Data/hora: 15/06/2024 13:26:08

Biblioteca(s): | Embrapa Amazônia Ocidental.
Data corrente: | 23/10/2012
Data da última atualização: | 04/02/2013
Autoria: | SILVA, A. M. O. DA; SILVA, G. F. da; DIAS, M. C.; SOUZA, A.; CLEMENT, C. R.; SOUSA, N. R.
Afiliação: | GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; MIGUEL COSTA DIAS, CPAA; NELCIMAR REIS SOUSA, CPAA.
Título: | Desenvolvimento de "inter-retrotransposon amplified polymorphism" para análise de diversidade genética em germoplasma de mandioca.
Ano de publicação: | 2012
Fonte/Imprenta: | In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012. Anais. Belém, PA. 2012.
Idioma: | Português
Conteúdo: | A mandioca, Manihot esculenta Crantz, possui importância econômica na maioria dos países tropicais e subtropicais. A variabilidade genética da espécie não foi totalmente explorada e novas informações podem ajudar a expandir seu uso. Os marcadores moleculares baseados em retrotransposons, devido a sua abundancia no genoma, permitem uma eficiente análise de diversidade genética. O IRAP (Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism) é baseado no polimorfismo entre retrotransposons, possui uma alta reprodutibilidade, elevado nível de polimorfismo e baixo custo. O objetivo deste trabalho foi desenvolver primers para IRAP em mandioca. Oito diferentes retrotransposons do tipo LTR foram selecionados para o desenvolvimento de IRAP e os primers baseados nestes elementos foram denominados de ME_1 a ME_8. Foram analisados 21 indivíduos (12 de Anori/AM, 6 Anamã/AM e 3 da Bahia) provenientes do banco de germoplasma de mandioca da Embrapa Amazônia Ocidental. O percentual de loci polimórficos, heterozigosidade esperada (*h) e o Índice de Shannon (*I) foram calculados usando o software PopGene 1.31. Dos oito primers desenvolvidos, dois deles (ME_1 e ME_3) produziram poucas e fracas bandas. Os demais primers produziram de 21 a 61 bandas com médias de 85% de polimorfismo (65,5 - 97), 0,33 de heterozigosidade (0,24 ? 0,40) e 0,49 de índice de Shannon (0,35 ? 0,57). Dos pares de primers desenhados, ME_4 apresentou os menores valores e o ME_8 os maiores para todos os parâmetros avaliados.
Palavras-Chave: | IRAP; Retrotransposon.
Thesagro: | Manihot Esculenta; Polimorfismo.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/76029/1/166-2.doc-gilvan.pdf
Registro original: | Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA)
Exemplares: | CPAA - (24911-1) - UPC - AA - PP - S8948 -  - S8948 - DIS