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| Registros recuperados : 209 | |
| 141. |  | MACHADO, G. M.; CARVALHO, J. O.; SIQUEIRA FILHO, E.; CAIXETA, E. S.; FRANCO, M. M.; RUMPF, R.; DODE, M. A. N. Effect of Percoll volume, duration and force of centrifugation, on in vitro production and sex ratio of bovine embryos. Theriogenology, v. 71, n. 8, p. 1289-1297, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 142. | | FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; CRUZ, C. D.; SOUZA, F. de F.; FERRAO, M. A. G.; ZAMBOLIM, Z.; SAKIYAMA, N. S. The effects of encoding data in diversity studies and the applicability of the weighting index approach for data analysis from different molecular markers. Plant Systematics and Evolution, v. 300, n. 7, p. 1649-1661, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Rondônia; Embrapa Semiárido. |
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| 143. | | BRITO, G. G.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIN, E. M.; ZAMBOLIM, L.; ALMEIDA, R. M.; DIOLA, V.; SAKIYAMA, N.; LOUREIRO, M. E. Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do híbrido de timor à Hemileia vastatrix. In: Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 5., 2007, Águas de Lindóia. Anais. Brasília, D.F. : Embrapa Café, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 144. | | PEREIRA, L. F. P.; DIOLA, V.; CAÇÃO, S. M. B.; CAIXETA, E. T.; BRITO, G. G. de; ZAMBOLIN, E. M.; LOUREIRO, M. E. Mapeamento integrado de Coffea arabica: identificação de marcadores e clones BAC para o gene de resistência a ferrugem. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 23. 2010, Bali, Indonesia.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 145. | | FAGUNDES, N. S.; MICHALCZECHEN-LACERDA, V. A.; CAIXETA, E. S.; MACHADO, G. M.; RODRIGUES, F. C.; MELO, E. de O.; DODE, M. A. N.; FRANCO, M. M. Methylation status in the intragenic differentially methylated region of the IGF2 locus in Bos taurus indicus oocytes with different developmental competencies. Molecular Human Reproduction, v. 17, n. 2, p. 85-91, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 146. | | CAPUCHO, A. S.; RUFINO, R. J. N.; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T.; OLIVEIRA, A. C. B. de; ALMEIDA, R. F. de; BRITO, G. G. de; ZAMBOLIM, L. Método de inoculação de Hemileia vastarix Berk. et Br. em folhas destacadas de cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 4., 2005, Londrina. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 147. | | SAAVEDRA, L. M.; CAIXETA, E. T.; BARKA, G. D.; BORÉM, A.; ZAMBOLIM, L.; NASCIMENTO, M.; CRUZ, C. D.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A. Marker-assisted recurrent selection for pyramiding leaf rust and coffee berry disease resistance alleles in Coffea Arabica L. Genes, v. 14, n. 1, 2023. 18 p.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 148. | | ALKIMIM, E. R.; CAIXETA, E. T.; SOUSA, T. V.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Marker-assisted selection provides arabica coffee with genes from other Coffea species targeting on multiple resistance to rust and coffee berry disease. Molecular Breeding, v. 37, n. 6, p. 1-10, jan. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 149. | | RUFINO, R. J. N.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; PENA, G. F.; ALMEIDA, R. F. de; ALVARENGA, S. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Marcadores microssatélites para o cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 4., 2005, Londrina. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 150. | | MOTTA, L. B.; SOARES, T. C. B.; FERRAO, M. A. G.; CAIXETA, E. T.; LORENZON, R. M.; SOUZA NETO, J. D. de. Molecular characterization of arabica and conilon coffee plants genotypes by SSR and ISSR markers. Brazilian Archives of biology and technology, v. 57 , n. 5, p.728-735 , 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 151. | | SOUZA, F. de F.; CAIXETA, E. T.; FERRÃO, L. F. V.; PENA, G. F.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; CRUZ, C. D. Molecular diversity in Coffea canephora germplasm conserved and cultivated in Brazil. Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 13, p. 221-227, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Semiárido. |
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| 152. | | CRUZ, A. F.; SIVA, L. F.; SOUSA, T. V.; NICOLI, A.; PAULA JUNIOR, T. J. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, L. Molecular diversity in Fusarium oxysporum isolates from common bean fields in Brazil. European Journal of Plant Pathology, v. 152, n. 2, p. 343-354, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 153. | | SOUSA, T. V.; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Molecular markers useful to discriminate Coffea arabica cultivars with high genetic similarity. Euphytica, v. 213, n. 3, March, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 154. | | FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; PENA, G.; ZAMBOLIM, E. M.; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; FERRAO, M. A. G.; SAKIYAMA, N. S. New EST-SSR markers of Coffea arabica: transferability and application to studies of molecular characterization and genetic mapping. Molecular Breeding, v. 35, n. 1, p. 2-5, jan. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 155. | | SUDANO, M. J.; CAIXETA, E. S.; PASCHOAL, D. M.; MARTINS JÚNIOR, A.; MACHADO, R.; BURATINI, J.; LANDIM-ALVARENGA, F. D. C. Cryotolerance and global gene-expression patterns of Bos taurus indicus and Bos taurus taurus in vitroand in vivo-produced blastocysts. Reproduction, Fertility and Development, v. 26, p. 1129-1141,2013.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 156. | | CORDEIRO, M. H. M.; BRUCKNER, C. H.; ROSADO, R. D. S.; SANTOS, C. E. M. dos; CAIXETA, E. T.; SOUSA, T. V.; CRUZ, C. D. Contribution of male genitors in open-pollination progenies of sour passion fruit. Euphytica, v. 216, n. 9, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 157. | | DIOLA, V.; LOUREIRO, M. E.; BRITO, G. G. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIN, E. M.; SAKIYAMA, N. S.; PEREIRA, L. F. P. Construção do mapa genético e físico para um gene de resistência a Hemileia vastatrix em café. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para produção de alimentos e bioenergia. Fortaleza: SBFV: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 158. | | SOUSA, T. V.; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R. de; ZAMBOLIM, L. Population structure and genetic diversity of coffee progenies derived from Catuaí and Híbrido de Timor revealed by genome-wide SNP marker. Tree Genetics & Genomes, v. 13, n. 6, Dec. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 159. | | LANES, E. C. M.; VIANA, J. M. S.; PAES, G. P.; PAULA, M. F. B.; MAIA, C.; CAIXETA, E. T.; MIRANDA, G. V. Population structure and genetic diversity of maize inbreds derived from tropical hybrids. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 3, p. 7365-7376, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 160. | | PORTO, B. N.; CAIXETA, E. T.; VIDIGAL, P. M. P.; LELIS, D. T.; ZAMBOLIM, E. M.; RESENDE, M. L. V. de. Predição do secretoma de Hemileia vastatrix RAÇA XXXIII. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRSIL, 9., 2015, Curitiba. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| Registros recuperados : 209 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
26/01/2022 |
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Data da última atualização: |
26/01/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
OLIVEIRA, G. F.; NASCIMENTO, A. C. C.; NASCIMENTO, M.; SANT'ANNA, I. de C.; ROMERO, J. V.; AZEVEDO, C. F.; BHERING, L. L.; CAIXETA, E. T. |
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Afiliação: |
GABRIELA FRANÇA OLIVEIRA, UFV; ANA CAROLINA CAMPANA NASCIMENTO, UFV; MOYSÉS NASCIMENTO, UFV; ISABELA DE CASTRO SANT'ANNA, IAC; JUAN VICENTE ROMERO, AGROSAVIA; CAMILA FERREIRA AZEVEDO, UFV; LEONARDO LOPES BHERING, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa. |
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Título: |
Quantile regression in genomic selection for oligogenic traits in autogamous plants: a simulation study. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 16, n. 1, e0243666, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0243666 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study assessed the efficiency of Genomic selection (GS) or genome‐wide selection (GWS), based on Regularized Quantile Regression (RQR), in the selection of genotypes to breed autogamous plant populations with oligogenic traits. To this end, simulated data of an F2 population were used, with traits with different heritability levels (0.10, 0.20 and 0.40), controlled by four genes. The generations were advanced (up to F6) at two selection intensities (10% and 20%). The genomic genetic value was computed by RQR for different quantiles (0.10, 0.50 and 0.90), and by the traditional GWS methods, specifically RR-BLUP and BLASSO. A second objective was to find the statistical methodology that allows the fastest fixation of favorable alleles. In general, the results of the RQR model were better than or equal to those of traditional GWS methodologies, achieving the fixation of favorable alleles in most of the evaluated scenarios. At a heritability level of 0.40 and a selection intensity of 10%, RQR (0.50) was the only methodology that fixed the alleles quickly, i.e., in the fourth generation. Thus, it was concluded that the application of RQR in plant breeding, to simulated autogamous plant populations with oligogenic traits, could reduce time and consequently costs, due to the reduction of selfing generations to fix alleles in the evaluated scenarios. |
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Thesagro: |
Regressão Linear; Seleção Genótipa. |
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Thesaurus NAL: |
Genomics; Plant breeding; Plant selection guides. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/230507/1/Quantile-regression-in-genomic.pdf
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Marc: |
LEADER 02224naa a2200277 a 4500
001 2139325
005 2022-01-26
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0243666$2DOI
100 1 $aOLIVEIRA, G. F.
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260 $c2021
520 $aThis study assessed the efficiency of Genomic selection (GS) or genome‐wide selection (GWS), based on Regularized Quantile Regression (RQR), in the selection of genotypes to breed autogamous plant populations with oligogenic traits. To this end, simulated data of an F2 population were used, with traits with different heritability levels (0.10, 0.20 and 0.40), controlled by four genes. The generations were advanced (up to F6) at two selection intensities (10% and 20%). The genomic genetic value was computed by RQR for different quantiles (0.10, 0.50 and 0.90), and by the traditional GWS methods, specifically RR-BLUP and BLASSO. A second objective was to find the statistical methodology that allows the fastest fixation of favorable alleles. In general, the results of the RQR model were better than or equal to those of traditional GWS methodologies, achieving the fixation of favorable alleles in most of the evaluated scenarios. At a heritability level of 0.40 and a selection intensity of 10%, RQR (0.50) was the only methodology that fixed the alleles quickly, i.e., in the fourth generation. Thus, it was concluded that the application of RQR in plant breeding, to simulated autogamous plant populations with oligogenic traits, could reduce time and consequently costs, due to the reduction of selfing generations to fix alleles in the evaluated scenarios.
650 $aGenomics
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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