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| Registros recuperados : 30 | |
| 1. |  | REGITANO, L. C. de A.; OLIVEIRA, P. N. DE; ANDRADE, B. G. DE. Hologenoma ruminante: caracterização da população de microrganismos do trato digestivo de ruminantes e seu impacto sobre o genoma funcional do hospedeiro, desempenho, qualidade do produto e impacto ambiental. In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W. G. da. Estratégias de adaptação às mudanças do clima dos sistemas agropecuários brasileiros. Brasília, DF: MAPA, 2021. p.36-37.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 2. | | REGITANO, L. C. de A.; OLIVEIRA, P. N. DE; ANDRADE, B. G. DE. Ruminant hologenome characterization of microorganism populations in ruminants digestive tract and their impact on the host s functional genome, performance, product quality and environmental impact. In: SOTTA, E. D.; SAMPAIO, F. G.; MARZALL, K.; SILVA, W . G. da. Adapting to climate change: strategies for brazilian agricultural and livestock system. Brasília, DF: MAPA, 2021. p.36-37.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 4. | | CONTEVILLE, L. C.; ANDRADE, B. G.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Carbohydrate active enzymes in metagenome-assembled genomes from ruminal and stool microbiomes of nelore cattle. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal. [Abstracts]. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 426. e-book. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana de Almeida Regitano.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 5. | | PEREIRA, B. C. S.; OLIVEIRA, A. de C. LADEIRA, A. M. M.; VITAL, B. R.; ANDRADE, B. G. Propriedades energéticas da madeira e do carvão vegetal de Eucalyptus benthamii Maiden et Cambage. In: CONGRESSO BRASILEIRO SOBRE FLORESTAS ENERGÉTICAS, 1., 2009, Belo Horizonte. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2009. 1 CD-ROM. (Embrapa Florestas. Documentos, 178). Seção: Matéria Prima e Processos de Conversão Energética.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 6. | | AQUINO, L. M. de; CONTEVILLE, L. C.; ANDRADE, B. G. N.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Identificação de genes de resistência e elementos móveis no microbioma ruminal e fecal de touros Nelore. JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 15., 2023, São Carlos, SP. Anais [...]. São Carlos, SP: Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Instrumentação, 2023. p. 40. (Embrapa Pecuária Sudeste, Eventos técnicos & científicos, 01). Organizadores: Cintia Righetti Marcondes; Daniel Souza Corrêa. Evento virtual.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 7. | | SILVA, J. V. da; CONTEVILLE, L. C.; ANDRADE, B. G.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Microbial abundance and expression in the rumen microbiome of nelore cattle. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal. [Abstracts]. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 420. e-book.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 8. | | CARNEIRO, A. de C. O.; VITAL, B. R.; CARVALHO, A. M. L.; OLIVEIRA, A. C.; PEREIRA, B. L. C.; ANDRADE, B. G. de. Determinação da massa molar de taninos vegetais através da técnica da cromatografia de permeação em gel. Scientia Forestalis, Piracicaba, v. 38, n. 87, p. 419-429, set. 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 9. | | AQUINO, L. M. DE; CONTEVILLE, L. C.; ANDRADE, B. G.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Characterization of antibiotic resistance genes and identification of mobile elements in the gastrointestinal microbiome of Nelore bulls. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 68., 2023, Ouro Preto. Paleogenomics: sequencing ancient DNA. [Ribeirão Preto]: Sociedade Brasileira de Genética, 2023. p. 488. e-Book.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 10. | | OLIVEIRA, P. S. N. DE; ANDRADE, B. G.; CARDOSO, T. F.; PASCHOAL, J. J.; JOSAHKIAN, L. A.; ALMEIDA, L. F.; MARCONDES, C. R.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REECY, J. M.; REGITANO, L. C. de A. Differentially expressed miRNAs in the stool of Bos indicus divergent for feed efficiency. Italian Journal of Animal Science, v. 22, supplement 1, 2023. p. 193-194. Congress of the Animal Science and Production Association, 25., Monopoli (BARI – ITALY), June 13–16, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 11. | | OLIVEIRA, P. S. N. DE; ANDRADE, B. G.; CONTEVILLE, L. C.; CARDOSO, T. F.; PASCHOAL, J. J.; JOSAHKIAN, L. A.; ALMEIDA, L. F.; MARCONDES, C. R.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REECY, J. M.; REGITANO, L. C. de A. Microbial diversity in the stool of Bos indicus divergent for feed efficiency. Italian Journal of Animal Science, v. 22, supplement 1, 2023. p. 194. Congress of the Animal Science and Production Association, 25., Monopoli (BARI – ITALY), June 13–16, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 12. | | SILVA, W. DOS S.; CARDOSO, T. F.; ANDRADE, B. G. N.; SILVA, J. V.; CONTEVILLE, L. C.; AFONSO, J.; BRUSCADIN, J.; OKINO, C. H.; KAPRITCHKOFF, R. T. I.; CHAGAS, A. C. de S.; REGITANO, L. C. de A. Componentes do microbioma fecal e ruminal associados à suscetibilidade à infecção por Haemonchus contortus em ovinos Morada Nova. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA SÃO CARLOS, 14., 2022, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação; Embrapa Pecuária Sudeste, 2022. p. 77. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 73).| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 13. | | NICIURA, S. C. M.; CARDOSO, T. F.; IBELLI, A. M. G.; OKINO, C. H.; ANDRADE, B. G.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S.; ESTEVES, S. N.; MINHO, A. P.; REGITANO, L. C. de A.; GONDRO, C. Multi-omics data elucidate parasite-host-microbiota interactions and resistance to Haemonchus contortus. in sheep Parasites & Vectors, v. 17, n. 102, 2024.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 14. | | SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; ROCHA, M. I. P.; BRUSCADIN, J. J.; DINIZ, W. J. da S.; CARDOSO, T. F.; CESAR, A. S. M.; AFONSO, J.; ANDRADE, B. G. N.; MUDADU, M. de A.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Allele-specific expression is widespread in Bos indicus muscle and affects meat quality candidate genes. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-11, 2020. Na publicação: Adhemar Zerlotini. Article number: 10204.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 15. | | BRUSCADIN, J. J.; CARDOSO, T. F.; DINIZ, W. J. da S.; AFONSO, J.; SOUZA, M. M. de; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; SILVA, V. H. da; FERRAZ, J. B. S.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Allele-specific expression reveals functional SNPs affecting muscle-related genes in bovine. Biochimica et Biophysica Acta. Gene Regulatory Mechanisms, v. 1865, n. 8, 194886, Nov. 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 16. | | BUSS, C. E.; AFONSO, J.; OLIVEIRA, P. S. N. DE; PETRINI, J.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; GUSTANI-BUSS, E. C.; CARDOSO, T. F.; ROVADOSKI, G. A.; DINIZ, W. J. DA S.; LIMA, A. O. DE; ROCHA, M. I. P.; ANDRADE, B. G. N.; WOLF, J. B.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Bivariate GWAS reveals pleiotropic regions among feed efficiency and beef quality-related traits in Nelore cattle. Mammalian Genome, v. 34, p. 90-103, dec. 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 17. | | CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI NETO, A.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle. Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 18. | | BRUSCADIN, J. J.; CARDOSO, T. F.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; AFONSO, J.; VIEIRA, D.; MALHEIROS, J. M.; ANDRADE, B. G. N.; PETRINI, J.; FERRAZ, J. B. S.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Differential allele-specific expression revealed functional variants and candidate genes related to meat quality traits in B. indicus muscle. Genes, v. 13, n. 12, 2336, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 19. | | BRUSCADIN, J. J.; CARDOSO, T. F.; DINIZ, W. J. da S.; SOUZA, M. M. de; AFONSO, J.; VIEIRA, D. da S.; MALHEIROS, J.; ANDRADE, B. G.; PETRINI, J.; FERRAZ, J. B. S.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G.; COUTINHO, L. L. L; REGITANO, L. C. de A. Differential allelic expression and co-expression revealed oxidative stress-dependent proteolysis as a key regulator of nelore beef tenderness. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal. [Abstracts]. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 207. e-book. Na publicação: Adhemar Zerlotini.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 20. | | BUSS, C. E.; DINIZ, W. J. da S.; ANDRADE, B. G.; LIMA, A. O. de; GEISTLINGER, L.; AFONSO, J.; TULLIO, R. R.; TIZIOTO, P. C.; PETRINI, J.; COUTINHO, L. L.; WOLF, J. B.; MOURAO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. Identification of pleiotropic loci for daily weight gain and intramuscular fat in cattle using bivariate genome-wide association analysis. In: INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS CONFERENCE, 36., 2017, Dublin. Proceedings... Dublin: University College Dublin, 2017. p. 161-162.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| Registros recuperados : 30 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agricultura Digital. Para informações adicionais entre em contato com cnptia.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
26/07/2022 |
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Data da última atualização: |
10/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 2 |
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Autoria: |
CARDOSO, T. F.; BRUSCADIN, J. J.; AFONSO, J.; PETRINI, J.; ANDRADE, B. G. N.; OLIVEIRA, P. S. N. de; MALHEIROS, J. M.; ROCHA, M. I. P.; ZERLOTINI NETO, A.; FERRAZ, J. B. S.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
UFSCar; ESALQ/USP; Munster Technological University; UFSCar; Federal University of Latin American Integration, Foz do Iguaçu; UFSCar; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; FZEA/USP; ESALQ/USP; ESALQ/USP; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
EEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle. |
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Palavras-Chave: |
Cofatores de transcrição; Expressão gênica; Fatores de transcrição; Loci de característica quantitativa; Nelore cattle; Polimorfismos de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Gado Nelore. |
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Thesaurus NAL: |
Gene expression; Quantitative trait loci; Single nucleotide polymorphism; Transcription (genetics); Transcription factors. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02647naa a2200421 a 4500
001 2144939
005 2022-11-10
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00335-022-09959-8$2DOI
100 1 $aCARDOSO, T. F.
245 $aEEF1A1 transcription cofactor gene polymorphism is associated with muscle gene expression and residual feed intake in Nelore cattle.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aAbstract. Cis-acting effects of noncoding variants on gene expression and regulatory molecules constitute a significant factor for phenotypic variation in complex traits. To provide new insights into the impacts of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) on transcription factors (TFs) and transcription cofactors (TcoF) coding genes, we carried out a multi-omic analysis to identify cis-regulatory effects of SNPs on these genes? expression in muscle and describe their association with feed efficiency-related traits in Nelore cattle. As a result, we identified one SNP, the rs137256008C > T, predicted to impact the EEF1A1 gene expression (? = 3.02; P-value = 3.51E-03) and the residual feed intake trait (? = -3.47; P-value = 0.02). This SNP was predicted to modify transcription factor sites and overlaps with several QTL for feed efficiency traits. In addition, coexpression network analyses showed that animals containing the T allele of the rs137256008 SNP may be triggering changes in the gene network. Therefore, our analyses reinforce and contribute to a better understanding of the biological mechanisms underlying gene expression control of feed efficiency traits in bovines. The cis-regulatory SNP can be used as biomarker for feed efficiency in Nelore cattle.
650 $aGene expression
650 $aQuantitative trait loci
650 $aSingle nucleotide polymorphism
650 $aTranscription (genetics)
650 $aTranscription factors
650 $aGado Nelore
653 $aCofatores de transcrição
653 $aExpressão gênica
653 $aFatores de transcrição
653 $aLoci de característica quantitativa
653 $aNelore cattle
653 $aPolimorfismos de nucleotídeo único
700 1 $aBRUSCADIN, J. J.
700 1 $aAFONSO, J.
700 1 $aPETRINI, J.
700 1 $aANDRADE, B. G. N.
700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. de
700 1 $aMALHEIROS, J. M.
700 1 $aROCHA, M. I. P.
700 1 $aZERLOTINI NETO, A.
700 1 $aFERRAZ, J. B. S.
700 1 $aMOURÃO, G. B.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
773 $tMammalian Genome$gv. 33, n. 4, p. 619-628, Dec. 2022.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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