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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
15/01/2013 |
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Data da última atualização: |
15/01/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ALMEIDA, I. F. de; CRUZ, C. D.; RESENDE, M. D. V. de; ALMEIDA, R. V. de. |
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Afiliação: |
Ísis Fernanda de Almeida, Universidade Estadual de Goiás; Cosme Damião Cruz, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Ramon Vinícius de Almeida, Universidade Estadual de Goiás. |
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Título: |
Método de estimação e validação na seleção genômica. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Agrotecnologia, Anápolis, v. 3, n. 2, 2012. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A seleção genômica ampla (GWS) consiste na utilização simultânea de centenas ou milhares de marcadores, os quais cobrem o genoma de maneira densa, de forma que todos os genes de um caráter quantitativo estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos uma parte dos marcadores. Este trabalho teve por objetivo avaliar a acurácia ao se aplicar diferentes métodos estatísticos de seleção genômica (RR-BLUP e BLASSO) e diferentes formas de validação. Foram simulados genomas com dez grupos de ligação contendo 100 marcas bi-alélicas e co-dominantes por grupo, totalizando 1010 marcadores apresentando intervalos entre marcas adjacentes equidistantes. Esses genomas foram utilizados para a geração da população simulada de famílias de meios-irmãos com 1.000 indivíduos. As diferentes características quantitativas, uniformes e binomiais, de herdabilidade 0,40, foram avaliadas. Para um tipo de validação criou-se uma população de validação independente com 1000 indivíduos e para outro tipo, aplicou-se a validação cruzada de Jacknife, usando a mesma população para estimação e validação. Os programas estatísticos utilizados foram GENES, SELEGEN GENÔMICA e R. As acurácias apresentaram valores entre 0,55 e 0,92. De forma geral, a validação feita através da população independente apresentou valores mais elevados de acurácia. Para famílias de meios-irmãos e com distribuição binomial dos efeitos genéticos, o método BLASSO foi ligeiramente superior ao RR-BLUP. Para a distribuição uniforme, os dois métodos de análise apresentaram valores superiores de acurácia a depender da forma de validação. MenosA seleção genômica ampla (GWS) consiste na utilização simultânea de centenas ou milhares de marcadores, os quais cobrem o genoma de maneira densa, de forma que todos os genes de um caráter quantitativo estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos uma parte dos marcadores. Este trabalho teve por objetivo avaliar a acurácia ao se aplicar diferentes métodos estatísticos de seleção genômica (RR-BLUP e BLASSO) e diferentes formas de validação. Foram simulados genomas com dez grupos de ligação contendo 100 marcas bi-alélicas e co-dominantes por grupo, totalizando 1010 marcadores apresentando intervalos entre marcas adjacentes equidistantes. Esses genomas foram utilizados para a geração da população simulada de famílias de meios-irmãos com 1.000 indivíduos. As diferentes características quantitativas, uniformes e binomiais, de herdabilidade 0,40, foram avaliadas. Para um tipo de validação criou-se uma população de validação independente com 1000 indivíduos e para outro tipo, aplicou-se a validação cruzada de Jacknife, usando a mesma população para estimação e validação. Os programas estatísticos utilizados foram GENES, SELEGEN GENÔMICA e R. As acurácias apresentaram valores entre 0,55 e 0,92. De forma geral, a validação feita através da população independente apresentou valores mais elevados de acurácia. Para famílias de meios-irmãos e com distribuição binomial dos efeitos genéticos, o método BLASSO foi ligeiramente superior ao RR-BLUP. Para a distribuição uniforme, os dois m... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Análise genômica. |
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Thesagro: |
Genética; Marcador Molecular. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/74155/1/2012-M.Deon-RAgrotec-Metodos.pdf
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Marc: |
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520 $aA seleção genômica ampla (GWS) consiste na utilização simultânea de centenas ou milhares de marcadores, os quais cobrem o genoma de maneira densa, de forma que todos os genes de um caráter quantitativo estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos uma parte dos marcadores. Este trabalho teve por objetivo avaliar a acurácia ao se aplicar diferentes métodos estatísticos de seleção genômica (RR-BLUP e BLASSO) e diferentes formas de validação. Foram simulados genomas com dez grupos de ligação contendo 100 marcas bi-alélicas e co-dominantes por grupo, totalizando 1010 marcadores apresentando intervalos entre marcas adjacentes equidistantes. Esses genomas foram utilizados para a geração da população simulada de famílias de meios-irmãos com 1.000 indivíduos. As diferentes características quantitativas, uniformes e binomiais, de herdabilidade 0,40, foram avaliadas. Para um tipo de validação criou-se uma população de validação independente com 1000 indivíduos e para outro tipo, aplicou-se a validação cruzada de Jacknife, usando a mesma população para estimação e validação. Os programas estatísticos utilizados foram GENES, SELEGEN GENÔMICA e R. As acurácias apresentaram valores entre 0,55 e 0,92. De forma geral, a validação feita através da população independente apresentou valores mais elevados de acurácia. Para famílias de meios-irmãos e com distribuição binomial dos efeitos genéticos, o método BLASSO foi ligeiramente superior ao RR-BLUP. Para a distribuição uniforme, os dois métodos de análise apresentaram valores superiores de acurácia a depender da forma de validação.
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Clima Temperado. Para informações adicionais entre em contato com cpact.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Clima Temperado. |
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Data corrente: |
04/12/2018 |
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Data da última atualização: |
20/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
BRUBNETTO, G.; TIECHER, T. L.; HAMMERSHMITT, R. K.; FACCO, D. B.; FERREIRA, P. A. A.; CONTI. L. de; SILVA, L. O. S.; MAYER, N. A.; ANTUNES, L. E. C.; CESCO, S.; MIMMO, T. |
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Afiliação: |
G. Brunetto; T.L. Tiecher; R.K. Hammerschmitt; D.B. Facco; P.A.A. Ferreira; L. De Conti; L.O.S. Silva; NEWTON ALEX MAYER, CPACT; LUIS EDUARDO CORREA ANTUNES, CPACT; S. Cesco; T. Mimmo. |
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Título: |
Peach rootstock tolerance to excess zinc in sandy acidic soil. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Acta Horticulturae, v. 1217, p. 75-82, 2018. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Publicado no ISHS Acta Horticulturae 1217: VIII International Symposium on Mineral Nutrition of Fruit Crops |
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Conteúdo: |
In some areas dedicated to the cultivation of peach plants, soils are characterized by high levels of zinc (Zn) as a consequence of successive applications of Zn-containing fungicides and/or use of animal manure as fertilizer. In these cases, choosing an appropriate Zn-tolerant rootstock is essential to optimize orchard production. The current study evaluated the behavior of three peach rootstocks grown in a soil containing variable levels of Zn availability. Samples of a Typic Hapludalf soil were collected from a natural grassland in southern Brazil. The soil was dried and sieved. Subsamples of the soil were amended with increasing rates of Zn added as ZnSO4, incubated for 60 days, transferred to rhizoboxes, and planted with three types of peach rootstocks (Tsukuba-1, Rigitano and Flordaguard). The treatments were arranged in a completely randomized experimental design with three replications per rootstock X Zn dosage treatment. The rootstocks were grown for 65 days, at which time dry matter production of leaves, shoots and stem, as well as increase in height and stem diameter at ground level, were measured. Total concentrations of Zn, Fe, N, P, Ca and Mg were analyzed in each organ. The photosynthetic pigments and catalase (CAT) activity were analyzed in the leaves. Concentrations of Zn increased linearly in all the organs of all the rootstocks; however, the Tsukuba-1 rootstock presented greater sensitivity to high levels of Zn availability in soil, with a reduction in leaf dry matter production, chlorophyll a and carotenoid concentrations, and CAT activity. The Flordaguard rootstock showed an increase in height with increasing Zn concentration applied to the soil. Development of the Rigitano rootstock plants was unaffected by Zn amendment. MenosIn some areas dedicated to the cultivation of peach plants, soils are characterized by high levels of zinc (Zn) as a consequence of successive applications of Zn-containing fungicides and/or use of animal manure as fertilizer. In these cases, choosing an appropriate Zn-tolerant rootstock is essential to optimize orchard production. The current study evaluated the behavior of three peach rootstocks grown in a soil containing variable levels of Zn availability. Samples of a Typic Hapludalf soil were collected from a natural grassland in southern Brazil. The soil was dried and sieved. Subsamples of the soil were amended with increasing rates of Zn added as ZnSO4, incubated for 60 days, transferred to rhizoboxes, and planted with three types of peach rootstocks (Tsukuba-1, Rigitano and Flordaguard). The treatments were arranged in a completely randomized experimental design with three replications per rootstock X Zn dosage treatment. The rootstocks were grown for 65 days, at which time dry matter production of leaves, shoots and stem, as well as increase in height and stem diameter at ground level, were measured. Total concentrations of Zn, Fe, N, P, Ca and Mg were analyzed in each organ. The photosynthetic pigments and catalase (CAT) activity were analyzed in the leaves. Concentrations of Zn increased linearly in all the organs of all the rootstocks; however, the Tsukuba-1 rootstock presented greater sensitivity to high levels of Zn availability in soil, with a reduction in lea... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Acidic soils; Foliar fungicides; Photosynthetic pigments. |
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Thesagro: |
Pêssego; Porta Enxerto. |
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Thesaurus NAL: |
Heavy metals; Phytotoxicity. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aIn some areas dedicated to the cultivation of peach plants, soils are characterized by high levels of zinc (Zn) as a consequence of successive applications of Zn-containing fungicides and/or use of animal manure as fertilizer. In these cases, choosing an appropriate Zn-tolerant rootstock is essential to optimize orchard production. The current study evaluated the behavior of three peach rootstocks grown in a soil containing variable levels of Zn availability. Samples of a Typic Hapludalf soil were collected from a natural grassland in southern Brazil. The soil was dried and sieved. Subsamples of the soil were amended with increasing rates of Zn added as ZnSO4, incubated for 60 days, transferred to rhizoboxes, and planted with three types of peach rootstocks (Tsukuba-1, Rigitano and Flordaguard). The treatments were arranged in a completely randomized experimental design with three replications per rootstock X Zn dosage treatment. The rootstocks were grown for 65 days, at which time dry matter production of leaves, shoots and stem, as well as increase in height and stem diameter at ground level, were measured. Total concentrations of Zn, Fe, N, P, Ca and Mg were analyzed in each organ. The photosynthetic pigments and catalase (CAT) activity were analyzed in the leaves. Concentrations of Zn increased linearly in all the organs of all the rootstocks; however, the Tsukuba-1 rootstock presented greater sensitivity to high levels of Zn availability in soil, with a reduction in leaf dry matter production, chlorophyll a and carotenoid concentrations, and CAT activity. The Flordaguard rootstock showed an increase in height with increasing Zn concentration applied to the soil. Development of the Rigitano rootstock plants was unaffected by Zn amendment.
650 $aHeavy metals
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700 1 $aCESCO, S.
700 1 $aMIMMO, T.
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