Data/hora: 06/06/2024 06:37:27

Biblioteca(s): | Embrapa Café.
Data corrente: | 28/02/2020
Data da última atualização: | 28/02/2020
Autoria: | ANGELO, P. C. da S.; ARIYOSHI, C.; CAIXETA, E. T.; PEREIRA, L. F. P.; RIBAS, A. F.; SERA, G. H.
Afiliação: | PAULA CRISTINA DA SILVA ANGELO, CNPCa; Caroline Ariyoshi, Universidade Estadual de Londrina/IAPAR; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; Alessandra F. Ribas, Universidade do Oeste Paulista; Gustavo H. Sera, IAPAR.
Título: | Variabilidade no domínio LRR de peptídeos codificados em "clusters" homólogos ao SH3 em diferentes genomas de Coffea.
Ano de publicação: | 2019
Fonte/Imprenta: | In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.
Idioma: | Português
Notas: | Título em inglês: LRR domain variability for peptides encoded in gene clusters homologous to the SH3 in different Coffea genomes.
Conteúdo: | O locus SH3 é relacionado com as reações de defesa contra Hemileia vastatrix, o agente causador da ferrugem alaranjada. Há um ?cluster? de genes CC-NBS-LRR no locus SH3 da variedade IAPAR59 de Coffea arabica. Esse ?cluster? reúne oito cópias de CC-NBS-LRRs, que variam na sua estrutura primária, especialmente na região carboxi-terminal onde são localizados motivos ricos em leucina. Esses motivos LRR são característicos de proteínas que participam do reconhecimento de patógenos pelas plantas. Os ?clusters? homólogos na variedade Caturra e em um cafeeiro de origem etíope da espécie C. arabica, em C. canephora DH200-94 e em C. eugenioides CCC68 foram identificados. A variabilidade das regiões codificadoras incluídas no ?cluster? SH3 foi avaliada alinhando com o aplicativo CLUSTAW e agrupando pelo método de Fitsh-Margoliash as sequências da região carboxi-terminal dos peptídeos deduzidos de todas as cópias de NBS-LRRs codificadas em ?clusters? homólogos naqueles quatro genótipos e também previamente analisadas em IAPAR59 e em C. canephora IF200. Concluiu-se que há divergência entre as sequências dos domínios LRR de diferentes membros dos ?clusters? em diferentes genótipos, o que pode ser parcialmente resultante dos processos de sequenciamento e montagem, mas que também resulta de evolução e seleção. Também há diferença no número de cópias do gene em diferentes genótipos. Consideramos a hipótese de que o número, a organização, a integridade e a estrutura primária dos genes nos ?clusters? SH3 podem estar relacionados com o mecanismo de reconhecimento das raças fisiológicas de H. vastatrix por diferentes variedades de cafeeiros.
Palavras-Chave: | Coffee disease; Doença do cafeeiro; Isoformaprotéica; Polimorfismo estrutural; Structural polymorphism.
Thesaurus Nal: | Protein isoforms.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/211232/1/Variabilidade-no-dominio-LRR-de-peptideos.pdf
Registro original: | Embrapa Café (CNPCa)
Exemplares: | CNPCa - (1364-1) - UPC - AA - DD -  -  -  - DIS