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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
27/09/2018 |
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Data da última atualização: |
06/11/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BARBEDO, J. G. A.; KOENIGKAN, L. V.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; COSTA, R. V. da; NECHET, K. de L.; GODOY, C. V.; LOBO JUNIOR, M.; PATRÍCIO, F. R. A.; TALAMINI, V.; CHITARRA, L. G.; OLIVEIRA, S. A. S. de; ISHIDA, A. K. N.; FERNANDES, J. M. C.; SANTOS, T. T.; CAVALCANTI, F. R.; TERAO, D.; ANGELOTTI, F. |
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Afiliação: |
JAYME GARCIA ARNAL BARBEDO, CNPTIA; LUCIANO VIEIRA KOENIGKAN, CNPTIA; BERNARDO DE ALMEIDA HALFELD VIEIRA, CNPMA; RODRIGO VERAS DA COSTA, CNPMS; KATIA DE LIMA NECHET, CNPMA; CLAUDIA VIEIRA GODOY, CNPSO; MURILLO LOBO JUNIOR, CNPAF; F. R. A. PATRÍCIO, Instituto Biológico, Campinas, SP; VIVIANE TALAMINI, CPATC; LUIZ GONZAGA CHITARRA, CNPA; SAULO ALVES SANTOS DE OLIVEIRA, CNPMF; ALESSANDRA KEIKO NAKASONE ISHIDA, CPATU; JOSE MAURICIO CUNHA FERNANDES, CNPT; THIAGO TEIXEIRA SANTOS, CNPTIA; FABIO ROSSI CAVALCANTI, CNPUV; DANIEL TERAO, CNPMA; FRANCISLENE ANGELOTTI, CPATSA. |
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Título: |
Annotated plant pathology databases for image-based detection and recognition of diseases. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista IEEE America Latina, v. 16, n. 6, p. 1749-1757, jun. 2018. |
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Idioma: |
Inglês
Português |
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Notas: |
O título da revista foi grafado no artigo como IEEE LATIN AMERICA TRANSACTIONS, mas registro de título do periódico é REVISTA IEEE AMÉRICA LATINA. |
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Conteúdo: |
Over the last few years, considerable effort has been spent by Embrapa in the construction of a plant disease database representative enough for the development of effective methods for automatic plant disease detection and recognition. In October of 2016, this database, called PDDB, had 2326 images of 171 diseases and other disorders affecting 21 plant species. PDDB size, although considerable, is not enough to allow the use of powerful techniques such as deep learning. In order to increase its size, each image was subdivided according to certain criteria, increasing the number of images to 46,513. Both the original (PDDB) and subdivided (XDB)databases are now being made freely available for academic research purposes, thus supporting new studies and contributing to speed up the advances in the area. Both collections are expected to grow continuously in order to expand their reach. PDDB and XDB can be accessed in the link https://www.digipathos-rep.cnptia.embrapa.br/. |
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Palavras-Chave: |
Aprendizagem profunda; Banco de dados; Imagem em processamento; Patologia vegetal. |
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Thesagro: |
Doença de Planta. |
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Thesaurus Nal: |
Databases; Plant diseases and disorders; Plant pathology. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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Data corrente: |
14/01/2020 |
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Data da última atualização: |
14/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
ALVES, R. P.; MUNIZ, A. V. C. da S.; PEREIRA, C. S. A.; COSTA, T. S.; CARVALHO, S. V. A.; BLANK, M. de F. A.; BLANK, A. F. |
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Afiliação: |
RODRIGO P. ALVES; ANA VERUSKA CRUZ DA SILVA MUNIZ, CPATC; CAMILA S. ALMEIDA PEREIRA; TATIANA S. COSTA; SHEILA V. ALVARES CARVALHO; MARIA DE FATIMA ARRIGONI BLANK; ARIE F. BLANK. |
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Título: |
Genetic divergence in basil cultivars and hybrids. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 37, n. 2, p. 180-187, April./June, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Basil is an aromatic herb that stands out fo its economic importance. It is consumed in natura and sed to obtain essential oil. The cultivation of this species in several regions of the world has allowed variations by natural crosses and euploidy, leading to the wide genetic variability found nowadays. Considering the importance of this species, we aimed to analyze the genetic diversity of 27 basil genotypes using ISSR molecular markers. Fourteen primers were employed for DNA amplification, resulting in 86% polymorphism. Based on the Jaccard?s dissimilarity index, the highest index (0.80) was observed between the individuals BAS001 and BAS012, while the lowest index (0.18) was detected between the genotypes BAS014 and BAS015. The genetic similarity among individuals was calculated, forming four distinct clusters. Most individuals (40.7%) were allocated in cluster I. The polymorphic information content (PIC) (0.89) indicated considerable levels of genetic diversity among genotypes. In this sense, the ISSR markers were efficient in the detection of polymorphisms between the accessions, suggesting the genetic variability of the collection. This result demonstrates the importance of the use of molecular markers and the advantages that this information provides to the breeding of the species. O manjericão é uma erva aromática que se destaca por possuir importância econômica. É consumido in natura e também utilizado na obtenção de óleo essencial. O cultivo desta espécie em diversas regiões do mundo permitiu que surgissem variações mediante cru-zamentos naturais e euploidia, ocasionando a ampla variabilidade genética existente. Considerando a importância desta espécie, este trabalho teve como objetivo analisar a diversidade genética de 27 genótipos de manjericão usando marcadores moleculares ISSR. Qua-torze primers foram utilizados para amplificação do DNA, resultando em 86% de polimorfismo. Com base no índice de dissimilaridade de Jaccard, observou-se o maior índice (0,80) entre os indivíduos BAS001 e BAS012, enquanto que o menor índice de dissimilari-dade (0,18) foi detectado entre os genótipos BAS014 e BAS015. A semelhança genética entre indivíduos foi calculada, formando quatro grupos distintos. A maioria dos indivíduos (40,7%) foi agrupada no grupo I. O conteúdo de informação polimórfica (PIC) (0,89) indicou níveis consideráveis de diversidade genética entre os genótipos. Neste sentido, os marcadores ISSR foram eficientes na detecção de polimorfismos entre os acessos e confirmaram que é possível inferir a variabilidade genética na coleção. Isso demonstra a importância do uso de marcadores moleculares e as vantagens que esta informação pode oferecer ao melhoramento genético das espécies. MenosBasil is an aromatic herb that stands out fo its economic importance. It is consumed in natura and sed to obtain essential oil. The cultivation of this species in several regions of the world has allowed variations by natural crosses and euploidy, leading to the wide genetic variability found nowadays. Considering the importance of this species, we aimed to analyze the genetic diversity of 27 basil genotypes using ISSR molecular markers. Fourteen primers were employed for DNA amplification, resulting in 86% polymorphism. Based on the Jaccard?s dissimilarity index, the highest index (0.80) was observed between the individuals BAS001 and BAS012, while the lowest index (0.18) was detected between the genotypes BAS014 and BAS015. The genetic similarity among individuals was calculated, forming four distinct clusters. Most individuals (40.7%) were allocated in cluster I. The polymorphic information content (PIC) (0.89) indicated considerable levels of genetic diversity among genotypes. In this sense, the ISSR markers were efficient in the detection of polymorphisms between the accessions, suggesting the genetic variability of the collection. This result demonstrates the importance of the use of molecular markers and the advantages that this information provides to the breeding of the species. O manjericão é uma erva aromática que se destaca por possuir importância econômica. É consumido in natura e também utilizado na obtenção de óleo essencial. O cultivo desta espécie em diversa... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Erva aromática. |
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Thesagro: |
Conservação; Manjericão. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/208694/1/1806-9991-hb-37-02-180.pdf
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Marc: |
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520 $aBasil is an aromatic herb that stands out fo its economic importance. It is consumed in natura and sed to obtain essential oil. The cultivation of this species in several regions of the world has allowed variations by natural crosses and euploidy, leading to the wide genetic variability found nowadays. Considering the importance of this species, we aimed to analyze the genetic diversity of 27 basil genotypes using ISSR molecular markers. Fourteen primers were employed for DNA amplification, resulting in 86% polymorphism. Based on the Jaccard?s dissimilarity index, the highest index (0.80) was observed between the individuals BAS001 and BAS012, while the lowest index (0.18) was detected between the genotypes BAS014 and BAS015. The genetic similarity among individuals was calculated, forming four distinct clusters. Most individuals (40.7%) were allocated in cluster I. The polymorphic information content (PIC) (0.89) indicated considerable levels of genetic diversity among genotypes. In this sense, the ISSR markers were efficient in the detection of polymorphisms between the accessions, suggesting the genetic variability of the collection. This result demonstrates the importance of the use of molecular markers and the advantages that this information provides to the breeding of the species. O manjericão é uma erva aromática que se destaca por possuir importância econômica. É consumido in natura e também utilizado na obtenção de óleo essencial. O cultivo desta espécie em diversas regiões do mundo permitiu que surgissem variações mediante cru-zamentos naturais e euploidia, ocasionando a ampla variabilidade genética existente. Considerando a importância desta espécie, este trabalho teve como objetivo analisar a diversidade genética de 27 genótipos de manjericão usando marcadores moleculares ISSR. Qua-torze primers foram utilizados para amplificação do DNA, resultando em 86% de polimorfismo. Com base no índice de dissimilaridade de Jaccard, observou-se o maior índice (0,80) entre os indivíduos BAS001 e BAS012, enquanto que o menor índice de dissimilari-dade (0,18) foi detectado entre os genótipos BAS014 e BAS015. A semelhança genética entre indivíduos foi calculada, formando quatro grupos distintos. A maioria dos indivíduos (40,7%) foi agrupada no grupo I. O conteúdo de informação polimórfica (PIC) (0,89) indicou níveis consideráveis de diversidade genética entre os genótipos. Neste sentido, os marcadores ISSR foram eficientes na detecção de polimorfismos entre os acessos e confirmaram que é possível inferir a variabilidade genética na coleção. Isso demonstra a importância do uso de marcadores moleculares e as vantagens que esta informação pode oferecer ao melhoramento genético das espécies.
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