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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
16/10/2023 |
Data da última atualização: |
19/10/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
LEONI, G.; BUZANSKAS, M. E.; MARCONDES, C. R.; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P.; BERNARDES, P. A. |
Afiliação: |
GABRIELA LEONI, Universidade Federal de Santa Catarina; MARCOS ELI BUZANSKAS, Universidade Federal da Paraíba; CINTIA RIGHETTI MARCONDES, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; DANÍSIO PRADO MUNARI, Universidade Estadual Paulista; PRISCILA ARRIGUCCI BERNARDES, University Institute for Future Farming System. |
Título: |
Imputação utilizando painéis personalizados em bovinos da raça Canchim. |
Ano de publicação: |
2023 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 15., 2023, Jataí. O reinado dos fenótipos: novos desafios. Anais.... Jataí: SBMA, 2023. |
Páginas: |
p. 120-122. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Uma alternativa para reduzir o custo da aplicação da seleção genômica é a realização da imputação dos genótipos. No entanto, para raças em que a população é pequena, há indisponibilidade de grande quantidade de animais genotipados com alta densidade, como observado para raça Canchim. A utilização de raças fundadoras pode colaborar com a imputação, porém algumas vezes resulta em baixa acurácia. Assim, o objetivo deste estudo foi comparar a acurácia de imputação de painéis comerciais com painéis personalizados de baixa densidade imputados para um painel de alta densidade em bovinos da raça Canchim, utilizando população referência formada por animais da raça Nelore. Foram utilizados 400 animais Nelore na população referência e 396 animais Canchim e do grupo genético MA na população de imputação. Os painéis comerciais de baixa densidade considerados continham 20 mil e 50 mil SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) e 3 tipos de personalizações foram aplicadas com o objetivo de obter as mesmas densidades dos painéis comerciais, formando assim 8 diferentes cenários. A acurácia de imputação apresentou valores superiores nos painéis personalizados quando comparados com os comerciais e também, conforme a densidade dos painéis eram maiores, as acurácias tiveram seu valor aumentado. Houve pequena diferença entre a primeira forma de personalizar o painel comparado com a segunda e terceira, indicando que a maneira como o painel é construído interfere nas acurácias de imputação. |
Palavras-Chave: |
Bovino de corte; Genômica; Marcadores moleculares. |
Thesagro: |
Gado Canchim. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1157271/1/ImputacaoUtilizandoPaineis.pdf
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Marc: |
LEADER 02308nam a2200229 a 4500 001 2157271 005 2023-10-19 008 2023 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aLEONI, G. 245 $aImputação utilizando painéis personalizados em bovinos da raça Canchim.$h[electronic resource] 260 $aIn: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 15., 2023, Jataí. O reinado dos fenótipos: novos desafios. Anais.... Jataí: SBMA$c2023 300 $ap. 120-122. 520 $aUma alternativa para reduzir o custo da aplicação da seleção genômica é a realização da imputação dos genótipos. No entanto, para raças em que a população é pequena, há indisponibilidade de grande quantidade de animais genotipados com alta densidade, como observado para raça Canchim. A utilização de raças fundadoras pode colaborar com a imputação, porém algumas vezes resulta em baixa acurácia. Assim, o objetivo deste estudo foi comparar a acurácia de imputação de painéis comerciais com painéis personalizados de baixa densidade imputados para um painel de alta densidade em bovinos da raça Canchim, utilizando população referência formada por animais da raça Nelore. Foram utilizados 400 animais Nelore na população referência e 396 animais Canchim e do grupo genético MA na população de imputação. Os painéis comerciais de baixa densidade considerados continham 20 mil e 50 mil SNPs (polimorfismos de nucleotídeo único) e 3 tipos de personalizações foram aplicadas com o objetivo de obter as mesmas densidades dos painéis comerciais, formando assim 8 diferentes cenários. A acurácia de imputação apresentou valores superiores nos painéis personalizados quando comparados com os comerciais e também, conforme a densidade dos painéis eram maiores, as acurácias tiveram seu valor aumentado. Houve pequena diferença entre a primeira forma de personalizar o painel comparado com a segunda e terceira, indicando que a maneira como o painel é construído interfere nas acurácias de imputação. 650 $aGado Canchim 653 $aBovino de corte 653 $aGenômica 653 $aMarcadores moleculares 700 1 $aBUZANSKAS, M. E. 700 1 $aMARCONDES, C. R. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 700 1 $aMUNARI, D. P. 700 1 $aBERNARDES, P. A.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
26/01/2006 |
Data da última atualização: |
28/05/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CARVALHO, B. C. L. de; CARVALHO, H. W. L. de; LEAL, M. de L. da S.; SANTOS, M. X. dos; MARQUES, H. da S.; SILVA, I. O.; SAMAPIO, G. V.; DOURADO, V. V. |
Afiliação: |
EMBRAPA-CNPMS. |
Título: |
Adaptabilidade e estabilidade de variedades e híbridos de milho no Estado da Bahia. |
Ano de publicação: |
1999 |
Fonte/Imprenta: |
Agrotrópica, Ilhéus, v. 11, n. 3, p. 153-162, 1999. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Foram realizados dez ensaios de competição de variedades e de híbridos de milho, em cinco localidades, nas principais zonas produtoras de milho do Estado da Bahia, no ano agrícola de 1998, visando conhecer a adaptabilidade e a estabilidade desses materiais para fins de recomendação. Foram avaliados 25 variedades e 30 híbridos em blocos ao acaso, com três repetições. As análises de variância conjuntas evidenciaram diferenças entre as variedades e os híbridos, entre os locais, e um comportamento inconsistente das cultivares nas diferentes condições ambientais para os caracteres: altura da planta e da inserção da espiga, estande de colheita, número de espigas colhidas e peso dos grãos. As produtividades médias alcançadas com as variedades e os híbridos mostraram o potencial das regiões produtoras para o desenvolvimento da cultura do milho. Os híbridos expressaram melhor adaptação que as variedades e, dentre eles, destacaram-se Dina 1000, Pioneer 3021 e CargilI 909. A maioria dos híbridos mostrou uma alta estabilidade nos ambientes considerados. As variedades AL 30, CMS 50 e Sintético Dentado expressaram bom desempenho produtivo e se destacaram para os ambientes com boa tecnologia de produção. Entretanto, as variedades Sintético Duro, BR 5028- São Francisco, BR 5037 -Asa Branca, BR 50 l l-Sertanejo e CMS 453, que também expressaram boa adaptação, podem proporcionar melhoria na agricultura regional. |
Palavras-Chave: |
Adaptability; Hybrid varieties; Maize; Stability. |
Thesagro: |
Variedade; Zea mays. |
Thesaurus NAL: |
crop yield; varieties. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/66766/1/Adaptabilidade-estabilidade-23.pdf
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Marc: |
LEADER 02293naa a2200301 a 4500 001 1489183 005 2018-05-28 008 1999 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCARVALHO, B. C. L. de 245 $aAdaptabilidade e estabilidade de variedades e híbridos de milho no Estado da Bahia.$h[electronic resource] 260 $c1999 520 $aForam realizados dez ensaios de competição de variedades e de híbridos de milho, em cinco localidades, nas principais zonas produtoras de milho do Estado da Bahia, no ano agrícola de 1998, visando conhecer a adaptabilidade e a estabilidade desses materiais para fins de recomendação. Foram avaliados 25 variedades e 30 híbridos em blocos ao acaso, com três repetições. As análises de variância conjuntas evidenciaram diferenças entre as variedades e os híbridos, entre os locais, e um comportamento inconsistente das cultivares nas diferentes condições ambientais para os caracteres: altura da planta e da inserção da espiga, estande de colheita, número de espigas colhidas e peso dos grãos. As produtividades médias alcançadas com as variedades e os híbridos mostraram o potencial das regiões produtoras para o desenvolvimento da cultura do milho. Os híbridos expressaram melhor adaptação que as variedades e, dentre eles, destacaram-se Dina 1000, Pioneer 3021 e CargilI 909. A maioria dos híbridos mostrou uma alta estabilidade nos ambientes considerados. As variedades AL 30, CMS 50 e Sintético Dentado expressaram bom desempenho produtivo e se destacaram para os ambientes com boa tecnologia de produção. Entretanto, as variedades Sintético Duro, BR 5028- São Francisco, BR 5037 -Asa Branca, BR 50 l l-Sertanejo e CMS 453, que também expressaram boa adaptação, podem proporcionar melhoria na agricultura regional. 650 $acrop yield 650 $avarieties 650 $aVariedade 650 $aZea mays 653 $aAdaptability 653 $aHybrid varieties 653 $aMaize 653 $aStability 700 1 $aCARVALHO, H. W. L. de 700 1 $aLEAL, M. de L. da S. 700 1 $aSANTOS, M. X. dos 700 1 $aMARQUES, H. da S. 700 1 $aSILVA, I. O. 700 1 $aSAMAPIO, G. V. 700 1 $aDOURADO, V. V. 773 $tAgrotrópica, Ilhéus$gv. 11, n. 3, p. 153-162, 1999.
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Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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