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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
Data corrente: |
10/05/2022 |
Data da última atualização: |
09/11/2023 |
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
Autoria: |
SILVA, T. L. C. da. |
Afiliação: |
THALLITON LUIZ CARVALHO DA SILVA, Universidade Federal de Lavras, Lavras, MG. |
Título: |
Fenômica e integração de transcritômica e metabolômica na análise das respostas de Gliricidia sepium (JACQ.) STEUD. e Portulaca oleracea L. ao estresse salino. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Lavras, MG: Universidade Federal de Lavras, 2021. |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Dissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, área de concentração em Biotecnologia Vegetal, para a obtenção do título de Mestre. Orientador: Manoel Teixeira Souza Junior, pesquisador da Embrapa Agroenergia. Coorientador: Leonardo Fonseca Valadares, pesquisador da Embrapa Agroenergia. |
Conteúdo: |
A salinidade do solo é um dos estresses abióticos que mais ameaçam a agricultura. Este estresse está presente em mais de 100 países ao redor do mundo. Devido a estimativa de um aumento populacional mundial para cerca de 9 bilhões de pessoas em 2050 e, consequentemente, um aumento da demanda por produtos agrícolas, a pressão para a utilização dessas áreas tem aumentado. O objetivo geral do presente estudo foi aplicar estratégias de análise individual e integrada de dados ômicos provenientes de transcritômica e metabolômica visando ganhar conhecimento sobre os mecanismos moleculares responsáveis pela tolerância à salinidade observada em Gliricidia sepium e Portulaca oleracea. Para tal, foram utilizados dados do banco de dados ?Sal da Terra?, pertencentes ao programa de PD&I de mesmo nome desenvolvido na Embrapa Agroenergia, que contempla dados de fenômica, ionômica, genômica, transcritômica (mRNA e microRNA), metabolômica e proteômica caracterizando a resposta de dendê (Elaeis guineensis), beldroega (Portulaca oleracea) e gliricídia (Gliricidia sepium) ao estresse salino. As amostras do transcritoma foram submetidas a uma análise de RNA-Seq usando uma plataforma Illumina HiSeq e a estratégia ?paired-end?, a análise dos dados foi feita com o software OmicsBox versão 1.3. As amostras de metaboloma foram analisadas em um sistema UHPLC equipado com uma coluna de fase reversa. A espectrometria de massa de alta resolução (HRMS) foi realizada em um analisador Q-TOF usando fonte de eletrospray em ESI (+) - MS e ESI (-) - MS. Os dados adquiridos foram pré-processados usando o XCMS Online e posteriormente exportados para o MetaboAnalyst para análises estatísticas, anotação e observação das vias metabólicas. A plataforma Omics Fusion, foi utilizada para realizar a análise integrativa entre transcritos e metabólitos. Os resultados alcançados permitiram correlacionar e diferenciar grupos de plantas submetidas ao estresse salino, revelando genes / transcritos, metabólitos e vias responsivas a este estresse tanto em gliricídia, quanto em beldroega. MenosA salinidade do solo é um dos estresses abióticos que mais ameaçam a agricultura. Este estresse está presente em mais de 100 países ao redor do mundo. Devido a estimativa de um aumento populacional mundial para cerca de 9 bilhões de pessoas em 2050 e, consequentemente, um aumento da demanda por produtos agrícolas, a pressão para a utilização dessas áreas tem aumentado. O objetivo geral do presente estudo foi aplicar estratégias de análise individual e integrada de dados ômicos provenientes de transcritômica e metabolômica visando ganhar conhecimento sobre os mecanismos moleculares responsáveis pela tolerância à salinidade observada em Gliricidia sepium e Portulaca oleracea. Para tal, foram utilizados dados do banco de dados ?Sal da Terra?, pertencentes ao programa de PD&I de mesmo nome desenvolvido na Embrapa Agroenergia, que contempla dados de fenômica, ionômica, genômica, transcritômica (mRNA e microRNA), metabolômica e proteômica caracterizando a resposta de dendê (Elaeis guineensis), beldroega (Portulaca oleracea) e gliricídia (Gliricidia sepium) ao estresse salino. As amostras do transcritoma foram submetidas a uma análise de RNA-Seq usando uma plataforma Illumina HiSeq e a estratégia ?paired-end?, a análise dos dados foi feita com o software OmicsBox versão 1.3. As amostras de metaboloma foram analisadas em um sistema UHPLC equipado com uma coluna de fase reversa. A espectrometria de massa de alta resolução (HRMS) foi realizada em um analisador Q-TOF usando fonte de el... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Estresse Abiótico; Multi-ômica. |
Thesagro: |
Salinidade. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1142813/1/Thalliton-Luiz-Carvalho-da-Silva-Dissertacao-Mestrado-2021.pdf
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Marc: |
LEADER 03056nam a2200157 a 4500 001 2142813 005 2023-11-09 008 2021 bl uuuu m 00u1 u #d 100 1 $aSILVA, T. L. C. da 245 $aFenômica e integração de transcritômica e metabolômica na análise das respostas de Gliricidia sepium (JACQ.) STEUD. e Portulaca oleracea L. ao estresse salino.$h[electronic resource] 260 $aLavras, MG: Universidade Federal de Lavras$c2021 500 $aDissertação apresentada à Universidade Federal de Lavras, como parte das exigências do Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia Vegetal, área de concentração em Biotecnologia Vegetal, para a obtenção do título de Mestre. Orientador: Manoel Teixeira Souza Junior, pesquisador da Embrapa Agroenergia. Coorientador: Leonardo Fonseca Valadares, pesquisador da Embrapa Agroenergia. 520 $aA salinidade do solo é um dos estresses abióticos que mais ameaçam a agricultura. Este estresse está presente em mais de 100 países ao redor do mundo. Devido a estimativa de um aumento populacional mundial para cerca de 9 bilhões de pessoas em 2050 e, consequentemente, um aumento da demanda por produtos agrícolas, a pressão para a utilização dessas áreas tem aumentado. O objetivo geral do presente estudo foi aplicar estratégias de análise individual e integrada de dados ômicos provenientes de transcritômica e metabolômica visando ganhar conhecimento sobre os mecanismos moleculares responsáveis pela tolerância à salinidade observada em Gliricidia sepium e Portulaca oleracea. Para tal, foram utilizados dados do banco de dados ?Sal da Terra?, pertencentes ao programa de PD&I de mesmo nome desenvolvido na Embrapa Agroenergia, que contempla dados de fenômica, ionômica, genômica, transcritômica (mRNA e microRNA), metabolômica e proteômica caracterizando a resposta de dendê (Elaeis guineensis), beldroega (Portulaca oleracea) e gliricídia (Gliricidia sepium) ao estresse salino. As amostras do transcritoma foram submetidas a uma análise de RNA-Seq usando uma plataforma Illumina HiSeq e a estratégia ?paired-end?, a análise dos dados foi feita com o software OmicsBox versão 1.3. As amostras de metaboloma foram analisadas em um sistema UHPLC equipado com uma coluna de fase reversa. A espectrometria de massa de alta resolução (HRMS) foi realizada em um analisador Q-TOF usando fonte de eletrospray em ESI (+) - MS e ESI (-) - MS. Os dados adquiridos foram pré-processados usando o XCMS Online e posteriormente exportados para o MetaboAnalyst para análises estatísticas, anotação e observação das vias metabólicas. A plataforma Omics Fusion, foi utilizada para realizar a análise integrativa entre transcritos e metabólitos. Os resultados alcançados permitiram correlacionar e diferenciar grupos de plantas submetidas ao estresse salino, revelando genes / transcritos, metabólitos e vias responsivas a este estresse tanto em gliricídia, quanto em beldroega. 650 $aSalinidade 653 $aEstresse Abiótico 653 $aMulti-ômica
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Cerrados; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Rondônia. |
Data corrente: |
09/02/2011 |
Data da última atualização: |
09/02/2011 |
Tipo da produção científica: |
Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Autoria: |
GUIMARAES, L. J. M.; PACHECO, C. A. P.; GUIMARAES, P. E. O.; MEIRELLES, W. F.; PARENTONI, S. N.; SILVA, A. R.; COSTA, R. V. da; CRUZ, J. C.; PRADO, C. E. L.; MACHADO, A. T.; SOUZA, F. R. S. de; CECCON, G.; GODINHO, V. de P. C.; CARDOSO, M. J.; CARVALHO, H. W. L. de; GONCALVES, J. R. P.; VILARINHO, A. A.; ARCE, H.; VALENTINI, L.; DENUCCI, S.; SOUZA, J. C. de; MIRANDA, G. V.; ARNHOLD, E. |
Afiliação: |
LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; CLESO ANTONIO PATTO PACHECO, CNPMS; PAULO EVARISTO DE O GUIMARAES, CNPMS; WALTER FERNANDES MEIRELLES, CNPMS; SIDNEY NETTO PARENTONI, CNPMS; ADELMO RESENDE DA SILVA, CNPMS; RODRIGO VERAS DA COSTA, CNPMS; JOSE CARLOS CRUZ, CNPMS; CARLOS EDUARDO DO PRADO LEITE, CNPMS; ALTAIR TOLEDO MACHADO, CPAC; FRANCISCO RONALDO SARMANHO DE SOUZA, CPATU; GESSI CECCON, CPAO; VICENTE DE PAULO CAMPOS GODINHO, CPAF-RO; MILTON JOSE CARDOSO, CPAMN; HELIO WILSON LEMOS DE CARVALHO, CPATC; JOSE RICARDO PUPO GONCALVES, CPAA; ALOISIO ALCANTARA VILARINHO, CPAF-RR; HERCULES ARCE, Agraer-MS; LUCIA VALENTINI, Pesagro; SYLMAR DENUCCI, CATI; JOAO CANDIDO DE SOUZA, UFLA; GLAUCO VIEIRA MIRANDA, UFV; EMMANUEL ARNHOLD, UFG. |
Título: |
Desempenho de variedades de milho: ano agrícola 2008/09. |
Ano de publicação: |
2010 |
Fonte/Imprenta: |
Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2010. |
Páginas: |
18 p. |
Série: |
(Embrapa Milho e Sorgo. Comunicado técnico, 182). |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Este trabalho teve por objetivo avaliar a produtividade de grãos, a adaptabilidade e estabilidade de produção, bem como outras características agronômicas, de 21 variedades de milho, dois híbridos intervarietais e dois híbridos duplos, no ano agrícola de 2008/09, em 30 localidades distribuídas nas regiões Sudeste, Centro- Oeste, Norte e Nordeste do Brasil. |
Palavras-Chave: |
Adaptabilidade; Característica agronômica; Estabilidade. |
Thesagro: |
Características Agronômicas; Grão; Produtividade; Variedade; Zea mays. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26808/1/CT-182.pdf
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Marc: |
LEADER 01715nam a2200493 a 4500 001 1876500 005 2011-02-09 008 2010 bl uuuu u0uu1 u #d 100 1 $aGUIMARAES, L. J. M. 245 $aDesempenho de variedades de milho$bano agrícola 2008/09. 260 $aSete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo$c2010 300 $a18 p. 490 $a(Embrapa Milho e Sorgo. Comunicado técnico, 182). 520 $aEste trabalho teve por objetivo avaliar a produtividade de grãos, a adaptabilidade e estabilidade de produção, bem como outras características agronômicas, de 21 variedades de milho, dois híbridos intervarietais e dois híbridos duplos, no ano agrícola de 2008/09, em 30 localidades distribuídas nas regiões Sudeste, Centro- Oeste, Norte e Nordeste do Brasil. 650 $aCaracterísticas Agronômicas 650 $aGrão 650 $aProdutividade 650 $aVariedade 650 $aZea mays 653 $aAdaptabilidade 653 $aCaracterística agronômica 653 $aEstabilidade 700 1 $aPACHECO, C. A. P. 700 1 $aGUIMARAES, P. E. O. 700 1 $aMEIRELLES, W. F. 700 1 $aPARENTONI, S. N. 700 1 $aSILVA, A. R. 700 1 $aCOSTA, R. V. da 700 1 $aCRUZ, J. C. 700 1 $aPRADO, C. E. L. 700 1 $aMACHADO, A. T. 700 1 $aSOUZA, F. R. S. de 700 1 $aCECCON, G. 700 1 $aGODINHO, V. de P. C. 700 1 $aCARDOSO, M. J. 700 1 $aCARVALHO, H. W. L. de 700 1 $aGONCALVES, J. R. P. 700 1 $aVILARINHO, A. A. 700 1 $aARCE, H. 700 1 $aVALENTINI, L. 700 1 $aDENUCCI, S. 700 1 $aSOUZA, J. C. de 700 1 $aMIRANDA, G. V. 700 1 $aARNHOLD, E.
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Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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