| |
|
|
| Registros recuperados : 474 | |
| 101. |  | ROSA, K. de O. da; TIZIOTO, P. C.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Seleção de genes candidatos a referência para estudos de expressão gênica por meio de análises de RNA-Seq e qPCR. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 6., 2014, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2014. p. 27. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 57) Editores técnicos: João de Mendonça Naime, Caue Ribeiro, Maria Alice Martins, Elaine Cristina Paris, Paulino Ribeiro Villas Boas, Ladislau Marcelino Rabello.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
|    |
| 103. | | MONTEIRO, J. P.; ZAROS, L. G.; SIDER, L. H.; TEIXEIRA, M.; COUTINHO, L. L.; VIEIRA, L. da S. Goat transcriptomics and gastrointestinal parasite resistance. In: SIMPÓSIO EMBRAPA LABEX EUA DE SANIDADE ANIMAL, 2., Brasília, 2012. Resumos... Brasília, DF: Embrapa Estudos e Capacitação, 2012. p. 147.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 104. | | PÉRTILLE, F.; ZANELLA, R.; FELÍCIO, A. M.; LEDUR, M. C.; PEIXOTO, J. de O.; COUTINHO, L. L. Identification of polymorphisms associated with production traits on chicken (Gallus gallus) chromosome 4. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 3, p. 10717-10728, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 105. | | FELÍCIO, A. M.; BOSCHIERO, C.; SILVA, N. A.; LEDUR, M. C.; JORGE, E. C.; COUTINHO, L. L. Identificação de polimorfismos nos genes MC4R, FGFBP1 e FGFBP2 em galinhas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010. Resumos. Guarujá: SBG , 2010. p. 80. Projeto/Plano de Ação: 01.06.10.602-02.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 106. | | COUTINHO, L. L.; JORGE, E. C.; ROSÁRIO, M. F. do; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C. Genômica animal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 17.; CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 9., 2007, Londrina, PR. Anais... Londrina: UEL/ ABZ, 2007. p.429-441 Projeto n. 01.02.102.10-10.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 108. | | ZIOBER, I. L.; PAIÃO, F. G.; MARCHI, D. F.; COUTINHO, L. L.; BINNECK, E.; NEPOMUCENO, A. L.; SHIMOKOMAKI, M. Heat and chemical stress modulate the expression of the alfa-RYR gene in broiler chickens. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 9, n. 2, p. 1258-1266, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
|  |
| 109. | | PEIXOTO, J. de O.; PERI, E.; COLDEBELLA, A.; TESSMANN, A. L.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Influence of the A286G polymorphism in the LEPR gene on carcass traits in a paternal broiler line. In: WORLD´S POULTRY CONGRESS, 24., 2012, Salvador. Abstract... Salvador: WSPA, 2012. 1 CD-ROM. World's Poultry Science Journal, v. 68, supl. 1, 2012. Projeto/Plano de Ação: 01.06.01.006.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 110. | | TREVISAN, L.; ATTILIO, D. B.; NINOV, K.; PADUAN, M.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; ROSÁRIO, M. F. do. Desenho e otimização de primers do gene FGF2 associado ao crescimento da galinha doméstica. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO, 20., 2012, Pirassununga. [Resumos]. São Paulo: USP, 2012. SIICUSP 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 111. | | ZANELLA, R.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Collaborative effort to identify genes involved with bone related traits in broiler chickens. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2013. P0640.| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 112. | | FAUSTO, D. A.; FERRAZ, A. L.; DELGADO, E. F.; ANDRADE, S. C. S.; COUTINHO, L. L.; FEIJO, G. L. D. Changes muscle gene expression profile in Bos indicus cows submitted to medium and high gain rates during recovery from undernutrition In: ANNUAL MEETING BRAZILIAN SOCIETY OF ANIMAL SCIENCE, 50., 2013, Campinas. The integration of Knowledge in animal production - abstracts. Campinas: SBZ, 2013 I CD ROM| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
| |
| 113. | | ROSA, A. J. M.; REGITANO, L. C. de A.; MERZEL, M.; PACKER, I. U.; RAZOOK, A. G.; COUTINHO, L. L. Polymorphism of growth hormone, microsatellite IGF-I and association with feedlot performance in Nelore cattle. Revista Brasileira de Genética, Ribeirao Preto, v.19, n.3 supl, p.297, 1996. Resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 115. | | NAKATA, L. C.; ZAROS, L. G.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, M. C. de S.; REGITANO, L. C. de A. Quantificação da expressão de IL-2, IL-12, MCP-1 em bovinos submetidos a infestação artificial por carrapatos Boophilus microplus (Acari: Ixodidae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA , 51., 2005, Águas de Lindóia. Lindóia: SBG, 2005. p. 104| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 117. | | CARVALHO, M. E.; GASPARIN, G.; SILVA, S. da L.; REGITANO, L. C. de A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L. Expressão de genes ligados à maciez da carne em bovinos da raça Nelore. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 119. | | REGITANO, L. C. de A.; AZEVEDO, J. L.; ROSA, A. J. M.; PACKER, I. U.; COUTINHO, L. L. Evidence of selection for growth hormone, microsatellites IGF-I and CSFM50 in Canchim bovine breed. Revista Brasileira de Genética, v.20, n.3, suppl., 1997, I.131, p.334.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 120. | | TAMBASCO, D. D.; JORGE, E.; ALENCAR, M. M. de; COUTINHO, L. L.; TABASCO, M. D.; REGITANO, L. C. de A. Evidência de alelo nulo para um loco microssatélite em uma amostra de Nelore. In: CONGRESSO NACIONAL DE GENETICA, 46., 2000, Aguas de Lindóia, SP. Anais... Aguas de Lindóia: SBG, 2000. Genetics and Molecular Brology, v.23, n.3, p.260-261, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
|  |
| Registros recuperados : 474 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
|
Data corrente: |
29/11/2019 |
|
Data da última atualização: |
02/12/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
SILVA, V. da; RAMOS, M.; GROENEN, M.; CROOIJMANS, R.; JOHANSSON, A.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L.; ZIMMER, R.; WALDRON, L.; GEISTLINGER, L. |
|
Afiliação: |
Vinicius da Silva, Wageningen University and Research; Marcel Ramos, Swedish University of Agricultural Sciences; Martien Groenen, Wageningen University and Research; Richard Crooijmans, Wageningen University and Research; Anna Johansson, Swedish University of Agricultural Sciences; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Luiz Coutinho, USP; Ralf Zimmer, Universität München; Levi Waldron, University of New York; Ludwig Geistlinger, University of New York. |
|
Título: |
CNVRanger: association analysis of CNVs with geneexpression and quantitative phenotypes. |
|
Ano de publicação: |
2020 |
|
Fonte/Imprenta: |
Bioinformatics, v. 36, n. 3, p. 972-973, 2020. |
|
DOI: |
10.1093/bioinformatics/btz632 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Copy number variation (CNV) is a major type of structural genomic variation that is increasingly studied acrossdifferent species for association with diseases and production traits. Established protocols for experimental detection andcomputational inference of CNVs from SNP array and next-generation sequencing data are available. We present theCNVRangerR/Bioconductor package which implements a comprehensive toolbox for structured downstream analysis ofCNVs. This includes functionality for summarizing individual CNV calls across a population, assessing overlap with func-tional genomic regions, and genome-wide association analysis with gene expression and quantitative phenotypes. |
|
Palavras-Chave: |
Expressão gênica; Fenótipos quantitativos; Genomic hybridization; Quantitative phenotypes; Structural genomic. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/218623/1/CNVRanger.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01575naa a2200301 a 4500
001 2115536
005 2020-12-02
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1093/bioinformatics/btz632$2DOI
100 1 $aSILVA, V. da
245 $aCNVRanger$bassociation analysis of CNVs with geneexpression and quantitative phenotypes.$h[electronic resource]
260 $c2020
520 $aCopy number variation (CNV) is a major type of structural genomic variation that is increasingly studied acrossdifferent species for association with diseases and production traits. Established protocols for experimental detection andcomputational inference of CNVs from SNP array and next-generation sequencing data are available. We present theCNVRangerR/Bioconductor package which implements a comprehensive toolbox for structured downstream analysis ofCNVs. This includes functionality for summarizing individual CNV calls across a population, assessing overlap with func-tional genomic regions, and genome-wide association analysis with gene expression and quantitative phenotypes.
653 $aExpressão gênica
653 $aFenótipos quantitativos
653 $aGenomic hybridization
653 $aQuantitative phenotypes
653 $aStructural genomic
700 1 $aRAMOS, M.
700 1 $aGROENEN, M.
700 1 $aCROOIJMANS, R.
700 1 $aJOHANSSON, A.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
700 1 $aCOUTINHO, L.
700 1 $aZIMMER, R.
700 1 $aWALDRON, L.
700 1 $aGEISTLINGER, L.
773 $tBioinformatics$gv. 36, n. 3, p. 972-973, 2020.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
