapped with one regions previsiouly know to regulate abdominal fat in chickens and the QTL region encompassed two putative candidate genes overlapping with signatures of selection and inherited CNVs. Our findings are helpful to better understand the genetic regulation of fatness in chickens. Resumo: O teor de gordura na carcaça é uma característica economicamente importante em frangos comerciais. O uso de SNPs de alta densidade em todo o genoma pode melhorar o poder e a resolução para identificar QTLs, genes candidatos putativos e variações no número de cópias (CNVs), para programas de seleção. O principal objetivo deste estudo foi identificar janelas genômicas e possíveis genes candidatos para o conteúdo de gordura na carcaça. Verificamos a sobreposição de QTL com regiões demonstrando assinaturas de seleção e CNVs herdadas identificadas na mesma população. Um total de 497 galinhas com 42 dias de idade da EMBRAPA F2 Chicken Resource Population desenvolvidas para estudos QTL foram genotipadas com o arranjo de genótipos SNP 600K (Affymetrix®) e fenotipadas para peso de gordura na carcaça (CFCW) e teor de gordura na carcaça seca. matéria básica (CFCDM). Após o controle de qualidade, um total de 480 amostras e 371.557 SNPs anotados em cromossomos autossômicos (GGA1-28) baseados em Gallus_gallus-5.0 (NCBI) foram mantidos para análise posterior. As análises de GWAS foram realizadas com o software GenSel usando o método de BayesB (π = 0,9988) para identificar janelas genômicas associadas ao CFCW ou CFC%. Foram identificadas 15 janelas genômicas associadas a% CFC em GGA1, 7, 15, 20 e 28 e, a partir delas, identificamos duas janelas adjacentes em GGA7 consideradas como os mesmos QTLs explicando 1,31 e 2,18% da variância genética para CFCW e CFC% , respectivamente. Este QTL se sobrepunha a uma das regiões previsamente conhecidas para regular a gordura abdominal em frangos e a região QTL englobava dois supostos genes candidatos que se sobrepunham com assinaturas de seleção e CNVs herdadas. Nossas descobertas são úteis para entender melhor a regulação genética da gordura em frangos.
650 $aAbdominal fat
650 $aAnimal genetic resources
650 $aBroiler chickens
650 $aCarcass characteristics
650 $aGenetic polymorphism
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aCarcaça
650 $aFrango de Corte
650 $aGenoma
650 $aGordura
650 $aMelhoramento Genético Animal
650 $aPolimorfismo Genético
653 $a600k snp genotyping array
653 $aAnalyses were performed with GenSel
653 $aGenotyping by sequencing
653 $aSelection signatures
700 1 $aGODOY, T. F.
700 1 $aBOSCHIERO, C.
700 1 $aCESAR, A. S. M.
700 1 $aREECY, J. M.
700 1 $aLEDUR, M. C.
700 1 $aGARRICK, D.
700 1 $aSILVA, V. H. da
700 1 $aCROOIJAMANS, R. P.
700 1 $aGROENEN, M. A. M.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
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Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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