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| Registros recuperados : 209 | |
| 141. |  | ALKIMIM, E. R.; CAIXETA, E. T.; SOUSA, T. V.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Marker-assisted selection provides arabica coffee with genes from other Coffea species targeting on multiple resistance to rust and coffee berry disease. Molecular Breeding, v. 37, n. 6, p. 1-10, jan. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 142. | | RUFINO, R. J. N.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; PENA, G. F.; ALMEIDA, R. F. de; ALVARENGA, S. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Marcadores microssatélites para o cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 4., 2005, Londrina. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 143. | | BRITO, G. G.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIN, E. M.; ZAMBOLIM, L.; ALMEIDA, R. M.; DIOLA, V.; SAKIYAMA, N.; LOUREIRO, M. E. Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do híbrido de timor à Hemileia vastatrix. In: Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 5., 2007, Águas de Lindóia. Anais. Brasília, D.F. : Embrapa Café, 2007.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 144. | | PEREIRA, L. F. P.; DIOLA, V.; CAÇÃO, S. M. B.; CAIXETA, E. T.; BRITO, G. G. de; ZAMBOLIN, E. M.; LOUREIRO, M. E. Mapeamento integrado de Coffea arabica: identificação de marcadores e clones BAC para o gene de resistência a ferrugem. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 23. 2010, Bali, Indonesia.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 145. | | CAPUCHO, A. S.; ZAMBOLIM, L.; ROSADO, A. W. C.; FERRÃO, R. G.; FERRAO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da; ZAMBOLIM, E. M.; CAIXETA, E. T. Resistência do conilon Vitória 8142 à raça I de Hemileia vastatrix. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 146. | | FEITOSA, F. de M.; ALMEIDA, D. P. de; ZAMBOLIM, L.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CAIXETA, E. T. Seleção assistida por marcadores moleculares de cafeeiros resistentes a ferrugem e antracnose dos frutos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 98| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 147. | | ALKIMIM, E. R.; CAIXETA, E. T.; SOUSA, T. V.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Seleção assistida por marcadores moleculares para resistência à ferrugem do cafeeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 148. | | ALKIMIM, E. R.; CAIXETA, E. T.; SOUSA, T. V.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. L. da; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L. Selective efficiency of genome-wide selection in Coffea canephora breeding. Tree Genetics & Genomes, v. 16, n. 3, p. 1-11, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 149. | | ALMEIDA, D. P. de; MOREIRA, K. F.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S.; CAIXETA, E. T. Eficácia de marcadores SCAR, CAPS e SSR na seleção assistida de cafeeiros resistentes a Hemileia vastatrix. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 44| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 150. | | MACHADO, G. M.; CARVALHO, J. O.; SIQUEIRA FILHO, E.; CAIXETA, E. S.; FRANCO, M. M.; RUMPF, R.; DODE, M. A. N. Effect of Percoll volume, duration and force of centrifugation, on in vitro production and sex ratio of bovine embryos. Theriogenology, v. 71, n. 8, p. 1289-1297, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 151. | | FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; CRUZ, C. D.; SOUZA, F. de F.; FERRAO, M. A. G.; ZAMBOLIM, Z.; SAKIYAMA, N. S. The effects of encoding data in diversity studies and the applicability of the weighting index approach for data analysis from different molecular markers. Plant Systematics and Evolution, v. 300, n. 7, p. 1649-1661, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Rondônia; Embrapa Semiárido. |
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| 152. | | SOUSA, T. V.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; CAIXETA, E. T. Estrutura de populações e diversidade genética de Coffea arabica analisadas por marcadores moleculares SNP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 533| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 153. | | CARVALHO, J. O.; MACHADO, G. M.; SIQUEIRA FILHO, E.; CAIXETA, E. S.; FRANCO, M. M.; RUMPF, R.; DODE, M. A. N. Gradiente de Percoll em diferentes volumes, tempo e força de centrifugação na produção In vitro e no sexo de embriões bovinos. Acta Scientiae Veterinariae, v. 36, supl. 2, p. S514, 2008 Edição dos resumos da 22. Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Tecnologia de Embriões, Guarujá, SP, 2008.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 154. | | LUDKE, W. H.; CORREIA, A. M.; FERREIRA, J. M. S.; SOARES, B. de A.; GOMES, B. E. L.; CAIXETA, E. T.; SILVA, F. L. da. Identificação de híbridos em soja utilizando marcadores moleculares microssatélites. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 329| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 155. | | GALLINA, A. P; ALMEIDA, R. F. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; FREITAS, F. de S.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Identificação de genes diferencialmente expressos durante a interação incompatível cafeeiro-Hemileia vastatrix. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 156. | | GALLINA, A. P; ALMEIDA, R. F. de; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; FREITAS, F. de S.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. Identificação de genes diferencialmente expressos durante a interação incompatível cafeeiro-Hemileia vastatrix. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 157. | | FLORES, J. C.; MOFATTO, L. S.; FREITAS-LOPES, R. do L.; FERREIRA, S. S.; ZAMBOLIM, E. M.; CARAZZOLLE, M. F.; ZAMBOLIM, L.; CAIXETA, E. T. High throughput transcriptome analysis of coffee reveals prehaustorial resistance in response to Hemileia vastatrix infection. Plant Molecular Biology, v. 95, n. 6, p. 607-623, Dec. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 158. | | SUELA, M. M.; AZEVEDO, C. F.; NASCIMENTO, A. C. C.; MOMEN, M.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CAIXETA, E. T.; MOROTA, G.; NASCIMENTO, M. Genome-wide association study for morphological, physiological, and productive traits in Coffea arabica using structural equation models. Tree Genetics & Genomes, v. 19, n. 3, 2023. 17 p.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 159. | | SETOTAW, T. A.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; SOUSA, T. V.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; SAKYAMA, N. S. Genome introgression of Híbrido de Timor and its potential to develop high cup quality C. arabica cultivars. Journal of Agricultural Science, v. 12, n. 4, p. 64-76, 2020.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 160. | | DIOLA, V.; CAÇÃO, S. M. B.; CAIXETA, E. T.; BRITO, G. G.; ZAMBOLIM, E. M.; PEREIRA, L. F. P.; LOUREIRO, M. E. Genetic and physical mapping of the resistant gene for H. vastatrix race II in Coffea arabica. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 23. 2010, Bali, Indonesia.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| Registros recuperados : 209 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
19/02/2019 |
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Data da última atualização: |
17/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
SOUSA, T. V.; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; RESENDE, M. D. V. de. |
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Afiliação: |
TIAGO VIEIRA SOUSA, BIOAGRO/BioCafé/Universidade Federal de Viçosa - UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, CNPCa; EMILLY RUAS ALKIMIM, Universidade Federal do Triângulo Mineiro - UFTM; ANTONIO CARLOS BAIAO DE OLIVEIRA, CNPCa; ANTONIO ALVES PEREIRA, Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais – Epamig; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitotecnia; LAÉRCIO ZAMBOLIM, Universidade Federal de Viçosa - UFV/Departamento de Fitopatologia; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF. |
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Título: |
Early Selection Enabled by the Implementation of Genomic Selection in Coffea arabica Breeding. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 9, January 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Genomic Selection (GS) has allowed the maximization of genetic gains per unit time in several annual and perennial plant species. However, no GS studies have addressed Coffea arabica, the most economically important species of the genus Coffea. Therefore, this study aimed (i) to evaluate the applicability and accuracy of GS in the prediction of the genomic estimated breeding value (GEBV); (ii) to estimate the genetic parameters; and (iii) to evaluate the time reduction of the selection cycle by GS in Arabica coffee breeding. A total of 195 Arabica coffee individuals, belonging to 13 families in generation of F2, susceptible backcross and resistant backcross, were phenotyped for 18 agronomic traits, and genotyped with 21,211 SNP molecular markers. Phenotypic data, measured in 2014, 2015, and 2016, were analyzed by mixed models. GS analyses were performed by the G-BLUPmethod, using the RKHS (Reproducing Kernel Hilbert Spaces) procedure, with a Bayesian algorithm. Heritabilities and selective accuracies were estimated, revealing moderate to high magnitude for most of the traits evaluated. Results of GS analyses showed the possibility of reducing the cycle time by 50%, maximizing selection gains per unit time. The effect of marker density on GS analyses was evaluated. Genomic selection proved to be promising for C. arabica breeding. The agronomic traits presented high complexity for they are controlled by several QTL and showed low genomic heritabilities, evidencing the need to incorporate genomic selection methodologies to the breeding programs of this species. MenosGenomic Selection (GS) has allowed the maximization of genetic gains per unit time in several annual and perennial plant species. However, no GS studies have addressed Coffea arabica, the most economically important species of the genus Coffea. Therefore, this study aimed (i) to evaluate the applicability and accuracy of GS in the prediction of the genomic estimated breeding value (GEBV); (ii) to estimate the genetic parameters; and (iii) to evaluate the time reduction of the selection cycle by GS in Arabica coffee breeding. A total of 195 Arabica coffee individuals, belonging to 13 families in generation of F2, susceptible backcross and resistant backcross, were phenotyped for 18 agronomic traits, and genotyped with 21,211 SNP molecular markers. Phenotypic data, measured in 2014, 2015, and 2016, were analyzed by mixed models. GS analyses were performed by the G-BLUPmethod, using the RKHS (Reproducing Kernel Hilbert Spaces) procedure, with a Bayesian algorithm. Heritabilities and selective accuracies were estimated, revealing moderate to high magnitude for most of the traits evaluated. Results of GS analyses showed the possibility of reducing the cycle time by 50%, maximizing selection gains per unit time. The effect of marker density on GS analyses was evaluated. Genomic selection proved to be promising for C. arabica breeding. The agronomic traits presented high complexity for they are controlled by several QTL and showed low genomic heritabilities, evidencing the need to ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Accelerating improvement; Complex traits; Ganho genético; Genetic gains; Genomic-enabled prediction accuracy; Selective efficiency; SNP molecular marker. |
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Thesagro: |
Café; Coffea Arábica. |
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Thesaurus NAL: |
Plant breeding. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/193820/1/Early-selection-enabled-by-the-implementation.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/197479/1/2019-M.Deon-FPS-Early.pdf
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Marc: |
LEADER 02545naa a2200325 a 4500
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245 $aEarly Selection Enabled by the Implementation of Genomic Selection in Coffea arabica Breeding.$h[electronic resource]
260 $c2019
520 $aGenomic Selection (GS) has allowed the maximization of genetic gains per unit time in several annual and perennial plant species. However, no GS studies have addressed Coffea arabica, the most economically important species of the genus Coffea. Therefore, this study aimed (i) to evaluate the applicability and accuracy of GS in the prediction of the genomic estimated breeding value (GEBV); (ii) to estimate the genetic parameters; and (iii) to evaluate the time reduction of the selection cycle by GS in Arabica coffee breeding. A total of 195 Arabica coffee individuals, belonging to 13 families in generation of F2, susceptible backcross and resistant backcross, were phenotyped for 18 agronomic traits, and genotyped with 21,211 SNP molecular markers. Phenotypic data, measured in 2014, 2015, and 2016, were analyzed by mixed models. GS analyses were performed by the G-BLUPmethod, using the RKHS (Reproducing Kernel Hilbert Spaces) procedure, with a Bayesian algorithm. Heritabilities and selective accuracies were estimated, revealing moderate to high magnitude for most of the traits evaluated. Results of GS analyses showed the possibility of reducing the cycle time by 50%, maximizing selection gains per unit time. The effect of marker density on GS analyses was evaluated. Genomic selection proved to be promising for C. arabica breeding. The agronomic traits presented high complexity for they are controlled by several QTL and showed low genomic heritabilities, evidencing the need to incorporate genomic selection methodologies to the breeding programs of this species.
650 $aPlant breeding
650 $aCafé
650 $aCoffea Arábica
653 $aAccelerating improvement
653 $aComplex traits
653 $aGanho genético
653 $aGenetic gains
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653 $aSelective efficiency
653 $aSNP molecular marker
700 1 $aCAIXETA, E. T.
700 1 $aALKIMIM, E. R.
700 1 $aOLIVEIRA, A. C. B. de
700 1 $aPEREIRA, A. A.
700 1 $aSAKIYAMA, N. S.
700 1 $aZAMBOLIM, L.
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
773 $tFrontiers in Plant Science$gv. 9, January 2019.
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Embrapa Café (CNPCa) |
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