BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Soja.
Data corrente:  03/11/2014
Data da última atualização:  13/07/2017
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  BARROS-CARVALHO, G. A.; PASCHOAL, A. R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; HUNGRIA, M.
Afiliação:  GESIELE ALMEIDA BARROS DE CARVALHO, CNPq - bolsista; ALEXANDRE ROSSI PASCHOAL, UTFPR; FRANCISMAR CORRÊA MARCELINO-GUIMARÃES, CNPSO; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO.
Título:  Prediction of potential novel microRNAs in soybean when in symbiosis.
Ano de publicação:  2014
Fonte/Imprenta:  Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 4, p. 8519-8529, 2014.
ISSN:  1676-5680
DOI:  10.4238/2014.October.20.28
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  MicroRNAs (miRNAs) are small molecules, noncoding proteins that are involved in many biological processes, especially in plants; among these processes is nodulation in the legume. Biological nitrogen fixation is a key process, with critical importance to the soybean crop. This study aimed to identify the potential of novel miRNAs to act during the root nodulation process. We utilized a set of transcripts that were differentially expressed in soybean roots 10 days after inoculation with Bradyrhizobium japonicum, which were obtained in a previous study, and performed a set of computational analyses that led us to select new miRNAs potentially involved in nodulation. Among these analyses, the set of transcripts were submitted to an in silico annotation of noncoding RNAs, including a search of similarity against miRNA public databases, ab initio tools for miRNA identification, structural search against miRNA families, prediction of the secondary structure of miRNA precursors, and prediction of the sequences of mature miRNAs. Subsequently, we applied filter procedures based on miRNA selections described in the literature (e.g., free energy value). In the next step, a manual curation inspection of the annotation was performed and the top candidates were selected and used for prediction of potential target genes, which were later checked manually in the database of the soybean genome. This prediction led us to the identification of 9 potential new miRNAs; among these, 4 were conser... Mostrar Tudo
Thesagro:  Soja.
Categoria do assunto:  --
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/110912/1/Prediction-of-potential-novel-microRNAs-in-soybean-when-in-symbiosis.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Soja (CNPSO)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPSO35507 - 1UPCSP - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoGODOY, C. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Riscos e oportunidades: ferrugem da soja. In: DESAFIOS do Cerrado: como sustentar a expansão da produção com produtividade e competitividade. Cuiabá: AMPA: APROSOJA; Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 119-147.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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2.Imagem marcado/desmarcadoMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V.; DIAS, W. Biotechnology approaches to overcome biotic stress constraints in soybean production in Brazil. In: WORKSHOP ON BIOTIC AND ABIOTIC STRESS TOLERANCE IN PLANTS, 2013, Ilhéus. The challenge for the 21st century: book of abstracts. [Brasília]: Embrapa: International Advanced Biology Consortium, 2013. p. 25-26.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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3.Imagem marcado/desmarcadoMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ARIAS, C. A. A.; HUNGRIA, M. Manual de biossegurança da Embrapa Soja. Londrina: Embrapa Soja, 2014. 51 p. (Embrapa Soja. Documentos, 354).
Tipo: Documentos
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4.Imagem marcado/desmarcadoGARCIA, C. L.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; KASHIWABARA, A. Y. Desenvolvimento de uma ferramenta para identificar regiões codificadoras nos transcritos do fungo Phakopsora pachyrhizi. In: WORKSHOP DE BIOINFORMÁTICA DA UTFPR, 2016, Cornélio Procópio. [Proceedings...]. Cornélio Procópio: UTFPR, 2016. p. 6. WB2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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5.Imagem marcado/desmarcadoMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; DARBEN, L. M.; CARVALHO, K. de; MARIN, S. R. R. Aplicações da qPCR. In: PEREIRA, T. C. (Org.). Introdução às técnicas de PCR convencional, em tempo real e digital. Ribeirão Preto: SBG, 2018. p. 129-140.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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6.Imagem marcado/desmarcadoMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; SANTOS, J. V. M. dos; PASSIANOTO, A. L. L.; ABDELNOOR, R. V. Biotechnology strategies to nematode control in crop plants: an overview. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE NEMATOLOGIA, 32., 2015, Londrina. Nematologia: problemas emergentes e perspectivas: anais. Londrina: Sociedade Brasileira de Nematologia, 2015. p. 30-32. Palestra.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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7.Imagem marcado/desmarcadoAOYAGI, L. N.; LOPES-CAITAR, V. S.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Caracterização estrutural de fatores de transcrição R2R3-MYB de plantas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz do Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro: anais. Maringá: SBMP, 2017. v. 1. E-book. p. 39.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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8.Imagem marcado/desmarcadoMIRANDA, M. P.; CARVALHO, C. R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; MENDONÇA, M. A. C. Morphological aspects of Passiflora edulis f. flavicarpa chromosomes using orange banding and rDNA-FISH tools. Caryologia, Firenze, v. 61, n. 2, p. 154-159, 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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9.Imagem marcado/desmarcadoLOPES-CAITAR, V. S.; PINHEIRO, J. B.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Nematodes in horticulture: an overview. Journal of Horticultural Science and Crop Research, v. 1, n. 1, e. 106, [2019]. 11 p.
Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSOARES, R. M.; FANTINATO, G. G. P.; FERREIRA, E. G. C.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Plant-to-seed transmission of Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens on soybean. Tropical Plant Pathology, v. 43, n. 4, p. 376-379, 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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11.Imagem marcado/desmarcadoLOPES-CAITAR, V. S.; SILVA, S. M. H.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Plant small heat shock proteins and its interactions with biotic stress. In: ASEA, A. A. A.; CLADERWOOD, S. K.; KAUR, P. (Ed.). Heat shock proteins and plants. Cham: Springer, 2016. v. 10. p. 19-39.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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12.Imagem marcado/desmarcadoFERNANDES, J. B.; NOMURA, R. B. G.; PASINI, A.; ROGGIA, S.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Potencial de translocação de dsRNA em vagens de soja para estudos de silenciamento gênico em insetos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 8., 2018, Goiânia. Inovação, tecnologias digitais e sustentabilidade da soja: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2018. p. 125-127.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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13.Imagem marcado/desmarcadoBORTOLAN, S.; BARCELLOS, F. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; HUNGRIA, M. Expressão dos genes nodC, nodW e nopP em Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 avaliada por RT-qPCR. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 11, p. 1491-1498, nov. 2009 Título em inglês: Expression of nodC, nodW and nopP genes in Bradyrhizobiumjaponicum CPAC 15 strain evaluated by RT-qPCR.
Biblioteca(s): Área de Informação da Sede.
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14.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, L. R.; RODRIGUES, E. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; OLIVEIRA, A. L. M.; HUNGRIA, M. Fast induction of biosynthetic polysaccharide genes lpxA, lpxE, and rkpI of Rhizobium sp. strain PRF 81 by common bean seed exudates is indicative of a key role in symbiosis. Functional & Integrative Genomics, v. 13, n. 2, p. 275-283, Jun. 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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15.Imagem marcado/desmarcadoSABINO, F. C.; SERCERO, B. C.; CRUZ, B. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Functional characterization of hubs proteins in soybean immune system networks. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls. Abstract... Abstract: 587.pdf.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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16.Imagem marcado/desmarcadoLOPES, V. S.; CARVALHO, M. C. C. G. de; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Genes Hsp20 de soja: organização no genoma e categorização entre subfamílias. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE SOJA, 6., 2012, Cuiabá. Soja: integração nacional e desenvolvimento sustentável: anais. Brasília, DF: Embrapa, 2012. 4 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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17.Imagem marcado/desmarcadoNOGUEIRA, L. M.; LUCCA E BRACCINI, A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; ABDELNOOR, R. V. Identification of highly informative microsatellites for soybean cultivar discrimination in Brazil. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF PLANT MOLECULAR BIOLOGY, 11., 2015, Iguassu Falls. Abstract... Abstract: 320.pdf.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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18.Imagem marcado/desmarcadoLOPES, V. S.; CARVALHO, M. C. C. G. de; DIAS, W. P.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. Caracterização in silico das sHSPs de soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 6., 2011, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2011. p. 34-37. (Embrapa Soja. Documentos 328). Editado por Odilon Ferreira Saraiva, Paula Geron Saiz Melo. Disponível em: .
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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19.Imagem marcado/desmarcadoMARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; GUIMARÃES, M. F. M.; DE-BARROS, E. G. Detection and quantification of Roundup Ready soybean residues in sausage samples by conventional and real-time PCR. Ciência e Tecnologia de Alimentos, Campinas, v. 28, p. 38-45, 2008. Suplemento.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
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20.Imagem marcado/desmarcadoBARROS-CARVALHO, G. A.; PASCHOAL, A. R.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; HUNGRIA, M. Prediction of potential novel microRNAs in soybean when in symbiosis. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 13, n. 4, p. 8519-8529, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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