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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
29/11/2019 |
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Data da última atualização: |
02/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, V. da; RAMOS, M.; GROENEN, M.; CROOIJMANS, R.; JOHANSSON, A.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L.; ZIMMER, R.; WALDRON, L.; GEISTLINGER, L. |
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Afiliação: |
Vinicius da Silva, Wageningen University and Research; Marcel Ramos, Swedish University of Agricultural Sciences; Martien Groenen, Wageningen University and Research; Richard Crooijmans, Wageningen University and Research; Anna Johansson, Swedish University of Agricultural Sciences; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Luiz Coutinho, USP; Ralf Zimmer, Universität München; Levi Waldron, University of New York; Ludwig Geistlinger, University of New York. |
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Título: |
CNVRanger: association analysis of CNVs with geneexpression and quantitative phenotypes. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Bioinformatics, v. 36, n. 3, p. 972-973, 2020. |
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DOI: |
10.1093/bioinformatics/btz632 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Copy number variation (CNV) is a major type of structural genomic variation that is increasingly studied acrossdifferent species for association with diseases and production traits. Established protocols for experimental detection andcomputational inference of CNVs from SNP array and next-generation sequencing data are available. We present theCNVRangerR/Bioconductor package which implements a comprehensive toolbox for structured downstream analysis ofCNVs. This includes functionality for summarizing individual CNV calls across a population, assessing overlap with func-tional genomic regions, and genome-wide association analysis with gene expression and quantitative phenotypes. |
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Palavras-Chave: |
Expressão gênica; Fenótipos quantitativos; Genomic hybridization; Quantitative phenotypes; Structural genomic. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/218623/1/CNVRanger.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
24/02/2017 |
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Data da última atualização: |
17/05/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PORCIUNCULA, G. C. da; FISCHER, V.; COSTA, J. A. A. da; FERNANDES, P. B.; GRUSKA, J. F.; CATTO, J. B. |
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Afiliação: |
Gabriela Caillava da Porciuncula, Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) - RS.; Vivian Fischer, UFRGS - RS; JOSE ALEXANDRE AGIOVA DA COSTA, CNPC; Patrick Bezerra Fernandes, Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia Goiano - Campus Rio Verde, GO; João Francisco Gruska, Faculdade Integradas do Vale do Iguaçu (UNIGUAÇU) - PR; JOAO BATISTA CATTO, CNPGC. |
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Título: |
Utilização de componentes principais para avaliar o temperamento de "Ovelhas pantaneiras". |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO DE PESQUISA E PÓS-GRADUAÇÃO DO CAMPUS RIO VERDE, 5., 2016, Rio Verde. Anais. Rio Verde: Instituto Federal Goiano, Campus Rio Verde, 2016. 2 f. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Resumo: Objetivou-se determinar quais as características medidas no teste de arena estão associadas com ECM de ovelhas do Grupo Genético Pantaneiro. Foram utilizadas 126 ovelhas pertencentes a Embrapa Gado de Corte. Ovelhas com ECM <4 foram classificadas como ECM ruim e as ovelhas com >4 foram classificadas como ECM bom. O temperamento foi avaliado no Teste de Arena. Foi realizado uma análise descritiva dos dados. Os dados foram analisados através dos fatores principais. O ECM foi associado positivamente com a distância de fuga, idade e vocalizações de baixa intensidade, demonstrando que animais com ECM bom ficavam mais próximo ao observador e se apresentaram mais calmas frente a situações de estresse. Ovelhas com ECM >4 apresentam menor distância de fuga e mais número de vocalizações de baixa intensidade demonstrando um comportamento materno calmo menor agitação frente a situações de medo. |
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Palavras-Chave: |
Análise multivariada; Animal behaviour; ECM; Gado Pantaneiro; Grupo genético; Reatividade. |
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Thesagro: |
Comportamento animal; Método estatístico; Ovino. |
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Thesaurus NAL: |
Brazil; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/156722/1/cnpc-2016-Utilizacao-de-componentes.pdf
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Marc: |
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520 $aResumo: Objetivou-se determinar quais as características medidas no teste de arena estão associadas com ECM de ovelhas do Grupo Genético Pantaneiro. Foram utilizadas 126 ovelhas pertencentes a Embrapa Gado de Corte. Ovelhas com ECM <4 foram classificadas como ECM ruim e as ovelhas com >4 foram classificadas como ECM bom. O temperamento foi avaliado no Teste de Arena. Foi realizado uma análise descritiva dos dados. Os dados foram analisados através dos fatores principais. O ECM foi associado positivamente com a distância de fuga, idade e vocalizações de baixa intensidade, demonstrando que animais com ECM bom ficavam mais próximo ao observador e se apresentaram mais calmas frente a situações de estresse. Ovelhas com ECM >4 apresentam menor distância de fuga e mais número de vocalizações de baixa intensidade demonstrando um comportamento materno calmo menor agitação frente a situações de medo.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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