| |
|
|
| Registros recuperados : 65 | |
| 2. |  | TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; ANDRADE, A. C. RNA-Seq em Coffea arabica: genes candidatos em condições de estresse abiótico. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
|    |
| 3. | | ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Análise da expressão de genes candidatos para a tolerância à seca, em genótipos de Coffea arabica, por PCR quantitativo. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 019. p. 59.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 4. | | TORRES, L. F.; DÉCHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H.; ANDRADE, A. C. Transcriptome analysis in Coffea arabica, under several abiotic stresses, reveals differentially expressed genes in leaves. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 5. | | VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Caracterização de genótipos de Coffea canephora tolerantes ao estresse hídrico. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia: Fundação de Apoio à Pesquisa Científica e Tecnológica - FUNCREDI, 2008. p.132.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 6. | | REICHEL, T.; ALVES, G. S. C.; AQUINO, S. O.; CARNEIRO, F.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P. Expression analysis ofdrebsubfamily genes in leaves and roots of Coffea canephora Conilon subjected to Drought. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFE SCIENCE, 26., 2016, China. The programm & abstrcets... China: Asic, 2016. p. 183.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 8. | | VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; FREIRE, L. P.; VIEIRA, N. G.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Identificação e caracterização de genes candidatos para a tolerância à seca em clones de café Conilon (Coffea canephora). In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 10. | | MERA, A. C.; ALVES, G. S. C.; GUYOT, B.; DAVRIEUX, F.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Efeitos de estresse hídrico na composição bioquímica de grãos de Coffea arabica Cv. Rubi. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 11. | | MERA, A. C.; ALVES, G. S. C.; GUYOT, B.; DAVRIEUX, F.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Efeitos de estresse hídrico na composição bioquímica de grãos de coffea arabica cv. rubi. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 12. | | ALVES, G. S. C.; RAMOS, H.; RODRIGUES, G. C.; VIEIRA, L. G. E.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Estresse hídrico altera o perfil de expressão de isoformas da subunidade menor (RBCS) da rubisco em folhas de Coffea arabica e Coffea canephora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 13. | | RODRIGUES, G. C.; ALVES, G. S. C.; RAMOS, H.; VIEIRA, L. G. E.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Estresse hídrico altera o perfil de expressão de isoformas da subunidade menor (RBCS) da rubisco em folhas de Coffea arabica e Coffea canephora. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas: anais... Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 14. | | AQUINO, S. O.; CARNEIRO, FERNANDA A; REGO, E. C. S.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Functional analysis of different promoter haplotypes of the coffee (Coffea Canephora) CcDREB1D gene through genetic transformation of Nicotiana tabacum. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFE SCIENCE, 26., 2016, China. The programm & abstrcets... China: Asic, 2016. p. 184.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 15. | | FREIRE, L. P.; VIEIRA, N. G.; VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; HEIMBECK, I. G. R.; RODRIGUES, G. C.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Análise de expressão e polimorfismo nucléicos de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 16. | | ALVES, G. S. C.; FREIRE, L. P.; HEIMBECK, I. G. R.; VIEIRA, N. G.; VINECKY, F.; MARRACCINI, P.; PAIVA, L. V.; ANDRADE, A. C. Identificação e análise de polimorfismos na região promotora do gene DREB2A em vários genótipos do gênero Coffea. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 17. | | HEIMBECK, I. R.; BRAND, G. D.; PRATES, M. V.; ALVES, G. S. C.; MARRACCINI, P.; BLOCH JUNIOR, C.; ANDRADE, A. C. Identificação e caracterização de proteínas expressas em diferentes estágios de desenvolvimento de frutos de café (Coffea arabica L.). In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 040. p. 80.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 18. | | VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; FREIRE, L. P.; VIEIRA, N. G.; ALVARENGA, M. O.; DA SILVA, F. R.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. Identificação de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro, por meio de análises da expressão gênica com macroarranjos de cDNA e PCR quantitativo. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 13., 2008, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. Resumo 037. p. 77.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 19. | | TORRES, L. F.; DECHAMP, E.; ALVES, G. S. C.; DINIZ, L. E. C.; PAIVA, L. V; BREITLER, J-C.; ANDRADE, A. C.; MARRACINI, P.; ETIENNE, HERVE. Influence of abiotic stresses in phenotypic expression of transgenic plants of Coffea Arabica under action CcDREB1D promoter. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFE SCIENCE, 26., 2016, China. The programm & abstrcets... China: Asic, 2016.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 20. | | ALVES, G. S. C.; DECHAMP, E.; FREIRE, L. P.; POT, D.; THIS, D.; PAIVA, L. V.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; ETIENNE, H. Characterization of CcDREB1D promoter region from contrasting genotypes of Coffea canephora by homologous transformation in Coffea Arabica. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 25., 2014, Armenia, Colombia. [Proceedings...]. [Armenia]: ASIC, 2015. p. 42-47.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|  |
| Registros recuperados : 65 | |
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|
Data corrente: |
15/08/2017 |
|
Data da última atualização: |
17/04/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G. |
|
Afiliação: |
NANCY EUNICE NIÑO CASTAÑEDA, UNB; GABRIEL SERGIO COSTA ALVES, UNB; ROSANE MANSAN ALMEIDA, UNB; EDSON PERITO AMORIM, CNPMF; CLAUDIA FORTES FERREIRA, CNPMF; ROBERTO COITI TOGAWA, CENARGEN; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, CENARGEN; PRISCILA GRYNBERG, Cenargen; JANSEN RODRIGO PEREIRA SANTOS, UNIVERSITY OF CALIFORNIA, USA; JUVENIL ENRIQUE CARES, UNB; ROBERT NEIL GERARD MILLER, UNB. |
|
Título: |
Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
Annals of Botany, v. 119, p. 915-930, 2017. |
|
DOI: |
10.1093/aob/mcw272 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Background and Aims: Endoparasitic root-knot nematodes (RKNs) ( Meloidogyne spp.) cause considerable losses in banana ( Musa spp.), with Meloidogyne incognita a predominant species in Cavendish sub-group bananas. This study investigates the root transcriptome in Musa acuminata genotypes 4297-06 (AA) and Cavendish Grande Naine (CAV; AAA) during early compatible interactions with M. incognita . Methods: Roots were analysed by brightfield light microscopy over a 35 d period to examine nematode penetration and morphological cell transformation. RNA samples were extracted 3, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with nematode J2 juveniles, and cDNA libraries were sequenced using lllumina HiSeq technology. Sequences were mapped to the M. acuminata ssp. malaccensis var. Pahang genome sequence, differentially expressed genes (DEGs) identified and transcript representation determined by gene set enrichment and pathway mapping. Key Results: Microscopic analysis revealed a life cycle of M. incognita completing in 24 d in CAV and 27 d in 4279-06. Comparable numbers of DEGs were up- and downregulated in each genotype, with potential involvement of many in early host defence responses involving reactive oxygen species and jasmonate/ethylene signalling. DEGs revealed concomitant auxin metabolism and cell wall modification processes likely to be involved in giant cell formation. Notable transcripts related to host defence included those coding for leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinases, peroxidases, thaumatin-like pathogenesis-related proteins, and DREB, ERF, MYB, NAC and WRKY transcription factors. Transcripts related to giant cell development included indole acetic acid-amido synthetase GH3.8 genes, involved in auxin metabolism, as well as genes encoding expansins and hydrolases, involved in cell wall modification. Conclusions: Expression analysis in M. acuminata during compatible interactions with RKNs provides insights into genes modulated during infection and giant cell formation. Increased understanding of both defence responses to limit parasitism during compatible interactions and effector-targeted host genes in this complex interaction will facilitate the development of genetic improvement measures for RKNs. MenosBackground and Aims: Endoparasitic root-knot nematodes (RKNs) ( Meloidogyne spp.) cause considerable losses in banana ( Musa spp.), with Meloidogyne incognita a predominant species in Cavendish sub-group bananas. This study investigates the root transcriptome in Musa acuminata genotypes 4297-06 (AA) and Cavendish Grande Naine (CAV; AAA) during early compatible interactions with M. incognita . Methods: Roots were analysed by brightfield light microscopy over a 35 d period to examine nematode penetration and morphological cell transformation. RNA samples were extracted 3, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with nematode J2 juveniles, and cDNA libraries were sequenced using lllumina HiSeq technology. Sequences were mapped to the M. acuminata ssp. malaccensis var. Pahang genome sequence, differentially expressed genes (DEGs) identified and transcript representation determined by gene set enrichment and pathway mapping. Key Results: Microscopic analysis revealed a life cycle of M. incognita completing in 24 d in CAV and 27 d in 4279-06. Comparable numbers of DEGs were up- and downregulated in each genotype, with potential involvement of many in early host defence responses involving reactive oxygen species and jasmonate/ethylene signalling. DEGs revealed concomitant auxin metabolism and cell wall modification processes likely to be involved in giant cell formation. Notable transcripts related to host defence included those coding for leucine-rich repeat receptor-like serine/th... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Monocotyledons; Root-knot nematode. |
|
Thesagro: |
Meloidogyne Incognita; Musa Acuminata. |
|
Thesaurus NAL: |
Biotic stress; Transcriptome. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/166757/1/Gene-expression-analysis-in-Musa-Artigo-1.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/162722/1/mcw272.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 03215naa a2200325 a 4500
001 2076414
005 2023-04-17
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1093/aob/mcw272$2DOI
100 1 $aCASTAÑEDA, N. E. N.
245 $aGene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aBackground and Aims: Endoparasitic root-knot nematodes (RKNs) ( Meloidogyne spp.) cause considerable losses in banana ( Musa spp.), with Meloidogyne incognita a predominant species in Cavendish sub-group bananas. This study investigates the root transcriptome in Musa acuminata genotypes 4297-06 (AA) and Cavendish Grande Naine (CAV; AAA) during early compatible interactions with M. incognita . Methods: Roots were analysed by brightfield light microscopy over a 35 d period to examine nematode penetration and morphological cell transformation. RNA samples were extracted 3, 7 and 10 days after inoculation (DAI) with nematode J2 juveniles, and cDNA libraries were sequenced using lllumina HiSeq technology. Sequences were mapped to the M. acuminata ssp. malaccensis var. Pahang genome sequence, differentially expressed genes (DEGs) identified and transcript representation determined by gene set enrichment and pathway mapping. Key Results: Microscopic analysis revealed a life cycle of M. incognita completing in 24 d in CAV and 27 d in 4279-06. Comparable numbers of DEGs were up- and downregulated in each genotype, with potential involvement of many in early host defence responses involving reactive oxygen species and jasmonate/ethylene signalling. DEGs revealed concomitant auxin metabolism and cell wall modification processes likely to be involved in giant cell formation. Notable transcripts related to host defence included those coding for leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinases, peroxidases, thaumatin-like pathogenesis-related proteins, and DREB, ERF, MYB, NAC and WRKY transcription factors. Transcripts related to giant cell development included indole acetic acid-amido synthetase GH3.8 genes, involved in auxin metabolism, as well as genes encoding expansins and hydrolases, involved in cell wall modification. Conclusions: Expression analysis in M. acuminata during compatible interactions with RKNs provides insights into genes modulated during infection and giant cell formation. Increased understanding of both defence responses to limit parasitism during compatible interactions and effector-targeted host genes in this complex interaction will facilitate the development of genetic improvement measures for RKNs.
650 $aBiotic stress
650 $aTranscriptome
650 $aMeloidogyne Incognita
650 $aMusa Acuminata
653 $aMonocotyledons
653 $aRoot-knot nematode
700 1 $aALVES, G. S. C.
700 1 $aALMEIDA, R. M.
700 1 $aAMORIM, E. P.
700 1 $aFERREIRA, C. F.
700 1 $aTOGAWA, R. C.
700 1 $aCOSTA, M. M. do C.
700 1 $aGRYNBERG, P.
700 1 $aSANTOS, J. R. P.
700 1 $aCARES, J. E.
700 1 $aMILLER, R. N. G.
773 $tAnnals of Botany$gv. 119, p. 915-930, 2017.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
