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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
21/06/2005 |
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Data da última atualização: |
21/06/2005 |
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Autoria: |
GOES, A. de; MARTINS, R. D.; REIS, R. F. dos. |
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Afiliação: |
FCAV/UNESP. |
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Título: |
Efeito de fungicidas cúpricos, aplicados isoladamente ou em combinação com mancozeb, na expressão de sintomas de fitotoxicidade e controle da ferrugem causada por Puccinia psidii em goiabeira. |
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Ano de publicação: |
2004 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v.26, n.2, p.237-240, 2004. |
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ISSN: |
0100-2945 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Dois experimentos foram conduzidos em pomares de goiabeira 'Paluma', nos municípios de Monte Alto e Vista Alegre do Alto-SP. No primeiro experimento, avaliou-se o efeito de formulações de fungicidas cúpricos, aplicados isoladamente e em mistura com mancozeb, quanto ao efeito fitotóxico em botões florais e em frutos de goiabeira, em três estádios de desenvolvimento. No segundo experimento, foram avaliados os mesmos fungicidas usados no primeiro experimento, sendo, porém, acrescido do tratamento constituído por tebuconazole, cujo alvo foi sua eficiência no controle da ferrugem. No primeiro experimento, verificou-se que nenhum dos fungicidas testados causou abortamento de flores ou outros tipos de sintomas de fitotoxicidade em frutos de tamanho inferior a 15 mm de diâmetro. Contrariamente, estes fungicidas, quando aplicados isoladamente, em frutos entre 25 a 35 mm de diâmetro, causaram sintomas severos de fitotoxicidade. Em frutos de tamanho superior a 40 mm de diâmetro, estes fungicidas causaram sintomas de fitotoxicidade de níveis leves a moderados. A combinação de fungicidas cúpricos com mancozeb causou sintomas de fitotoxicidade em níveis leves, enquanto com mancozeb isoladamente não foram verificados sintomas de fitotoxicidade. No segundo experimento, verificou-se que os fungicidas cúpricos, aplicados isoladamente, foram eficientes no controle da ferrugem da goiabeira, apresentando eficiência comparável ao tratamento-padrão representado por tebuconazole. Esta eficiência foi também observada mediante o emprego da combinação mancozeb e óxido cuproso ou hidróxido de cobre. MenosDois experimentos foram conduzidos em pomares de goiabeira 'Paluma', nos municípios de Monte Alto e Vista Alegre do Alto-SP. No primeiro experimento, avaliou-se o efeito de formulações de fungicidas cúpricos, aplicados isoladamente e em mistura com mancozeb, quanto ao efeito fitotóxico em botões florais e em frutos de goiabeira, em três estádios de desenvolvimento. No segundo experimento, foram avaliados os mesmos fungicidas usados no primeiro experimento, sendo, porém, acrescido do tratamento constituído por tebuconazole, cujo alvo foi sua eficiência no controle da ferrugem. No primeiro experimento, verificou-se que nenhum dos fungicidas testados causou abortamento de flores ou outros tipos de sintomas de fitotoxicidade em frutos de tamanho inferior a 15 mm de diâmetro. Contrariamente, estes fungicidas, quando aplicados isoladamente, em frutos entre 25 a 35 mm de diâmetro, causaram sintomas severos de fitotoxicidade. Em frutos de tamanho superior a 40 mm de diâmetro, estes fungicidas causaram sintomas de fitotoxicidade de níveis leves a moderados. A combinação de fungicidas cúpricos com mancozeb causou sintomas de fitotoxicidade em níveis leves, enquanto com mancozeb isoladamente não foram verificados sintomas de fitotoxicidade. No segundo experimento, verificou-se que os fungicidas cúpricos, aplicados isoladamente, foram eficientes no controle da ferrugem da goiabeira, apresentando eficiência comparável ao tratamento-padrão representado por tebuconazole. Esta eficiência fo... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
fungicidas; manejo integrado; Psidium guava. |
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Thesagro: |
Erwinia Psidii. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aDois experimentos foram conduzidos em pomares de goiabeira 'Paluma', nos municípios de Monte Alto e Vista Alegre do Alto-SP. No primeiro experimento, avaliou-se o efeito de formulações de fungicidas cúpricos, aplicados isoladamente e em mistura com mancozeb, quanto ao efeito fitotóxico em botões florais e em frutos de goiabeira, em três estádios de desenvolvimento. No segundo experimento, foram avaliados os mesmos fungicidas usados no primeiro experimento, sendo, porém, acrescido do tratamento constituído por tebuconazole, cujo alvo foi sua eficiência no controle da ferrugem. No primeiro experimento, verificou-se que nenhum dos fungicidas testados causou abortamento de flores ou outros tipos de sintomas de fitotoxicidade em frutos de tamanho inferior a 15 mm de diâmetro. Contrariamente, estes fungicidas, quando aplicados isoladamente, em frutos entre 25 a 35 mm de diâmetro, causaram sintomas severos de fitotoxicidade. Em frutos de tamanho superior a 40 mm de diâmetro, estes fungicidas causaram sintomas de fitotoxicidade de níveis leves a moderados. A combinação de fungicidas cúpricos com mancozeb causou sintomas de fitotoxicidade em níveis leves, enquanto com mancozeb isoladamente não foram verificados sintomas de fitotoxicidade. No segundo experimento, verificou-se que os fungicidas cúpricos, aplicados isoladamente, foram eficientes no controle da ferrugem da goiabeira, apresentando eficiência comparável ao tratamento-padrão representado por tebuconazole. Esta eficiência foi também observada mediante o emprego da combinação mancozeb e óxido cuproso ou hidróxido de cobre.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
02/12/2010 |
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Data da última atualização: |
27/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
HERAI, R. H.; COSTA, G. G. D. L.; R. JÚNIOR, O.; VIDAL, R. O.; NASCIMENTO, L. C.; PARIZZI, L. P.; PEREIRA, G. G. A.; CARAZZOLLE, M. F. |
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Afiliação: |
LGE/IB/UNICAMP, LBA/CNPTIA; LGE/UNICAMP; LGE/IB/UNICAMP; LGE/IB/UNICAMP, LNBio; LGE/IB/UNICAMP; LGE/IB/UNICAMP; LGE/IB/UNICAMP, LNBio; LGE/IB/UNICAMP, CENAPAD. |
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Título: |
TORNADO: an automated pipeline for de novo hybrid genome assembly based on free software packages for sanger and next generation sequencing technologies (NGS). |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. |
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Páginas: |
p. 119. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
X-meeting 2010. |
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Conteúdo: |
Next generation sequence technologies (NGS) made possible to sequence entirely genomes in a fast way and low cost, from unicellular to complex organisms, like plants and mammals. These sequences can be assembled (i ) using a reference genome or by some de novo bioinformatics method, such as Velvet, SOAPDenovo, Edena, ABYSS, GS Assembler 454, Mira and ZORRO. They are mainly based on de Bruijin graphs or, in a few softwares, reads overlapping to form contigs and scaffolds. The involved filtering and assembly step are very sensitive for each type of tool, and can be a key factor to generate the best assembly results. This way, when a set of sequences from distinct technologies exists, from Sanger to NGS, it is necessary the use of distinct assembly strategies for each type of data. Actually, at our knowledge, there is no automated hybrid strategies based on in-use of distinct assembly softwares that can be applied to assembly hybrid data generated by NGS or Sanger platforms. This works presents TORNADO, and automated pipeline for hybrid genome assembly based on free software packages. TORNADO did not proposed new methods for genome assembly. It just uses the best described software strategies for each type of genomic data to perform the hybrid assembly. It was organized in two main modules that are configured by XML file. In the first module, input data are filtered for trimming and experimental artifacts clipping. In the second module, based on sequence type, TORNADO automatically performs the assembly task using Mira for 454 and Sanger reads, Velvet for Illumina/Solexa or Solid/Life Tech reads. Finally, each assembled data are merged in a single assembly using ZORRO. If there are paired-end (mate pairs data) reads, an additional step involves CloseGaps software, which closes the gaps between assembled scaffolds. TORNADO was already applied to assembly hybrid genomic reads from Moniliophthora perniciosa fungi, Witche's broom causal in plant cacao. Results showed that our strategy can works like an useful method to automatically assembly hybrid genome data. TORNADO's was implemented using Java and PERL programming language technologies. MenosNext generation sequence technologies (NGS) made possible to sequence entirely genomes in a fast way and low cost, from unicellular to complex organisms, like plants and mammals. These sequences can be assembled (i ) using a reference genome or by some de novo bioinformatics method, such as Velvet, SOAPDenovo, Edena, ABYSS, GS Assembler 454, Mira and ZORRO. They are mainly based on de Bruijin graphs or, in a few softwares, reads overlapping to form contigs and scaffolds. The involved filtering and assembly step are very sensitive for each type of tool, and can be a key factor to generate the best assembly results. This way, when a set of sequences from distinct technologies exists, from Sanger to NGS, it is necessary the use of distinct assembly strategies for each type of data. Actually, at our knowledge, there is no automated hybrid strategies based on in-use of distinct assembly softwares that can be applied to assembly hybrid data generated by NGS or Sanger platforms. This works presents TORNADO, and automated pipeline for hybrid genome assembly based on free software packages. TORNADO did not proposed new methods for genome assembly. It just uses the best described software strategies for each type of genomic data to perform the hybrid assembly. It was organized in two main modules that are configured by XML file. In the first module, input data are filtered for trimming and experimental artifacts clipping. In the second module, based on sequence type, TORNADO automatic... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bases de dados; Bioinformática. |
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Thesagro: |
Genoma. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Computer software; Databases; Genome; Moniliophthora perniciosa. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/23820/1/p119.pdf
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Marc: |
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520 $aNext generation sequence technologies (NGS) made possible to sequence entirely genomes in a fast way and low cost, from unicellular to complex organisms, like plants and mammals. These sequences can be assembled (i ) using a reference genome or by some de novo bioinformatics method, such as Velvet, SOAPDenovo, Edena, ABYSS, GS Assembler 454, Mira and ZORRO. They are mainly based on de Bruijin graphs or, in a few softwares, reads overlapping to form contigs and scaffolds. The involved filtering and assembly step are very sensitive for each type of tool, and can be a key factor to generate the best assembly results. This way, when a set of sequences from distinct technologies exists, from Sanger to NGS, it is necessary the use of distinct assembly strategies for each type of data. Actually, at our knowledge, there is no automated hybrid strategies based on in-use of distinct assembly softwares that can be applied to assembly hybrid data generated by NGS or Sanger platforms. This works presents TORNADO, and automated pipeline for hybrid genome assembly based on free software packages. TORNADO did not proposed new methods for genome assembly. It just uses the best described software strategies for each type of genomic data to perform the hybrid assembly. It was organized in two main modules that are configured by XML file. In the first module, input data are filtered for trimming and experimental artifacts clipping. In the second module, based on sequence type, TORNADO automatically performs the assembly task using Mira for 454 and Sanger reads, Velvet for Illumina/Solexa or Solid/Life Tech reads. Finally, each assembled data are merged in a single assembly using ZORRO. If there are paired-end (mate pairs data) reads, an additional step involves CloseGaps software, which closes the gaps between assembled scaffolds. TORNADO was already applied to assembly hybrid genomic reads from Moniliophthora perniciosa fungi, Witche's broom causal in plant cacao. Results showed that our strategy can works like an useful method to automatically assembly hybrid genome data. TORNADO's was implemented using Java and PERL programming language technologies.
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700 1 $aCARAZZOLLE, M. F.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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