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| Registros recuperados : 168 | |
| 81. |  | CORDEIRO, T. F.; GALVÃO, P. G.; GUEDES, H.; MENESES, C. H. G.; VIDAL, M. S.; ARAÚJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I. Avaliação da expressão gênica em Gluconacetobacter diazotrophicus durante a interação com cana-de-açúcar. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DOBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009. 6| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 83. | | CARVALHO, P. A.; MENESES, C. H. S. G.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. An eglA-like gene mutant of Gluconaceto bacter diazotrophicus PAL5 is defective in rice roots surfae attachment. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. SlV. 14| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 84. | | PASSOS, S. R.; CORREIA, M. E. F.; SOARES, L. H. de B.; ARAUJO, J. L. S. de; RUMJANEK, N. G.; XAVIER, G. R. Exploração do potencial biotecnológico da microbiota associada ao trato intestinal de Trigoniulus corallinus (Diplopoda). In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 85. | | SILVA, H. A. P da; GALISA, P. de S.; OLIVEIRA, R. S. da S.; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. Expressão gênica induzida por estresses abióticos em nódulos de feijão-caupi. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 6, p. 797-807, jun. 2012. Titulo em inglês: Gene expression induced by abiotic stress in cowpea nodules.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 86. | | SILVA, H. A. P. DA.; GALISA, P. DE S.; OLIVEIRA, R. S. DA; VIDAL, M. S.; ARAUJO, J. L. S. de. Expressão gênica induzida por estresses abióticos em nódulos de feijão-caupi. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 47, n. 6, p. 797-807, abr./jun., 2012.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 87. | | SOUSA, A. M. B. de; ARAUJO, J. L. S. de; LIMA, M. A. de; FREITAS, A. C. R. de; URQUIAGA, S.; ALVES, B. J. R. Efeito do nitrogênio na população de metanogênicas e emissões de metano, em diferentes cultivares de arroz irrigado. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 32.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 16.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 14.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 11., FERTBIO 2016. Goiânia. Rumo aos novos desafios: anais. Goiânia: UFG, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Cocais. |
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| 88. | | SOUSA, A. M. B. de; ARAUJO, J. L. S. de; LIMA, M. A. de; FREITAS, A. C. R. de; URQUIAGA, S. S.; ALVES, B. J. R. Efeito do nitrogênio na população de metanogênicas e emissões de metano, em diferentes cultivares de arroz irrigado. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 32.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 16.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 14.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 11., 2016, Goiânia. Rumo aos novos desafios: anais... Goiânia: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2016. p. 1045-1046.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 90. | | FERREIRA, E. P. de B.; MERCANTE, F. M.; HUNGRIA, M.; MENDES, I. de C.; ARAÚJO, J. L. S. de; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ARAÚJO, A. P. Contribuições para melhoria da eficiência da fixação biológica de nitrogênio no feijoeiro comum no Brasil. Tópicos em Ciência do Solo, v. 8, p. 251-323, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 91. | | FERREIRA, E. P. de B.; MERCANTE, F. M.; HUNGRIA, M.; MENDES, I. de C.; ARAÚJO, J. L. S. de; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ARAÚJO, A. P. Contribuições para melhoria da eficiência da fixação biológica de nitrogênio no feijoeiro comum no Brasil. In: ARAÚJO, A. P.; ALVES, B. J. R. (Ed.). Tópicos em ciência do solo. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013. v. 8. p. 251-323.| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Soja. |
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| 92. | | FERREIRA, E. P. de B.; MERCANTE, F. M.; HUNGRIA, M.; MENDES, I. de C.; ARAÚJO, J. L. S. de; FERNANDES JUNIOR, P. I.; ARAÚJO, A. P. Contribuições para melhoria da eficiência da fixação biológica de nitrogênio no feijoeiro comum no Brasil. In: ARAÚJO, A. P.; ALVES, B. J. R. (Ed.). Tópicos em ciência do solo. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013. v. 8. p. 251-323.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 93. | | GALVÃO, P. Q.; RODRIGUES, E. P.; ROUWS, L. F. M.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Analysis of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5 nitB mutant. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON BIOLOGICAL NITROGEN WITH NON-LEGUMES, 12.; INTERNATIONAL INCT SYMPOSIUM ON NITROGEN BIOLOGICAL FIXATION, 2., 03 a 8 de outubro, 2010, Búzios, RJ. Book of abstracts... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010. SI 13| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 94. | | SILVA, C. G. N. da; MONTEIRO, E. de C.; DINIZ, P. P.; TERRA, L. A.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. Designing and validation of specifc primers for the quantitative detection of bacteria in sugarcane inoculant. Brazilian Journal of Microbiology, v. 54, p. 2627–2640, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 95. | | SILVA, C. G. N. da; MONTEIRO, E. de C.; DINIZ, P. P.; TERRA, L. A.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. Designing and validation of specific primers for the quantitative detection of bacteria in sugarcane inoculant. Brazilian Journal of Microbiology,, Published: 16 October 2023| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 96. | | VILLA, J. C.; ZOFFOLI, B. C.; PITARD, R. M.; ARAUJO, J. L. S. de; SOUZA FILHO, B. F.; ARAUJO, A. P.; STRALIOTTO, R. Caracterização de isolados indígenas de rizóbio visando a seleção de estirpes eficientes e adaptados a área de cultivo tradicional de feijoeiro no Estado do Rio de Janeiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. FertBio 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 97. | | FERREIRA, V. de L.; GALISA, P. de S.; SCHWAB, S.; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de. Caracterização da função de MatE em Gluconacetobacter diazotrophicus. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 10., 18 a 24 de outubro de 2010, Seropédica. Ciência para o Desenvolvimento Sustentável: anais... Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 98. | | CARVALHO, P. de A.; MENESES, C. H. S. G.; ROUWS, L. F. M.; ARAÚJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I. Caracterização funcional de uma provável B-1,4-endoglucanase de Gluconacetobacter diazotrophicus PAL5T. In: SEMANA CIENTÍFICA JOHANNA DÖBEREINER, 9., 19 a 23 de outubro de 2009, Seropédica. Ciência no Brasil: desafios, avanços e aplicações: caderno de resumos. Seropédica: Embrapa Agrobiologia, 2009. p.43| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 99. | | VIDEIRA, S. S.; OLIVEIRA, D. M. de; BARROS, D. R.; BALDANI, J. I.; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, V. L. D. Diversidade morfológica de bactérias diazotróficas oriundas de plantas de capim-elefante no Estado do rio de Janeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25., 2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 100. | | SILVA, P. R. A.; ARAUJO, J. L. S. de; VIDAL, M. S.; CRUZ, L. M.; SOUZA, E. M. de; BALDANI, J. I. Draft genome sequence of Paraburkholderia tropica Ppe8 strain, a sugarcane endophytic diazotrophic bacterium. Brazilian Journal of Microbiology, v. 49, n. 2, p. 2010-2011, Apr./Jun. 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| Registros recuperados : 168 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
18/12/2023 |
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Data da última atualização: |
18/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
SILVA, C. G. N. da; MONTEIRO, E. de C.; DINIZ, P. P.; TERRA, L. A.; SCHWAB, S.; REIS, V. M.; ARAUJO, J. L. S. de; URQUIAGA, S. |
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Afiliação: |
CLEUDISON GABRIEL NASCIMENTO DA SILVA, UFRRJ; EDEVALDO DE CASTRO MONTEIRO, UFRRJ; PRISCILA PEREIRA DINIZ, UFRRJ; LEONARDO ARAUJO TERRA, UFRRJ; STEFAN SCHWAB, CNPAB; VERONICA MASSENA REIS, CNPAB; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; SEGUNDO SACRAMENTO U CABALLERO, CNPAB. |
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Título: |
Designing and validation of specifc primers for the quantitative detection of bacteria in sugarcane inoculant. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Brazilian Journal of Microbiology, v. 54, p. 2627–2640, 2023. |
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ISSN: |
1678-4405 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Endophytic diazotrophic plant growth-promoting bacteria Herbaspirillum rubrisubalbicans (HCC103), Herbaspirillum seropedicae (HRC54), Paraburkholderia tropica (Ppe8T), Gluconacetobacter diazotrophicus (Pal5T), and Nitrospirillum amazonense (CBAmC) have been used as inoculants for sugarcane. The genome sequences of these strains were used to design a set of specifc primers for the real-time PCR (qPCR) assay. Primer specifcity was confrmed by conventional PCR using the genomic DNAs of 25 related bacterial species and the fve target strains. The qPCR assays were conducted using root and shoot samples from two sugarcane varieties (RB867515 and RB92579). These samples were collected both with and without inoculation, using the target strains specifed in this study. The sugarcane plants were grown in a greenhouse, utilizing a substrate composed of sterile sand and vermiculite in a 2:1 ratio, for a duration of 55 days. The primers designed for this study successfully amplifed target DNA fragments from each of the bacterial species, enabling their diferentiation at the species level. The total bacterial population present in the sugarcane quantifed using qPCR was on average 105.2 cells g−1 of fresh tissue. Across both evaluated varieties, it was observed that the population of inoculated bacteria tended to decrease over time and became more concentrated in the sugarcane roots compared to the aerial parts. The qPCR results suggest that both the host and the microbes infuence the endophytic population and the bacterial number decreases with plant age. MenosEndophytic diazotrophic plant growth-promoting bacteria Herbaspirillum rubrisubalbicans (HCC103), Herbaspirillum seropedicae (HRC54), Paraburkholderia tropica (Ppe8T), Gluconacetobacter diazotrophicus (Pal5T), and Nitrospirillum amazonense (CBAmC) have been used as inoculants for sugarcane. The genome sequences of these strains were used to design a set of specifc primers for the real-time PCR (qPCR) assay. Primer specifcity was confrmed by conventional PCR using the genomic DNAs of 25 related bacterial species and the fve target strains. The qPCR assays were conducted using root and shoot samples from two sugarcane varieties (RB867515 and RB92579). These samples were collected both with and without inoculation, using the target strains specifed in this study. The sugarcane plants were grown in a greenhouse, utilizing a substrate composed of sterile sand and vermiculite in a 2:1 ratio, for a duration of 55 days. The primers designed for this study successfully amplifed target DNA fragments from each of the bacterial species, enabling their diferentiation at the species level. The total bacterial population present in the sugarcane quantifed using qPCR was on average 105.2 cells g−1 of fresh tissue. Across both evaluated varieties, it was observed that the population of inoculated bacteria tended to decrease over time and became more concentrated in the sugarcane roots compared to the aerial parts. The qPCR results suggest that both the host and the microbes infuence the endo... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diazotrophic bacteria; DPGPB quantifcation; Primers; Real Time PCR. |
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Thesagro: |
Saccharum Officinarum. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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520 $aEndophytic diazotrophic plant growth-promoting bacteria Herbaspirillum rubrisubalbicans (HCC103), Herbaspirillum seropedicae (HRC54), Paraburkholderia tropica (Ppe8T), Gluconacetobacter diazotrophicus (Pal5T), and Nitrospirillum amazonense (CBAmC) have been used as inoculants for sugarcane. The genome sequences of these strains were used to design a set of specifc primers for the real-time PCR (qPCR) assay. Primer specifcity was confrmed by conventional PCR using the genomic DNAs of 25 related bacterial species and the fve target strains. The qPCR assays were conducted using root and shoot samples from two sugarcane varieties (RB867515 and RB92579). These samples were collected both with and without inoculation, using the target strains specifed in this study. The sugarcane plants were grown in a greenhouse, utilizing a substrate composed of sterile sand and vermiculite in a 2:1 ratio, for a duration of 55 days. The primers designed for this study successfully amplifed target DNA fragments from each of the bacterial species, enabling their diferentiation at the species level. The total bacterial population present in the sugarcane quantifed using qPCR was on average 105.2 cells g−1 of fresh tissue. Across both evaluated varieties, it was observed that the population of inoculated bacteria tended to decrease over time and became more concentrated in the sugarcane roots compared to the aerial parts. The qPCR results suggest that both the host and the microbes infuence the endophytic population and the bacterial number decreases with plant age.
650 $aSaccharum Officinarum
653 $aDiazotrophic bacteria
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653 $aReal Time PCR
700 1 $aMONTEIRO, E. de C.
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700 1 $aREIS, V. M.
700 1 $aARAUJO, J. L. S. de
700 1 $aURQUIAGA, S.
773 $tBrazilian Journal of Microbiology$gv. 54, p. 2627–2640, 2023.
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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