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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
31/10/2017 |
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Data da última atualização: |
31/10/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RENDÓN-ANAYA, M.; MONTERO-VARGAS, J. M.; SABURIDO-ALVAREZ, S.; VLASOVA, A.; CAPELLA-GUTIERREZ, S.; ORDAZ-ORTIZ, J. J.; AGUILAR, O. M.; VIANELLO, R. P.; SANTALLA, M.; DELAYE, L.; GABALDÓN, T.; GEPTS, P.; WINKLER, R.; GUIGÓ, R.; DELGADO-SALINAS, A.; HERRERA-ESTRELLA, A. |
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Afiliação: |
MARTHA RENDÓN-ANAYA, CINVESTAV, México; JOSAPHAT M. MONTERO-VARGAS, CINVESTAV, México; SOLEDAD SABURIDO-ALVAREZ, CINVESTAV, México; ANNA VLASOVA, CENTRE FOR GENOMIC REGULATION, Barcelona; SALVADOR CAPELLA-GUTIERREZ, CENTRE FOR GENOMIC REGULATION, Barcelona; JOSE JUAN ORDAZ-ORTIZ, CINVESTAV, México; O. MARIO AGUILAR, UNLP-CONICET, Argentina; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; MARTA SANTALLA, NATIONAL SPANISH RESEARCH COUNCIL, Espanha; LUIS DELAYE, CINVESTAV, México; TONI GABALDON, CENTRE FOR GENOMIC REGULATION, Barcelona; PAUL GEPTS, UNIVERSITY OF CALIFORNIA, Davis; ROBERT WINKLER, CINVESTAV, México; RODERIC GUIGÓ, CENTRE FOR GENOMIC REGULATION, Barcelona; ALFONSO DELGADO-SALINAS, UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MEXICO; ALFREDO HERRERA-ESTRELLA, CINVESTAV, México. |
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Título: |
Genomic history of the origin and domestication of common bean unveils its closest sister species. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Genome Biology, v. 18, n. 1, p. 1-17, Mar. 2017. |
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DOI: |
0.1186/s13059-017-1190-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Modern civilization depends on only a few plant species for its nourishment. These crops were derived via several thousands of years of human selection that transformed wild ancestors into high-yielding domesticated descendants. Among cultivated plants, common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the most important grain legume. Yet, our understanding of the origins and concurrent shaping of the genome of this crop plant is limited. Results: We sequenced the genomes of 29 accessions representing 12 Phaseolus species. Single nucleotide polymorphism-based phylogenomic analyses, using both the nuclear and chloroplast genomes, allowed us to detect a speciation event, a finding further supported by metabolite profiling. In addition, we identified ~1200 protein coding genes (PCGs) and ~100 long non-coding RNAs with domestication-associated haplotypes. Finally, we describe asymmetric introgression events occurring among common bean subpopulations in Mesoamerica and across hemispheres. Conclusions: We uncover an unpredicted speciation event in the tropical Andes that gave rise to a sibling species, formerly considered the ?wild ancestor? of P. vulgaris, which diverged before the split of the Mesoamerican and Andean P. vulgaris gene pools. Further, we identify haplotypes strongly associated with genes underlying the emergence of domestication traits. Our findings also reveal the capacity of a predominantly autogamous plant to outcross and fix loci from different populations, even from distant species, which led to the acquisition by domesticated beans of adaptive traits from wild relatives. The occurrence of such adaptive introgressions should be exploited to accelerate breeding programs in the near future. MenosBackground: Modern civilization depends on only a few plant species for its nourishment. These crops were derived via several thousands of years of human selection that transformed wild ancestors into high-yielding domesticated descendants. Among cultivated plants, common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the most important grain legume. Yet, our understanding of the origins and concurrent shaping of the genome of this crop plant is limited. Results: We sequenced the genomes of 29 accessions representing 12 Phaseolus species. Single nucleotide polymorphism-based phylogenomic analyses, using both the nuclear and chloroplast genomes, allowed us to detect a speciation event, a finding further supported by metabolite profiling. In addition, we identified ~1200 protein coding genes (PCGs) and ~100 long non-coding RNAs with domestication-associated haplotypes. Finally, we describe asymmetric introgression events occurring among common bean subpopulations in Mesoamerica and across hemispheres. Conclusions: We uncover an unpredicted speciation event in the tropical Andes that gave rise to a sibling species, formerly considered the ?wild ancestor? of P. vulgaris, which diverged before the split of the Mesoamerican and Andean P. vulgaris gene pools. Further, we identify haplotypes strongly associated with genes underlying the emergence of domestication traits. Our findings also reveal the capacity of a predominantly autogamous plant to outcross and fix loci from different populations, e... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Adaptive traits; Genomic introgression. |
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Thesagro: |
Feijão; Phaseolus vulgaris. |
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Thesaurus Nal: |
Biological speciation; Domestication; Genomics. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/165852/1/CNPAF-2017-gb.pdf
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Marc: |
LEADER 02878naa a2200397 a 4500
001 2078520
005 2017-10-31
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 35 | |
| 1. |  | MAISFORTE, N. da S.; MONTEIRO, A. F. M.; FAZOLIN, M. Frações do óleo essencial de Piper aduncum L. utilizadas como sinérgicas de inseticidas fosforado e benzoilureia. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 4., 2021, Rio Branco, AC. Atividades agropecuária e florestal para o desenvolvimento sustentável da Amazônia: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2022. Apresentação oral. p. 23-27. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 4). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 3. | | LIMA, M. E. C.; FAZOLIN, M.; MAISFORTE, N. da S.; MONTEIRO, A. F. M. Aumento do desempenho sinérgico do óleo essencial de Piper aduncum L. pelo enriquecimento de suas frações terpênicas - organofosforado. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 5., 2022, Rio Branco, AC. O papel da tecnologia agrícola na segurança alimentar: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2023. p. 11-16. Apresentação oral. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 5). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 4. | | MAISFORTE, N. da S.; FAZOLIN, M.; LIMA, M. E. C.; MONTEIRO, A. F. M. Aumento do desempenho sinérgico do óleo essencial de Piper aduncum L. pelo enriquecimento de suas frações terpênicas - piretroide sintético. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 5., 2022, Rio Branco, AC. O papel da tecnologia agrícola na segurança alimentar: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2023. p. 17-22. Apresentação oral. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 5). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 5. | | LIMA, M. E. C. de; FAZOLIN, M.; MAISFORTE, N. da S.; MONTEIRO, A. F. M. Avaliação do grau de fitotoxicidade de emulsões de ricinoleato de sódio com o óleo essencial de Piper aduncum L. (Piperaceae), em plântulas de Phaseolus vulgaris L. (Fabaceae). In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 4., 2021, Rio Branco, AC. Atividades agropecuária e florestal para o desenvolvimento sustentável da Amazônia: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2022. Apresentação oral. p. 95-102. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 4). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 6. | | LIMA, M. E. C. de; FAZOLIN, M.; MONTEIRO, A. F. M. Avaliação de frações do óleo de Piper aduncum L. como sinérgicas de inseticidas carbamatos e espinosinas. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 4., 2021, Rio Branco, AC. Atividades agropecuária e florestal para o desenvolvimento sustentável da Amazônia: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2022. Apresentação oral. p. 11-16. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 4). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 7. | | LIMA, M. E. C. de; OLIVEIRA, H. K. G.; MONTEIRO, A. F. M.; FAZOLIN, M. Avaliação inseticida de composições químicas por adição de monoterpenos, sesquiterpenos e fenilpropanoides ao dilapiol. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 1., 2018, Rio Branco, AC. Pesquisa e inovação para a Agropecuária no Acre: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2019. p. 51-56. Apresentação oral. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 1).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 10. | | CAVALCANTE, E. S.; VIANA, L. de O.; MONTEIRO, A. F. M.; FAZOLIN, M. Comparação da eficácia inseticida de diferentes frações do óleo essencial de Piper aduncum L. no controle da lagarta-do-cartucho do milho In: CONGRESSO REGIONAL DE PESQUISA DO ESTADO DO ACRE, 2.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFAC, 25., 2016, Rio Branco/Cruzeiro do Sul. Inovação: sustentabilidade e desenvolvimento regional: anais. Rio Branco, AC: Edufac, 2016. p. 83.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 12. | | VIANA, L. de O.; CAVALCANTE, E. S.; MONTEIRO, A. F. M.; FAZOLIN, M. Influência da decomposição solar sobre a eficácia inseticida do óleo essencial de Piper aduncum L. no controle da lagarta-do-cartucho do milho. In: CONGRESSO REGIONAL DE PESQUISA DO ESTADO DO ACRE, 2.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFAC, 25., 2016, Rio Branco/Cruzeiro do Sul. Inovação: sustentabilidade e desenvolvimento regional: anais. Rio Branco, AC: Edufac, 2016. p. 125.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 14. | | MAISFORTE, N. da S.; FAZOLIN, M.; LIMA, M. E. C. de; MONTEIRO, A. F. M. Estabilidade física de emulsões de ricinoleato de sódio adicionado ao óleo essencial de Piper aduncum L., em diferentes concentrações. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 4., 2021, Rio Branco, AC. Atividades agropecuária e florestal para o desenvolvimento sustentável da Amazônia: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2022. Apresentação oral. p. 89-94. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 4). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 16. | | OLIVEIRA, H. K. L. G.; LIMA, M. E. C. de; MONTEIRO, A. F. M.; FAZOLIN, M. Sinergismo relacionado à proporção dos constituintes do óleo essencial de Piper aduncum L. In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 4., 2021, Rio Branco, AC. Atividades agropecuária e florestal para o desenvolvimento sustentável da Amazônia: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2022. Apresentação oral. p. 17-21. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 4). Editores técnicos: Rodrigo Souza Santos; Fabiano Marçal Estanislau.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 18. | | FAZOLIN, M.; MONTEIRO, A. F. M.; ESTRELA, J. L. V.; SILVA, M. S. de F.; SILVA, I. M. da. Manejo da resistência de lagartas a benzoilfeniluréias utilizando sinergista vegetal. South American Journal of Basic Education, Technical and Technological, v. 9, n. 1, p. 242-261, jan./abr. 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 20. | | FAZOLIN, M.; ESTRELA, J. L. V.; MONTEIRO, A. F. M.; SILVA, I. M. da; GOMES, L. P. Sinérgico alternativo para inseticidas inibidores de acetilcolinesterase. Revista Agro@mbiente On-line, Boa Vista, v. 11, n. 3, p. 232-240, jul./set. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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