BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Informática Agropecuária.
Data corrente:  02/01/2014
Data da última atualização:  02/01/2014
Tipo da produção científica:  Resumo em Anais de Congresso
Autoria:  YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H.
Afiliação:  MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ROBERTO H. HERAI, University of California San Diego.
Título:  Chargaff's "Grammar of Biology": new fractal-like rules.
Ano de publicação:  2013
Fonte/Imprenta:  In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts]... [S.l.: s.n.], 2013.
Páginas:  Não paginado.
Idioma:  Inglês
Notas:  Pôster P1003.
Conteúdo:  Chargaff once said that "I saw before me in dark contours the beginning of a grammar of Biology?. In linguistics, "grammar" is the set of natural language rules, but we do not know for sure what Chargaff meant by a "grammar" of Biology. Chargaff discovered some rules about nucleotides that have been named Chargaff's rules. In this work, we further develop his "grammar". Using new concepts, we were able to discover new higher order genomic rules that seem to be invariant across a large set of organisms, and show a fractal-like property, since no matter the scale, the same pattern is observed (self-similarity). We hope that these new invariant genomic rules may be used in different contexts, for example for short read data bias detection and genome assembly quality assessment.
Palavras-Chave:  Bioinformática; Genômica; Propriedade fractal.
Thesaurus NAL:  Bioinformatics; Genomics.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/94599/1/P1003.odt
https://pag.confex.com/pag/xxi/webprogram/Paper5758.html
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Informática Agropecuária (CNPTIA)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPTIA17702 - 1UPCPL - DD

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1.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H. Metodologias de bioinformática para detecção e estudo de sequencias repetitivas em loci gênicos de transcritos quiméricos. 2010. 178 p. Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular na Área de Bioinformática) - Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas. Orientador: Michel Eduardo Beleza Yamagishi.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
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2.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. A bioinformatics approach to detect interchromosomal trans-splicing in bovine full length cDNA databanks. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 18., 2010, San Diego. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. Não paginado. P869. PAG-XVIII.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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3.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. MappingTools. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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4.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. FastaSequenceTools. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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5.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. FOC-Control. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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6.Imagem marcado/desmarcadoFALCÃO, P. R. K.; HERAI, R. H. Foc-Web. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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7.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. FusionFinder. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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8.Imagem marcado/desmarcadoGIACHETTO, P. F.; HERAI, R. H. BOS_ANNOTATION: Pipeline baseado em bancos de dados públicos para associação e anotação automática de transcriptomas bovinos. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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9.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. Chargaff's "Grammar of Biology": new fractal-like rules. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 21., 2013, San Diego. [Abstracts]... [S.l.: s.n.], 2013. Não paginado. Pôster P1003.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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10.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. Chargaff. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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11.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Detecting evidences of inter-chromosomal trans-spliced genes using a bioinformatic approach. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 4., 2008, Salvador. Proceedings... Salvador: AB³C, 2008. Não paginado. X-meeting 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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12.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Detection of human interchromosomal trans-splicing in sequence databanks. Briefings in Bioinformatics, London, v. 2, n. 2, p. 198-209, 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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13.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. RepGraph. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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14.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. Uma ferramenta WEB para identificação e visualização de sequências repetitivas em lócus gênico de animais e plantas. Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009. Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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15.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. A Web-based tool for identification and visualization of repetitive sequences within gene loci. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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16.Imagem marcado/desmarcadoHERAI, R. H.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B. Algoritmos de bioinformática para detecção de nullomers no transcriptoma humano. In: ENCONTRO ACADÊMICO DE MODELAGEM COMPUTACIONAL, 2.,2009, Petrópolis. Resumos... Petrópolis: Laboratório nacional de computação científica, 2009. p. 35-36. IIEAMC/LNCC 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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17.Imagem marcado/desmarcadoALVAREZ, J. C.; HERAI, R. H.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. G. A. PredIP: an in silico approach for automated protein interaction prediction in genomic and transcriptomic sequence databanks. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 85. AB3C X-meeting 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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18.Imagem marcado/desmarcadoYAMAGISHI, M. E. B.; FALCÃO, P. R. K.; VIEIRA, F. D.; HERAI, R. H. An indirect evidence of the Fibonacci String model for DNA repetitive sequence growth. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 3., 2007, São Paulo. Proceedings... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. p. 58. X-Meeting 2007.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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19.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, A. de; FRONZA, C. F.; HERAI, R. H.; ALVES, D. Evidence of deterministic evolution in the immunological memory process. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON MATHEMATICAL AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 9., 2009, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: BIOMAT Institute for Advanced Studies of Biosystems, 2009. p. 1-14.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
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20.Imagem marcado/desmarcadoREIS, O.; COSTA, G. G. L.; HERAI, R. H.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G. RNA-seq: the need for biological replicates. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts... [S.l.: s.n.], 2010. p. 194. AB3C X-meeting 2010.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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