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Registros recuperados : 4 | |
4. | | WAMSER, G. H.; ARRUDA, B.; STINGHEN, J. C.; ROZZETTO, D. S.; BERTOLDO, J. G.; LANNES, S. D.; GUIDOLIN, A. F.; COIMBRA, J. L. M. Caracterização e estimativa da variabilidade genética de genótipos de cebola. Horticultura Brasileira, Brasília, DF, v. 30, n. 2, p. 327-332, abr./jun. 2012. Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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Registros recuperados : 4 | |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
20/04/2011 |
Data da última atualização: |
11/12/2017 |
Autoria: |
SALGADO, C. C.; CRUZ, C. D.; NASCIMENTO, M.; BARRERA, C. F. S. |
Afiliação: |
Caio Césio Salgado, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Cosme Damião Cruz, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Moysés Nascimento, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Carlos Felipe Sanches Barrera, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento. |
Título: |
O uso da variância como metodologia alternativa para integração de mapas genéticos. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 66-73, jan. 2011. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Título em inglês: Variance utilization as an alternative methodology for integrating genetic maps. |
Conteúdo: |
O objetivo deste trabalho foi desenvolver um processo de integração de mapas genéticos, com o uso do inverso da variância, e testar sua eficiência. Foram utilizadas populações simuladas F2 codominante e de retrocruzamento, com tamanhos populacionais de 100, 150, 200 e 400 indivíduos, tendo-se considerado uma espécie diploide fictícia com 2n = 2x = 2 cromossomos, com o comprimento total do genoma por grupo de ligação estipulado em 100 cM, 21 marcas por grupo de ligação e marcadores equidistantes em 5 cM. Os genomas foram comparados quanto ao tamanho do grupo de ligação, variância das distâncias entre marcas adjacentes, correlação de Spearman e quanto ao estresse relativo à adequação das distâncias estimadas. Cada genoma simulado foi fragmentado em quatro novos mapas: três com oito marcadores e um com nove marcadores, cada qual com quatro marcadores âncoras. Os mapas foram alinhados, ordenados, integrados e, em seguida, comparados ao mapa de origem. O processo de integração de mapas proposto mostrou-se eficiente. Os mapas gerados tiveram pequena tensão interna em comparação aos mapas dos quais se originaram. A integração de mapas depende do tipo de população utilizada, tamanho da população, tipo de marcador, da frequência de recombinação e da fase de ligação. |
Palavras-Chave: |
Frequência de recombinação; Grupos de ligação; Internal tension; Recombination frequency; Tensão interna. |
Thesagro: |
Marcador molecular. |
Thesaurus NAL: |
Genetic markers; Linkage groups. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/105560/1/O-uso-da-variancia.pdf
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Marc: |
LEADER 02209naa a2200265 a 4500 001 1886534 005 2017-12-11 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aSALGADO, C. C. 245 $aO uso da variância como metodologia alternativa para integração de mapas genéticos. 260 $c2011 500 $aTítulo em inglês: Variance utilization as an alternative methodology for integrating genetic maps. 520 $aO objetivo deste trabalho foi desenvolver um processo de integração de mapas genéticos, com o uso do inverso da variância, e testar sua eficiência. Foram utilizadas populações simuladas F2 codominante e de retrocruzamento, com tamanhos populacionais de 100, 150, 200 e 400 indivíduos, tendo-se considerado uma espécie diploide fictícia com 2n = 2x = 2 cromossomos, com o comprimento total do genoma por grupo de ligação estipulado em 100 cM, 21 marcas por grupo de ligação e marcadores equidistantes em 5 cM. Os genomas foram comparados quanto ao tamanho do grupo de ligação, variância das distâncias entre marcas adjacentes, correlação de Spearman e quanto ao estresse relativo à adequação das distâncias estimadas. Cada genoma simulado foi fragmentado em quatro novos mapas: três com oito marcadores e um com nove marcadores, cada qual com quatro marcadores âncoras. Os mapas foram alinhados, ordenados, integrados e, em seguida, comparados ao mapa de origem. O processo de integração de mapas proposto mostrou-se eficiente. Os mapas gerados tiveram pequena tensão interna em comparação aos mapas dos quais se originaram. A integração de mapas depende do tipo de população utilizada, tamanho da população, tipo de marcador, da frequência de recombinação e da fase de ligação. 650 $aGenetic markers 650 $aLinkage groups 650 $aMarcador molecular 653 $aFrequência de recombinação 653 $aGrupos de ligação 653 $aInternal tension 653 $aRecombination frequency 653 $aTensão interna 700 1 $aCRUZ, C. D. 700 1 $aNASCIMENTO, M. 700 1 $aBARRERA, C. F. S. 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 46, n. 1, p. 66-73, jan. 2011.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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