| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
|
Data corrente: |
13/10/2008 |
|
Data da última atualização: |
14/11/2008 |
|
Autoria: |
COSTA, A. M. |
|
Título: |
Caracterização de regiões de integração de minicírculos de kDNA de Trypanosoma cruzi no genoma humano. |
|
Ano de publicação: |
2008 |
|
Fonte/Imprenta: |
2008. |
|
Páginas: |
165 f. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Tese (Doutorado) - Universidade de Brasília, Brasília. |
|
Conteúdo: |
A integração de minicírculos de kDNA do Trypanossoma cruzi no genoma hospedeiro foi correlacionada com alterações na expressão gênica. Com a finalidade de caracterizar as regiões híbridas e ampliar o conhecimento biológico realizou-se os isolamentos e clonagens dos minicírculos integrados no genoma de macrófagos humanos em cultura e de tecidos de coelhos chagásicos.
Observou-se instabilidade genética dos segmentos que continham as integrações. As clonagens realizadas em diferentes combinações de vetores e hospedeiras não evitaram os rearranjos. A análise de restrição e o seqUenciamento dos segmentos recuperados mostraram alterações no tamanho e na estrutura do vetor. A técnica de captura desenvolvida no presente estudo permitiu confirmar a instabilidade genética dos minicírculos preferencialmente integrados. A análise de restrição e o seqUenciamento desses fragmentos mostraram que os minicírculos recuperados apresentaram encurtamentos nas regiões variáveis em relação ao padrão descrito na literatura. Verificou-se que o encurtamento ocorreu durante ou após a integração no genoma. As regiões variáveis encurtadas de 50 pb foram recuperadas das linhagens subclonais de macrófago A 11, C4, C6 e coração de coelhos chagásicos. Quando comparadas entre si essas regiões apresentaram similaridade na ordem de 90%. Em relação à região variável 80 pb, recuperada do macrófago C6, a similaridade foi em tomo de 75%. O resultado sugeriu a existência de classes de minicírculos que se integram preferencialmente no genoma hospedeiro.
Foram obtidos clones híbridos estáveis contendo o final da região conservada nas extremidades seguidas pela região variável truncada, fi'agmento de elemento UNE-I, com ou sem a presença de microssatélite. A origem híbrida foi confirmada por fi'agmentação do clone que foi utilizado como sonda na hibridação de macrófagos humanos normais e DNA de T cruzi.
O segmento 87, obtido por captura, apresentou o minicírculo de kDNA com 4 regiões variáveis truncadas, intercaladas por regiões conservadas normais seguidas do microssatélite CA e da região humana com similaridade ao clone murino AC131797.3. A análise "in silico" do segmento 87 mostrou a presença de seqüências regulatórias da expressão gênica. Foram identificadas 9 possíveis ORFs, sendo duas compreendo a região híbrida (ORF1 e 2). Verificou-se nas integrações recuperadas de coração de coelhos chagásicos segmentos similares à região humana encontrada no clone 87, indicando a recorrência dos sítios recombinativos.
A análise "in silico" do clone 87, G I O e das regiões hospedeiras obtidas dos bancos de dados mostrou a presença de estruturas do tipo não 8 nos locais próximos ao ponto de recombinação. A presença da estrutura não 8 no segmento 87 foi confirmada pela alteração na mobilidade eletroforética. Em todos os pontos de entrada do minicírculo no genoma hospedeiro verificou-se a redução da tensão local e aumento da tensão global na região, sugerindo a possibilidade de ocorrência de novos eventos recombinativos envolvendo o segmento. O conjunto das informações indica que a integração é mediada por recombinação homologa mediada por similaridades estruturais presentes no DNA hospedeiro e minicírculo de kDNA. MenosA integração de minicírculos de kDNA do Trypanossoma cruzi no genoma hospedeiro foi correlacionada com alterações na expressão gênica. Com a finalidade de caracterizar as regiões híbridas e ampliar o conhecimento biológico realizou-se os isolamentos e clonagens dos minicírculos integrados no genoma de macrófagos humanos em cultura e de tecidos de coelhos chagásicos.
Observou-se instabilidade genética dos segmentos que continham as integrações. As clonagens realizadas em diferentes combinações de vetores e hospedeiras não evitaram os rearranjos. A análise de restrição e o seqUenciamento dos segmentos recuperados mostraram alterações no tamanho e na estrutura do vetor. A técnica de captura desenvolvida no presente estudo permitiu confirmar a instabilidade genética dos minicírculos preferencialmente integrados. A análise de restrição e o seqUenciamento desses fragmentos mostraram que os minicírculos recuperados apresentaram encurtamentos nas regiões variáveis em relação ao padrão descrito na literatura. Verificou-se que o encurtamento ocorreu durante ou após a integração no genoma. As regiões variáveis encurtadas de 50 pb foram recuperadas das linhagens subclonais de macrófago A 11, C4, C6 e coração de coelhos chagásicos. Quando comparadas entre si essas regiões apresentaram similaridade na ordem de 90%. Em relação à região variável 80 pb, recuperada do macrófago C6, a similaridade foi em tomo de 75%. O resultado sugeriu a existência de classes de minicírculos que se integram p... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Biotecnologia; Clonagem; DNA; Doença de Chagas; Engenharia Genética. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 03902nam a2200193 a 4500
001 1570909
005 2008-11-14
008 2008 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aCOSTA, A. M.
245 $aCaracterização de regiões de integração de minicírculos de kDNA de Trypanosoma cruzi no genoma humano.
260 $a2008.$c2008
300 $a165 f.
500 $aTese (Doutorado) - Universidade de Brasília, Brasília.
520 $aA integração de minicírculos de kDNA do Trypanossoma cruzi no genoma hospedeiro foi correlacionada com alterações na expressão gênica. Com a finalidade de caracterizar as regiões híbridas e ampliar o conhecimento biológico realizou-se os isolamentos e clonagens dos minicírculos integrados no genoma de macrófagos humanos em cultura e de tecidos de coelhos chagásicos. Observou-se instabilidade genética dos segmentos que continham as integrações. As clonagens realizadas em diferentes combinações de vetores e hospedeiras não evitaram os rearranjos. A análise de restrição e o seqUenciamento dos segmentos recuperados mostraram alterações no tamanho e na estrutura do vetor. A técnica de captura desenvolvida no presente estudo permitiu confirmar a instabilidade genética dos minicírculos preferencialmente integrados. A análise de restrição e o seqUenciamento desses fragmentos mostraram que os minicírculos recuperados apresentaram encurtamentos nas regiões variáveis em relação ao padrão descrito na literatura. Verificou-se que o encurtamento ocorreu durante ou após a integração no genoma. As regiões variáveis encurtadas de 50 pb foram recuperadas das linhagens subclonais de macrófago A 11, C4, C6 e coração de coelhos chagásicos. Quando comparadas entre si essas regiões apresentaram similaridade na ordem de 90%. Em relação à região variável 80 pb, recuperada do macrófago C6, a similaridade foi em tomo de 75%. O resultado sugeriu a existência de classes de minicírculos que se integram preferencialmente no genoma hospedeiro. Foram obtidos clones híbridos estáveis contendo o final da região conservada nas extremidades seguidas pela região variável truncada, fi'agmento de elemento UNE-I, com ou sem a presença de microssatélite. A origem híbrida foi confirmada por fi'agmentação do clone que foi utilizado como sonda na hibridação de macrófagos humanos normais e DNA de T cruzi. O segmento 87, obtido por captura, apresentou o minicírculo de kDNA com 4 regiões variáveis truncadas, intercaladas por regiões conservadas normais seguidas do microssatélite CA e da região humana com similaridade ao clone murino AC131797.3. A análise "in silico" do segmento 87 mostrou a presença de seqüências regulatórias da expressão gênica. Foram identificadas 9 possíveis ORFs, sendo duas compreendo a região híbrida (ORF1 e 2). Verificou-se nas integrações recuperadas de coração de coelhos chagásicos segmentos similares à região humana encontrada no clone 87, indicando a recorrência dos sítios recombinativos. A análise "in silico" do clone 87, G I O e das regiões hospedeiras obtidas dos bancos de dados mostrou a presença de estruturas do tipo não 8 nos locais próximos ao ponto de recombinação. A presença da estrutura não 8 no segmento 87 foi confirmada pela alteração na mobilidade eletroforética. Em todos os pontos de entrada do minicírculo no genoma hospedeiro verificou-se a redução da tensão local e aumento da tensão global na região, sugerindo a possibilidade de ocorrência de novos eventos recombinativos envolvendo o segmento. O conjunto das informações indica que a integração é mediada por recombinação homologa mediada por similaridades estruturais presentes no DNA hospedeiro e minicírculo de kDNA.
650 $aBiotecnologia
650 $aClonagem
650 $aDNA
650 $aDoença de Chagas
650 $aEngenharia Genética
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
|
Data corrente: |
22/12/2020 |
|
Data da última atualização: |
28/12/2020 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
HIGA, L. de O. S.; CSORDAS, B. G.; GARCIA, M. V.; OSHIRO, L. M.; DUARTE, P. O.; BARROS, J. C.; ANDREOTTI, R. |
|
Afiliação: |
Leandro de Oliveira Souza Higa1; Bárbara Guimarães Csordas; Marcos Valério Garcia; Leandra Marla Oshiro; Pâmella Oliveira Duarte; JACQUELINE CAVALCANTE BARROS, CNPGC; RENATO ANDREOTTI E SILVA, CNPGC. |
|
Título: |
Spotted fever group Rickettsia and Borrelia sp. Cooccurrence in Amblyomma sculptum in the Midwest region of Brazil. |
|
Ano de publicação: |
2020 |
|
Fonte/Imprenta: |
Experimental and Applied Acarology, v. 81, p. 441?455, 2020. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
More than 70 tick species are found in Brazil, distributed over five genera and including main vectors of infectious disease agents affecting both animals and humans. The genus Amblyomma is the most relevant for public health in Brazil, wherein Amblyomma aureolatum, Amblyomma ovale and Amblyomma sculptum have been incriminated as vectors of Rickettsia and Borrelia pathogens. The objective of this study was to investigate the presence of Rickettsia spp. and Borrelia spp. in ticks in the Brazilian mid-western savannah. DNA extraction, PCR for Borrelia spp. (flgE gene) and Rickettsia spp. (ompA and gltA genes) and subsequent sequencing were performed. A total of 1875 ticks were collected and identified as A. sculptum except for two Amblyomma coelebs ticks. Molecular evidence for Borrelia spp. and Rickettsia parkeri was found in A. sculptum. This is the first molecular evidence for R. parkeri in A. sculptum ticks in the Midwest region and Borrelia spp. circulating in a tick of the Amblyomma genus in Brazil. |
|
Palavras-Chave: |
Pathogen; Savannah; Tick-borne disease. |
|
Thesaurus NAL: |
Ixodidae. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/219595/1/15-Spotted-fever-group-Rickettsia-and-Borrelia-sp..pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01735naa a2200241 a 4500
001 2128624
005 2020-12-28
008 2020 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aHIGA, L. de O. S.
245 $aSpotted fever group Rickettsia and Borrelia sp. Cooccurrence in Amblyomma sculptum in the Midwest region of Brazil.$h[electronic resource]
260 $c2020
520 $aMore than 70 tick species are found in Brazil, distributed over five genera and including main vectors of infectious disease agents affecting both animals and humans. The genus Amblyomma is the most relevant for public health in Brazil, wherein Amblyomma aureolatum, Amblyomma ovale and Amblyomma sculptum have been incriminated as vectors of Rickettsia and Borrelia pathogens. The objective of this study was to investigate the presence of Rickettsia spp. and Borrelia spp. in ticks in the Brazilian mid-western savannah. DNA extraction, PCR for Borrelia spp. (flgE gene) and Rickettsia spp. (ompA and gltA genes) and subsequent sequencing were performed. A total of 1875 ticks were collected and identified as A. sculptum except for two Amblyomma coelebs ticks. Molecular evidence for Borrelia spp. and Rickettsia parkeri was found in A. sculptum. This is the first molecular evidence for R. parkeri in A. sculptum ticks in the Midwest region and Borrelia spp. circulating in a tick of the Amblyomma genus in Brazil.
650 $aIxodidae
653 $aPathogen
653 $aSavannah
653 $aTick-borne disease
700 1 $aCSORDAS, B. G.
700 1 $aGARCIA, M. V.
700 1 $aOSHIRO, L. M.
700 1 $aDUARTE, P. O.
700 1 $aBARROS, J. C.
700 1 $aANDREOTTI, R.
773 $tExperimental and Applied Acarology$gv. 81, p. 441?455, 2020.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
