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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
01/02/2011 |
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Data da última atualização: |
24/02/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
HIGA, R. H.; TOZZI, C. L. |
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Afiliação: |
ROBERTO HIROSHI HIGA, FEEC/UNICAMP, CNPTIA; CLÉSIO LUIS TOZZI, FEEC/UNICAMP. |
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Título: |
Prediction of binding hot spot residues by using structural and evolutionary parameters. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 32, n. 3, p. 626-633, 2009. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
In this work, we present a method for predicting hot spot residues by using a set of structural and evolutionary parameters. Unlike previous studies, we use a set of parameters which do not depend on the structure of the protein in complex, so that the predictor can also be used when the interface region is unknown. Despite the fact that no information concerning proteins in complex is used for prediction, the application of the method to a compiled dataset described in the literature achieved a performance of 60.4%, as measured by F-Measure, corresponding to a recall of 78.1% and a precision of 49.5%. This result is higher than those reported by previous studies using the same data set. |
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Palavras-Chave: |
Estrutura proteica; Interações proteína-proteína; Previsão de resíduos hot spots. |
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Thesaurus Nal: |
Prediction; Protein structure. |
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Categoria do assunto: |
W Química e Física |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/26210/1/gmb2009.pdf
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Marc: |
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520 $aIn this work, we present a method for predicting hot spot residues by using a set of structural and evolutionary parameters. Unlike previous studies, we use a set of parameters which do not depend on the structure of the protein in complex, so that the predictor can also be used when the interface region is unknown. Despite the fact that no information concerning proteins in complex is used for prediction, the application of the method to a compiled dataset described in the literature achieved a performance of 60.4%, as measured by F-Measure, corresponding to a recall of 78.1% and a precision of 49.5%. This result is higher than those reported by previous studies using the same data set.
650 $aPrediction
650 $aProtein structure
653 $aEstrutura proteica
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653 $aPrevisão de resíduos hot spots
700 1 $aTOZZI, C. L.
773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 32, n. 3, p. 626-633, 2009.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Para informações adicionais entre em contato com cenargen.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
09/11/2005 |
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Data da última atualização: |
24/05/2022 |
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Autoria: |
MELO, D. F.; ÁVILA, Z. R.; MELLO, S. C. M.; BERNARDES, V. C. D.; SILVA, J. B. T. |
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Título: |
Uso de Biodac em substrato para o cultivo de Dicyma pulvinata. |
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Ano de publicação: |
2005 |
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Fonte/Imprenta: |
Fitopatologia Brasileira, Brasília, v. 30, p. 168, ago. 2005. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Suplemento: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 38., 2005, Brasília, DF. |
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Palavras-Chave: |
Dicyma pulvinata. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 00593nam a2200169 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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