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| Registros recuperados : 34 | |
| 2. |  | CECÍLIO FILHO, A. B.; GRANJEIRO, L. C.; CAZETTA, J. O. Exportação de nutrientes pelos frutos de melancia em função de épocas de cultivo, fontes e doses de potássio. Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, jul. 2004. Suplemento 2. Trabalho apresentado no 44º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2004. Publicado também como resumo em: Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, p. 488, jul. 2004. Suplemento.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 3. | | GRANJEIRO, L. C.; CECÍLIO FILHO, A. B.; CAZETTA, J. O. Concentrações de nutrientes no limpo foliar de melancia em função de épocas de cultivo, fontes e doses de potássio. Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, jul. 2004. Suplemento 2. Trabalho apresentado no 44º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2004. Publicado também como resumo em: Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, p. 487-488, jul. 2004. Suplemento.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 4. | | COELHO, R. L.; CECÍLIO FILHO, A. B.; CAZETTA, J. O. Teor de nitrato em cultivares de almeirão em função de concentração de nitrogênio na solução nutritiva. Horticultura Brasileira, Brasília, v. 20, n. 2, jul. 2002. Suplemento 2. Trabalho apresentado no 42º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2002. Publicado também como resumo em: Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 20, n. 2, p. 285, jul. 2002. Suplemento 1.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 5. | | CAVARIANNI, R. L.; CAZETTA, J. O.; MAY, A.; BARBOSA, J. C.; CECILIO FILHO, A. B. Acumulo de nitrato em cultivares de alface, cultivadas no inverno, em funcao do ambiente de cultivo. Horticultura Brasileira, Brasilia, v.18, p.322-323, jul. 2000. Suplemento. Trabalho apresentado no 40. Congresso Brasileiro de Olericultura, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 6. | | CAVARIANNI, R. L.; CAZETTA, J. O.; MAY, A.; BARBOSA, J. C.; CECILIO FILHO, A. B. Acumulo de nitrato em cultivares de alface, cultivadas na primavera, em funcao do ambiente de cultivo. Horticultura Brasileira, Brasilia, v.18, p.324-325, jul. 2000. Suplemento. Trabalho apresentado no 40. Congresso Brasileiro de Olericultura, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 7. | | CAVARIANNI, R. L.; CORRADI, M. M.; CECÍLIO FILHO, A. B.; MAY, A.; CAZETTA, J. O. Acúmulo de nitrato em cultivares de rúcula em função da concentração de nitrogênio na solução nutritiva. Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, jul. 2004. Suplemento 2. Trabalho apresentado no 44º Congresso Brasileiro de Olericultura, 2004. Publicado também como resumo em: Horticultura Brasileira, Brasília, v. 22, n. 2, p. 463, jul. 2004. Suplemento.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 8. | | ALVES, M.; CAZETTA, J. O.; NUNES, M. A.; OLIVEIRA, C. A. L. de; COLOMBI, C. A. Ação de diferentes preparações de extrato pirolenhoso sobre Brevipalpus phoenicis (GEIJSKES). Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 29, n. 2, p. 382-385, ago. 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 9. | | LIMA, R. de L. S. de; SIQUEIRA, D. L. de; WEBER, O. B.; CAZETTA, J. O. Comportamento de estacas e parte do ramo na formação de mudas de aceroleira. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 28, n. 1, p. 83-86, abril, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 12. | | SANTOS, C. L. R. dos; CAZETTA, J. O.; SARAN, L. M.; SANCHES, A. Otimização da análise da atividade da redutase do nitrato e sua caracterização em folhas de cana-de-açúcar. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 5, p. 384-394, maio. 2014. Título em inglês: Optimization of nitrate reductase activity analysis and its characterization in sugarcane leaves.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | DEMÉTRIO, C. S.; FORNASIERI FILHO, D.; CAZETTA, J. O.; CAZETTA, D. A. Desempenho de híbridos de milho submetidos a diferentes espaçamentos e densidade populacionais. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 12, p. 1691-1697, dez. 2008. Título em inglês: Performance of maize hybrids submitted to different row spacing and population densities.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | CAVARIANNI, R. L.; CECÍLIO FILHO, A. B.; COELHO, R. L.; CAZETTA, J. O. Teor de nitrato em cultivares de almeirão, cultivados em hidroponia, em função do horário de colheita. Científica, Jaboticabal, v. 33, n. 1, p. 50-56, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 17. | | HERNANDES, A.; CAZETTA, J. O.; NATALE, W.; ROZANE, D. E.; SOUZA, H. A. de; ROMUALDO, L. M. Fracionamento de manganês acumulado nos tecidos de mudas de caramboleira. Revista Brasileira de Ciência do Solo, Viçosa, MG, v. 35, p. 1679-1685, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 18. | | PIO, R.; CHAGAS, E. A.; BARBOSA, W.; SIGNORINI, G.; ALVARENGA, A. A.; ABRAHÃO, E.; CAZETTA, J. O.; ENTELMANN, F. A. Emergência e desenvolvimento de plântulas de cultivares de marmeleiro para uso como porta-enxertos. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 29, n. 1, p. 133-136, abr. 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 20. | | CHAGAS, E. A.; PASQUAL, M.; RAMOS, J. D.; PIO, L. A. S.; DUTRA, L. F.; CAZETTA, J. O. Cultivo de embriões imaturos de citros em diferentes concentrações de carvão ativado e ácido giberélico. Ciência e agrotecnologia, Lavras, v. 29, n. 6, p. 1125-1131, nov./dez. 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| Registros recuperados : 34 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
29/02/2016 |
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Data da última atualização: |
21/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
BELESINI, A. A.; TELLES, B. R.; CASTRO, G. M. de; GIACHETTO, P. F.; VANTINI, J. da S.; CARVALHO, F. M. de S.; CARLIN, S. R.; CAZETTA, J. O.; FERRO, M. I. T.; PINHEIRO, D. G. |
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Afiliação: |
ALINE ANDRUCIOLI BELESINI, FCAV/Unesp; BRUNA ROBIATI TELLES, FCAV/Unesp; GIOVANNI MARQUES DE CASTRO, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; JULIANA DA SILVA VANTINI, FCAV/Unesp; FLÁVIA MARIA DE SOUZA CARVALHO, FCAV/Unesp; SAMIRA RODRIGUES CARLIN, IAC/Apta; JAIRO OSWALDO CAZETTA, FCAV/Unesp; MARIA INES T. FERRO, FCAV/Unesp; DANIEL GUARIZ PINHEIRO, FCAV/Unesp. |
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Título: |
de novo assembly and transcriptome analysis of sugarcane leaves from contrasting varieties submited to prolonged water stress. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 24., 2016, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2016. |
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Páginas: |
Não paginado. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
PAG 2016. Pôster P0792. |
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Conteúdo: |
Sugarcane is an important crop, major source of sugar and alcohol, accounting for two-thirds of the world's sugar production. In Brazil, the sugarcane culture has expanded to areas with prolonged drought seasons, which is constraining its production. In order to identify genes and molecular process related to sugarcane drought tolerance, we performed de novo assembly and transcriptome analysis of two sugarcane genotypes, one tolerant and other sensitive to water stress, submitted to three water deficit condition (30, 60 and 90 days). The de novo assembly of leaves transcriptome was performed using short reads from Illumina RNA-Seq platform, which produced more than 1 billion reads, which were assembled into 177,509 and 185,153 transcripts sequences for the tolerant and sensitive cultivars, respectively. These transcripts were aligned with Sorghum bicolor, Miscanthus giganteus, Arabidopsis thaliana sequences and sugarcane sequences available in public databases. This analysis allowed the identification of a set of sugarcane genes shared with other species, as well as led to the identification of novel transcripts not cataloged yet. Differential expression analysis between genotypes and among days of water deficit were performed with EdgeR and DESeq. The differentially expressed genes were annotated and categorized using Blast2GO. The terms "enzyme regulator" and "transcription regulator" were highlighted within the differentially expressed genes between the contrasting cultivars, suggesting the importance of gene regulation during water deficit. This study found new molecular patterns, which provided hypotheses on plant response to drought and provided important information about genes involved in drought tolerance response. MenosSugarcane is an important crop, major source of sugar and alcohol, accounting for two-thirds of the world's sugar production. In Brazil, the sugarcane culture has expanded to areas with prolonged drought seasons, which is constraining its production. In order to identify genes and molecular process related to sugarcane drought tolerance, we performed de novo assembly and transcriptome analysis of two sugarcane genotypes, one tolerant and other sensitive to water stress, submitted to three water deficit condition (30, 60 and 90 days). The de novo assembly of leaves transcriptome was performed using short reads from Illumina RNA-Seq platform, which produced more than 1 billion reads, which were assembled into 177,509 and 185,153 transcripts sequences for the tolerant and sensitive cultivars, respectively. These transcripts were aligned with Sorghum bicolor, Miscanthus giganteus, Arabidopsis thaliana sequences and sugarcane sequences available in public databases. This analysis allowed the identification of a set of sugarcane genes shared with other species, as well as led to the identification of novel transcripts not cataloged yet. Differential expression analysis between genotypes and among days of water deficit were performed with EdgeR and DESeq. The differentially expressed genes were annotated and categorized using Blast2GO. The terms "enzyme regulator" and "transcription regulator" were highlighted within the differentially expressed genes between the contrasting cultiv... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Cana-de-açúcar; Tolerância à seca; Transcriptoma. |
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Thesaurus NAL: |
Bioinformatics; Drought tolerance; Sugarcane; Transcriptomics; Water stress. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/140287/1/PAG-p0792.pdf
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Marc: |
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520 $aSugarcane is an important crop, major source of sugar and alcohol, accounting for two-thirds of the world's sugar production. In Brazil, the sugarcane culture has expanded to areas with prolonged drought seasons, which is constraining its production. In order to identify genes and molecular process related to sugarcane drought tolerance, we performed de novo assembly and transcriptome analysis of two sugarcane genotypes, one tolerant and other sensitive to water stress, submitted to three water deficit condition (30, 60 and 90 days). The de novo assembly of leaves transcriptome was performed using short reads from Illumina RNA-Seq platform, which produced more than 1 billion reads, which were assembled into 177,509 and 185,153 transcripts sequences for the tolerant and sensitive cultivars, respectively. These transcripts were aligned with Sorghum bicolor, Miscanthus giganteus, Arabidopsis thaliana sequences and sugarcane sequences available in public databases. This analysis allowed the identification of a set of sugarcane genes shared with other species, as well as led to the identification of novel transcripts not cataloged yet. Differential expression analysis between genotypes and among days of water deficit were performed with EdgeR and DESeq. The differentially expressed genes were annotated and categorized using Blast2GO. The terms "enzyme regulator" and "transcription regulator" were highlighted within the differentially expressed genes between the contrasting cultivars, suggesting the importance of gene regulation during water deficit. This study found new molecular patterns, which provided hypotheses on plant response to drought and provided important information about genes involved in drought tolerance response.
650 $aBioinformatics
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700 1 $aCASTRO, G. M. de
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aVANTINI, J. da S.
700 1 $aCARVALHO, F. M. de S.
700 1 $aCARLIN, S. R.
700 1 $aCAZETTA, J. O.
700 1 $aFERRO, M. I. T.
700 1 $aPINHEIRO, D. G.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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