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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
15/04/2014 |
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Data da última atualização: |
05/02/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; VENTURA, R. V.; SCHENKEL, F. S.; SARGOLZAEI, M.; MEIRELLES, S. L. C. O; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; SILVA, M. V. G. B.; NICIURA, S. C. M.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; MUNARI, D. P. |
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Afiliação: |
MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL. |
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Título: |
Genome-wide association for growth traits in Canchim beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, v. 9, n. 4, e94802 2014. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Studies are being conducted on the applicability of genomic data to improve the accuracy of the selection process in livestock, and genome-wide association studies (GWAS) provide valuable information to enhance the understanding on the genetics of complex traits. The aim of this study was to identify genomic regions and genes that play roles in birth weight (BW), weaning weight adjusted for 210 days of age (WW), and long-yearling weight adjusted for 420 days of age (LYW) in Canchim cattle. GWAS were performed by means of the Generalized Quasi-Likelihood Score (GQLS) method using genotypes from the BovineHD BeadChip and estimated breeding values for BW, WW, and LYW. Data consisted of 285 animals from the Canchim breed and 114 from the MA genetic group (derived from crossings between Charolais sires and 1/2 Canchim + 1/2 Zebu dams). After applying a false discovery rate correction at a 10% significance level, a total of 4, 12, and 10 SNPs were significantly associated with BW, WW, and LYW, respectively. These SNPs were surveyed to their corresponding genes or to surrounding genes within a distance of 250 kb. The genes DPP6 (dipeptidyl-peptidase 6) and CLEC3B (C-type lectin domain family 3 member B) were highlighted, considering its functions on the development of the brain and skeletal system, respectively. The GQLS method identified regions on chromosome associated with birth weight, weaning weight, and long-yearling weight in Canchim and MA animals. New candidate regions for body weight traits were detected and some of them have interesting biological functions, of which most have not been previously reported. The observation of QTL reports for body weight traits, covering areas surrounding the genes (SNPs) herein identified provides more evidence for these associations. Future studies targeting these areas could provide further knowledge to uncover the genetic architecture underlying growth traits in Canchim cattle. MenosAbstract. Studies are being conducted on the applicability of genomic data to improve the accuracy of the selection process in livestock, and genome-wide association studies (GWAS) provide valuable information to enhance the understanding on the genetics of complex traits. The aim of this study was to identify genomic regions and genes that play roles in birth weight (BW), weaning weight adjusted for 210 days of age (WW), and long-yearling weight adjusted for 420 days of age (LYW) in Canchim cattle. GWAS were performed by means of the Generalized Quasi-Likelihood Score (GQLS) method using genotypes from the BovineHD BeadChip and estimated breeding values for BW, WW, and LYW. Data consisted of 285 animals from the Canchim breed and 114 from the MA genetic group (derived from crossings between Charolais sires and 1/2 Canchim + 1/2 Zebu dams). After applying a false discovery rate correction at a 10% significance level, a total of 4, 12, and 10 SNPs were significantly associated with BW, WW, and LYW, respectively. These SNPs were surveyed to their corresponding genes or to surrounding genes within a distance of 250 kb. The genes DPP6 (dipeptidyl-peptidase 6) and CLEC3B (C-type lectin domain family 3 member B) were highlighted, considering its functions on the development of the brain and skeletal system, respectively. The GQLS method identified regions on chromosome associated with birth weight, weaning weight, and long-yearling weight in Canchim and MA animals. New candidate r... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genome-wide; Growth trait; Raça Canchim; Race Canchim. |
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Thesagro: |
Gado de corte. |
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Thesaurus Nal: |
Beef cattle; genome-wide association study. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/105444/1/Artigo-MVinicius-journal.plosone.0094802.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114268/1/Buzanskas2014-Genome.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/101136/1/PROCI-2014.00012.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 189 | |
| 41. |  | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; FREIRE, E. C.; FARIAS, F. J. C.; COSTA, J. N. da; SANTANA, J. C. F. de; ANDRADE, F. P. de. Avaliação do ensaio regional de cultivares de algodoeiro herbáceo nos Cerrados do Meio-Norte do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 4., 2003, Goiânia. Algodão: um mercado em evolução: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão; Goiânica: Fundação GO, 2003. 1 CD-ROM. (Embrapa Algodão. Documentos, 118).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 44. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; FREIRE, E. C.; FARIAS, F. J. C.; COSTA, J. N. da; SANTANA, J. C. F. de; ANDRADE, F. P. de. Avaliação de cultivares de algodoeiro herbáceo na região Meio-Norte do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 4., 2003, Goiânia. Algodão: um mercado em evolução: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão; Goiânica: Fundação GO, 2003. 1 CD-ROM. (Embrapa Algodão. Documentos, 118).| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 45. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; FREIRE, E. C.; FARIAS, F. J. C.; COSTA, J. N. da; SANTANA, J. C. F. de; ANDRADE, F. P. de. Avaliação de cultivares de algodoeiro herbáceo na região Meio-Norte do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 4., 2003, Goiânia. Algodão: um mercado em evolução: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão; Goiânica: Fundação GO, 2003. 1 CD-ROM. (Embrapa Algodão. Documentos, 118).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 47. | | VIDAL NETO, F. das C.; SILVA FILHO, J. L. da; ARAUJO, G. P. de; ANDRADE, F. P. de; SANTOS, J. W. dos; SOUSA, S. L. de. Ensaio regional de linhagens e cultivares de algodoeiro herbáceo do Nordeste. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Sustentabilidade da cotonicultura brasileira e expansão dos mercados: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 48. | | VIDAL NETO, F. das C.; SILVA FILHO, J. L. da; ARAÚJO, G. P. de; ANDRADE, F. P. de; SANTOS, J. W. dos; SOUZA, S. L. de. Ensaio regional de linhagens e cultivares de algodoeiro herbáceo do Nordeste. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Anais... Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 49. | | VIDAL NETO, F. das C.; CARVALHO, L. P. de; ANDRADE, F. P. de; SANTOS, J. W. dos; SOUZA, S. L. de; ARAÚJO, G. P. de. Ensaio de valor de cultivo e uso (VCU 2008), do programa de melhoramento da Embrapa no Nordeste. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Sustentabilidade da cotonicultura brasileira e expansão dos mercados: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 50. | | VIDAL NETO, F. das C.; CARVALHO, L. P. de; ANDRADE, F. P. de; SANTOS, J. W. dos; SOUZA, S. L. de; ARAÚJO, G. P. de. Ensaio de valor de cultivo e uso (VCU ? 2008) do programa de melhoramento da Embrapa no Nordeste. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Anais... Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 51. | | MILANI, M.; NOBREGA, M. B. de M.; ANDRADE, F. P. de; FREITAS, J. G.; MOTA, J. R.; SILVA, G. A. da. Avaliação de genótipos de mamona de porte médio em Irecê – BA, safra 2009. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 53. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; FREIRE, E. C.; FARIAS, F. J. C.; COSTA, J. N. da; SANTANA, J. C. F. de; ANDRADE, F. P. de. Caracterização varietal de algodoeiro herbáceo nos cerrados do Sudoeste Piauiense e Sul Maranhense. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 4., 2003, Goiânia. Algodão: um mercado em evolução: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão; Goiânica: Fundação GO, 2003. 1 CD-ROM. (Embrapa Algodão. Documentos, 118).| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 54. | | RIBEIRO, J. L.; RIBEIRO, V. Q.; FREIRE, E. C.; FARIAS, F. J. C.; COSTA, J. N. da; SANTANA, J. C. F. de; ANDRADE, F. P. de. Caracterização varietal de algodoeiro herbáceo nos cerrados do Sudoeste Piauiense e Sul Maranhense. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 4., 2003, Goiânia. Algodão: um mercado em evolução: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão; Goiânica: Fundação GO, 2003. 1 CD-ROM. (Embrapa Algodão. Documentos, 118).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 55. | | FREIRE, E. C.; SANTOS, J. W. dos; ANDRADE, F. P. de; VIDAL NETO, F. das C.; LIRA, M. A.; RIBEIRO, J. L. Adaptabilidade e estabilidade de cultivares de gergelim. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 29, n. 6, p. 891-900, jun. 1994. Título em inglês: Adaptability and stability of sesame cultivars.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 56. | | FREIRE, E. C.; PEDROSA, M. B.; COSTA, M. N. da; VIEIRA, R. de M.; ANDRADE, F. P. de; SANTOS, J. W. dos. Indices morfologicos e analise multivariada na avaliacao de especies e populacoes de algodoeiro do Nordeste. Revista de Oleaginosas e Fibrosas, v.3, n.2, p.93-1000, 1999.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 57. | | ARAUJO, G. P. de; VIDAL NETO, F. das C.; CARVALHO, L. P. de; SILVA FILHO, J. L. da; ANDRADE, F. P. de; SANTOS, J. W. dos. Correlações entre variáveis agronômicas e da fibra, em algodão colorido. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Sustentabilidade da cotonicultura brasileira e expansão dos mercados: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 58. | | ARAUJO, G. P. de; VIDAL NETO, F. das C.; CARVALHO, L. P. de; SILVA FILHO, J. L. da; ANDRADE, F. P. de; SANTOS, J. W. dos. Correlações entre variáveis agronômicas e da fibra em algodão colorido. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Anais... Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 59. | | MEDEIROS, E. P. de; LEITE, B. F.; ARAUJO, J. B. de; ANDRADE, F. P. de; SEVERINO, L. S.; GAMBARRA NETO, F. F. Desenvolvimento de um sistema portátil baseado em câmeras de infravermelho para classificação de pluma de algodão com pegajosidade. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 11., 2017, Maceió. Resumos... Inovação e rentabilidade na cotonicultura: resumos... Brasília, DF: Associação Brasileira dos Produtores de Algodão - Abrapa, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 60. | | FREIRE, E. C.; MORELLO, C. de L.; ANDRADE, F. P. de; SANTOS, J. W. dos; ASSUNÇÃO, J. H. de; BEZERRA, W.; FERNANDES, J. I. Desempenho das cultivares de algodoeiro avaliadas no Estado de Goiás, nas safras 2001/02 e 2002/03. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2004. 8 p. (Comunicado Técnico, 204)| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas | Circulação/Nível: -- - -- |
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