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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
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Data corrente: |
28/09/2022 |
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Data da última atualização: |
28/09/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ABREU, V. A. C. de; ALVES, R. M.; SILVA, S. R.; FERRO, J. A.; DOMINGUES, D. S.; MIRANDA, V. F. O.; VARANI, A. M. |
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Afiliação: |
VINICIUS A. C. DE ABREU, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARÁ; RAFAEL MOYSES ALVES, CPATU; SAURA R. SILVA, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; JESUS A. FERRO, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; DOUGLAS S. DOMINGUES, ESCOLA SUPERIOR DE AGRICULTURA LUIZ DE QUEIROZ; VITOR F.O. MIRANDA, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; ALESSANDRO M. VARANI, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA. |
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Título: |
Comparative analyses of Theobroma cacao and T. grandiflorum mitogenomes reveal conserved gene content embedded within complex and plastic structures. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Gene, v. 849, 146904, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146904 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Unlike the chloroplast genomes (ptDNA), the plant mitochondrial genomes (mtDNA) are much more plastic in structure and size but maintain a conserved and essential gene set related to oxidative phosphorylation. Moreover, the plant mitochondrial genes and mtDNA are good markers for phylogenetic, evolutive, and comparative analyses. The two most known species in Theobroma L. (Malvaceae s.l.) genus are T. cacao, and T. grandiflorum. Besides the economic value, both species also show considerable biotechnology potential due to their other derived products, thus, aggregating additional economic value for the agroindustry. Here, we assembled and compared the mtDNA of Theobroma cacao and T. grandiflorum to generate a new genomics resource and unravel evolutionary trends. Graph-based analyses revealed that both mtDNA exhibit multiple alternative arrangements, confirming the dynamism commonly observed in plant mtDNA. The disentangled assembly graph revealed potential predominant circular molecules. The master circle molecules span 543,794 bp for T. cacao and 501,598 bp for T. grandiflorum, showing 98.9% of average sequence identity. Both mtDNA contains the same set of 39 plant mitochondrial genes, commonly found in other rosid mitogenomes. The main features are a duplicated copy of atp4, the absence of rpl6, rps2, rps8, and rps11, and the presence of two chimeric open-reading frames. Moreover, we detected few ptDNA integrations mainly represented by tRNAs, and no viral sequences were detected. Phylogenomics analyses indicate Theobroma spp. are nested in Malvaceae family. The main mtDNA differences are related to distinct structural rearrangements and exclusive regions associated with relics of Transposable Elements, supporting the hypothesis of dynamic mitochondrial genome maintenance and divergent evolutionary paths and pressures after species differentiation. MenosUnlike the chloroplast genomes (ptDNA), the plant mitochondrial genomes (mtDNA) are much more plastic in structure and size but maintain a conserved and essential gene set related to oxidative phosphorylation. Moreover, the plant mitochondrial genes and mtDNA are good markers for phylogenetic, evolutive, and comparative analyses. The two most known species in Theobroma L. (Malvaceae s.l.) genus are T. cacao, and T. grandiflorum. Besides the economic value, both species also show considerable biotechnology potential due to their other derived products, thus, aggregating additional economic value for the agroindustry. Here, we assembled and compared the mtDNA of Theobroma cacao and T. grandiflorum to generate a new genomics resource and unravel evolutionary trends. Graph-based analyses revealed that both mtDNA exhibit multiple alternative arrangements, confirming the dynamism commonly observed in plant mtDNA. The disentangled assembly graph revealed potential predominant circular molecules. The master circle molecules span 543,794 bp for T. cacao and 501,598 bp for T. grandiflorum, showing 98.9% of average sequence identity. Both mtDNA contains the same set of 39 plant mitochondrial genes, commonly found in other rosid mitogenomes. The main features are a duplicated copy of atp4, the absence of rpl6, rps2, rps8, and rps11, and the presence of two chimeric open-reading frames. Moreover, we detected few ptDNA integrations mainly represented by tRNAs, and no viral sequences were ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Genoma; Horticultura; Malvaceae; Theobroma Cacao; Theobroma Grandiflorum. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
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Data corrente: |
03/01/2020 |
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Data da última atualização: |
08/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Documentos |
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Autoria: |
AMARAL, E. F. do; BARDALES, N. G.; ARAÚJO, E. A. de; OLIVEIRA, T. K. de; HAVERROTH, M.; MARTORANO, L. G.; FRANKE, I. L.; CARMO, L. F. Z. do; OLIVEIRA, C. H. A. de; MELO, V. F.; MORAES, J. R. da S. C. de; MELO, A. W. F. de; LANI, J. L. |
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Afiliação: |
EUFRAN FERREIRA DO AMARAL, CPAF-AC; NILSON GOMES BARDALES, BOLSISTA CNPq/FAPAC/EMBRAPA ACRE; EDSON ALVES DE ARAÚJO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; TADARIO KAMEL DE OLIVEIRA, CPAF-AC; MOACIR HAVERROTH, CPAF-AC; LUCIETA GUERREIRO MARTORANO, CPATU; IDESIO LUIS FRANKE, CPAF-AC; LÚCIO FLÁVIO ZANCANELA DO CARMO, INSTITUTO FEDERAL DO ACRE; CHARLES HENDERSON ALVES DE OLIVEIRA, INSTITUTO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E REGULAÇÃO DE SERVIÇOS AMBIENTAIS; VALDINAR FERREIRA MELO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE RORAIMA; JOSÉ REINALDO DA SILVA CABRAL DE MORAES, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; ANTONIO WILLIAN FLORES DE MELO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; JOÃO LUIZ LANI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA. |
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Título: |
Solos da Terra Indígena Kaxinawá Nova Olinda, Feijó, Estado do Acre, Brasil. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2019. |
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Série: |
(Embrapa Acre. Documentos, 159). |
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ISSN: |
0104-9046 |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Selo ODS 17. |
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Conteúdo: |
Neste trabalho o objetivo foi analisar a gênese dos solos da Terra Indígena Kaxinawá Nova Olinda em diferentes geoambientes, bem como avaliar as características das ordens, que ocorrem a partir da estruturação de uma base de dados de perfis, que permita a gestão da informação para indicativos de uso. Esta publicação está de acordo com o Objetivo de Desenvolvimento Sustentável 17 (Parcerias e Meios de Implementação). Os Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS) são uma coleção de 17 metas globais estabelecidas pela Assembleia Geral das Nações Unidas. |
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Palavras-Chave: |
Acre; Amazonia Occidental; Amazônia Ocidental; Comunidades tradicionais; Feijó (AC); Formación del suelo; Pueblos indígenas; Reconocimiento de suelos; Selo ODS 17; Terra Indígena Kaxinawá Nova Olinda (TIKNO); Western Amazon. |
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Thesagro: |
Gênese do Solo; Reconhecimento do Solo. |
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Thesaurus NAL: |
Indigenous peoples; Soil formation; Soil surveys. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/209163/1/26945.pdf
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Marc: |
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520 $aNeste trabalho o objetivo foi analisar a gênese dos solos da Terra Indígena Kaxinawá Nova Olinda em diferentes geoambientes, bem como avaliar as características das ordens, que ocorrem a partir da estruturação de uma base de dados de perfis, que permita a gestão da informação para indicativos de uso. Esta publicação está de acordo com o Objetivo de Desenvolvimento Sustentável 17 (Parcerias e Meios de Implementação). Os Objetivos de Desenvolvimento Sustentável (ODS) são uma coleção de 17 metas globais estabelecidas pela Assembleia Geral das Nações Unidas.
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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