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Registros recuperados : 104 | |
82. | | SOUZA, G. R. de; MARTINS, S. A.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; NECHET, K. de L.; DINIZ, I. S.; PELZER, G. Q. Controle alternativo da mancha fuliginosa do tomateiro com óleo essencial de Xylopia aromatica. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE DEFENSIVOS AGRÍCOLAS NATURAIS, 5., 2011, Jaguariúna. [Anais...] Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2011. 1 CD ROM. 5 p. Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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83. | | LIMA, H. E. de; NECHET, K. de L.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; OLIVEIRA, J. R.; MIZUBUTI, E. S. G.; SOUZA, G. R. de. Severidade da mancha bacteriana do feijão-caupi corrigida pela desfolha. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 47.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MOFO BRANCO, 2014, Londrina. Desafios futuros: anais. Londrina: SBF, 2014. Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Roraima. |
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85. | | PELZER, G. Q.; SCHURT, D. A.; SOUZA, L. T.; LIMA, H. E. de; ARAUJO, R. S.; GONCALVES, R. P.; RIBEIRO, M. M.; SOUZA, G. R. de. Efeito dos compostos voláteis produzidos por leveduras na inibição do crescimento micelial de Aspergillus flavus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 51., 2109, Recife. Os avanços da Fitopatologia na Era Genômica: anais. Recife: SBF: UFPRE/PPGF, 2019. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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86. | | NECHET, K. de L.; LIMA, H. E.; VIEIRA, B. de A. H.; SOUZA, G. R. de; SOUZA, G. R.; ALVES, C. P.; TORREYAS, L. S.; OLIVEIRA, J. R. Efeito de concentrações de inóculo de Xanthomonas axonopodis pv. vignicola na desfolha do feijão-caupi. In: Tropical Plant Pathology, v. 35, supl., 04.004, ago. 2010. Edição dos resumos do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 43. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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87. | | MORENO, G. S.; CARVALHO, L. M. J. de; FREITAS, S. C. de; CRUZ, A. G. da; MOURA, M. R. L.; SOUZA, G. R. de. Determination of minerals in burgers with low sodium contents. In: INTERNATIONAL ISEKI_FOOD CONFERENCE, 2., 2011, Milan. Bridging training and research for industry and the wider community: book of abstracts. Vienna: ISEKI-Food Association, 2011. Ref. P184. Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
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88. | | PELZER, G. Q.; SILVA, W. L. M.; VIEIRA, B. de A. H.; SOUZA, G. R. de; NECHET, K. de L.; MARTINS, S. A.; DINIZ, I. S. Efeito de sideróforos produzidos por rizobactérias no crescimento de Sclerotium Rolfsii. In: Tropical Plant Pathology, v. 35, supl., 02.013, ago. 2010. Edição dos resumos do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 43. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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89. | | SCHURT, D. A.; SILVA, M. R. da; RIBEIRO, M. M.; SOUZA, N. L. M.; SOUZA, G. R. de; SOUSA, N. V. de. Biocontrole de Rhizoctonia solani (AG1-IF e AG1-IA) em plantas de soja por isolados bacterianos e a promoção de crescimento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 53., 2023, Brasília, DF. Anais 2023. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2023. p. 237. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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91. | | LIMA, H. E. de; NECHET, K. de L.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; OLIVEIRA, J. R. de; MIZUBUTI, E. S. G.; SOUZA, G. R. de. Epidemiological aspects of cowpea bacterial blight. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 40, n. 1, p. 46-55, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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92. | | PELZER, G, Q.; HALFELD-VIEIRA, B. A.; SILVA, L. M.; SOUZA, G. R. de; PERIN, L.; ZILLI, J. E.; NECHET, K. de L. Mecanismos envolvidos na promoção de cresimento vegetal por rizobactérias de tomateiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Resumos... [São Paulo]: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2009. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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93. | | RODRIGUES, K. S.; LIMA, H. E. de; SCHURT, D. A.; SOUZA, G. R. de; SOUZA, I. L.; RIBEIRO, C. M. C. Período de exposição do ouriço no solo e incidência de fungos na castanha-do-Brasil (Bertholletia excelsa). In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE INTERAMERICANA DE HORTICULTURA TROPICAL, 61., 2015, Manaus. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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94. | | SILVA, W. L. M.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; SOUZA, G. R. de; SCHURT, D. A.; MACIEL, F. C. S.; SILVA, M. W. Otimização do isolamento de bactérias do Filoplano de maracujazeiro. In: Summa Phytopathologica, v. 38, supl. resumo 097, 2012. Edição dos resumos do 35º Congresso Paulista de Fitopatologia, 2012, Jaguariúna. Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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95. | | SILVA, W. L. M.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; SCHURT, D. A.; SOUZA, G. R. de; TRASSATO, L. B.; SILVA, M. F. Seleção de bactérias com capacidade de biocontrole da Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae. In: Tropical Plant Pathology, v. 37, supl. resumo 472 - Controle Biológico, 2012. Edição dos resumos do 45º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2012, Manaus/AM. Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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96. | | DINIZ, I. S.; SOUZA, G. R. de; PELZER, G. Q.; NECHET, K. de L.; VIEIRA, B. de A. H.; SIQUEIRA, R. H. da S. Seleção de rizobactérias do feijão-caupi com base no mecanismo de antibiose por difusão em meio para o controle de rhizoctonia solani. In: REUNIÃO ANUAL DA SBPC, 62., 2010, Natal. Ciências do mar: herança para o futuro: anais/resumos. [s.l.]: SBPC, 2010. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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97. | | MARTINS, S. A.; NECHET, K. de L.; VIEIRA, B. de A. H.; SOUZA, G. R. de; DINIZ I. S.; PELZER, G. Q.; SILVA, W. L. M. Seleção de rizobactérias do feijão-caupi produtoras de -1,3- glucanase para o controle de Rhizoctonia Solani. In: Tropical Plant Pathology, v. 35, supl., 02.038, ago. 2010. Edição dos resumos do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 43. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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98. | | DINIZ, I. S.; NECHET, K de L.; HALFELD-VIEIRA, B. A.; SOUZA, G. R. de; PELZER, G. Q.; ZILLI, J. E. Seleção de rizobactérias produtoras de quitinase para controle de Rhizoctonia solani. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Resumos... [São Paulo]: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2009. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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99. | | SOUZA, I. L.; LIMA, H. E. de; SCHURT, D. A.; SOUZA, G. R. de; SANTOS, A. F.; RODRIGUES, K. S.; RIBEIRO, C. M. C. Seleção de Trichoderma spp. visando controle biológico de Aspergillus Flavus em amêndoas de castanha-do-Brasil. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE INTERAMERICANA DE HORTICULTURA TROPICAL, 61., 2015, Manaus. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2015. Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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100. | | SILVA, W. L. M.; HALFELD-VIEIRA, B. de A.; SCHURT, D. A.; SOUZA, G. R. de; MARTINS, S. A.; TRASSATO, L. B. Sensibilidade de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae a cobre in vitro. In: Tropical Plant Pathology, v. 37, supl. resumo 494 - Controle Químico, 2012. Edição dos resumos do 45º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2012, Manaus/AM Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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Registros recuperados : 104 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
Data corrente: |
09/10/2020 |
Data da última atualização: |
16/11/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMPOS, T. de. |
Afiliação: |
Jônatas Chagas de Oliveira, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Recursos Genéticos da Rede Bionorte, Universidade Federal do Acre; André Lucas Domingos da Silva, Programa de Pós-Graduação em Ciência, Inovação e Tecnologia para a Amazônia, Universidade Federal do Acre; Carla Cristina da Silva, Universidade Estadual de Campinas; Anete Pereira de Souza, Universidade Estadual de Campinas; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC. |
Título: |
Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2., 2019, Rio Branco, AC. A Contribuição da ciência para a agropecuária no Acre: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2020. |
Páginas: |
p. 83-88. |
Descrição Física: |
Banner. |
Série: |
(Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 2). |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Editores técnicos: Virgínia de Souza Álvares; Fabiano Marçal Estanislau. |
Conteúdo: |
O uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi extraído e utilizado para montagem das bibliotecas, as quais foram sequenciadas e tiveram seu genoma funcional montado com o software Trinity® e metodologia de novo. Um total de 336 milhões de reads foi obtido, dos quais 84.229 foram utilizados na identificação de microssatélites. Dos 4.461 marcadores encontrados, 186 foram selecionados para validação e 80 (43%) apresentaram perfil ideal de amplificação. Desses 80, 29 foram genotipados e apresentaram-se polimórficos. Foi possível acessar a diversidade genética em 20 genótipos. Esses dados indicam a informatividade dos novos marcadores, os quais poderão contribuir para acelerar o melhoramento do amendoim forrageiro. |
Palavras-Chave: |
Acre; Amarillo MG-100; Amazonia Occidental; Amazônia Ocidental; Amendoim forrageiro; Análisis de secuencia; Belomonte; Cacahuetes forrajeros; Cultivo mixto; Embrapa Acre; Forage peanut; Genoma funcional; Leguminosas forrajeras; Pastos forrajeros; Repeticiones de microsatélite; Rio Branco (AC); RNA sequencing; RNA-Seq; Western Amazon. |
Thesagro: |
Banco de Germoplasma; Gramínea Forrageira; Leguminosa Forrageira; Marcador Genético; Pastagem Consorciada. |
Thesaurus NAL: |
Arachis pintoi; Forage grasses; Forage legumes; Germplasm conservation; Microsatellite repeats; Mixed cropping; Sequence analysis. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216570/1/27049.pdf
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Marc: |
LEADER 03415nam a2200577 a 4500 001 2125415 005 2023-11-16 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aOLIVEIRA, J. C. de 245 $aCaracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites.$h[electronic resource] 260 $aIn: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2., 2019, Rio Branco, AC. A Contribuição da ciência para a agropecuária no Acre: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre$c2020 300 $ap. 83-88.$cBanner. 490 $a(Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 2). 500 $aEditores técnicos: Virgínia de Souza Álvares; Fabiano Marçal Estanislau. 520 $aO uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi extraído e utilizado para montagem das bibliotecas, as quais foram sequenciadas e tiveram seu genoma funcional montado com o software Trinity® e metodologia de novo. Um total de 336 milhões de reads foi obtido, dos quais 84.229 foram utilizados na identificação de microssatélites. Dos 4.461 marcadores encontrados, 186 foram selecionados para validação e 80 (43%) apresentaram perfil ideal de amplificação. Desses 80, 29 foram genotipados e apresentaram-se polimórficos. Foi possível acessar a diversidade genética em 20 genótipos. Esses dados indicam a informatividade dos novos marcadores, os quais poderão contribuir para acelerar o melhoramento do amendoim forrageiro. 650 $aArachis pintoi 650 $aForage grasses 650 $aForage legumes 650 $aGermplasm conservation 650 $aMicrosatellite repeats 650 $aMixed cropping 650 $aSequence analysis 650 $aBanco de Germoplasma 650 $aGramínea Forrageira 650 $aLeguminosa Forrageira 650 $aMarcador Genético 650 $aPastagem Consorciada 653 $aAcre 653 $aAmarillo MG-100 653 $aAmazonia Occidental 653 $aAmazônia Ocidental 653 $aAmendoim forrageiro 653 $aAnálisis de secuencia 653 $aBelomonte 653 $aCacahuetes forrajeros 653 $aCultivo mixto 653 $aEmbrapa Acre 653 $aForage peanut 653 $aGenoma funcional 653 $aLeguminosas forrajeras 653 $aPastos forrajeros 653 $aRepeticiones de microsatélite 653 $aRio Branco (AC) 653 $aRNA sequencing 653 $aRNA-Seq 653 $aWestern Amazon 700 1 $aSILVA, A. L. D. da 700 1 $aSILVA, C. C. da 700 1 $aSOUZA, A. P. de 700 1 $aFORMIGHIERI, E. F. 700 1 $aCAMPOS, T. de
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