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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
22/12/2020 |
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Data da última atualização: |
22/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PORTELA, R. M.; TAMBARUSSI, E. V.; AGUIAR, A. V. de; GANDARA, F. B.; PERES, F. S. B.; ROSA, J. R. B. F. |
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Afiliação: |
Renan Marcelo Portela, Universidade Estadual do Centro-Oeste; Evandro Vagner Tambarussi, Universidade Estadual do Centro-Oeste; ANANDA VIRGINIA DE AGUIAR, CNPF; Flávio B. Gandara, ESALQ; Fabiana Schmidt Bandeira Peres, Universidade Estadual do Centro-Oeste; João Ricardo Bachega Feijó Rosa, ESALQ. |
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Título: |
Using a coalescent approach to assess gene flow and effective population size of Acrocomia aculeata (Jacq.) Lodd. Ex Mart. in the Brazilian Atlantic Forest. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Tree Genetics & Genomes, v. 16, article number 35, 2020. 9 p. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11295-020-1426-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Acrocomia aculeata is a tropical palm tree native to Central and South America that has significant economic, social, and environmental potential. However, land encroachment due to the expansion of agribusiness, and other factors such as urban sprawl, have resulted in the fragmentation and destruction of its habitat, leading to the loss of genes and genotypes in A. aculeata populations. In this context, the objective of this study was to characterize the genetic variability of A. aculeata populations by estimating gene flow and effective population size using an approach based on coalescent theory. Four populations located in the municipalities of Teodoro Sampaio (TSI and TSII), Rosana (RA), and Amparo (AP) in São Paulo State, Brazil, were genotyped with nine microsatellite markers. Gene flow and effective population size were estimated using a coalescent-based Bayesian inference implemented in the MIGRATE-N software. The effective population size (Ne) was obtained considering an assumed mutation rate of 5 × 10?5. Gene flow (Nm) for pairwise populations ranged from 0.28 to 1.17, with higher levels of migration between the three geographically proximal locations (TSI, TSII, and RA). The estimates of effective population size (Ne) were 444, 835, 838, and 874 for AP, TSII, RA, and TSI, respectively, showing that the effects caused by genetic drift may be more pronounced when Ne is smaller. The coalescent-based results add to our understanding of A. aculeata population genetics and suggest that some traditional assessment methods may be ineffective in characterizing historical evolutionary processes. MenosAcrocomia aculeata is a tropical palm tree native to Central and South America that has significant economic, social, and environmental potential. However, land encroachment due to the expansion of agribusiness, and other factors such as urban sprawl, have resulted in the fragmentation and destruction of its habitat, leading to the loss of genes and genotypes in A. aculeata populations. In this context, the objective of this study was to characterize the genetic variability of A. aculeata populations by estimating gene flow and effective population size using an approach based on coalescent theory. Four populations located in the municipalities of Teodoro Sampaio (TSI and TSII), Rosana (RA), and Amparo (AP) in São Paulo State, Brazil, were genotyped with nine microsatellite markers. Gene flow and effective population size were estimated using a coalescent-based Bayesian inference implemented in the MIGRATE-N software. The effective population size (Ne) was obtained considering an assumed mutation rate of 5 × 10?5. Gene flow (Nm) for pairwise populations ranged from 0.28 to 1.17, with higher levels of migration between the three geographically proximal locations (TSI, TSII, and RA). The estimates of effective population size (Ne) were 444, 835, 838, and 874 for AP, TSII, RA, and TSI, respectively, showing that the effects caused by genetic drift may be more pronounced when Ne is smaller. The coalescent-based results add to our understanding of A. aculeata population genetics ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Conservation; Genética de população; Migration; Mitigação. |
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Thesagro: |
Conservação; Macaúba; Melhoramento Genético Vegetal. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic improvement; Population genetics. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
08/06/2009 |
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Data da última atualização: |
09/09/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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Autoria: |
MACHADO, R.; SUDANO, M. J.; BARBOSA, R. T.; BERGAMASCHI, M. A. C. M.; BINELLI, M. |
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Afiliação: |
RUI MACHADO, CPPSE; MATEUS JOSÉ SUDANO, UNESP-JABOTICABAL; ROGERIO TAVEIRA BARBOSA, CPPSE; MARCO AURELIO C MEIRA BERGAMASCHI, CPPSE; MÁRIO BINELLI, USP-PIRASSUNUNGA. |
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Título: |
Metodologia para obtenção de concepto bovino. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
São Carlos: Embrapa Pecuária Sudeste, 2009. |
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Páginas: |
22 p. |
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Série: |
(Embrapa Pecuária Sudeste. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 19). |
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ISSN: |
1981-2078 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A mortalidade embrionária precoce é a maior causa de perdas reprodutivas em bovinos. Para aprofundar os conhecimentos sobre essa mortalidade é requerido o uso de ferramentas de estudo em diferentes áreas, tais como a embriologia (morfológica e funcional). Este estudo testou duas técnicas e validou uma delas para a obtenção de conceptos bovinos (embrião + membranas extra-embrionárias) aos 18 dias de gestação. Para tanto, num experimento piloto testaram-se dois métodos: transcervical e cirúrgico. Dez vacas e um reprodutor da raça Nelore (Bos indicus) foram acasalados. As coletas de concepto foram feitas 18 dias após cada cobertura. O método transcervical seguiu o procedimento padronizado para a coleta de embriões por lavagem uterina em sistema fechado com sonda de três vias (de Foley), porém de calibre maior (24 G) do que o rotineiramente utilizado. O método cirúrgico teve abordagem por incisão no flanco esquerdo, ventrolateralmente à tuberosidade coxal; após exteriorização do útero, cada corno uterino foi lavado com solução salina fosfatada e tamponada por meio de um cateter flexível acoplado a uma seringa. A exteriorização uterina foi difícil, mas a cicatrização ocorreu normalmente, com restabelecimento reprodutivo após 60 dias. Foram recuperados quatro conceptos pelo método transcervical e nenhum pelo método cirúrgico. Concluiu-se que o método de eleição para coletas em escala de conceptos com 18 dias é o transcervical. Em outro experimento foram usadas 71 vacas, das quais 38 foram submetidas ao método transcervical (n = 64 lavagens); nas demais foi feito diagnóstico de prenhez por ultra-som. A taxa de recuperação de conceptos (método transcervical) não diferiu (P > 0,05) da taxa de prenhez por ultra-sonografia entre lavadas e não-lavadas, e as taxas de recuperação de conceptos após uma, duas ou três lavagens não diferiram (P > 0,05). Concluiu-se que a coleta pelo método transcervical produz números confiáveis de recuperação embrionária e não afeta o desempenho reprodutivo subsequente de vacas da raça Nelore. MenosA mortalidade embrionária precoce é a maior causa de perdas reprodutivas em bovinos. Para aprofundar os conhecimentos sobre essa mortalidade é requerido o uso de ferramentas de estudo em diferentes áreas, tais como a embriologia (morfológica e funcional). Este estudo testou duas técnicas e validou uma delas para a obtenção de conceptos bovinos (embrião + membranas extra-embrionárias) aos 18 dias de gestação. Para tanto, num experimento piloto testaram-se dois métodos: transcervical e cirúrgico. Dez vacas e um reprodutor da raça Nelore (Bos indicus) foram acasalados. As coletas de concepto foram feitas 18 dias após cada cobertura. O método transcervical seguiu o procedimento padronizado para a coleta de embriões por lavagem uterina em sistema fechado com sonda de três vias (de Foley), porém de calibre maior (24 G) do que o rotineiramente utilizado. O método cirúrgico teve abordagem por incisão no flanco esquerdo, ventrolateralmente à tuberosidade coxal; após exteriorização do útero, cada corno uterino foi lavado com solução salina fosfatada e tamponada por meio de um cateter flexível acoplado a uma seringa. A exteriorização uterina foi difícil, mas a cicatrização ocorreu normalmente, com restabelecimento reprodutivo após 60 dias. Foram recuperados quatro conceptos pelo método transcervical e nenhum pelo método cirúrgico. Concluiu-se que o método de eleição para coletas em escala de conceptos com 18 dias é o transcervical. Em outro experimento foram usadas 71 vacas, das quais ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Concepto; Mortalidade embrionaria. |
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Thesagro: |
Bovino; Embriao animal; Morfologia animal; Producao animal. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CPPSE-2009/18334/1/Boletim19.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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