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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
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Data corrente: |
05/12/2007 |
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Data da última atualização: |
24/01/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERREIRA, P. de T de O.; LEMOS, T. O.; NAGATA, T.; INOUE-NAGATA, A. K. |
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Afiliação: |
PAULO DE TARSO DE OLIVEIRA FERREIRA; THAÍS OLIVEIRA LEMOS, UNIVERSIDADE CATÓLICA DE BRASÍLIA; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE CATÓLICA DE BRASÍLIA; ALICE KAZUKO INOUE NAGATA, CNPH. |
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Título: |
One-step cloning approach for construction of agroinfectious begomovirus clones. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Virological Methods, Amsterdam, v. 147, n. 2, p. 351-354, Feb. 2008. |
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ISSN: |
1879-0984 |
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DOI: |
10.1016/j.jviromet.2007.10.001 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Most begomoviruses have a bipartite genome containing two circular ssDNA segments (DNA-A and DNA-B). Routine infectious clone construction relies upon cloning of the whole genome, which is then subcloned as a tandem one-and-half or two genome- (containing two replication origins) cassette into a vector prior to agro-inoculation. The construction of cassettes containing two replication origins is, however, a time-consuming process. Here an improved method for rapid construction of agroinfectious begomovirus clones is described. Total DNA was extracted from a tomato plant infected with Tomato golden vein virus and viral ssDNA molecules were amplified using phi-29 bacteriophage polymerase. High molecular weight DNA was partially digested with a single cutting restriction endonuclease (BamHI) and DNA fragments containing genome dimers were ligated into pCAMBIA0380, and used to transform Escherichia coli cells. This transformation yielded clones containing either DNA-A or DNA-B dimers. One clone each was used to transform Agrobacterium tumefaciens cells. DNA-A and DNA-B transformants were mixed and inoculated into test plants. All inoculated plants (tomato and Nicotiana benthamiana) became infected, confirming the infectivity of the clones. This approach was proven to be extremely fast and useful for the production of infectious clones. |
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Palavras-Chave: |
Cultivar Santa Clara. |
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Thesagro: |
Agrobacterium Tumefaciens; Clonagem; Tomate. |
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Thesaurus Nal: |
Begomovirus; Cloning (plants); Solanum lycopersicum. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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001 1780604
005 2024-01-24
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260 $c2008
520 $aMost begomoviruses have a bipartite genome containing two circular ssDNA segments (DNA-A and DNA-B). Routine infectious clone construction relies upon cloning of the whole genome, which is then subcloned as a tandem one-and-half or two genome- (containing two replication origins) cassette into a vector prior to agro-inoculation. The construction of cassettes containing two replication origins is, however, a time-consuming process. Here an improved method for rapid construction of agroinfectious begomovirus clones is described. Total DNA was extracted from a tomato plant infected with Tomato golden vein virus and viral ssDNA molecules were amplified using phi-29 bacteriophage polymerase. High molecular weight DNA was partially digested with a single cutting restriction endonuclease (BamHI) and DNA fragments containing genome dimers were ligated into pCAMBIA0380, and used to transform Escherichia coli cells. This transformation yielded clones containing either DNA-A or DNA-B dimers. One clone each was used to transform Agrobacterium tumefaciens cells. DNA-A and DNA-B transformants were mixed and inoculated into test plants. All inoculated plants (tomato and Nicotiana benthamiana) became infected, confirming the infectivity of the clones. This approach was proven to be extremely fast and useful for the production of infectious clones.
650 $aBegomovirus
650 $aCloning (plants)
650 $aSolanum lycopersicum
650 $aAgrobacterium Tumefaciens
650 $aClonagem
650 $aTomate
653 $aCultivar Santa Clara
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700 1 $aNAGATA, T.
700 1 $aINOUE-NAGATA, A. K.
773 $tJournal of Virological Methods, Amsterdam$gv. 147, n. 2, p. 351-354, Feb. 2008.
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Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
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| Registros recuperados : 23 | |
| 2. |  | LOPES, V. S.; CARVALHO, M. C. C. G. de; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Genes Hsp20 de soja: organização no genoma e categorização entre subfamílias. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 17, res. 12.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 4. | | UTIYAMA, A. S.; ABE, V. Y.; DARBEN, L. M.; CARVALHO, K.; CARVALHO, M. C. C. G. de; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Avaliação funcional de proteínas candidatas a efetores de Phakopsora pachyrhizi por meio da análise de espécies reativas a oxigênio (ROS) e deposição de calose. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 13., 2018, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2018. p. 38-45.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 5. | | POLIZEL-PODANOSQUI, A. M.; CARVALHO, M. C. C. G. de; ROCHA, C. S.; DARBEN, L. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; AOYAOGI, L. N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Temporal gene expression analysis of effector candidates of Phakopsora pachyrhizi across the infection cycle. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, 16., 2014, Rhodes. [Abstracts...]. Atenas: International Society of Molecular Plant-Microbe Interactions, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 6. | | LOPES, V. S.; FUGANTI, R.; BARBOSA, J. F.; DE CARVALHO, M. C. C. G.; MARIN, S. R. R.; SILVA, J. F. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Estudos in vivo do papel de inserções AT(n) da região promotora do gene Gmhsp17.6-L na regulação de genes em soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4., 2009, Londrina. Resumos... Londrina: Embrapa Soja, 2009. p. 169-174. (Embrapa Soja. Documentos, 312). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 7. | | CARVALHO, K. de; RINCÃO, M. P.; DARBEN, L. M.; CARVALHO, M. C. C. G. de; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. External application of dsRNA targeting a Phakopsora pachyrhizi effector candidate attenuated fungal pathogenicity. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. Abstracts... [S. l.: s. n.], 2017. não paginado. PLANT AND ANIMAL GENOME XXV CONFERENCE - INTLPAG, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 8. | | DARBEN, L. M.; QI, M.; YOKOYAMA, A.; CARVALHO, M. C. C. G. de; ABDELNOOR, R. V.; WHITHAM, S. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Functional characterization of P. pachyrhizi effector candidates. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls. Abstract... Abstract: 840.pdf.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 9. | | SILVA, A. G.; HISHINUMA-SILVA, S. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; NOMURA, R. G.; DIAS, W. P.; LOPES, I. de O. N.; CARVALHO, M. C. C. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Análise funcional do gene At4g10250 em resposta à infecção por Meloidogyne javanica em Arabidopsis thaliana. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 13., 2018, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2018. p. 46-52.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 10. | | YOKOYAMA, A.; DARBEN, L. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; AOYAGI, L. N.; CARVALHO, M. C. C. G. de; SOARES, R. M.; ALMEIDA, A. M. R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Diversidade genética de isolados monouredinias de Phakopsora pachyrhizi coletados em diferentes regiões do Brasil. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 8., 2013, Londrina. Resumos expandidos... Londrina: Embrapa Soja, 2013. p. 11-15. (Embrapa Soja. Documentos, 339).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 11. | | CARVALHO, M. C. C. G. de; NASCIMENTO, L. C.; POLIZEL-PODANOSQUI, A. M.; ROCHA, C. S.; DARBEN, L. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; CARAZZOLLE, M. F.; OLIVEIRA, M. L. C. S.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. The transcriptome interactions between Phakopsora pachykopsora pachyrhizi-soybean. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: SBF, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | COSTA, R. P. S.; DE CARVALHO, K.; RINCÃO, M. P.; NOMURA, R. B. G.; AVELINO, B. B.; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; DE CARVALHO, M. C. C. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Validation of a system for functional gene analysis in P. pachyrhizi by ectopic application of dsRNA. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 13. | | DARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; PARMEZAN, T. R.; KUWAHARA, M. K.; CARVALHO, M. C. C. G. de; GONELA, A.; SOARES, R. M.; ALMEIDA, A. M. R.; GODOY, C. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Evaluation of virulence of Phakopsora pachyrhizi monourediniais isolates collected in Brazil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: SBF, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 14. | | PEREIRA, S. S.; SENA, J. A. D.; RODRIGUES, F. A.; CARVALHO, M. C. C. G.; PEREIRA, R. M.; MARIN, S. R. R.; BINNECK, E.; ABDELNOOR, R. V.; NEPOMUCENO, A. L.; MARCELINO, F. C. Expression profile of soybean MYB family genes under drought conditions. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA, 3., 2010, Fortaleza. Programa e resumos. Brasília, DF: SBBiotec, 2010. p. 221.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | AOYAGI, L. N.; LOPES-CAITAR, V. S.; CARVALHO, M. C. C. G. de; DARBEN, L. M.; POLIZEL-PODANOSQUI, A.; KUWAHARA, M. K.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Genomic and transcriptomic characterization of the transcription factor family R2R3-MYB in soybean and its involvement in the resistance responses to Phakopsora pachyrhizi. Plant Sciense, Limerick, v. 229, p. 32-42, Dec. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 16. | | LOPES-CAITAR, V. S.; CARVALHO, M. C. C. G. de; LUANA M. DARBEN; KUWAHARA, M. K.; NEPOMUCENO, A. L.; DIAS, W. P.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Genome-wide analysis of the Hsp20 gene family in soybean: comprehensive sequence, genomic organization and expression profile analysis under abiotic and biotic stresses. BMC Genomics, v. 14, article 577, 2013. 17 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 17. | | DARBEN, L. M.; YOKOYAMA, A.; PARMEZAN, T. R.; LOPES-CAITAR, V. S.; AOYAGI, L. N.; CARVALHO, M. C. C. G. de; GODOY, C. V.; GONELA, A.; SOARES, R. M.; ALMEIDA, A. M. R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Molecular diversity of monouredinial Phakopsora pachyrhizi isolates collected in Brazil. In: WORKSHOP ON BIOTIC AND ABIOTIC STRESS TOLERANCE IN PLANTS, 2013, Ilhéus. The challenge for the 21st century: book of abstracts. [Brasília]: Embrapa: International Advanced Biology Consortium, 2013. p. 56.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | KUMA, K. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; ROMERO, C. C. T.; DARBEN, L. M.; SILVA, S. M. H.; CARVALHO, M. C. C. G. de; KUWAHARA, M. K.; OLIVEIRA, M. C. N. de; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Functional characterization of soybean GmHsp17.6B and GmHsp22.4 genes in response to Meloidogyne javanica infection. In: WORKSHOP ON BIOTIC AND ABIOTIC STRESS TOLERANCE IN PLANTS, 2013, Ilhéus. The challenge for the 21st century: book of abstracts. [Brasília]: Embrapa: International Advanced Biology Consortium, 2013. p. 34.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | KUMA, K. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; ROMERO, C. C. T.; SILVA, S. M. H.; CARVALHO, M. C. C. G.; ABDELNOOR, R. V.; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. A high efficient protocol for soybean root transformation by Agrobacterium rhizogenes and most stable reference genes for RT-qPCR analysis. Plant Cell Reports, v. 34, n. 11, p. 1987-2000, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 20. | | CARVALHO, K.; ABE, V. Y.; DARBEN, L. M.; RINCÃO, M. P.; QI, M.; UTIYAMA, A. S.; CARVALHO, M. C. C. G.; LOPES, I. de O. N.; ABDELNOOR, R. V.; WHITHAM, S. A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Host induced gene silencing in P. pachyrhizi effectors interfere in virulence of soybean attenuating fungal pathogenicity In: IS-MPMI Congress, 18., 2019, Glasgow. [Abstracts...]. [S. l.: s. n.], 2019.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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